MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 42117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003366	AGA	2	6	405	410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308983
2	NC_003366	AAT	2	6	425	430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308983
3	NC_003366	ATA	2	6	452	457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308983
4	NC_003366	ATA	2	6	525	530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308983
5	NC_003366	TTA	2	6	593	598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308983
6	NC_003366	AGA	3	9	664	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308983
7	NC_003366	GAA	2	6	703	708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308983
8	NC_003366	ATG	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308983
9	NC_003366	TGA	2	6	748	753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308983
10	NC_003366	GCA	2	6	827	832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18308983
11	NC_003366	ATT	2	6	874	879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308983
12	NC_003366	GGA	2	6	887	892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18308983
13	NC_003366	TTC	2	6	939	944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18308983
14	NC_003366	AGT	2	6	964	969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308983
15	NC_003366	ATC	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308983
16	NC_003366	TTA	2	6	1002	1007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308983
17	NC_003366	GAT	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308983
18	NC_003366	TTA	2	6	1067	1072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308983
19	NC_003366	GAT	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308983
20	NC_003366	AAG	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308983
21	NC_003366	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18308983
22	NC_003366	ATC	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308983
23	NC_003366	AGA	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308983
24	NC_003366	ACC	2	6	1258	1263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18308983
25	NC_003366	CTA	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308983
26	NC_003366	AAT	2	6	1399	1404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308983
27	NC_003366	ATA	2	6	1469	1474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308983
28	NC_003366	TAA	2	6	1477	1482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308983
29	NC_003366	ATT	2	6	1530	1535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308983
30	NC_003366	AGA	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308983
31	NC_003366	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308983
32	NC_003366	TGG	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18308983
33	NC_003366	TAC	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308983
34	NC_003366	TGA	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308983
35	NC_003366	CAA	2	6	2151	2156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18308984
36	NC_003366	TAG	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308984
37	NC_003366	TAA	2	6	2307	2312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308984
38	NC_003366	AGA	2	6	2353	2358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308984
39	NC_003366	TTA	2	6	2396	2401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308984
40	NC_003366	AGA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308984
41	NC_003366	CTT	2	6	2499	2504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18308984
42	NC_003366	TTC	2	6	2535	2540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18308984
43	NC_003366	TAT	2	6	2547	2552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308984
44	NC_003366	AGA	2	6	2692	2697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308984
45	NC_003366	ATT	2	6	2740	2745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308984
46	NC_003366	ATG	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308984
47	NC_003366	TTA	2	6	2810	2815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308984
48	NC_003366	TGA	2	6	2932	2937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308984
49	NC_003366	AGA	2	6	2980	2985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308984
50	NC_003366	TAT	2	6	3112	3117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308984
51	NC_003366	AAG	2	6	3308	3313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308985
52	NC_003366	TGA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308985
53	NC_003366	AGA	2	6	3922	3927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308986
54	NC_003366	AAG	3	9	3958	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308986
55	NC_003366	TAT	2	6	4004	4009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308986
56	NC_003366	ATA	2	6	4026	4031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308986
57	NC_003366	AGA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308986
58	NC_003366	ATA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308986
59	NC_003366	GAT	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308986
60	NC_003366	ATA	2	6	4365	4370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308986
61	NC_003366	ATA	2	6	4445	4450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308986
62	NC_003366	TTA	3	9	4478	4486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308986
63	NC_003366	GAT	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308986
64	NC_003366	TAA	2	6	4560	4565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308986
65	NC_003366	AGA	2	6	4579	4584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308986
66	NC_003366	GTA	2	6	4689	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308987
67	NC_003366	TTG	2	6	4792	4797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18308987
68	NC_003366	TCA	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308987
69	NC_003366	ATG	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308988
70	NC_003366	GTA	2	6	5256	5261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308988
71	NC_003366	TCA	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308988
72	NC_003366	TTG	2	6	5298	5303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18308988
73	NC_003366	TGA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308988
74	NC_003366	TGA	2	6	5386	5391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308988
75	NC_003366	GGC	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18308988
76	NC_003366	TGG	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18308988
77	NC_003366	GAA	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308988
78	NC_003366	TGA	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308988
79	NC_003366	AGA	2	6	5794	5799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308988
80	NC_003366	AGA	2	6	5809	5814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308988
81	NC_003366	GGT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18308988
82	NC_003366	ATG	2	6	5883	5888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308988
83	NC_003366	ATG	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308988
84	NC_003366	TAA	2	6	5983	5988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308988
85	NC_003366	GGT	2	6	6005	6010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18308988
86	NC_003366	AGA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308988
87	NC_003366	CTG	2	6	6132	6137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18308988
88	NC_003366	AGA	2	6	6256	6261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308988
89	NC_003366	TTA	2	6	6299	6304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308988
90	NC_003366	AAG	2	6	6328	6333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308988
91	NC_003366	AAG	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308988
92	NC_003366	TCA	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308988
93	NC_003366	TGG	2	6	6454	6459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18308988
94	NC_003366	AAT	2	6	6517	6522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308988
95	NC_003366	ATA	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308988
96	NC_003366	AAT	3	9	6643	6651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308988
97	NC_003366	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308988
98	NC_003366	TTC	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18308988
99	NC_003366	ACC	2	6	6760	6765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18308988
100	NC_003366	TGC	3	9	6814	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18308988
101	NC_003366	ATA	2	6	6830	6835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308988
102	NC_003366	TGG	2	6	6844	6849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18308988
103	NC_003366	TAG	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308988
104	NC_003366	ACT	2	6	6920	6925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308988
105	NC_003366	ATT	2	6	6946	6951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308988
106	NC_003366	TGA	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308988
107	NC_003366	AAG	2	6	7024	7029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308988
108	NC_003366	AGA	2	6	7041	7046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308988
109	NC_003366	TTG	2	6	7185	7190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18308989
110	NC_003366	AGA	2	6	7235	7240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308989
111	NC_003366	ACC	2	6	7329	7334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18308989
112	NC_003366	TCA	2	6	7346	7351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308989
113	NC_003366	ATG	2	6	7356	7361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308989
114	NC_003366	TTG	2	6	7404	7409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18308989
115	NC_003366	CAG	2	6	7446	7451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18308989
116	NC_003366	TAA	2	6	7513	7518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308989
117	NC_003366	TCA	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308989
118	NC_003366	CTA	2	6	7635	7640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18308989
119	NC_003366	ACC	2	6	7645	7650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18308989
120	NC_003366	CAG	2	6	7755	7760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18308989
121	NC_003366	AAT	3	9	7762	7770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308989
122	NC_003366	GCT	2	6	7790	7795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18308989
123	NC_003366	TAG	2	6	7818	7823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308989
124	NC_003366	ATA	2	6	7868	7873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308989
125	NC_003366	TAA	2	6	7897	7902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308989
126	NC_003366	AGA	2	6	8183	8188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308989
127	NC_003366	TAA	2	6	8203	8208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308989
128	NC_003366	TAA	2	6	8241	8246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308989
129	NC_003366	ATA	2	6	8256	8261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308989
130	NC_003366	TGA	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308989
131	NC_003366	ATA	2	6	8279	8284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308989
132	NC_003366	GCT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18308989
133	NC_003366	AGA	2	6	8381	8386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308989
134	NC_003366	ATT	2	6	8482	8487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308989
135	NC_003366	AGA	2	6	8500	8505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308989
136	NC_003366	AGA	2	6	8540	8545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308989
137	NC_003366	AGA	2	6	8581	8586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308989
138	NC_003366	AAG	2	6	8595	8600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308989
139	NC_003366	TGT	2	6	8605	8610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18308989
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141	NC_003366	AGA	2	6	8710	8715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308989
142	NC_003366	TTG	2	6	8721	8726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18308989
143	NC_003366	TTA	2	6	8759	8764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308989
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145	NC_003366	AAG	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308989
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147	NC_003366	AGT	2	6	9337	9342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308989
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149	NC_003366	ATG	2	6	9366	9371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308989
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151	NC_003366	TGT	2	6	9488	9493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18308990
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153	NC_003366	TTA	2	6	9546	9551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308990
154	NC_003366	AGA	2	6	9560	9565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308990
155	NC_003366	AGA	2	6	9581	9586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18308990
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157	NC_003366	TAA	2	6	9618	9623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308990
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160	NC_003366	ATA	2	6	15690	15695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18308992
161	NC_003366	TTA	2	6	15776	15781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308992
162	NC_003366	GAT	2	6	15819	15824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18308992
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165	NC_003366	TAT	2	6	16354	16359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308993
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167	NC_003366	TAT	2	6	16551	16556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18308993
168	NC_003366	TTC	2	6	16617	16622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18308993
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