MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 9370

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003366	TA	3	6	223	228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003366	TA	4	8	1341	1348	50 %	50 %	0 %	0 %	18308983
3	NC_003366	CT	3	6	1414	1419	0 %	50 %	0 %	50 %	18308983
4	NC_003366	AT	3	6	2006	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003366	GA	3	6	2301	2306	50 %	0 %	50 %	0 %	18308984
6	NC_003366	TG	3	6	3291	3296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003366	TA	3	6	3569	3574	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
8	NC_003366	TA	3	6	3691	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
9	NC_003366	CA	3	6	3717	3722	50 %	0 %	0 %	50 %	18308986
10	NC_003366	TC	3	6	3915	3920	0 %	50 %	0 %	50 %	18308986
11	NC_003366	AT	3	6	4094	4099	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
12	NC_003366	GA	3	6	4122	4127	50 %	0 %	50 %	0 %	18308986
13	NC_003366	AT	3	6	4150	4155	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
14	NC_003366	AT	3	6	4228	4233	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
15	NC_003366	AT	4	8	4353	4360	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
16	NC_003366	GA	3	6	4681	4686	50 %	0 %	50 %	0 %	18308987
17	NC_003366	TA	3	6	5145	5150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003366	AG	3	6	5632	5637	50 %	0 %	50 %	0 %	18308988
19	NC_003366	AG	3	6	6338	6343	50 %	0 %	50 %	0 %	18308988
20	NC_003366	AT	3	6	6715	6720	50 %	50 %	0 %	0 %	18308988
21	NC_003366	GA	3	6	6721	6726	50 %	0 %	50 %	0 %	18308988
22	NC_003366	TA	3	6	6749	6754	50 %	50 %	0 %	0 %	18308988
23	NC_003366	TA	3	6	6768	6773	50 %	50 %	0 %	0 %	18308988
24	NC_003366	AG	3	6	6793	6798	50 %	0 %	50 %	0 %	18308988
25	NC_003366	AT	3	6	7071	7076	50 %	50 %	0 %	0 %	18308988
26	NC_003366	AT	3	6	7396	7401	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
27	NC_003366	AT	3	6	7918	7923	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
28	NC_003366	AG	3	6	8016	8021	50 %	0 %	50 %	0 %	18308989
29	NC_003366	TA	3	6	8052	8057	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
30	NC_003366	AC	3	6	8059	8064	50 %	0 %	0 %	50 %	18308989
31	NC_003366	TA	3	6	8153	8158	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
32	NC_003366	AG	4	8	8215	8222	50 %	0 %	50 %	0 %	18308989
33	NC_003366	AC	3	6	8316	8321	50 %	0 %	0 %	50 %	18308989
34	NC_003366	AT	3	6	8632	8637	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
35	NC_003366	AG	3	6	8673	8678	50 %	0 %	50 %	0 %	18308989
36	NC_003366	AC	3	6	8747	8752	50 %	0 %	0 %	50 %	18308989
37	NC_003366	AT	3	6	8853	8858	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
38	NC_003366	CT	3	6	10876	10881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003366	AC	3	6	11365	11370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_003366	AG	3	6	11390	11395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003366	AC	3	6	11533	11538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003366	GA	3	6	11748	11753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003366	TC	3	6	11757	11762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_003366	TC	3	6	12717	12722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_003366	GA	3	6	13014	13019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003366	GT	3	6	13345	13350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003366	AG	4	8	13484	13491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003366	TG	3	6	14959	14964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003366	AT	3	6	15192	15197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003366	TA	3	6	15345	15350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003366	AT	4	8	15768	15775	50 %	50 %	0 %	0 %	18308992
52	NC_003366	TA	3	6	16112	16117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003366	TA	3	6	16144	16149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003366	TA	3	6	16175	16180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003366	TA	4	8	16239	16246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003366	TA	3	6	16471	16476	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
57	NC_003366	AT	3	6	16674	16679	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
58	NC_003366	TA	3	6	16768	16773	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
59	NC_003366	AT	3	6	17920	17925	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
60	NC_003366	TA	3	6	18017	18022	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
61	NC_003366	AT	3	6	18119	18124	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
62	NC_003366	GA	3	6	18306	18311	50 %	0 %	50 %	0 %	18308993
63	NC_003366	TA	4	8	18562	18569	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
64	NC_003366	TA	3	6	18655	18660	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
65	NC_003366	TA	3	6	19093	19098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003366	TA	4	8	19216	19223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003366	AT	3	6	19248	19253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003366	AG	3	6	19589	19594	50 %	0 %	50 %	0 %	18308994
69	NC_003366	AT	3	6	20211	20216	50 %	50 %	0 %	0 %	18308994
70	NC_003366	AT	3	6	20567	20572	50 %	50 %	0 %	0 %	18308994
71	NC_003366	AG	3	6	20578	20583	50 %	0 %	50 %	0 %	18308994
72	NC_003366	AT	3	6	20693	20698	50 %	50 %	0 %	0 %	18308995
73	NC_003366	AT	3	6	20953	20958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003366	TA	3	6	21002	21007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003366	AG	3	6	21016	21021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003366	AT	3	6	21207	21212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003366	GA	3	6	21501	21506	50 %	0 %	50 %	0 %	161485645
78	NC_003366	AG	3	6	21792	21797	50 %	0 %	50 %	0 %	161485645
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80	NC_003366	AT	3	6	22518	22523	50 %	50 %	0 %	0 %	161485645
81	NC_003366	AT	3	6	22566	22571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003366	TA	3	6	22587	22592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003366	AT	3	6	22886	22891	50 %	50 %	0 %	0 %	18308997
84	NC_003366	TA	3	6	23172	23177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003366	GA	3	6	23284	23289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003366	TC	3	6	23363	23368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_003366	GA	3	6	24133	24138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003366	TC	3	6	24212	24217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_003366	AT	3	6	24487	24492	50 %	50 %	0 %	0 %	18308999
90	NC_003366	AT	3	6	24715	24720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003366	AT	4	8	24740	24747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003366	TA	3	6	24956	24961	50 %	50 %	0 %	0 %	18309000
93	NC_003366	AT	3	6	25010	25015	50 %	50 %	0 %	0 %	18309000
94	NC_003366	AT	3	6	25079	25084	50 %	50 %	0 %	0 %	18309000
95	NC_003366	AT	3	6	25187	25192	50 %	50 %	0 %	0 %	18309000
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99	NC_003366	AT	3	6	26088	26093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003366	TA	3	6	26130	26135	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
101	NC_003366	AT	3	6	26913	26918	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
102	NC_003366	AT	3	6	27086	27091	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
103	NC_003366	AG	3	6	27103	27108	50 %	0 %	50 %	0 %	18309002
104	NC_003366	TA	3	6	27208	27213	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
105	NC_003366	AG	3	6	27495	27500	50 %	0 %	50 %	0 %	18309002
106	NC_003366	AG	3	6	27514	27519	50 %	0 %	50 %	0 %	18309002
107	NC_003366	TA	3	6	28501	28506	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
108	NC_003366	AT	3	6	28537	28542	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
109	NC_003366	AC	3	6	29260	29265	50 %	0 %	0 %	50 %	18309002
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111	NC_003366	AT	3	6	29471	29476	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
112	NC_003366	GA	5	10	29782	29791	50 %	0 %	50 %	0 %	18309003
113	NC_003366	TA	4	8	30895	30902	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
114	NC_003366	AT	3	6	30940	30945	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
115	NC_003366	AG	3	6	30953	30958	50 %	0 %	50 %	0 %	18309003
116	NC_003366	TA	3	6	31151	31156	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
117	NC_003366	TA	3	6	31571	31576	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
118	NC_003366	GA	3	6	31762	31767	50 %	0 %	50 %	0 %	18309003
119	NC_003366	TA	3	6	32675	32680	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
120	NC_003366	AG	3	6	32724	32729	50 %	0 %	50 %	0 %	18309003
121	NC_003366	TA	3	6	32921	32926	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
122	NC_003366	TA	3	6	33078	33083	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
123	NC_003366	TA	3	6	33297	33302	50 %	50 %	0 %	0 %	18309003
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125	NC_003366	AT	3	6	33867	33872	50 %	50 %	0 %	0 %	18309004
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127	NC_003366	AT	3	6	35196	35201	50 %	50 %	0 %	0 %	18309005
128	NC_003366	AT	3	6	35588	35593	50 %	50 %	0 %	0 %	18309005
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130	NC_003366	AT	4	8	36665	36672	50 %	50 %	0 %	0 %	18309006
131	NC_003366	AT	3	6	36947	36952	50 %	50 %	0 %	0 %	18309006
132	NC_003366	AT	4	8	38552	38559	50 %	50 %	0 %	0 %	18309007
133	NC_003366	AT	3	6	38651	38656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003366	AT	3	6	38674	38679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003366	TG	3	6	38784	38789	0 %	50 %	50 %	0 %	18309008
136	NC_003366	TA	3	6	38808	38813	50 %	50 %	0 %	0 %	18309008
137	NC_003366	CT	3	6	39291	39296	0 %	50 %	0 %	50 %	18309008
138	NC_003366	AT	3	6	39493	39498	50 %	50 %	0 %	0 %	18309008
139	NC_003366	TA	3	6	39682	39687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003366	AT	3	6	39770	39775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003366	TA	3	6	39916	39921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003366	TA	3	6	40549	40554	50 %	50 %	0 %	0 %	18309009
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144	NC_003366	TA	3	6	42116	42121	50 %	50 %	0 %	0 %	18309010
145	NC_003366	AT	3	6	42221	42226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003366	AT	4	8	42236	42243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003366	AG	3	6	42725	42730	50 %	0 %	50 %	0 %	18309011
148	NC_003366	AG	3	6	42765	42770	50 %	0 %	50 %	0 %	18309011
149	NC_003366	AT	3	6	42929	42934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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