MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens str. 13 chromosome

Total Repeats: 6924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003366	TA	4	8	1341	1348	50 %	50 %	0 %	0 %	18308983
2	NC_003366	CT	3	6	1414	1419	0 %	50 %	0 %	50 %	18308983
3	NC_003366	GA	3	6	2301	2306	50 %	0 %	50 %	0 %	18308984
4	NC_003366	TA	3	6	3569	3574	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
5	NC_003366	TA	3	6	3691	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
6	NC_003366	CA	3	6	3717	3722	50 %	0 %	0 %	50 %	18308986
7	NC_003366	TC	3	6	3915	3920	0 %	50 %	0 %	50 %	18308986
8	NC_003366	AT	3	6	4094	4099	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
9	NC_003366	GA	3	6	4122	4127	50 %	0 %	50 %	0 %	18308986
10	NC_003366	AT	3	6	4150	4155	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
11	NC_003366	AT	3	6	4228	4233	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
12	NC_003366	AT	4	8	4353	4360	50 %	50 %	0 %	0 %	18308986
13	NC_003366	GA	3	6	4681	4686	50 %	0 %	50 %	0 %	18308987
14	NC_003366	AG	3	6	5632	5637	50 %	0 %	50 %	0 %	18308988
15	NC_003366	AG	3	6	6338	6343	50 %	0 %	50 %	0 %	18308988
16	NC_003366	AT	3	6	6715	6720	50 %	50 %	0 %	0 %	18308988
17	NC_003366	GA	3	6	6721	6726	50 %	0 %	50 %	0 %	18308988
18	NC_003366	TA	3	6	6749	6754	50 %	50 %	0 %	0 %	18308988
19	NC_003366	TA	3	6	6768	6773	50 %	50 %	0 %	0 %	18308988
20	NC_003366	AG	3	6	6793	6798	50 %	0 %	50 %	0 %	18308988
21	NC_003366	AT	3	6	7071	7076	50 %	50 %	0 %	0 %	18308988
22	NC_003366	AT	3	6	7396	7401	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
23	NC_003366	AT	3	6	7918	7923	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
24	NC_003366	AG	3	6	8016	8021	50 %	0 %	50 %	0 %	18308989
25	NC_003366	TA	3	6	8052	8057	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
26	NC_003366	AC	3	6	8059	8064	50 %	0 %	0 %	50 %	18308989
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28	NC_003366	AG	4	8	8215	8222	50 %	0 %	50 %	0 %	18308989
29	NC_003366	AC	3	6	8316	8321	50 %	0 %	0 %	50 %	18308989
30	NC_003366	AT	3	6	8632	8637	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
31	NC_003366	AG	3	6	8673	8678	50 %	0 %	50 %	0 %	18308989
32	NC_003366	AC	3	6	8747	8752	50 %	0 %	0 %	50 %	18308989
33	NC_003366	AT	3	6	8853	8858	50 %	50 %	0 %	0 %	18308989
34	NC_003366	AT	4	8	15768	15775	50 %	50 %	0 %	0 %	18308992
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36	NC_003366	AT	3	6	16674	16679	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
37	NC_003366	TA	3	6	16768	16773	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
38	NC_003366	AT	3	6	17920	17925	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
39	NC_003366	TA	3	6	18017	18022	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
40	NC_003366	AT	3	6	18119	18124	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
41	NC_003366	GA	3	6	18306	18311	50 %	0 %	50 %	0 %	18308993
42	NC_003366	TA	4	8	18562	18569	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
43	NC_003366	TA	3	6	18655	18660	50 %	50 %	0 %	0 %	18308993
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45	NC_003366	AT	3	6	20211	20216	50 %	50 %	0 %	0 %	18308994
46	NC_003366	AT	3	6	20567	20572	50 %	50 %	0 %	0 %	18308994
47	NC_003366	AG	3	6	20578	20583	50 %	0 %	50 %	0 %	18308994
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50	NC_003366	AG	3	6	21792	21797	50 %	0 %	50 %	0 %	161485645
51	NC_003366	AC	3	6	21825	21830	50 %	0 %	0 %	50 %	161485645
52	NC_003366	AT	3	6	22518	22523	50 %	50 %	0 %	0 %	161485645
53	NC_003366	AT	3	6	22886	22891	50 %	50 %	0 %	0 %	18308997
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63	NC_003366	AT	3	6	27086	27091	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
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65	NC_003366	TA	3	6	27208	27213	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
66	NC_003366	AG	3	6	27495	27500	50 %	0 %	50 %	0 %	18309002
67	NC_003366	AG	3	6	27514	27519	50 %	0 %	50 %	0 %	18309002
68	NC_003366	TA	3	6	28501	28506	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
69	NC_003366	AT	3	6	28537	28542	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
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72	NC_003366	AT	3	6	29471	29476	50 %	50 %	0 %	0 %	18309002
73	NC_003366	GA	5	10	29782	29791	50 %	0 %	50 %	0 %	18309003
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112	NC_003366	AT	3	6	48064	48069	50 %	50 %	0 %	0 %	18309017
113	NC_003366	AT	3	6	48187	48192	50 %	50 %	0 %	0 %	18309017
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122	NC_003366	TA	4	8	57477	57484	50 %	50 %	0 %	0 %	18309026
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126	NC_003366	TA	3	6	59383	59388	50 %	50 %	0 %	0 %	18309027
127	NC_003366	AT	3	6	59513	59518	50 %	50 %	0 %	0 %	18309027
128	NC_003366	TA	3	6	59552	59557	50 %	50 %	0 %	0 %	18309027
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145	NC_003366	AT	3	6	69099	69104	50 %	50 %	0 %	0 %	18309039
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