MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Chlamydophila caviae GPIC chromosome

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003361	GTTGGT	2	12	4986	4997	0 %	50 %	50 %	0 %	29839773
2	NC_003361	TGTTTT	2	12	6637	6648	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003361	AGAAAA	2	12	10128	10139	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	29839776
4	NC_003361	GATACA	2	12	11846	11857	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29839777
5	NC_003361	TCTTCA	2	12	12158	12169	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	29839777
6	NC_003361	CAAATA	2	12	16063	16074	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	29839779
7	NC_003361	CTGCTA	2	12	21091	21102	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29839783
8	NC_003361	AAGTAT	2	12	21108	21119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29839783
9	NC_003361	TGATAA	2	12	23263	23274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29839784
10	NC_003361	AATACC	2	12	29572	29583	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	29839788
11	NC_003361	TCCTCT	2	12	31380	31391	0 %	50 %	0 %	50 %	29839790
12	NC_003361	TCTTCA	2	12	32934	32945	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_003361	TTTTTC	2	12	34223	34234	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29839794
14	NC_003361	GAAATG	2	12	37219	37230	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29839795
15	NC_003361	TGTTTT	2	12	37690	37701	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003361	TACCTT	2	12	38758	38769	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	29839796
17	NC_003361	TTTTTA	2	12	39205	39216	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003361	TAGATA	2	12	40301	40312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29839798
19	NC_003361	TTTAAT	2	12	42586	42597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839800
20	NC_003361	ATTTGA	2	12	46505	46516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	29839805
21	NC_003361	GACAAG	2	12	54168	54179	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29839810
22	NC_003361	CTTATC	2	12	54205	54216	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	29839810
23	NC_003361	AAATTT	2	12	54974	54985	50 %	50 %	0 %	0 %	29839811
24	NC_003361	AGCACG	2	12	61281	61292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29839816
25	NC_003361	AGCTTG	2	12	61380	61391	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29839816
26	NC_003361	TTATGG	2	12	62062	62073	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	29839816
27	NC_003361	ATGAAG	2	12	62888	62899	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29839816
28	NC_003361	GATGCG	2	12	63879	63890	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29839817
29	NC_003361	GAAGCC	2	12	64378	64389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_003361	TATCTT	2	12	71727	71738	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29839824
31	NC_003361	CCCGAT	2	12	72767	72778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	29839825
32	NC_003361	AAGATT	2	12	77139	77150	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29839829
33	NC_003361	CGCTCT	2	12	77395	77406	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_003361	TTTTAA	2	12	77559	77570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003361	AACAAT	2	12	77623	77634	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	29839830
36	NC_003361	TCAGAT	2	12	77887	77898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29839830
37	NC_003361	AGAGGG	2	12	77907	77918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29839830
38	NC_003361	AAATAA	2	12	80250	80261	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003361	GCATCA	2	12	86524	86535	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29839839
40	NC_003361	ATATCG	3	18	90377	90394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29839841
41	NC_003361	CCTTTG	2	12	91656	91667	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	29839841
42	NC_003361	CCATCC	2	12	92720	92731	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	29839842
43	NC_003361	AATTAA	2	12	93634	93645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003361	GGGAGG	2	12	94515	94526	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	29839844
45	NC_003361	CAAAAT	2	12	99875	99886	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	29839851
46	NC_003361	TGAATA	2	12	101841	101852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29839854
47	NC_003361	ACTTTA	2	12	103598	103609	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	29839856
48	NC_003361	ATGTTA	2	12	105753	105764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	29839859
49	NC_003361	GCTAAT	2	12	111877	111888	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29839867
50	NC_003361	GTAAAG	2	12	112195	112206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29839868
51	NC_003361	TAAAGG	2	12	115057	115068	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29839875
52	NC_003361	AACAAA	2	12	118228	118239	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	29839880
53	NC_003361	AGCTTT	2	12	119447	119458	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29839882
54	NC_003361	ATCTTC	2	12	121716	121727	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	29839885
55	NC_003361	TGCATT	2	12	124223	124234	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29839887
56	NC_003361	GGATAT	2	12	125940	125951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839890
57	NC_003361	ATATGA	2	12	127614	127625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29839891
58	NC_003361	AGCAAC	2	12	129318	129329	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	29839892
59	NC_003361	TAGAAG	2	12	134230	134241	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29839896
60	NC_003361	CTTTAA	2	12	134896	134907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	29839896
61	NC_003361	TTTCCG	2	12	149307	149318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	29839910
62	NC_003361	TATTTT	2	12	150721	150732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	29839911
63	NC_003361	AGAGAA	2	12	165435	165446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29839924
64	NC_003361	GTTTTT	2	12	172404	172415	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	29839931
65	NC_003361	TGGGGC	2	12	176851	176862	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	29839937
66	NC_003361	GCTAAA	2	12	180077	180088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29839939
67	NC_003361	ACCAAC	2	12	181806	181817	50 %	0 %	0 %	50 %	29839940
68	NC_003361	CATCAG	2	12	182431	182442	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29839941
69	NC_003361	GCAATA	2	12	184742	184753	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_003361	TTGTTT	2	12	186510	186521	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	29839945
71	NC_003361	CGTATG	2	12	196978	196989	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29839949
72	NC_003361	AGGGAA	2	12	206710	206721	50 %	0 %	50 %	0 %	29839959
73	NC_003361	ATTCGT	2	12	207255	207266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29839960
74	NC_003361	ATTAAG	2	12	207531	207542	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29839960
75	NC_003361	CAGGAA	2	12	208233	208244	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29839961
76	NC_003361	ATTTGT	2	12	217450	217461	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29839972
77	NC_003361	ATCAAT	2	12	219592	219603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	29839972
78	NC_003361	GCTTTT	2	12	220691	220702	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	29839972
79	NC_003361	AGGAAC	2	12	220978	220989	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29839972
80	NC_003361	GCCACC	2	12	225275	225286	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	29839974
81	NC_003361	ATTTTT	2	12	225721	225732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003361	CCAATA	2	12	226408	226419	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	29839976
83	NC_003361	ATATTT	2	12	227617	227628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29839977
84	NC_003361	ATTTTG	2	12	231851	231862	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29839983
85	NC_003361	TTCTCA	2	12	234034	234045	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	29839985
86	NC_003361	TAGGAA	2	12	234750	234761	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29839985
87	NC_003361	ATTTTT	2	12	237736	237747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	29839988
88	NC_003361	TTTTTC	2	12	237955	237966	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29839988
89	NC_003361	CGGCAG	2	12	238524	238535	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	29839988
90	NC_003361	GATATG	2	12	246236	246247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29839997
91	NC_003361	TTTTCT	2	12	254793	254804	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29840007
92	NC_003361	GATTGC	2	12	255154	255165	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29840008
93	NC_003361	ATGCCA	2	12	259218	259229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840011
94	NC_003361	GTGTAG	2	12	260433	260444	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	29840011
95	NC_003361	AATCCT	2	12	260859	260870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840012
96	NC_003361	GGGAAA	2	12	266875	266886	50 %	0 %	50 %	0 %	29840018
97	NC_003361	TATTTC	2	12	270507	270518	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29840020
98	NC_003361	TTAATT	2	12	273879	273890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003361	GTTATG	2	12	274438	274449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	29840025
100	NC_003361	TTCTGT	2	12	276608	276619	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	29840027
101	NC_003361	TAAGAA	2	12	276916	276927	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	29840027
102	NC_003361	GCTTGT	2	12	278400	278411	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	29840028
103	NC_003361	GGAGCC	2	12	279648	279659	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	29840028
104	NC_003361	GCTATT	2	12	281444	281455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840030
105	NC_003361	GGAGAG	2	12	283327	283338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29840032
106	NC_003361	AGGATT	2	12	289261	289272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840036
107	NC_003361	TACTTG	2	12	289926	289937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840036
108	NC_003361	TCATTA	2	12	290673	290684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_003361	TAAAAT	2	12	290765	290776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003361	CAAAGT	2	12	291257	291268	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29840037
111	NC_003361	CGGCAG	2	12	293016	293027	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	29840037
112	NC_003361	TGACTC	2	12	299672	299683	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29840040
113	NC_003361	AGAAAG	2	12	310463	310474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29840045
114	NC_003361	ATCTTC	2	12	313891	313902	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	29840046
115	NC_003361	AATTTA	2	12	314163	314174	50 %	50 %	0 %	0 %	29840046
116	NC_003361	AAATCC	2	12	319088	319099	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	29840048
117	NC_003361	TCAGAC	2	12	320366	320377	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840048
118	NC_003361	AGGGTT	2	12	324819	324830	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	29840050
119	NC_003361	TTAGCT	2	12	324985	324996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840050
120	NC_003361	AGATCC	2	12	325293	325304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840050
121	NC_003361	AGGATT	2	12	327530	327541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840051
122	NC_003361	TCGGCA	2	12	328050	328061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	29840051
123	NC_003361	TGTTGC	2	12	334096	334107	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	29840052
124	NC_003361	ATTAGA	2	12	339839	339850	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003361	AAGCAG	2	12	341069	341080	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29840058
126	NC_003361	AGGTTG	2	12	342162	342173	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	29840059
127	NC_003361	CTTTAT	2	12	349409	349420	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29840065
128	NC_003361	GCAATG	2	12	353533	353544	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	29840067
129	NC_003361	ACCCTT	2	12	356076	356087	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	29840069
130	NC_003361	AATGCC	2	12	367046	367057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840080
131	NC_003361	CTTCAG	2	12	367069	367080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29840080
132	NC_003361	AACCTA	2	12	369206	369217	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	29840082
133	NC_003361	TGCATC	2	12	369631	369642	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29840083
134	NC_003361	GAATAT	2	12	370693	370704	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29840084
135	NC_003361	TGGCGG	2	12	374828	374839	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	29840088
136	NC_003361	GCTGAG	2	12	376624	376635	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29840089
137	NC_003361	TAAGGA	2	12	378578	378589	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29840090
138	NC_003361	GTATGT	2	12	390254	390265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	29840101
139	NC_003361	TTTATC	2	12	392297	392308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29840104
140	NC_003361	TCCTAA	2	12	394213	394224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840106
141	NC_003361	TACGAT	2	12	397216	397227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29840109
142	NC_003361	ATTTCA	2	12	398250	398261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	29840110
143	NC_003361	ATTTAA	2	12	400323	400334	50 %	50 %	0 %	0 %	29840113
144	NC_003361	TCAAGC	2	12	400887	400898	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840114
145	NC_003361	GTTAAA	2	12	401389	401400	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29840114
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147	NC_003361	TGAAGA	2	12	405951	405962	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29840118
148	NC_003361	TAAGAA	2	12	406940	406951	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	29840119
149	NC_003361	ATTAAA	2	12	407988	407999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840119
150	NC_003361	GTGTAT	2	12	411166	411177	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	29840122
151	NC_003361	ATAGGC	2	12	411183	411194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	29840122
152	NC_003361	AATATC	2	12	423271	423282	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	29840136
153	NC_003361	ATCTAA	2	12	423762	423773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	29840137
154	NC_003361	TTTAGC	2	12	424152	424163	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840137
155	NC_003361	TGATTT	2	12	426853	426864	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29840139
156	NC_003361	ACTTTT	2	12	429355	429366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29840142
157	NC_003361	AGGAAT	2	12	435179	435190	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29840147
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159	NC_003361	TTTTGA	2	12	437297	437308	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29840150
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161	NC_003361	GCTTTT	2	12	445018	445029	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	29840154
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164	NC_003361	GAGCAA	2	12	455292	455303	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29840166
165	NC_003361	AAGACA	2	12	455654	455665	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_003361	TTAGGA	2	12	462039	462050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840173
167	NC_003361	AACTAT	2	12	462222	462233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	29840173
168	NC_003361	CTTTAG	2	12	464529	464540	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840175
169	NC_003361	TAAAAT	2	12	466171	466182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_003361	GAATGA	2	12	466705	466716	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29840178
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175	NC_003361	AAAAAT	2	12	470978	470989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_003361	ATCAAA	2	12	474808	474819	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	29840183
177	NC_003361	AATCAG	2	12	475762	475773	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29840185
178	NC_003361	TTTCTA	2	12	477623	477634	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
179	NC_003361	GATATT	2	12	478510	478521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	29840186
180	NC_003361	GTACTT	2	12	490036	490047	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840195
181	NC_003361	GTTCTT	2	12	491895	491906	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	29840197
182	NC_003361	CTAGCA	2	12	499080	499091	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840203
183	NC_003361	AGTTGG	2	12	500929	500940	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	29840204
184	NC_003361	TTAAAA	2	12	508765	508776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_003361	TTTGGA	2	12	513401	513412	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	29840216
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188	NC_003361	CTTTTC	2	12	515515	515526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840218
189	NC_003361	GCAGCT	2	12	517636	517647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	29840220
190	NC_003361	TTTTCC	2	12	528282	528293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29840227
191	NC_003361	TACAGC	2	12	531274	531285	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840230
192	NC_003361	TTAGAC	2	12	531501	531512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29840230
193	NC_003361	TATTTG	2	12	532970	532981	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29840232
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195	NC_003361	TGAAGT	2	12	534272	534283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840233
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199	NC_003361	TAACTA	2	12	543642	543653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
200	NC_003361	TTAAAG	2	12	553348	553359	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29840249
201	NC_003361	GCTTTT	2	12	553479	553490	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	29840249
202	NC_003361	TAACGC	2	12	556870	556881	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840251
203	NC_003361	CTATGC	2	12	557920	557931	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29840252
204	NC_003361	ATAGGA	2	12	558643	558654	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29840252
205	NC_003361	TTGAAA	2	12	560088	560099	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
206	NC_003361	GTGGCT	2	12	560397	560408	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	29840254
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210	NC_003361	TCATTT	2	12	565432	565443	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29840257
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216	NC_003361	CAACTT	2	12	576346	576357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840266
217	NC_003361	TATCAT	2	12	576379	576390	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	29840266
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220	NC_003361	CCATGC	2	12	593492	593503	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	29840281
221	NC_003361	AAGTTT	2	12	593576	593587	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	29840281
222	NC_003361	TTTTTA	2	12	594211	594222	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_003361	TTCTAA	2	12	594348	594359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	29840282
224	NC_003361	GTTGGG	2	12	594902	594913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29840282
225	NC_003361	TTCCCA	2	12	596013	596024	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	29840283
226	NC_003361	TCGCTA	2	12	600550	600561	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29840288
227	NC_003361	GTTATC	2	12	602722	602733	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840291
228	NC_003361	TAATTT	2	12	607029	607040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_003361	ATAGGG	2	12	608561	608572	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	29840298
230	NC_003361	TGCCTA	2	12	609850	609861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29840299
231	NC_003361	GCTTAT	2	12	610126	610137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840299
232	NC_003361	TTCTTT	2	12	621535	621546	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29840307
233	NC_003361	ATAAGA	2	12	623384	623395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	29840309
234	NC_003361	AGCAGA	2	12	626407	626418	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29840313
235	NC_003361	AGATAA	2	12	626686	626697	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	29840313
236	NC_003361	TATTTC	2	12	627467	627478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29840314
237	NC_003361	TATTGT	2	12	629257	629268	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29840315
238	NC_003361	AAATTA	2	12	630428	630439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840315
239	NC_003361	TAAAAA	2	12	631796	631807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_003361	GAGATG	2	12	633908	633919	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	29840317
241	NC_003361	TTCAAA	2	12	637907	637918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	29840317
242	NC_003361	TATGGA	2	12	638023	638034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840317
243	NC_003361	TGAAGA	2	12	641137	641148	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29840317
244	NC_003361	TAAAAG	2	12	645104	645115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
245	NC_003361	AATAGA	2	12	648502	648513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	29840321
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250	NC_003361	TATAAA	2	12	666422	666433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29840340
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254	NC_003361	ATTTTT	2	12	675317	675328	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	29840353
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262	NC_003361	AAGCTT	2	12	693439	693450	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29840368
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265	NC_003361	TATAAT	2	12	700670	700681	50 %	50 %	0 %	0 %	29840373
266	NC_003361	TTGCTG	2	12	700683	700694	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	29840373
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268	NC_003361	TCCATA	2	12	704425	704436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29840374
269	NC_003361	CTAAAC	2	12	705311	705322	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	29840374
270	NC_003361	TCATTT	2	12	706073	706084	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29840375
271	NC_003361	ATAGCA	2	12	710358	710369	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29840377
272	NC_003361	GTCATC	2	12	712955	712966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29840381
273	NC_003361	GGATCT	2	12	715275	715286	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29840382
274	NC_003361	AAGCTA	2	12	715582	715593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29840382
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278	NC_003361	CAACTG	2	12	730697	730708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29840397
279	NC_003361	ATACAG	2	12	731647	731658	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29840397
280	NC_003361	TGTTTA	2	12	738528	738539	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29840403
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282	NC_003361	GATAAA	2	12	741954	741965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_003361	AGCAAA	2	12	743274	743285	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	29840408
284	NC_003361	TCTATT	2	12	748148	748159	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29840414
285	NC_003361	TATTTT	2	12	748325	748336	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	29840414
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290	NC_003361	TATTCT	2	12	762541	762552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
291	NC_003361	TGGTGA	2	12	763139	763150	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	29840425
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299	NC_003361	CGTTAA	2	12	791163	791174	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29840442
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301	NC_003361	AATTAA	2	12	792843	792854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_003361	ATTGCT	2	12	810493	810504	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29840460
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311	NC_003361	GCATTC	2	12	837495	837506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29840488
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314	NC_003361	CAAAAC	2	12	840341	840352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840490
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335	NC_003361	CATACC	2	12	900288	900299	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	29840542
336	NC_003361	CAGAAA	2	12	901111	901122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	29840543
337	NC_003361	TACAAG	2	12	909095	909106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29840549
338	NC_003361	CAACAG	2	12	910633	910644	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	29840550
339	NC_003361	TAATTG	2	12	912322	912333	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	29840552
340	NC_003361	CATCAC	2	12	914908	914919	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	29840556
341	NC_003361	TGAGAT	2	12	916458	916469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29840556
342	NC_003361	TTCTAA	2	12	916616	916627	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	29840556
343	NC_003361	AATTAA	2	12	917179	917190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_003361	GAAAAT	2	12	918397	918408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
345	NC_003361	CCCCTA	2	12	919955	919966	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
346	NC_003361	AGCACC	2	12	922900	922911	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	29840561
347	NC_003361	CAAAAC	2	12	923627	923638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29840561
348	NC_003361	TAGAAA	2	12	928491	928502	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	29840563
349	NC_003361	CAAAAA	2	12	937818	937829	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	29840569
350	NC_003361	CCGCCA	2	12	942254	942265	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	29840576
351	NC_003361	TCCTAT	2	12	943863	943874	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	29840578
352	NC_003361	TCAACA	2	12	943926	943937	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	29840578
353	NC_003361	ATAAGG	2	12	964534	964545	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29840596
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355	NC_003361	GCTGAT	2	12	969639	969650	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29840604
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.