MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis bv. 1 str. 16M chromosome I

Total Repeats: 283

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003317	CCAAC	2	10	159	168	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_003317	TTTGT	2	10	48059	48068	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003317	TCGGG	2	10	52560	52569	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_003317	GTTGT	2	10	63716	63725	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003317	TTGCG	2	10	73322	73331	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_003317	ACCCG	2	10	94470	94479	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_003317	TCGGG	2	10	94483	94492	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_003317	CAAAA	2	10	99539	99548	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_003317	CATCG	2	10	112291	112300	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_003317	TGGCA	2	10	115600	115609	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_003317	CCGCT	2	10	120904	120913	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_003317	TGAGT	2	10	132232	132241	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003317	TTTGT	2	10	143500	143509	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003317	GCCGC	2	10	159926	159935	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_003317	CATTT	2	10	161055	161064	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003317	TTCGG	2	10	162687	162696	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003317	GCATC	2	10	173371	173380	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_003317	ACGGC	2	10	173678	173687	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_003317	CGCTC	2	10	176169	176178	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_003317	TTTGT	2	10	179305	179314	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003317	GAAGA	2	10	198221	198230	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003317	TCGTG	2	10	199661	199670	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_003317	GGGCT	2	10	199806	199815	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_003317	GCTTC	2	10	200359	200368	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_003317	GAAGA	2	10	200674	200683	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003317	ACAGC	2	10	201174	201183	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_003317	AGAGG	2	10	202785	202794	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003317	TTGAA	2	10	202803	202812	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003317	ATTTT	2	10	211012	211021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003317	AAACA	2	10	216297	216306	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_003317	TGATC	2	10	223235	223244	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_003317	GCTTC	2	10	246929	246938	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_003317	GCGGT	2	10	254583	254592	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_003317	ATCTT	2	10	310818	310827	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003317	GGCGG	2	10	312152	312161	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
36	NC_003317	TTTGT	2	10	315024	315033	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003317	CGCTC	2	10	315208	315217	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_003317	TGGAA	2	10	321547	321556	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003317	AGGCG	2	10	328692	328701	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_003317	TTTTG	2	10	330432	330441	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003317	GCCTT	2	10	336966	336975	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_003317	GGGCA	2	10	338108	338117	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_003317	GAAAA	2	10	349802	349811	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003317	GCGCA	2	10	349832	349841	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_003317	GGTAG	2	10	363329	363338	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003317	TTCGG	2	10	374333	374342	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_003317	GGCCT	2	10	377191	377200	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_003317	TTCTT	2	10	377346	377355	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_003317	AACAG	2	10	377368	377377	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_003317	TCCCC	2	10	380722	380731	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
51	NC_003317	TCGTC	2	10	381549	381558	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_003317	GACAA	2	10	386968	386977	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_003317	GAAAA	2	10	397652	397661	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003317	GAAGA	2	10	397849	397858	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003317	TCGTG	2	10	399289	399298	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_003317	GGGCT	2	10	399434	399443	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003317	GCTTC	2	10	399987	399996	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_003317	GAAGA	2	10	400302	400311	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003317	ACAGC	2	10	400802	400811	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_003317	AGAGG	2	10	402412	402421	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003317	TTGAA	2	10	402430	402439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003317	AGTGA	2	10	406680	406689	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003317	CGTTC	2	10	408366	408375	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_003317	TTTGA	2	10	416762	416771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003317	TTTGA	2	10	419589	419598	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003317	CAATC	2	10	420350	420359	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_003317	AGGCA	2	10	423950	423959	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_003317	CTGGG	2	10	437550	437559	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003317	GTTTT	2	10	439850	439859	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003317	GGGCG	2	10	441591	441600	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
71	NC_003317	TGTCT	2	10	447910	447919	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_003317	CCCGG	2	10	465229	465238	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_003317	GTTTT	2	10	469112	469121	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003317	ACAAA	2	10	469180	469189	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_003317	GGAAA	2	10	478677	478686	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003317	ACAAG	2	10	486361	486370	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_003317	TTTGT	2	10	493041	493050	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003317	CCATT	2	10	498200	498209	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_003317	GACCG	2	10	502751	502760	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_003317	CTTTG	2	10	513062	513071	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003317	TCGGT	2	10	518007	518016	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_003317	CCTCA	2	10	525902	525911	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_003317	GAAAA	2	10	527326	527335	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003317	CGCTA	2	10	527366	527375	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_003317	GGCAA	2	10	528720	528729	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_003317	AAGGA	2	10	528774	528783	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003317	AACCG	2	10	544789	544798	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_003317	TCATT	2	10	548643	548652	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_003317	GAAGC	2	10	556380	556389	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_003317	GTCCC	2	10	560285	560294	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_003317	GGATG	2	10	564234	564243	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003317	CCGAT	2	10	569418	569427	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_003317	TTGCT	2	10	571170	571179	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_003317	GAAAG	2	10	574338	574347	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003317	ATTCA	2	10	580737	580746	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_003317	CAAAG	2	10	582092	582101	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_003317	TGATT	2	10	602649	602658	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003317	ACAAA	2	10	638215	638224	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_003317	GAAAT	2	10	643307	643316	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003317	GGCAG	2	10	647583	647592	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_003317	TTTGT	2	10	647662	647671	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003317	ACCGT	2	10	650995	651004	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_003317	CAGGG	2	10	656167	656176	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_003317	GCATG	2	10	656953	656962	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_003317	TATCA	2	10	685152	685161	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_003317	TTTGT	2	10	695733	695742	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003317	TTGCT	2	10	718225	718234	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_003317	AGCAA	2	10	748334	748343	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_003317	TTTGT	2	10	752225	752234	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003317	ATAAA	2	10	753514	753523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003317	TTTGA	2	10	753635	753644	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003317	TCTTT	2	10	757857	757866	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_003317	GACAT	2	10	758491	758500	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_003317	AGAGG	2	10	758693	758702	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003317	ACAAA	2	10	762617	762626	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_003317	TTTGT	2	10	763919	763928	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003317	CCGTT	2	10	768000	768009	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_003317	GAAGG	2	10	770752	770761	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003317	GGGAA	2	10	772073	772082	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003317	GAAAA	2	10	795430	795439	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003317	ATTGA	2	10	830421	830430	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003317	GAGCG	2	10	844692	844701	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_003317	GCGGA	2	10	852671	852680	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_003317	ACAAA	2	10	859843	859852	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_003317	AGGCG	2	10	863009	863018	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_003317	CTTTT	2	10	874692	874701	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_003317	TCAAT	2	10	879211	879220	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_003317	GGACC	2	10	886279	886288	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_003317	ATTGA	2	10	904965	904974	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003317	TGCGT	2	10	920725	920734	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_003317	AAAAC	2	10	932556	932565	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_003317	TGTGC	2	10	933659	933668	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_003317	GGGGC	2	10	935868	935877	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
134	NC_003317	ATGAG	2	10	938883	938892	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003317	CCATG	2	10	939689	939698	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_003317	GGGGA	2	10	940092	940101	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003317	TTCGT	2	10	942212	942221	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_003317	ATTTT	2	10	961165	961174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003317	CTTTT	2	10	961348	961357	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_003317	GCCCT	2	10	965702	965711	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_003317	TAAAA	2	10	970628	970637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003317	TAAAA	2	10	972592	972601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003317	ATCAT	2	10	972658	972667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_003317	TCGTG	2	10	980064	980073	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_003317	CGCTG	2	10	983895	983904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_003317	CTGAA	2	10	983906	983915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_003317	TTTGT	2	10	985927	985936	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003317	TTTGT	2	10	990830	990839	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003317	TTCAT	2	10	992694	992703	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_003317	TTTGT	2	10	1242835	1242844	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_003317	ACAAA	2	10	2102138	2102147	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
283	NC_003317	ATTAA	2	10	2117099	2117108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.