MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 plasmid pGMI1000MP

Total Repeats: 2070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003296	GGGCA	2	10	2595	2604	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_003296	AAAAG	2	10	3062	3071	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003296	CAACT	2	10	3351	3360	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_003296	AAGAC	2	10	5114	5123	60 %	0 %	20 %	20 %	17548225
5	NC_003296	GTCCA	2	10	7073	7082	20 %	20 %	20 %	40 %	17548227
6	NC_003296	GCTGT	2	10	7145	7154	0 %	40 %	40 %	20 %	17548227
7	NC_003296	CGCGC	2	10	10431	10440	0 %	0 %	40 %	60 %	17548229
8	NC_003296	CGCAT	2	10	10750	10759	20 %	20 %	20 %	40 %	17548229
9	NC_003296	ATCGA	2	10	12052	12061	40 %	20 %	20 %	20 %	17548230
10	NC_003296	CGGCA	2	10	12613	12622	20 %	0 %	40 %	40 %	17548230
11	NC_003296	CCGCA	2	10	12852	12861	20 %	0 %	20 %	60 %	17548231
12	NC_003296	GCCGG	2	10	13134	13143	0 %	0 %	60 %	40 %	17548231
13	NC_003296	GCCAG	2	10	13343	13352	20 %	0 %	40 %	40 %	17548231
14	NC_003296	GCGCG	2	10	13710	13719	0 %	0 %	60 %	40 %	17548232
15	NC_003296	CCGGC	2	10	14002	14011	0 %	0 %	40 %	60 %	17548232
16	NC_003296	ATGCG	2	10	14971	14980	20 %	20 %	40 %	20 %	17548233
17	NC_003296	GCCGT	2	10	15826	15835	0 %	20 %	40 %	40 %	17548233
18	NC_003296	GCAGC	2	10	15944	15953	20 %	0 %	40 %	40 %	17548233
19	NC_003296	GATGC	2	10	15978	15987	20 %	20 %	40 %	20 %	17548233
20	NC_003296	CGCGC	2	10	16966	16975	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_003296	AATGG	2	10	19477	19486	40 %	20 %	40 %	0 %	17548236
22	NC_003296	CGGCG	2	10	22735	22744	0 %	0 %	60 %	40 %	17548239
23	NC_003296	CACGG	2	10	25171	25180	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_003296	GCTTG	2	10	25276	25285	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_003296	GGTGC	2	10	25444	25453	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_003296	CCGCA	2	10	25572	25581	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_003296	CGGCG	2	10	26255	26264	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_003296	CGGGG	2	10	26437	26446	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_003296	GATGA	2	10	27163	27172	40 %	20 %	40 %	0 %	17548244
30	NC_003296	CCAGG	2	10	28235	28244	20 %	0 %	40 %	40 %	17548245
31	NC_003296	GCAGG	2	10	29606	29615	20 %	0 %	60 %	20 %	17548247
32	NC_003296	CTCGC	2	10	32394	32403	0 %	20 %	20 %	60 %	17548249
33	NC_003296	CGTGT	2	10	33497	33506	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_003296	GGCCG	2	10	34859	34868	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_003296	GGCAT	2	10	35162	35171	20 %	20 %	40 %	20 %	17548251
36	NC_003296	GCTGC	2	10	36264	36273	0 %	20 %	40 %	40 %	17548252
37	NC_003296	AACTA	2	10	36763	36772	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_003296	CGGCG	2	10	39225	39234	0 %	0 %	60 %	40 %	17548254
39	NC_003296	ATCGC	2	10	39235	39244	20 %	20 %	20 %	40 %	17548254
40	NC_003296	CGTGG	2	10	39867	39876	0 %	20 %	60 %	20 %	17548254
41	NC_003296	GGCGC	2	10	40472	40481	0 %	0 %	60 %	40 %	17548255
42	NC_003296	GGGCT	2	10	41691	41700	0 %	20 %	60 %	20 %	17548257
43	NC_003296	GCACG	2	10	41717	41726	20 %	0 %	40 %	40 %	17548257
44	NC_003296	CCGCG	2	10	42311	42320	0 %	0 %	40 %	60 %	17548257
45	NC_003296	TCGTC	2	10	43935	43944	0 %	40 %	20 %	40 %	17548258
46	NC_003296	TCGCC	2	10	43956	43965	0 %	20 %	20 %	60 %	17548258
47	NC_003296	GAGCC	2	10	46185	46194	20 %	0 %	40 %	40 %	17548262
48	NC_003296	CGGCG	2	10	46299	46308	0 %	0 %	60 %	40 %	17548263
49	NC_003296	AAATC	2	10	47608	47617	60 %	20 %	0 %	20 %	17548265
50	NC_003296	GCGCA	2	10	48519	48528	20 %	0 %	40 %	40 %	17548265
51	NC_003296	GCTGA	2	10	49718	49727	20 %	20 %	40 %	20 %	17548266
52	NC_003296	GCGGT	2	10	51019	51028	0 %	20 %	60 %	20 %	17548267
53	NC_003296	GAAGA	2	10	52391	52400	60 %	0 %	40 %	0 %	17548269
54	NC_003296	ATGCA	2	10	57942	57951	40 %	20 %	20 %	20 %	17548273
55	NC_003296	CGAGC	2	10	58792	58801	20 %	0 %	40 %	40 %	17548273
56	NC_003296	GCATT	2	10	59081	59090	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003296	GCCGA	3	15	60901	60915	20 %	0 %	40 %	40 %	17548275
58	NC_003296	GCCAC	2	10	61045	61054	20 %	0 %	20 %	60 %	17548275
59	NC_003296	TGCAA	2	10	64416	64425	40 %	20 %	20 %	20 %	17548278
60	NC_003296	GCCAC	2	10	64497	64506	20 %	0 %	20 %	60 %	17548278
61	NC_003296	ACGAC	2	10	64841	64850	40 %	0 %	20 %	40 %	17548278
62	NC_003296	TGGCC	2	10	65172	65181	0 %	20 %	40 %	40 %	17548279
63	NC_003296	CGGCG	2	10	67616	67625	0 %	0 %	60 %	40 %	17548280
64	NC_003296	GCTGC	2	10	69256	69265	0 %	20 %	40 %	40 %	17548281
65	NC_003296	CCGCA	2	10	73169	73178	20 %	0 %	20 %	60 %	17548284
66	NC_003296	GACGC	2	10	73783	73792	20 %	0 %	40 %	40 %	17548285
67	NC_003296	GAACC	2	10	75454	75463	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_003296	AGCGC	2	10	76799	76808	20 %	0 %	40 %	40 %	17548287
69	NC_003296	GCCGT	2	10	76935	76944	0 %	20 %	40 %	40 %	17548287
70	NC_003296	CGAGC	2	10	78153	78162	20 %	0 %	40 %	40 %	17548289
71	NC_003296	GCGCG	2	10	80881	80890	0 %	0 %	60 %	40 %	17548291
72	NC_003296	CCTGC	2	10	81694	81703	0 %	20 %	20 %	60 %	17548291
73	NC_003296	GCCGC	2	10	89518	89527	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_003296	GGTTG	2	10	92295	92304	0 %	40 %	60 %	0 %	17548305
75	NC_003296	GAACG	2	10	92998	93007	40 %	0 %	40 %	20 %	17548306
76	NC_003296	CGCTA	2	10	93425	93434	20 %	20 %	20 %	40 %	17548306
77	NC_003296	ACCGC	2	10	94041	94050	20 %	0 %	20 %	60 %	17548306
78	NC_003296	AGGCG	2	10	94246	94255	20 %	0 %	60 %	20 %	17548306
79	NC_003296	CGCGG	2	10	97176	97185	0 %	0 %	60 %	40 %	17548307
80	NC_003296	TCGAT	2	10	97203	97212	20 %	40 %	20 %	20 %	17548307
81	NC_003296	TGCCG	2	10	98112	98121	0 %	20 %	40 %	40 %	17548309
82	NC_003296	GGCCG	2	10	98601	98610	0 %	0 %	60 %	40 %	17548310
83	NC_003296	CGTGC	2	10	98993	99002	0 %	20 %	40 %	40 %	17548311
84	NC_003296	GACGC	2	10	99341	99350	20 %	0 %	40 %	40 %	17548311
85	NC_003296	CTGGC	2	10	99419	99428	0 %	20 %	40 %	40 %	17548311
86	NC_003296	TCCCA	2	10	99863	99872	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_003296	TCAAC	2	10	100445	100454	40 %	20 %	0 %	40 %	17548312
88	NC_003296	ACTGG	2	10	101133	101142	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_003296	GGCTC	2	10	101934	101943	0 %	20 %	40 %	40 %	17548315
90	NC_003296	TGCCA	2	10	102231	102240	20 %	20 %	20 %	40 %	17548315
91	NC_003296	GAAAC	2	10	102529	102538	60 %	0 %	20 %	20 %	17548316
92	NC_003296	GCGCC	2	10	106352	106361	0 %	0 %	40 %	60 %	17548320
93	NC_003296	CGGCG	2	10	109896	109905	0 %	0 %	60 %	40 %	17548321
94	NC_003296	TTCCA	2	10	110105	110114	20 %	40 %	0 %	40 %	17548321
95	NC_003296	TGGCC	2	10	110580	110589	0 %	20 %	40 %	40 %	17548321
96	NC_003296	CGGCG	2	10	110620	110629	0 %	0 %	60 %	40 %	17548321
97	NC_003296	GCGAT	2	10	111992	112001	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_003296	ACCGC	2	10	112579	112588	20 %	0 %	20 %	60 %	17548322
99	NC_003296	GCCGC	2	10	112652	112661	0 %	0 %	40 %	60 %	17548322
100	NC_003296	GGCCG	2	10	112676	112685	0 %	0 %	60 %	40 %	17548322
101	NC_003296	CGGCG	2	10	112979	112988	0 %	0 %	60 %	40 %	17548322
102	NC_003296	CGGAC	2	10	113257	113266	20 %	0 %	40 %	40 %	17548322
103	NC_003296	GGCAC	2	10	115523	115532	20 %	0 %	40 %	40 %	17548324
104	NC_003296	ACGGC	2	10	116422	116431	20 %	0 %	40 %	40 %	17548324
105	NC_003296	GCCGC	2	10	116491	116500	0 %	0 %	40 %	60 %	17548324
106	NC_003296	AACGG	2	10	117036	117045	40 %	0 %	40 %	20 %	17548324
107	NC_003296	GACTC	2	10	118118	118127	20 %	20 %	20 %	40 %	17548325
108	NC_003296	CCGTG	2	10	119654	119663	0 %	20 %	40 %	40 %	17548326
109	NC_003296	CGGCG	2	10	120743	120752	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110	NC_003296	TCCAG	2	10	122440	122449	20 %	20 %	20 %	40 %	17548328
111	NC_003296	TCGCC	2	10	123608	123617	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_003296	GCGCG	2	10	125673	125682	0 %	0 %	60 %	40 %	17548331
113	NC_003296	CGGCG	2	10	126620	126629	0 %	0 %	60 %	40 %	17548332
114	NC_003296	CAGGC	2	10	128079	128088	20 %	0 %	40 %	40 %	17548332
115	NC_003296	CGGCG	2	10	128267	128276	0 %	0 %	60 %	40 %	17548332
116	NC_003296	CTGCA	2	10	128860	128869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_003296	GCTGC	2	10	129601	129610	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_003296	CCGGT	2	10	132969	132978	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_003296	CCGGT	2	10	134130	134139	0 %	20 %	40 %	40 %	17548337
120	NC_003296	GCGTG	2	10	137151	137160	0 %	20 %	60 %	20 %	17548341
121	NC_003296	CGCTG	2	10	137816	137825	0 %	20 %	40 %	40 %	17548341
122	NC_003296	ATCGC	2	10	139294	139303	20 %	20 %	20 %	40 %	17548341
123	NC_003296	CACAC	2	10	139351	139360	40 %	0 %	0 %	60 %	17548341
124	NC_003296	TCCGG	2	10	139708	139717	0 %	20 %	40 %	40 %	17548342
125	NC_003296	GCATC	2	10	140270	140279	20 %	20 %	20 %	40 %	17548342
126	NC_003296	ATGTC	2	10	140852	140861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_003296	CCGCG	2	10	141089	141098	0 %	0 %	40 %	60 %	161621738
128	NC_003296	ACGAG	2	10	141863	141872	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_003296	CCGGC	2	10	143480	143489	0 %	0 %	40 %	60 %	17548344
130	NC_003296	CGCGC	2	10	143829	143838	0 %	0 %	40 %	60 %	17548344
131	NC_003296	ACCGA	2	10	144344	144353	40 %	0 %	20 %	40 %	17548345
132	NC_003296	GCCGG	2	10	145992	146001	0 %	0 %	60 %	40 %	17548347
133	NC_003296	TGTGC	2	10	149214	149223	0 %	40 %	40 %	20 %	17548349
134	NC_003296	TGCGG	2	10	150156	150165	0 %	20 %	60 %	20 %	17548349
135	NC_003296	GCGAG	2	10	151653	151662	20 %	0 %	60 %	20 %	17548351
136	NC_003296	CGCCT	2	10	152428	152437	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_003296	TACCG	2	10	154024	154033	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_003296	ACGCC	2	10	154174	154183	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_003296	CACGC	2	10	154388	154397	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_003296	AGCGC	2	10	155501	155510	20 %	0 %	40 %	40 %	17548355
141	NC_003296	CGTGC	2	10	155710	155719	0 %	20 %	40 %	40 %	17548355
142	NC_003296	GCGCC	2	10	157150	157159	0 %	0 %	40 %	60 %	17548356
143	NC_003296	CGGCG	2	10	157908	157917	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_003296	CGGCG	2	10	157969	157978	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_003296	GGGCA	2	10	159206	159215	20 %	0 %	60 %	20 %	17548357
146	NC_003296	CGGAT	2	10	159871	159880	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_003296	CCCGG	2	10	159994	160003	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
148	NC_003296	CGATT	2	10	161678	161687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_003296	TTCCC	2	10	162483	162492	0 %	40 %	0 %	60 %	17548361
150	NC_003296	TCGCG	2	10	163164	163173	0 %	20 %	40 %	40 %	17548362
151	NC_003296	CCGGT	2	10	163424	163433	0 %	20 %	40 %	40 %	17548363
152	NC_003296	GGCGT	2	10	163536	163545	0 %	20 %	60 %	20 %	17548363
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155	NC_003296	TTGCG	2	10	166539	166548	0 %	40 %	40 %	20 %	17548365
156	NC_003296	AAGGC	2	10	166600	166609	40 %	0 %	40 %	20 %	17548365
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158	NC_003296	CCAGC	2	10	167117	167126	20 %	0 %	20 %	60 %	17548366
159	NC_003296	GCCGT	2	10	168362	168371	0 %	20 %	40 %	40 %	17548368
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161	NC_003296	CTTTT	2	10	171112	171121	0 %	80 %	0 %	20 %	17548370
162	NC_003296	CGCTG	2	10	172562	172571	0 %	20 %	40 %	40 %	17548372
163	NC_003296	CAAGC	2	10	172722	172731	40 %	0 %	20 %	40 %	17548372
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165	NC_003296	ATCGA	2	10	177837	177846	40 %	20 %	20 %	20 %	17548373
166	NC_003296	ACTGG	2	10	178049	178058	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
167	NC_003296	GCCGG	2	10	180557	180566	0 %	0 %	60 %	40 %	17548377
168	NC_003296	CCGGC	2	10	185067	185076	0 %	0 %	40 %	60 %	17548381
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171	NC_003296	TTCAA	2	10	188267	188276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_003296	GGCGA	2	10	188305	188314	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
173	NC_003296	TGGTT	2	10	189943	189952	0 %	60 %	40 %	0 %	17548384
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176	NC_003296	GCGGG	2	10	192159	192168	0 %	0 %	80 %	20 %	17548385
177	NC_003296	GCGCG	2	10	192619	192628	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
178	NC_003296	CCAGC	2	10	192992	193001	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
179	NC_003296	GCGTG	2	10	195012	195021	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
180	NC_003296	CCGGC	2	10	195314	195323	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
181	NC_003296	AGGCC	2	10	196174	196183	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
182	NC_003296	GGCCC	2	10	197161	197170	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
183	NC_003296	GCAGC	2	10	197435	197444	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NC_003296	GTTTC	2	10	199864	199873	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_003296	CGGGC	2	10	202560	202569	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
186	NC_003296	CGGGT	2	10	204962	204971	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
187	NC_003296	GGGCC	2	10	205435	205444	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
188	NC_003296	CGGGC	2	10	205758	205767	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
189	NC_003296	CACCG	2	10	207424	207433	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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192	NC_003296	TCGGC	2	10	210955	210964	0 %	20 %	40 %	40 %	17548390
193	NC_003296	TGCAG	2	10	211479	211488	20 %	20 %	40 %	20 %	17548391
194	NC_003296	CGCAG	2	10	212071	212080	20 %	0 %	40 %	40 %	17548392
195	NC_003296	CACGG	2	10	212194	212203	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
196	NC_003296	GCGCG	2	10	213186	213195	0 %	0 %	60 %	40 %	17548393
197	NC_003296	GTCGC	2	10	214055	214064	0 %	20 %	40 %	40 %	17548394
198	NC_003296	GCAAG	2	10	218398	218407	40 %	0 %	40 %	20 %	17548396
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202	NC_003296	GCGCG	2	10	221700	221709	0 %	0 %	60 %	40 %	17548398
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204	NC_003296	CCGCG	2	10	222879	222888	0 %	0 %	40 %	60 %	17548399
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206	NC_003296	CGGCG	2	10	225188	225197	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
207	NC_003296	AGCAG	2	10	225949	225958	40 %	0 %	40 %	20 %	17548403
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232	NC_003296	GGGCG	2	10	244162	244171	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
233	NC_003296	GCGCC	2	10	244289	244298	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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238	NC_003296	AGCGC	2	10	250383	250392	20 %	0 %	40 %	40 %	17548423
239	NC_003296	TGAAG	2	10	251314	251323	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
240	NC_003296	CGAGG	2	10	252460	252469	20 %	0 %	60 %	20 %	17548424
241	NC_003296	CGCTG	2	10	252773	252782	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
242	NC_003296	CTTGC	2	10	254929	254938	0 %	40 %	20 %	40 %	17548427
243	NC_003296	CACGT	2	10	256514	256523	20 %	20 %	20 %	40 %	17548429
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248	NC_003296	CGCGC	2	10	258631	258640	0 %	0 %	40 %	60 %	17548430
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250	NC_003296	CGTGT	2	10	259516	259525	0 %	40 %	40 %	20 %	17548431
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254	NC_003296	GGCGC	2	10	262655	262664	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
255	NC_003296	GGCGC	2	10	264611	264620	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
256	NC_003296	GCGCC	2	10	266349	266358	0 %	0 %	40 %	60 %	17548436
257	NC_003296	GGGCT	2	10	270369	270378	0 %	20 %	60 %	20 %	17548438
258	NC_003296	TGCAT	2	10	270550	270559	20 %	40 %	20 %	20 %	17548438
259	NC_003296	TCGGA	2	10	271314	271323	20 %	20 %	40 %	20 %	17548439
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261	NC_003296	CCCAG	2	10	275866	275875	20 %	0 %	20 %	60 %	17548441
262	NC_003296	AGCCA	2	10	276077	276086	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
263	NC_003296	GCGCA	2	10	276507	276516	20 %	0 %	40 %	40 %	17548442
264	NC_003296	GCTGG	2	10	278946	278955	0 %	20 %	60 %	20 %	17548444
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270	NC_003296	AGCTC	2	10	283818	283827	20 %	20 %	20 %	40 %	17548448
271	NC_003296	TGCGG	2	10	284020	284029	0 %	20 %	60 %	20 %	17548448
272	NC_003296	GGGCG	2	10	284492	284501	0 %	0 %	80 %	20 %	17548449
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274	NC_003296	ATGGC	2	10	286353	286362	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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497	NC_003296	GCAGC	2	10	500722	500731	20 %	0 %	40 %	40 %	17548616
498	NC_003296	CCGCG	2	10	501178	501187	0 %	0 %	40 %	60 %	17548616
499	NC_003296	GGGTG	2	10	501324	501333	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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