MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 plasmid pGMI1000MP

Total Repeats: 6452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003296	GCCC	2	8	128	135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_003296	GCTT	2	8	564	571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_003296	CCCG	2	8	658	665	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_003296	ACGC	2	8	728	735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_003296	AGTC	2	8	949	956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_003296	GTAT	2	8	1009	1016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003296	GACT	2	8	1187	1194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_003296	TCGA	2	8	1813	1820	25 %	25 %	25 %	25 %	17548222
9	NC_003296	CACG	2	8	2216	2223	25 %	0 %	25 %	50 %	17548222
10	NC_003296	CAAC	2	8	2697	2704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_003296	GCAG	2	8	3002	3009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003296	GAGT	2	8	3047	3054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003296	GCAT	2	8	3789	3796	25 %	25 %	25 %	25 %	17548224
14	NC_003296	GGCA	2	8	4386	4393	25 %	0 %	50 %	25 %	17548224
15	NC_003296	GCCC	2	8	4530	4537	0 %	0 %	25 %	75 %	17548225
16	NC_003296	AGCC	2	8	5396	5403	25 %	0 %	25 %	50 %	17548225
17	NC_003296	CCAT	2	8	5767	5774	25 %	25 %	0 %	50 %	17548226
18	NC_003296	CTGG	2	8	5882	5889	0 %	25 %	50 %	25 %	17548226
19	NC_003296	ATGG	2	8	6122	6129	25 %	25 %	50 %	0 %	17548226
20	NC_003296	GGGT	2	8	6522	6529	0 %	25 %	75 %	0 %	17548226
21	NC_003296	AGCC	2	8	6874	6881	25 %	0 %	25 %	50 %	17548227
22	NC_003296	GACG	2	8	7498	7505	25 %	0 %	50 %	25 %	17548227
23	NC_003296	GGCC	2	8	7778	7785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_003296	CCCA	2	8	7947	7954	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_003296	GTCG	2	8	8141	8148	0 %	25 %	50 %	25 %	17548228
26	NC_003296	GGCT	2	8	8298	8305	0 %	25 %	50 %	25 %	17548228
27	NC_003296	GTCG	2	8	8354	8361	0 %	25 %	50 %	25 %	17548228
28	NC_003296	GTCG	2	8	8468	8475	0 %	25 %	50 %	25 %	17548228
29	NC_003296	GGCC	2	8	9263	9270	0 %	0 %	50 %	50 %	17548228
30	NC_003296	GGCC	2	8	9545	9552	0 %	0 %	50 %	50 %	17548229
31	NC_003296	GAAG	2	8	9707	9714	50 %	0 %	50 %	0 %	17548229
32	NC_003296	TTCG	2	8	9977	9984	0 %	50 %	25 %	25 %	17548229
33	NC_003296	GATC	2	8	10298	10305	25 %	25 %	25 %	25 %	17548229
34	NC_003296	CAGC	2	8	10739	10746	25 %	0 %	25 %	50 %	17548229
35	NC_003296	GGCG	2	8	10880	10887	0 %	0 %	75 %	25 %	17548229
36	NC_003296	GCGG	2	8	11238	11245	0 %	0 %	75 %	25 %	17548229
37	NC_003296	CCGT	2	8	11467	11474	0 %	25 %	25 %	50 %	17548230
38	NC_003296	CCGA	2	8	11809	11816	25 %	0 %	25 %	50 %	17548230
39	NC_003296	GGCG	2	8	11970	11977	0 %	0 %	75 %	25 %	17548230
40	NC_003296	CACT	2	8	12478	12485	25 %	25 %	0 %	50 %	17548230
41	NC_003296	GGCC	2	8	12486	12493	0 %	0 %	50 %	50 %	17548230
42	NC_003296	GCCA	2	8	12931	12938	25 %	0 %	25 %	50 %	17548231
43	NC_003296	GCGT	2	8	13005	13012	0 %	25 %	50 %	25 %	17548231
44	NC_003296	CCAG	2	8	13076	13083	25 %	0 %	25 %	50 %	17548231
45	NC_003296	CGGG	2	8	13536	13543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003296	GGCA	2	8	13615	13622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_003296	ATCG	2	8	13760	13767	25 %	25 %	25 %	25 %	17548232
48	NC_003296	CCGG	2	8	13861	13868	0 %	0 %	50 %	50 %	17548232
49	NC_003296	GGCG	2	8	14056	14063	0 %	0 %	75 %	25 %	17548232
50	NC_003296	CGGC	3	12	14069	14080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_003296	GCCG	2	8	14135	14142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_003296	GCCG	2	8	14426	14433	0 %	0 %	50 %	50 %	17548233
53	NC_003296	AGGG	2	8	14643	14650	25 %	0 %	75 %	0 %	17548233
54	NC_003296	TCCG	2	8	14789	14796	0 %	25 %	25 %	50 %	17548233
55	NC_003296	TCCG	2	8	15121	15128	0 %	25 %	25 %	50 %	17548233
56	NC_003296	CGGC	2	8	15268	15275	0 %	0 %	50 %	50 %	17548233
57	NC_003296	CGGC	2	8	16058	16065	0 %	0 %	50 %	50 %	17548233
58	NC_003296	CGGC	2	8	16417	16424	0 %	0 %	50 %	50 %	17548233
59	NC_003296	GCCG	2	8	16651	16658	0 %	0 %	50 %	50 %	17548233
60	NC_003296	GACT	2	8	17052	17059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_003296	CGCC	2	8	17163	17170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_003296	TGGG	2	8	18145	18152	0 %	25 %	75 %	0 %	17548234
63	NC_003296	TCGA	2	8	18163	18170	25 %	25 %	25 %	25 %	17548234
64	NC_003296	GCCG	2	8	18414	18421	0 %	0 %	50 %	50 %	17548234
65	NC_003296	CCGG	2	8	18949	18956	0 %	0 %	50 %	50 %	17548235
66	NC_003296	GGGC	2	8	19185	19192	0 %	0 %	75 %	25 %	17548235
67	NC_003296	GGGC	2	8	19317	19324	0 %	0 %	75 %	25 %	17548235
68	NC_003296	GGTC	2	8	19500	19507	0 %	25 %	50 %	25 %	17548236
69	NC_003296	CGGC	2	8	19720	19727	0 %	0 %	50 %	50 %	17548236
70	NC_003296	GCAT	2	8	20683	20690	25 %	25 %	25 %	25 %	17548237
71	NC_003296	GGCG	2	8	20810	20817	0 %	0 %	75 %	25 %	17548237
72	NC_003296	CCGC	2	8	22033	22040	0 %	0 %	25 %	75 %	17548239
73	NC_003296	CCAG	2	8	22075	22082	25 %	0 %	25 %	50 %	17548239
74	NC_003296	CAGC	2	8	22259	22266	25 %	0 %	25 %	50 %	17548239
75	NC_003296	TGGC	2	8	22536	22543	0 %	25 %	50 %	25 %	17548239
76	NC_003296	GGCC	2	8	22612	22619	0 %	0 %	50 %	50 %	17548239
77	NC_003296	CGGC	2	8	22635	22642	0 %	0 %	50 %	50 %	17548239
78	NC_003296	GTCG	2	8	24194	24201	0 %	25 %	50 %	25 %	17548241
79	NC_003296	TGCG	2	8	24221	24228	0 %	25 %	50 %	25 %	17548241
80	NC_003296	GGGC	2	8	24560	24567	0 %	0 %	75 %	25 %	17548241
81	NC_003296	GCAT	2	8	24790	24797	25 %	25 %	25 %	25 %	17548241
82	NC_003296	GCAT	2	8	24951	24958	25 %	25 %	25 %	25 %	17548241
83	NC_003296	ACGC	2	8	26301	26308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_003296	AAAT	2	8	26727	26734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003296	TCCG	2	8	26901	26908	0 %	25 %	25 %	50 %	17548244
86	NC_003296	GCCT	2	8	27296	27303	0 %	25 %	25 %	50 %	17548244
87	NC_003296	GCCG	2	8	27582	27589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_003296	GCCG	2	8	27600	27607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_003296	CTGG	2	8	27643	27650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003296	TGCG	2	8	28084	28091	0 %	25 %	50 %	25 %	17548245
91	NC_003296	GGCG	2	8	28115	28122	0 %	0 %	75 %	25 %	17548245
92	NC_003296	TATC	3	12	28690	28701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_003296	CGGC	2	8	28852	28859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_003296	GAGG	2	8	28889	28896	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003296	CGGC	2	8	29052	29059	0 %	0 %	50 %	50 %	17548246
96	NC_003296	GTCC	2	8	29488	29495	0 %	25 %	25 %	50 %	17548247
97	NC_003296	GCCG	2	8	29545	29552	0 %	0 %	50 %	50 %	17548247
98	NC_003296	CCGA	2	8	30788	30795	25 %	0 %	25 %	50 %	17548248
99	NC_003296	GGCG	2	8	30904	30911	0 %	0 %	75 %	25 %	17548248
100	NC_003296	TGCG	2	8	31374	31381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_003296	ACGG	2	8	31763	31770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_003296	CCAT	2	8	31782	31789	25 %	25 %	0 %	50 %	17548249
103	NC_003296	CTGC	2	8	32094	32101	0 %	25 %	25 %	50 %	17548249
104	NC_003296	CTCG	2	8	32255	32262	0 %	25 %	25 %	50 %	17548249
105	NC_003296	ACCT	2	8	32298	32305	25 %	25 %	0 %	50 %	17548249
106	NC_003296	ATCG	2	8	32678	32685	25 %	25 %	25 %	25 %	17548249
107	NC_003296	CTCG	2	8	32759	32766	0 %	25 %	25 %	50 %	17548249
108	NC_003296	GCTG	2	8	32852	32859	0 %	25 %	50 %	25 %	17548249
109	NC_003296	CTCG	2	8	32867	32874	0 %	25 %	25 %	50 %	17548249
110	NC_003296	CTCG	2	8	33020	33027	0 %	25 %	25 %	50 %	17548249
111	NC_003296	GACC	2	8	33749	33756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_003296	GGGA	2	8	33791	33798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003296	CAGG	2	8	33836	33843	25 %	0 %	50 %	25 %	17548250
114	NC_003296	TTCT	2	8	34012	34019	0 %	75 %	0 %	25 %	17548250
115	NC_003296	GGCG	2	8	34020	34027	0 %	0 %	75 %	25 %	17548250
116	NC_003296	GTTG	2	8	34134	34141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003296	GCTC	2	8	34383	34390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_003296	GATT	2	8	34684	34691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003296	GCCG	2	8	34725	34732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_003296	CCGA	2	8	35175	35182	25 %	0 %	25 %	50 %	17548251
121	NC_003296	ACGT	2	8	35598	35605	25 %	25 %	25 %	25 %	17548251
122	NC_003296	CCGG	2	8	35646	35653	0 %	0 %	50 %	50 %	17548251
123	NC_003296	TCGG	2	8	36089	36096	0 %	25 %	50 %	25 %	17548252
124	NC_003296	TGCC	2	8	36336	36343	0 %	25 %	25 %	50 %	17548252
125	NC_003296	AAGG	2	8	36349	36356	50 %	0 %	50 %	0 %	17548252
126	NC_003296	GCTC	2	8	36708	36715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_003296	CGGC	2	8	36841	36848	0 %	0 %	50 %	50 %	17548253
128	NC_003296	GCAC	2	8	37306	37313	25 %	0 %	25 %	50 %	17548253
129	NC_003296	GCGG	2	8	37609	37616	0 %	0 %	75 %	25 %	17548253
130	NC_003296	CCGA	2	8	37857	37864	25 %	0 %	25 %	50 %	17548253
131	NC_003296	CAGC	2	8	37892	37899	25 %	0 %	25 %	50 %	17548253
132	NC_003296	CTGG	2	8	38522	38529	0 %	25 %	50 %	25 %	17548253
133	NC_003296	CGCT	2	8	39667	39674	0 %	25 %	25 %	50 %	17548254
134	NC_003296	CGGG	2	8	39926	39933	0 %	0 %	75 %	25 %	17548254
135	NC_003296	GACC	2	8	40259	40266	25 %	0 %	25 %	50 %	17548255
136	NC_003296	GCTG	2	8	40387	40394	0 %	25 %	50 %	25 %	17548255
137	NC_003296	GAGC	2	8	40493	40500	25 %	0 %	50 %	25 %	17548255
138	NC_003296	GGCT	2	8	41556	41563	0 %	25 %	50 %	25 %	17548257
139	NC_003296	CGGC	2	8	42070	42077	0 %	0 %	50 %	50 %	17548257
140	NC_003296	CGGC	2	8	42091	42098	0 %	0 %	50 %	50 %	17548257
141	NC_003296	CCCG	2	8	42599	42606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_003296	CCTG	2	8	43209	43216	0 %	25 %	25 %	50 %	17548258
143	NC_003296	CGGC	2	8	43780	43787	0 %	0 %	50 %	50 %	17548258
144	NC_003296	CCGG	2	8	44290	44297	0 %	0 %	50 %	50 %	17548259
145	NC_003296	GGCC	2	8	44811	44818	0 %	0 %	50 %	50 %	17548260
146	NC_003296	CATG	2	8	45682	45689	25 %	25 %	25 %	25 %	17548261
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497	NC_003296	CACC	2	8	157711	157718	25 %	0 %	0 %	75 %	17548356
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