MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 plasmid pGMI1000MP

Total Repeats: 1096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003296	GCCC	2	8	128	135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_003296	GCTT	2	8	564	571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_003296	CCCG	2	8	658	665	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_003296	ACGC	2	8	728	735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_003296	AGTC	2	8	949	956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_003296	GTAT	2	8	1009	1016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003296	GACT	2	8	1187	1194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_003296	CAAC	2	8	2697	2704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003296	GCAG	2	8	3002	3009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003296	GAGT	2	8	3047	3054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003296	GGCC	2	8	7778	7785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_003296	CCCA	2	8	7947	7954	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_003296	CGGG	2	8	13536	13543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_003296	GGCA	2	8	13615	13622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003296	CGGC	3	12	14069	14080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_003296	GCCG	2	8	14135	14142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_003296	GACT	2	8	17052	17059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_003296	CGCC	2	8	17163	17170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_003296	ACGC	2	8	26301	26308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_003296	AAAT	2	8	26727	26734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003296	GCCG	2	8	27582	27589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_003296	GCCG	2	8	27600	27607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_003296	CTGG	2	8	27643	27650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003296	TATC	3	12	28690	28701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_003296	CGGC	2	8	28852	28859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_003296	GAGG	2	8	28889	28896	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003296	TGCG	2	8	31374	31381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003296	ACGG	2	8	31763	31770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003296	GACC	2	8	33749	33756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_003296	GGGA	2	8	33791	33798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003296	GTTG	2	8	34134	34141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003296	GCTC	2	8	34383	34390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_003296	GATT	2	8	34684	34691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003296	GCCG	2	8	34725	34732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_003296	GCTC	2	8	36708	36715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_003296	CCCG	2	8	42599	42606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_003296	TCTT	2	8	46707	46714	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003296	TGGG	2	8	48727	48734	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003296	CAGG	2	8	57459	57466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003296	TGGT	2	8	59177	59184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003296	CCCA	2	8	61983	61990	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_003296	CGCC	2	8	75409	75416	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_003296	TCGG	2	8	75694	75701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_003296	TCGG	2	8	77885	77892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_003296	ATTC	2	8	77973	77980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003296	TGTC	2	8	82525	82532	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_003296	TGCA	2	8	83336	83343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_003296	AAAG	2	8	83715	83722	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003296	CGGG	2	8	83832	83839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003296	CGAT	2	8	83891	83898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003296	TGGG	2	8	86427	86434	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003296	AGCG	2	8	86489	86496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_003296	CGAT	2	8	90292	90299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_003296	CGAC	2	8	92013	92020	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_003296	GGCA	2	8	92413	92420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003296	CGGC	2	8	95046	95053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_003296	CCCA	2	8	101047	101054	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_003296	GATC	2	8	101266	101273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_003296	TTGC	2	8	102703	102710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003296	AGGG	2	8	102872	102879	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003296	TAGA	2	8	102953	102960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003296	TCGG	2	8	103168	103175	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_003296	CCGG	2	8	111935	111942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_003296	TGCC	2	8	112100	112107	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_003296	GGCG	2	8	112285	112292	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_003296	GCTT	2	8	114386	114393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_003296	AAAG	2	8	114461	114468	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003296	TTAG	2	8	114647	114654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003296	GCTC	2	8	120571	120578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_003296	CGAG	2	8	120607	120614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003296	GCTC	2	8	121218	121225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_003296	CGTT	2	8	123507	123514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_003296	GGTA	2	8	123542	123549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003296	CGGT	2	8	123551	123558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_003296	CGGG	2	8	124332	124339	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_003296	TGAT	2	8	128582	128589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003296	TCCG	2	8	129657	129664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_003296	CTGC	2	8	131422	131429	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_003296	TCCA	2	8	132344	132351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_003296	GCCG	2	8	132895	132902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_003296	GTCG	2	8	133302	133309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_003296	GCGT	2	8	135217	135224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_003296	AGTG	2	8	135253	135260	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003296	GCCG	2	8	135720	135727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_003296	GCCC	2	8	139648	139655	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_003296	CGTG	2	8	144835	144842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_003296	GACG	2	8	145026	145033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_003296	AGGG	2	8	145163	145170	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003296	TCGA	2	8	145849	145856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003296	ATCA	2	8	147308	147315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_003296	GGTT	2	8	150210	150217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003296	GCCA	2	8	152343	152350	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_003296	GGCG	2	8	154217	154224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_003296	GCGG	2	8	157926	157933	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003296	GCCC	3	12	159899	159910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_003296	GCCC	2	8	159984	159991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_003296	AGGC	2	8	161410	161417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_003296	TTTC	2	8	162346	162353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_003296	CGTG	2	8	171994	172001	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_003296	GCGA	2	8	177899	177906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_003296	CCCA	2	8	177919	177926	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_003296	GGTG	2	8	177930	177937	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003296	TGGC	2	8	177961	177968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003296	GATC	2	8	178911	178918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_003296	ATCA	2	8	181873	181880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_003296	ATGT	2	8	182818	182825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003296	CCAA	2	8	183747	183754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_003296	CGCA	2	8	184038	184045	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_003296	CTGG	2	8	184186	184193	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_003296	GCCG	2	8	184437	184444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_003296	GCCG	2	8	186642	186649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_003296	CAGG	2	8	192512	192519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_003296	GTGC	2	8	192539	192546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_003296	CGGC	2	8	192799	192806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_003296	GCCG	2	8	192818	192825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_003296	GACG	2	8	193292	193299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_003296	CGAT	2	8	193533	193540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_003296	CAGC	2	8	193844	193851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_003296	CCGG	2	8	193933	193940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_003296	GCGG	2	8	194050	194057	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_003296	TCGG	2	8	194118	194125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_003296	CCGT	2	8	194151	194158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_003296	GGCC	2	8	194451	194458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_003296	GCCG	2	8	194612	194619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_003296	GCAG	2	8	195004	195011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_003296	CGGC	2	8	195101	195108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_003296	CGGC	2	8	195561	195568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_003296	GGCG	2	8	195747	195754	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_003296	CGGT	2	8	195759	195766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_003296	GCAG	2	8	196003	196010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_003296	CGGC	2	8	196426	196433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_003296	CCGG	2	8	196454	196461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_003296	CGGG	2	8	197089	197096	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_003296	GCCG	2	8	197590	197597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_003296	GTCG	2	8	197825	197832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_003296	CGGG	2	8	198611	198618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_003296	GGCC	2	8	198913	198920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_003296	CCGT	2	8	199203	199210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_003296	GCCG	2	8	199267	199274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_003296	GGCG	2	8	199468	199475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_003296	CCGT	2	8	199765	199772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_003296	CTGG	2	8	199901	199908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_003296	CGCC	2	8	200392	200399	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_003296	TCGG	2	8	200526	200533	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_003296	CGGC	2	8	200659	200666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_003296	CAGC	2	8	200707	200714	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_003296	GCAT	2	8	201045	201052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_003296	GCCG	2	8	201087	201094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_003296	ATCG	2	8	201452	201459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_003296	CGGG	2	8	202147	202154	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_003296	GGCG	2	8	202301	202308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_003296	CGAT	2	8	202364	202371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_003296	GGCC	2	8	202845	202852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_003296	GCGT	2	8	203058	203065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
155	NC_003296	CGAT	2	8	203117	203124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_003296	CGCC	2	8	203565	203572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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241	NC_003296	CTTT	2	8	303088	303095	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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