MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 plasmid pGMI1000MP

Total Repeats: 352

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003296	G	6	6	1245	1250	0 %	0 %	100 %	0 %	17548222
2	NC_003296	A	7	7	4941	4947	100 %	0 %	0 %	0 %	17548225
3	NC_003296	G	6	6	6502	6507	0 %	0 %	100 %	0 %	17548226
4	NC_003296	G	6	6	27427	27432	0 %	0 %	100 %	0 %	17548244
5	NC_003296	G	6	6	46226	46231	0 %	0 %	100 %	0 %	17548262
6	NC_003296	T	6	6	47390	47395	0 %	100 %	0 %	0 %	17548264
7	NC_003296	A	7	7	47442	47448	100 %	0 %	0 %	0 %	17548264
8	NC_003296	G	6	6	55034	55039	0 %	0 %	100 %	0 %	17548269
9	NC_003296	A	6	6	58834	58839	100 %	0 %	0 %	0 %	17548273
10	NC_003296	G	6	6	73351	73356	0 %	0 %	100 %	0 %	17548284
11	NC_003296	G	6	6	78527	78532	0 %	0 %	100 %	0 %	17548289
12	NC_003296	T	7	7	83227	83233	0 %	100 %	0 %	0 %	17548292
13	NC_003296	G	6	6	84564	84569	0 %	0 %	100 %	0 %	17548295
14	NC_003296	T	6	6	84625	84630	0 %	100 %	0 %	0 %	17548295
15	NC_003296	A	7	7	88298	88304	100 %	0 %	0 %	0 %	17548299
16	NC_003296	C	7	7	92638	92644	0 %	0 %	0 %	100 %	17548306
17	NC_003296	G	6	6	96889	96894	0 %	0 %	100 %	0 %	17548307
18	NC_003296	C	6	6	101897	101902	0 %	0 %	0 %	100 %	17548315
19	NC_003296	G	8	8	106032	106039	0 %	0 %	100 %	0 %	17548319
20	NC_003296	A	7	7	118072	118078	100 %	0 %	0 %	0 %	17548325
21	NC_003296	G	7	7	120487	120493	0 %	0 %	100 %	0 %	17548326
22	NC_003296	G	6	6	128137	128142	0 %	0 %	100 %	0 %	17548332
23	NC_003296	T	6	6	129731	129736	0 %	100 %	0 %	0 %	17548334
24	NC_003296	T	7	7	129766	129772	0 %	100 %	0 %	0 %	17548334
25	NC_003296	C	6	6	141988	141993	0 %	0 %	0 %	100 %	17548344
26	NC_003296	G	6	6	146884	146889	0 %	0 %	100 %	0 %	17548347
27	NC_003296	A	8	8	147137	147144	100 %	0 %	0 %	0 %	17548347
28	NC_003296	T	6	6	148168	148173	0 %	100 %	0 %	0 %	17548348
29	NC_003296	A	6	6	150399	150404	100 %	0 %	0 %	0 %	17548350
30	NC_003296	T	6	6	150423	150428	0 %	100 %	0 %	0 %	17548350
31	NC_003296	A	6	6	150781	150786	100 %	0 %	0 %	0 %	17548351
32	NC_003296	A	6	6	152169	152174	100 %	0 %	0 %	0 %	17548352
33	NC_003296	C	6	6	152563	152568	0 %	0 %	0 %	100 %	17548353
34	NC_003296	C	7	7	152608	152614	0 %	0 %	0 %	100 %	17548353
35	NC_003296	C	7	7	152616	152622	0 %	0 %	0 %	100 %	17548353
36	NC_003296	T	6	6	161248	161253	0 %	100 %	0 %	0 %	17548359
37	NC_003296	G	6	6	163033	163038	0 %	0 %	100 %	0 %	17548362
38	NC_003296	G	7	7	166994	167000	0 %	0 %	100 %	0 %	17548366
39	NC_003296	G	6	6	176973	176978	0 %	0 %	100 %	0 %	17548372
40	NC_003296	G	7	7	177216	177222	0 %	0 %	100 %	0 %	17548372
41	NC_003296	A	6	6	177540	177545	100 %	0 %	0 %	0 %	17548373
42	NC_003296	T	8	8	178614	178621	0 %	100 %	0 %	0 %	17548375
43	NC_003296	G	6	6	181449	181454	0 %	0 %	100 %	0 %	17548377
44	NC_003296	A	8	8	181702	181709	100 %	0 %	0 %	0 %	17548377
45	NC_003296	A	6	6	183023	183028	100 %	0 %	0 %	0 %	17548379
46	NC_003296	G	6	6	183210	183215	0 %	0 %	100 %	0 %	17548379
47	NC_003296	T	6	6	190448	190453	0 %	100 %	0 %	0 %	17548384
48	NC_003296	C	6	6	191600	191605	0 %	0 %	0 %	100 %	17548385
49	NC_003296	C	7	7	217225	217231	0 %	0 %	0 %	100 %	17548396
50	NC_003296	A	6	6	239156	239161	100 %	0 %	0 %	0 %	17548414
51	NC_003296	A	6	6	240921	240926	100 %	0 %	0 %	0 %	17548416
52	NC_003296	T	8	8	243413	243420	0 %	100 %	0 %	0 %	17548419
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54	NC_003296	T	6	6	268734	268739	0 %	100 %	0 %	0 %	17548437
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63	NC_003296	G	6	6	298441	298446	0 %	0 %	100 %	0 %	17548457
64	NC_003296	T	6	6	302590	302595	0 %	100 %	0 %	0 %	17548459
65	NC_003296	G	6	6	312807	312812	0 %	0 %	100 %	0 %	17548463
66	NC_003296	G	8	8	318033	318040	0 %	0 %	100 %	0 %	17548465
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107	NC_003296	A	6	6	625429	625434	100 %	0 %	0 %	0 %	17548724
108	NC_003296	C	6	6	634395	634400	0 %	0 %	0 %	100 %	17548730
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111	NC_003296	G	6	6	676837	676842	0 %	0 %	100 %	0 %	17548761
112	NC_003296	G	6	6	677044	677049	0 %	0 %	100 %	0 %	17548761
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.