MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003277	AATCCG	2	12	1965	1976	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	228960845
2	NC_003277	CTGACA	2	12	4208	4219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	17233473
3	NC_003277	ACATCC	2	12	4520	4531	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	17233473
4	NC_003277	ACCGGC	2	12	5202	5213	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	17233474
5	NC_003277	ACCACG	2	12	5808	5819	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	17233475
6	NC_003277	TCCCCG	2	12	6011	6022	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	17233475
7	NC_003277	CCGCTC	2	12	6137	6148	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	17233475
8	NC_003277	TTGGTA	2	12	9307	9318	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	17233479
9	NC_003277	CACCGT	2	12	10296	10307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17233481
10	NC_003277	TATCCA	2	12	17379	17390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233485
11	NC_003277	TTGTCC	2	12	17642	17653	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	17233412
12	NC_003277	TCTGTT	2	12	18366	18377	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	17233486
13	NC_003277	ACAGTG	2	12	20111	20122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17233413
14	NC_003277	GACAGC	2	12	20123	20134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233413
15	NC_003277	AGCCTG	2	12	22545	22556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17233418
16	NC_003277	CCCTGT	2	12	23086	23097	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	32441710
17	NC_003277	TTTAGA	2	12	27872	27883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	17233490
18	NC_003277	ATTTTG	2	12	28811	28822	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	17233491
19	NC_003277	GGCGGT	2	12	28855	28866	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	17233491
20	NC_003277	CAGCGC	2	12	29799	29810	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	17233491
21	NC_003277	ATTCAT	2	12	30904	30915	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	17233492
22	NC_003277	ATGCTG	2	12	33028	33039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17233422
23	NC_003277	CTTACC	2	12	34488	34499	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	17233494
24	NC_003277	CGCTGG	2	12	40103	40114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17233423
25	NC_003277	TTTTTC	2	12	43389	43400	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	17233500
26	NC_003277	CTGGCG	2	12	50839	50850	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	32441713
27	NC_003277	AGGACG	2	12	51463	51474	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	17233431
28	NC_003277	GGCGCT	2	12	55887	55898	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17233437
29	NC_003277	CAGGTG	2	12	55918	55929	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	17233437
30	NC_003277	TTTTAT	2	12	63393	63404	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	17233445
31	NC_003277	GCTGCC	2	12	64705	64716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	17233447
32	NC_003277	GTGCCG	2	12	65194	65205	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17233447
33	NC_003277	ACAGTT	2	12	80613	80624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17233465
34	NC_003277	ATGAAA	2	12	83215	83226	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	17233467
35	NC_003277	TAACTC	2	12	83613	83624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233467
36	NC_003277	ACAGCC	2	12	86272	86283	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	17233468
37	NC_003277	AGCGGG	2	12	88612	88623	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	17233470
38	NC_003277	ATGTGG	2	12	90034	90045	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	17233470
39	NC_003277	ACGATG	2	12	92557	92568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17233471
40	NC_003277	GTGCTG	2	12	93034	93045	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	17233471

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.