MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003277	TCGTC	2	10	1631	1640	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_003277	ACCAC	2	10	4851	4860	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_003277	ATGTT	2	10	4920	4929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003277	GCTCC	2	10	4964	4973	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_003277	AATTT	2	10	14103	14112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003277	TGCAA	2	10	14906	14915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003277	GGCCC	2	10	15495	15504	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_003277	GCCGT	2	10	16315	16324	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_003277	TGACA	2	10	16375	16384	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003277	GTTGA	2	10	32602	32611	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003277	TAATG	2	10	37483	37492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003277	GTCTG	2	10	38725	38734	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_003277	TATAA	2	10	39632	39641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003277	ACGGG	2	10	48064	48073	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_003277	ACGGG	2	10	49241	49250	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003277	GAACA	2	10	54300	54309	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003277	GAACT	2	10	58634	58643	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_003277	CCCCG	2	10	58673	58682	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19	NC_003277	AAAAT	2	10	59578	59587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003277	TAATT	2	10	60759	60768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003277	ATTTC	2	10	84031	84040	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.