MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003277	G	10	10	914	923	0 %	0 %	100 %	0 %	17233405
2	NC_003277	A	6	6	1456	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	17233406
3	NC_003277	A	6	6	3643	3648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003277	T	6	6	4135	4140	0 %	100 %	0 %	0 %	17233473
5	NC_003277	T	6	6	4192	4197	0 %	100 %	0 %	0 %	17233473
6	NC_003277	A	7	7	4331	4337	100 %	0 %	0 %	0 %	17233473
7	NC_003277	A	7	7	4697	4703	100 %	0 %	0 %	0 %	17233473
8	NC_003277	C	7	7	4775	4781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_003277	A	6	6	4904	4909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003277	T	7	7	5540	5546	0 %	100 %	0 %	0 %	17233474
11	NC_003277	T	6	6	5978	5983	0 %	100 %	0 %	0 %	17233475
12	NC_003277	A	6	6	7266	7271	100 %	0 %	0 %	0 %	17233476
13	NC_003277	A	6	6	7465	7470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003277	T	6	6	8483	8488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003277	C	6	6	9383	9388	0 %	0 %	0 %	100 %	17233479
16	NC_003277	C	6	6	9914	9919	0 %	0 %	0 %	100 %	17233480
17	NC_003277	C	6	6	11010	11015	0 %	0 %	0 %	100 %	17233482
18	NC_003277	T	6	6	12280	12285	0 %	100 %	0 %	0 %	17233482
19	NC_003277	C	6	6	13347	13352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_003277	T	6	6	14110	14115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003277	A	6	6	14890	14895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003277	A	6	6	14945	14950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003277	A	6	6	14952	14957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003277	A	6	6	14981	14986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003277	A	6	6	15005	15010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003277	A	6	6	15130	15135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003277	T	7	7	15362	15368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003277	A	6	6	15387	15392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003277	A	6	6	15531	15536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003277	A	6	6	15740	15745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003277	A	6	6	15946	15951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003277	T	6	6	17627	17632	0 %	100 %	0 %	0 %	17233412
33	NC_003277	T	7	7	18088	18094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003277	A	6	6	19022	19027	100 %	0 %	0 %	0 %	17233487
35	NC_003277	A	6	6	19570	19575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003277	A	6	6	19768	19773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003277	A	6	6	20080	20085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003277	A	6	6	21421	21426	100 %	0 %	0 %	0 %	17233416
39	NC_003277	G	6	6	22701	22706	0 %	0 %	100 %	0 %	17233418
40	NC_003277	G	6	6	22871	22876	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003277	A	6	6	22945	22950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003277	A	6	6	24410	24415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003277	T	6	6	25471	25476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003277	A	6	6	26257	26262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003277	T	7	7	26324	26330	0 %	100 %	0 %	0 %	17233489
46	NC_003277	T	6	6	26393	26398	0 %	100 %	0 %	0 %	17233489
47	NC_003277	T	6	6	26859	26864	0 %	100 %	0 %	0 %	17233489
48	NC_003277	A	6	6	26973	26978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003277	G	6	6	27070	27075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003277	T	9	9	27961	27969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003277	T	6	6	28001	28006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003277	A	6	6	28015	28020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003277	A	7	7	31697	31703	100 %	0 %	0 %	0 %	17233493
54	NC_003277	T	6	6	31802	31807	0 %	100 %	0 %	0 %	17233493
55	NC_003277	T	6	6	31960	31965	0 %	100 %	0 %	0 %	17233493
56	NC_003277	T	6	6	31998	32003	0 %	100 %	0 %	0 %	17233493
57	NC_003277	T	6	6	32297	32302	0 %	100 %	0 %	0 %	17233493
58	NC_003277	T	10	10	32330	32339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003277	A	6	6	32353	32358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003277	A	6	6	32621	32626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003277	C	6	6	34003	34008	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_003277	T	6	6	34761	34766	0 %	100 %	0 %	0 %	17233494
63	NC_003277	A	6	6	37442	37447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003277	T	6	6	37661	37666	0 %	100 %	0 %	0 %	17233497
65	NC_003277	G	6	6	38571	38576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003277	T	6	6	43061	43066	0 %	100 %	0 %	0 %	17233500
67	NC_003277	A	6	6	43446	43451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003277	T	6	6	43507	43512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003277	A	6	6	43795	43800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003277	G	6	6	46621	46626	0 %	0 %	100 %	0 %	17233501
71	NC_003277	T	7	7	47215	47221	0 %	100 %	0 %	0 %	17233501
72	NC_003277	T	6	6	49170	49175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003277	A	6	6	49672	49677	100 %	0 %	0 %	0 %	17233429
74	NC_003277	T	6	6	51766	51771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003277	A	6	6	52314	52319	100 %	0 %	0 %	0 %	17233432
76	NC_003277	A	6	6	52747	52752	100 %	0 %	0 %	0 %	17233433
77	NC_003277	A	6	6	53228	53233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003277	G	6	6	53253	53258	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003277	A	6	6	53592	53597	100 %	0 %	0 %	0 %	17233434
80	NC_003277	T	7	7	53659	53665	0 %	100 %	0 %	0 %	17233434
81	NC_003277	A	6	6	57052	57057	100 %	0 %	0 %	0 %	17233437
82	NC_003277	T	6	6	57498	57503	0 %	100 %	0 %	0 %	17233438
83	NC_003277	T	6	6	57881	57886	0 %	100 %	0 %	0 %	17233439
84	NC_003277	A	6	6	58734	58739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003277	T	6	6	58970	58975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003277	T	6	6	59091	59096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003277	A	6	6	59716	59721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003277	A	6	6	60063	60068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003277	C	6	6	60275	60280	0 %	0 %	0 %	100 %	17233503
90	NC_003277	A	6	6	60855	60860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003277	A	6	6	60997	61002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003277	A	7	7	61506	61512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003277	T	7	7	61974	61980	0 %	100 %	0 %	0 %	17233441
94	NC_003277	T	6	6	62062	62067	0 %	100 %	0 %	0 %	17233441
95	NC_003277	T	9	9	62305	62313	0 %	100 %	0 %	0 %	17233442
96	NC_003277	A	6	6	63205	63210	100 %	0 %	0 %	0 %	17233444
97	NC_003277	T	6	6	63726	63731	0 %	100 %	0 %	0 %	17233445
98	NC_003277	A	6	6	63904	63909	100 %	0 %	0 %	0 %	17233445
99	NC_003277	G	6	6	65444	65449	0 %	0 %	100 %	0 %	17233447
100	NC_003277	A	6	6	66614	66619	100 %	0 %	0 %	0 %	17233448
101	NC_003277	T	6	6	67334	67339	0 %	100 %	0 %	0 %	17233450
102	NC_003277	A	6	6	67749	67754	100 %	0 %	0 %	0 %	17233452
103	NC_003277	A	8	8	69099	69106	100 %	0 %	0 %	0 %	17233453
104	NC_003277	A	6	6	70350	70355	100 %	0 %	0 %	0 %	17233453
105	NC_003277	T	6	6	71390	71395	0 %	100 %	0 %	0 %	17233454
106	NC_003277	A	6	6	71411	71416	100 %	0 %	0 %	0 %	17233454
107	NC_003277	G	6	6	73291	73296	0 %	0 %	100 %	0 %	17233457
108	NC_003277	G	6	6	76677	76682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003277	A	6	6	76990	76995	100 %	0 %	0 %	0 %	17233461
110	NC_003277	T	6	6	77570	77575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003277	T	7	7	77766	77772	0 %	100 %	0 %	0 %	17233462
112	NC_003277	A	6	6	78677	78682	100 %	0 %	0 %	0 %	17233464
113	NC_003277	T	6	6	78825	78830	0 %	100 %	0 %	0 %	17233464
114	NC_003277	G	6	6	78951	78956	0 %	0 %	100 %	0 %	17233464
115	NC_003277	T	6	6	80415	80420	0 %	100 %	0 %	0 %	17233465
116	NC_003277	G	6	6	80439	80444	0 %	0 %	100 %	0 %	17233465
117	NC_003277	A	6	6	82417	82422	100 %	0 %	0 %	0 %	17233465
118	NC_003277	A	8	8	82841	82848	100 %	0 %	0 %	0 %	17233466
119	NC_003277	A	7	7	83224	83230	100 %	0 %	0 %	0 %	17233467
120	NC_003277	A	6	6	84243	84248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003277	T	6	6	84701	84706	0 %	100 %	0 %	0 %	17233468
122	NC_003277	A	6	6	84812	84817	100 %	0 %	0 %	0 %	17233468
123	NC_003277	A	6	6	85314	85319	100 %	0 %	0 %	0 %	17233468
124	NC_003277	A	6	6	86300	86305	100 %	0 %	0 %	0 %	17233468
125	NC_003277	C	6	6	86396	86401	0 %	0 %	0 %	100 %	17233468
126	NC_003277	T	6	6	86826	86831	0 %	100 %	0 %	0 %	17233469
127	NC_003277	T	6	6	86924	86929	0 %	100 %	0 %	0 %	17233469
128	NC_003277	C	6	6	91228	91233	0 %	0 %	0 %	100 %	17233470
129	NC_003277	T	6	6	93243	93248	0 %	100 %	0 %	0 %	17233471
130	NC_003277	A	8	8	93518	93525	100 %	0 %	0 %	0 %	17233472

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.