MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003277	G	10	10	914	923	0 %	0 %	100 %	0 %	17233405
2	NC_003277	A	6	6	1456	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	17233406
3	NC_003277	T	6	6	4135	4140	0 %	100 %	0 %	0 %	17233473
4	NC_003277	T	6	6	4192	4197	0 %	100 %	0 %	0 %	17233473
5	NC_003277	A	7	7	4331	4337	100 %	0 %	0 %	0 %	17233473
6	NC_003277	A	7	7	4697	4703	100 %	0 %	0 %	0 %	17233473
7	NC_003277	T	7	7	5540	5546	0 %	100 %	0 %	0 %	17233474
8	NC_003277	T	6	6	5978	5983	0 %	100 %	0 %	0 %	17233475
9	NC_003277	A	6	6	7266	7271	100 %	0 %	0 %	0 %	17233476
10	NC_003277	C	6	6	9383	9388	0 %	0 %	0 %	100 %	17233479
11	NC_003277	C	6	6	9914	9919	0 %	0 %	0 %	100 %	17233480
12	NC_003277	C	6	6	11010	11015	0 %	0 %	0 %	100 %	17233482
13	NC_003277	T	6	6	12280	12285	0 %	100 %	0 %	0 %	17233482
14	NC_003277	T	6	6	17627	17632	0 %	100 %	0 %	0 %	17233412
15	NC_003277	A	6	6	19022	19027	100 %	0 %	0 %	0 %	17233487
16	NC_003277	A	6	6	21421	21426	100 %	0 %	0 %	0 %	17233416
17	NC_003277	G	6	6	22701	22706	0 %	0 %	100 %	0 %	17233418
18	NC_003277	T	7	7	26324	26330	0 %	100 %	0 %	0 %	17233489
19	NC_003277	T	6	6	26393	26398	0 %	100 %	0 %	0 %	17233489
20	NC_003277	T	6	6	26859	26864	0 %	100 %	0 %	0 %	17233489
21	NC_003277	A	7	7	31697	31703	100 %	0 %	0 %	0 %	17233493
22	NC_003277	T	6	6	31802	31807	0 %	100 %	0 %	0 %	17233493
23	NC_003277	T	6	6	31960	31965	0 %	100 %	0 %	0 %	17233493
24	NC_003277	T	6	6	31998	32003	0 %	100 %	0 %	0 %	17233493
25	NC_003277	T	6	6	32297	32302	0 %	100 %	0 %	0 %	17233493
26	NC_003277	T	6	6	34761	34766	0 %	100 %	0 %	0 %	17233494
27	NC_003277	T	6	6	37661	37666	0 %	100 %	0 %	0 %	17233497
28	NC_003277	T	6	6	43061	43066	0 %	100 %	0 %	0 %	17233500
29	NC_003277	G	6	6	46621	46626	0 %	0 %	100 %	0 %	17233501
30	NC_003277	T	7	7	47215	47221	0 %	100 %	0 %	0 %	17233501
31	NC_003277	A	6	6	49672	49677	100 %	0 %	0 %	0 %	17233429
32	NC_003277	A	6	6	52314	52319	100 %	0 %	0 %	0 %	17233432
33	NC_003277	A	6	6	52747	52752	100 %	0 %	0 %	0 %	17233433
34	NC_003277	A	6	6	53592	53597	100 %	0 %	0 %	0 %	17233434
35	NC_003277	T	7	7	53659	53665	0 %	100 %	0 %	0 %	17233434
36	NC_003277	A	6	6	57052	57057	100 %	0 %	0 %	0 %	17233437
37	NC_003277	T	6	6	57498	57503	0 %	100 %	0 %	0 %	17233438
38	NC_003277	T	6	6	57881	57886	0 %	100 %	0 %	0 %	17233439
39	NC_003277	C	6	6	60275	60280	0 %	0 %	0 %	100 %	17233503
40	NC_003277	T	7	7	61974	61980	0 %	100 %	0 %	0 %	17233441
41	NC_003277	T	6	6	62062	62067	0 %	100 %	0 %	0 %	17233441
42	NC_003277	T	9	9	62305	62313	0 %	100 %	0 %	0 %	17233442
43	NC_003277	A	6	6	63205	63210	100 %	0 %	0 %	0 %	17233444
44	NC_003277	T	6	6	63726	63731	0 %	100 %	0 %	0 %	17233445
45	NC_003277	A	6	6	63904	63909	100 %	0 %	0 %	0 %	17233445
46	NC_003277	G	6	6	65444	65449	0 %	0 %	100 %	0 %	17233447
47	NC_003277	A	6	6	66614	66619	100 %	0 %	0 %	0 %	17233448
48	NC_003277	T	6	6	67334	67339	0 %	100 %	0 %	0 %	17233450
49	NC_003277	A	6	6	67749	67754	100 %	0 %	0 %	0 %	17233452
50	NC_003277	A	8	8	69099	69106	100 %	0 %	0 %	0 %	17233453
51	NC_003277	A	6	6	70350	70355	100 %	0 %	0 %	0 %	17233453
52	NC_003277	T	6	6	71390	71395	0 %	100 %	0 %	0 %	17233454
53	NC_003277	A	6	6	71411	71416	100 %	0 %	0 %	0 %	17233454
54	NC_003277	G	6	6	73291	73296	0 %	0 %	100 %	0 %	17233457
55	NC_003277	A	6	6	76990	76995	100 %	0 %	0 %	0 %	17233461
56	NC_003277	T	7	7	77766	77772	0 %	100 %	0 %	0 %	17233462
57	NC_003277	A	6	6	78677	78682	100 %	0 %	0 %	0 %	17233464
58	NC_003277	T	6	6	78825	78830	0 %	100 %	0 %	0 %	17233464
59	NC_003277	G	6	6	78951	78956	0 %	0 %	100 %	0 %	17233464
60	NC_003277	T	6	6	80415	80420	0 %	100 %	0 %	0 %	17233465
61	NC_003277	G	6	6	80439	80444	0 %	0 %	100 %	0 %	17233465
62	NC_003277	A	6	6	82417	82422	100 %	0 %	0 %	0 %	17233465
63	NC_003277	A	8	8	82841	82848	100 %	0 %	0 %	0 %	17233466
64	NC_003277	A	7	7	83224	83230	100 %	0 %	0 %	0 %	17233467
65	NC_003277	T	6	6	84701	84706	0 %	100 %	0 %	0 %	17233468
66	NC_003277	A	6	6	84812	84817	100 %	0 %	0 %	0 %	17233468
67	NC_003277	A	6	6	85314	85319	100 %	0 %	0 %	0 %	17233468
68	NC_003277	A	6	6	86300	86305	100 %	0 %	0 %	0 %	17233468
69	NC_003277	C	6	6	86396	86401	0 %	0 %	0 %	100 %	17233468
70	NC_003277	T	6	6	86826	86831	0 %	100 %	0 %	0 %	17233469
71	NC_003277	T	6	6	86924	86929	0 %	100 %	0 %	0 %	17233469
72	NC_003277	C	6	6	91228	91233	0 %	0 %	0 %	100 %	17233470
73	NC_003277	T	6	6	93243	93248	0 %	100 %	0 %	0 %	17233471
74	NC_003277	A	8	8	93518	93525	100 %	0 %	0 %	0 %	17233472

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.