MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003276	TACCAC	2	12	791	802	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_003276	GGTAAT	2	12	2598	2609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233021
3	NC_003276	ATCTGT	2	12	3898	3909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17233023
4	NC_003276	AATTTT	2	12	11882	11893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233030
5	NC_003276	TGATAG	2	12	17057	17068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233038
6	NC_003276	AGCTTG	2	12	17604	17615	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_003276	ACTTAG	2	12	18928	18939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17233040
8	NC_003276	AGATAA	2	12	22754	22765	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	17233042
9	NC_003276	AATATC	2	12	22912	22923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	17233042
10	NC_003276	ATTTAT	2	12	24455	24466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233042
11	NC_003276	CTGTTA	2	12	26796	26807	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17233045
12	NC_003276	TACTGC	2	12	34091	34102	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_003276	GCAAAA	2	12	40608	40619	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_003276	CTAAGA	2	12	41890	41901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	17233065
15	NC_003276	TAATTT	2	12	44434	44445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233070
16	NC_003276	GAAAAA	2	12	46318	46329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	17233073
17	NC_003276	AATGGA	2	12	48651	48662	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	17233078
18	NC_003276	CGGCAT	2	12	53288	53299	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17233083
19	NC_003276	GATATT	2	12	54562	54573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	17233085
20	NC_003276	CCTGAT	2	12	56925	56936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	17233087
21	NC_003276	GAGGTA	2	12	63023	63034	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003276	AAGGAA	2	12	63279	63290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233089
23	NC_003276	TTAGAT	2	12	66946	66957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	17233094
24	NC_003276	TTAGAT	2	12	70014	70025	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	17233098
25	NC_003276	AAGCTA	2	12	70954	70965	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	17233099
26	NC_003276	TAGATG	2	12	71314	71325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233099
27	NC_003276	CTGAAT	2	12	71665	71676	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17233099
28	NC_003276	GTGGGC	2	12	74513	74524	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_003276	ACAATA	2	12	74922	74933	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	17233103
30	NC_003276	CGCCAG	2	12	75577	75588	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	17233104
31	NC_003276	CCAGAG	2	12	77685	77696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233105
32	NC_003276	AAGTCT	2	12	82369	82380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_003276	ACCAAA	2	12	84830	84841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_003276	TCAGCT	2	12	86371	86382	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	17233114
35	NC_003276	ACCTTC	2	12	86720	86731	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	17233114
36	NC_003276	TGGGAA	2	12	88073	88084	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	17233116
37	NC_003276	TGGTTC	2	12	88796	88807	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	17233117
38	NC_003276	GGTAAT	2	12	91815	91826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233122
39	NC_003276	AGCTAG	2	12	92625	92636	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_003276	ACCAAA	2	12	92931	92942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233123
41	NC_003276	ATTAGC	2	12	95253	95264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17233126
42	NC_003276	GGTAAT	2	12	96726	96737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233128
43	NC_003276	TGGGAA	2	12	104586	104597	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003276	TATTCT	2	12	108592	108603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	17233140
45	NC_003276	AAGTTC	2	12	109089	109100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17233140
46	NC_003276	TGCGTT	2	12	115295	115306	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	17233144
47	NC_003276	ACTGGT	2	12	118965	118976	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17233144
48	NC_003276	CTGCAC	2	12	121685	121696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17233144
49	NC_003276	CCAGCC	2	12	122335	122346	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	17233144
50	NC_003276	AAGCAG	2	12	122759	122770	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	17233144
51	NC_003276	CTCAAC	2	12	124371	124382	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	17233144
52	NC_003276	CATGGT	2	12	127603	127614	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17233145
53	NC_003276	TTCCTT	2	12	130419	130430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233146
54	NC_003276	ATCCAG	2	12	132683	132694	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	17233146
55	NC_003276	TTCAGA	2	12	133410	133421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17233146
56	NC_003276	TTATAT	2	12	138103	138114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233149
57	NC_003276	TAACTC	2	12	140199	140210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233150
58	NC_003276	TAGGTT	2	12	143552	143563	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	17233153
59	NC_003276	CCAAGC	2	12	144387	144398	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	17233154
60	NC_003276	AAAGCT	2	12	154793	154804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	17233169
61	NC_003276	AAGGTG	2	12	156773	156784	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	17233173
62	NC_003276	CAAGAG	2	12	159428	159439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	17233174
63	NC_003276	TTGCTT	3	18	159965	159982	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	17233174
64	NC_003276	GCGTAG	2	12	163799	163810	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_003276	GATTTG	2	12	164012	164023	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003276	GAGAAA	2	12	167351	167362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233184
67	NC_003276	ATACTG	2	12	172456	172467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17233188
68	NC_003276	ACTTCT	2	12	173576	173587	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	17233188
69	NC_003276	TTGAGG	2	12	175355	175366	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	17233190
70	NC_003276	TATCTG	2	12	176132	176143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17233191
71	NC_003276	GGTAAT	2	12	177826	177837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233194
72	NC_003276	TGTTAT	2	12	183482	183493	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	17233201
73	NC_003276	ACTCAG	2	12	188341	188352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_003276	CTCATT	2	12	189810	189821	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	17233205
75	NC_003276	AAAACT	2	12	191788	191799	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	17233206
76	NC_003276	CCATCA	2	12	199957	199968	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	17233210
77	NC_003276	CAACAT	2	12	204596	204607	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	17233213
78	NC_003276	GTTGAC	2	12	204629	204640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17233213
79	NC_003276	TAGTCA	2	12	216560	216571	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17233222
80	NC_003276	CAATAT	2	12	225742	225753	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	17233230
81	NC_003276	CTTTGA	2	12	227650	227661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17233231
82	NC_003276	AGAATT	2	12	229714	229725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	17233231
83	NC_003276	AACCCC	2	12	229871	229882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233232
84	NC_003276	CATGAG	2	12	230908	230919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17233234
85	NC_003276	TCAGCA	2	12	233690	233701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	17233237
86	NC_003276	TTGAGC	2	12	237362	237373	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17233242
87	NC_003276	CCTCAG	2	12	237775	237786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17233243
88	NC_003276	AGTTAC	2	12	245188	245199	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17233245
89	NC_003276	CTAAAG	2	12	248411	248422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	17233248
90	NC_003276	TAACTA	2	12	252172	252183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	17233250
91	NC_003276	AGAAAA	2	12	255726	255737	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003276	TCAAAG	2	12	262337	262348	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	17233258
93	NC_003276	TACACC	2	12	262493	262504	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	17233258
94	NC_003276	GTAAAT	2	12	263583	263594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	17233259
95	NC_003276	GTTAAT	2	12	264057	264068	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	17233259
96	NC_003276	ATCTAT	2	12	278617	278628	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	17233278
97	NC_003276	GGTAAT	2	12	283731	283742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233284
98	NC_003276	AACCAG	2	12	285779	285790	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	17233287
99	NC_003276	AAAGCT	2	12	286160	286171	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	17233288
100	NC_003276	TTGTGG	2	12	286350	286361	0 %	50 %	50 %	0 %	17233288
101	NC_003276	TCAGTT	2	12	287795	287806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17233290
102	NC_003276	TGCGGT	2	12	293488	293499	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	17233296
103	NC_003276	TCGCTT	2	12	296044	296055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	17233302
104	NC_003276	GGCTTG	2	12	299037	299048	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	17233307
105	NC_003276	GCTGTT	2	12	304093	304104	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_003276	CCCAAC	2	12	304504	304515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_003276	CCCAAC	2	12	305161	305172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_003276	TCACAG	2	12	308964	308975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	17233314
109	NC_003276	AAAATA	2	12	309546	309557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	17233314
110	NC_003276	GAGCAG	2	12	310575	310586	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	17233315
111	NC_003276	GGTAAT	2	12	314066	314077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233319
112	NC_003276	TACAGC	2	12	316158	316169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_003276	TTAACA	2	12	318080	318091	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	17233320
114	NC_003276	GAATAA	2	12	318906	318917	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	17233320
115	NC_003276	CACTGA	2	12	320655	320666	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	17233320
116	NC_003276	GTATTG	2	12	322463	322474	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	17233320
117	NC_003276	TGATGG	2	12	323703	323714	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	17233320
118	NC_003276	GTGCAG	2	12	325331	325342	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	17233320
119	NC_003276	TACAAG	2	12	325994	326005	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	17233320
120	NC_003276	TCACAG	2	12	328859	328870	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	17233320
121	NC_003276	TCTCAC	2	12	330291	330302	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	17233320
122	NC_003276	TCTCAC	2	12	330723	330734	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	17233320
123	NC_003276	TGGAGA	2	12	331167	331178	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	17233320
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125	NC_003276	ATCCCC	2	12	334516	334527	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	17233323
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128	NC_003276	CAGTTG	2	12	338407	338418	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17233326
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132	NC_003276	TCTGTT	2	12	346706	346717	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	62946412
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.