MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003276	CTCTT	2	10	5697	5706	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_003276	TTTTG	2	10	9944	9953	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003276	TGAAA	2	10	26666	26675	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003276	ATTTT	2	10	57526	57535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003276	CAAAA	2	10	57586	57595	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_003276	GTACC	2	10	57864	57873	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_003276	GTTTT	2	10	62519	62528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003276	AAAGC	2	10	80059	80068	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_003276	GTAAC	2	10	80299	80308	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003276	CAACA	2	10	81393	81402	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_003276	CAATG	2	10	81550	81559	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_003276	AAGTT	2	10	87128	87137	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003276	GAGTC	2	10	88149	88158	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_003276	TGCAC	2	10	90659	90668	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_003276	CAGTA	2	10	94336	94345	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003276	GTAAA	2	10	135539	135548	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003276	TTTTG	2	10	141626	141635	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003276	GGTAT	2	10	152827	152836	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003276	GGGTT	2	10	155682	155691	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003276	GCGGG	3	15	162686	162700	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_003276	AAGAT	2	10	164069	164078	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003276	AAATA	2	10	180492	180501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003276	TGGGT	2	10	180767	180776	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003276	TTAAA	2	10	186922	186931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003276	AAGGA	2	10	188426	188435	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003276	TTGAT	2	10	201513	201522	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003276	TCGCT	2	10	213956	213965	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_003276	TTTTA	2	10	231634	231643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003276	ATCCA	2	10	231660	231669	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_003276	ACTAA	2	10	233831	233840	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_003276	GGTTG	2	10	241600	241609	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003276	TTTTA	2	10	245457	245466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003276	ATCAA	2	10	258664	258673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_003276	GAACG	2	10	258680	258689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003276	ATGAA	2	10	262694	262703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003276	TTATG	2	10	265803	265812	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003276	TATGA	2	10	265973	265982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003276	GTATA	2	10	268134	268143	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003276	TAATG	2	10	277440	277449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003276	GGGGT	2	10	303074	303083	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003276	TCTTG	2	10	303337	303346	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_003276	AGATC	2	10	303898	303907	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_003276	TCTTG	2	10	303981	303990	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_003276	AGATC	2	10	304530	304539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_003276	TCTTG	2	10	304613	304622	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_003276	TCTTG	2	10	305930	305939	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_003276	TCTTG	2	10	306143	306152	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_003276	TGTGG	2	10	308489	308498	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003276	ATTCA	2	10	331667	331676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_003276	AATTT	2	10	350806	350815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003276	TTAAT	2	10	355565	355574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003276	TATTC	2	10	356633	356642	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_003276	GCTTT	2	10	357250	357259	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_003276	GCAAT	2	10	357315	357324	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_003276	TCAAC	2	10	366441	366450	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_003276	TTGCA	2	10	372109	372118	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003276	CCAAA	2	10	375473	375482	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_003276	TACTC	2	10	375593	375602	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_003276	TAATT	2	10	375636	375645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003276	AAGAT	2	10	376902	376911	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003276	AAACC	2	10	385686	385695	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_003276	GCAAT	2	10	390460	390469	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.