MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003276	AAAAG	2	10	1252	1261	80 %	0 %	20 %	0 %	17233019
2	NC_003276	CCAAA	2	10	3060	3069	60 %	0 %	0 %	40 %	17233021
3	NC_003276	ATTCA	2	10	6806	6815	40 %	40 %	0 %	20 %	17233026
4	NC_003276	ACCAA	2	10	8854	8863	60 %	0 %	0 %	40 %	17233028
5	NC_003276	AAGTG	2	10	12772	12781	40 %	20 %	40 %	0 %	17233031
6	NC_003276	TAAGT	2	10	14844	14853	40 %	40 %	20 %	0 %	17233035
7	NC_003276	AATGT	2	10	17089	17098	40 %	40 %	20 %	0 %	17233038
8	NC_003276	ATTGT	2	10	17432	17441	20 %	60 %	20 %	0 %	17233038
9	NC_003276	GACCT	2	10	19963	19972	20 %	20 %	20 %	40 %	17233040
10	NC_003276	TCTGC	2	10	21554	21563	0 %	40 %	20 %	40 %	17233042
11	NC_003276	AAACC	2	10	21961	21970	60 %	0 %	0 %	40 %	17233042
12	NC_003276	ATTTA	2	10	22374	22383	40 %	60 %	0 %	0 %	17233042
13	NC_003276	CACTC	2	10	23202	23211	20 %	20 %	0 %	60 %	17233042
14	NC_003276	CATCC	2	10	24425	24434	20 %	20 %	0 %	60 %	17233042
15	NC_003276	AACAT	2	10	24483	24492	60 %	20 %	0 %	20 %	17233042
16	NC_003276	AGCGT	2	10	26343	26352	20 %	20 %	40 %	20 %	17233044
17	NC_003276	ACTTA	2	10	27355	27364	40 %	40 %	0 %	20 %	17233045
18	NC_003276	CCGCG	2	10	28741	28750	0 %	0 %	40 %	60 %	17233046
19	NC_003276	TCATT	2	10	28789	28798	20 %	60 %	0 %	20 %	17233046
20	NC_003276	AAGCC	2	10	29842	29851	40 %	0 %	20 %	40 %	17233046
21	NC_003276	AACCA	2	10	29852	29861	60 %	0 %	0 %	40 %	17233046
22	NC_003276	CCCCA	2	10	32231	32240	20 %	0 %	0 %	80 %	17233048
23	NC_003276	GGATT	2	10	36803	36812	20 %	40 %	40 %	0 %	17233058
24	NC_003276	AAACT	2	10	37644	37653	60 %	20 %	0 %	20 %	17233059
25	NC_003276	TGAAG	2	10	41507	41516	40 %	20 %	40 %	0 %	17233065
26	NC_003276	ACTTC	2	10	43460	43469	20 %	40 %	0 %	40 %	17233068
27	NC_003276	CAATC	2	10	51417	51426	40 %	20 %	0 %	40 %	17233081
28	NC_003276	GGAGC	2	10	53906	53915	20 %	0 %	60 %	20 %	17233084
29	NC_003276	TTTTA	2	10	55128	55137	20 %	80 %	0 %	0 %	17233086
30	NC_003276	TCATC	2	10	55232	55241	20 %	40 %	0 %	40 %	17233087
31	NC_003276	TTGAT	2	10	55928	55937	20 %	60 %	20 %	0 %	17233087
32	NC_003276	GGTTT	2	10	57215	57224	0 %	60 %	40 %	0 %	17233087
33	NC_003276	TTAGA	2	10	60125	60134	40 %	40 %	20 %	0 %	17233088
34	NC_003276	AATTG	2	10	61273	61282	40 %	40 %	20 %	0 %	17233088
35	NC_003276	TCAAG	2	10	63425	63434	40 %	20 %	20 %	20 %	17233089
36	NC_003276	AACAA	2	10	64374	64383	80 %	0 %	0 %	20 %	17233090
37	NC_003276	CTAAA	2	10	64392	64401	60 %	20 %	0 %	20 %	17233090
38	NC_003276	GCCTT	2	10	69344	69353	0 %	40 %	20 %	40 %	17233097
39	NC_003276	TTGAG	2	10	75876	75885	20 %	40 %	40 %	0 %	17233105
40	NC_003276	CACGG	2	10	75953	75962	20 %	0 %	40 %	40 %	17233105
41	NC_003276	GTTGT	2	10	82652	82661	0 %	60 %	40 %	0 %	17233110
42	NC_003276	TCTGC	2	10	87149	87158	0 %	40 %	20 %	40 %	17233115
43	NC_003276	CCAAA	2	10	92277	92286	60 %	0 %	0 %	40 %	17233122
44	NC_003276	TATTT	2	10	94749	94758	20 %	80 %	0 %	0 %	17233125
45	NC_003276	CCAAA	2	10	97188	97197	60 %	0 %	0 %	40 %	17233128
46	NC_003276	TGTTT	2	10	99287	99296	0 %	80 %	20 %	0 %	17233131
47	NC_003276	TCTGC	2	10	100281	100290	0 %	40 %	20 %	40 %	17233133
48	NC_003276	AAACC	2	10	102890	102899	60 %	0 %	0 %	40 %	17233137
49	NC_003276	ACTAG	2	10	104751	104760	40 %	20 %	20 %	20 %	17233138
50	NC_003276	CATCG	2	10	105227	105236	20 %	20 %	20 %	40 %	17233138
51	NC_003276	CTAAC	2	10	108840	108849	40 %	20 %	0 %	40 %	17233140
52	NC_003276	TATTT	2	10	112175	112184	20 %	80 %	0 %	0 %	17233142
53	NC_003276	TTTAT	2	10	112637	112646	20 %	80 %	0 %	0 %	17233142
54	NC_003276	TAGTT	2	10	114184	114193	20 %	60 %	20 %	0 %	17233143
55	NC_003276	AAGAG	2	10	115584	115593	60 %	0 %	40 %	0 %	17233144
56	NC_003276	GTTTG	2	10	117103	117112	0 %	60 %	40 %	0 %	17233144
57	NC_003276	AAAAT	2	10	123495	123504	80 %	20 %	0 %	0 %	17233144
58	NC_003276	TTTGT	2	10	123508	123517	0 %	80 %	20 %	0 %	17233144
59	NC_003276	GGGCA	2	10	124859	124868	20 %	0 %	60 %	20 %	17233145
60	NC_003276	AAAGT	2	10	126260	126269	60 %	20 %	20 %	0 %	17233145
61	NC_003276	GCTAC	2	10	128098	128107	20 %	20 %	20 %	40 %	17233145
62	NC_003276	GCACT	2	10	128928	128937	20 %	20 %	20 %	40 %	17233146
63	NC_003276	TTTTC	2	10	130399	130408	0 %	80 %	0 %	20 %	17233146
64	NC_003276	TTGTA	2	10	131560	131569	20 %	60 %	20 %	0 %	17233146
65	NC_003276	TCCTT	2	10	132063	132072	0 %	60 %	0 %	40 %	17233146
66	NC_003276	ATTTT	2	10	132124	132133	20 %	80 %	0 %	0 %	17233146
67	NC_003276	AATTA	2	10	132180	132189	60 %	40 %	0 %	0 %	17233146
68	NC_003276	CTTTT	2	10	133104	133113	0 %	80 %	0 %	20 %	17233146
69	NC_003276	CATTG	2	10	134051	134060	20 %	40 %	20 %	20 %	17233146
70	NC_003276	AGGTG	2	10	134071	134080	20 %	20 %	60 %	0 %	17233146
71	NC_003276	ATCAT	2	10	137319	137328	40 %	40 %	0 %	20 %	17233149
72	NC_003276	CTGCA	2	10	138046	138055	20 %	20 %	20 %	40 %	17233149
73	NC_003276	GAAGT	2	10	140302	140311	40 %	20 %	40 %	0 %	17233150
74	NC_003276	GTTTG	2	10	143565	143574	0 %	60 %	40 %	0 %	17233153
75	NC_003276	GGACG	2	10	144600	144609	20 %	0 %	60 %	20 %	17233154
76	NC_003276	TTATT	2	10	145424	145433	20 %	80 %	0 %	0 %	17233155
77	NC_003276	TCTCA	2	10	147546	147555	20 %	40 %	0 %	40 %	17233159
78	NC_003276	CAAAG	2	10	147954	147963	60 %	0 %	20 %	20 %	17233160
79	NC_003276	GATTT	2	10	151184	151193	20 %	60 %	20 %	0 %	17233164
80	NC_003276	ACCAA	2	10	152771	152780	60 %	0 %	0 %	40 %	17233166
81	NC_003276	TACGC	2	10	155504	155513	20 %	20 %	20 %	40 %	17233170
82	NC_003276	AAGAA	2	10	157994	158003	80 %	0 %	20 %	0 %	17233173
83	NC_003276	GCCAT	2	10	160532	160541	20 %	20 %	20 %	40 %	17233175
84	NC_003276	ATCCA	2	10	161413	161422	40 %	20 %	0 %	40 %	17233177
85	NC_003276	AATTA	2	10	163470	163479	60 %	40 %	0 %	0 %	17233178
86	NC_003276	TGAAA	2	10	163617	163626	60 %	20 %	20 %	0 %	17233178
87	NC_003276	TCTGA	2	10	165688	165697	20 %	40 %	20 %	20 %	17233181
88	NC_003276	ACCAA	2	10	166625	166634	60 %	0 %	0 %	40 %	17233183
89	NC_003276	TATAT	2	10	170489	170498	40 %	60 %	0 %	0 %	17233187
90	NC_003276	TTGGT	2	10	173836	173845	0 %	60 %	40 %	0 %	17233188
91	NC_003276	CCAAA	2	10	178288	178297	60 %	0 %	0 %	40 %	17233194
92	NC_003276	TGATT	2	10	179267	179276	20 %	60 %	20 %	0 %	17233195
93	NC_003276	CAATC	2	10	184410	184419	40 %	20 %	0 %	40 %	17233202
94	NC_003276	TTAAT	2	10	186018	186027	40 %	60 %	0 %	0 %	17233203
95	NC_003276	TTGCT	2	10	186085	186094	0 %	60 %	20 %	20 %	17233203
96	NC_003276	ATCTT	2	10	188869	188878	20 %	60 %	0 %	20 %	17233205
97	NC_003276	TGGTT	2	10	191001	191010	0 %	60 %	40 %	0 %	17233206
98	NC_003276	TTCTG	2	10	196747	196756	0 %	60 %	20 %	20 %	17233207
99	NC_003276	ATCTA	2	10	197961	197970	40 %	40 %	0 %	20 %	17233207
100	NC_003276	TGAAT	2	10	198220	198229	40 %	40 %	20 %	0 %	17233207
101	NC_003276	AGTCA	2	10	203321	203330	40 %	20 %	20 %	20 %	17233212
102	NC_003276	TGGCA	2	10	204887	204896	20 %	20 %	40 %	20 %	17233213
103	NC_003276	CCAAC	2	10	205259	205268	40 %	0 %	0 %	60 %	17233214
104	NC_003276	AACCA	2	10	207815	207824	60 %	0 %	0 %	40 %	17233215
105	NC_003276	TACCC	2	10	207940	207949	20 %	20 %	0 %	60 %	17233215
106	NC_003276	TTACC	2	10	207985	207994	20 %	40 %	0 %	40 %	17233215
107	NC_003276	AACAT	2	10	208778	208787	60 %	20 %	0 %	20 %	17233216
108	NC_003276	TTGCC	2	10	213282	213291	0 %	40 %	20 %	40 %	17233220
109	NC_003276	TGTTT	2	10	213361	213370	0 %	80 %	20 %	0 %	17233220
110	NC_003276	TTAGT	2	10	213564	213573	20 %	60 %	20 %	0 %	17233220
111	NC_003276	AAATT	2	10	214711	214720	60 %	40 %	0 %	0 %	17233222
112	NC_003276	CAAAC	2	10	215551	215560	60 %	0 %	0 %	40 %	17233222
113	NC_003276	AAATT	2	10	216433	216442	60 %	40 %	0 %	0 %	17233222
114	NC_003276	GACAG	2	10	217912	217921	40 %	0 %	40 %	20 %	17233223
115	NC_003276	CTTGA	2	10	218530	218539	20 %	40 %	20 %	20 %	17233224
116	NC_003276	AAAGC	2	10	218656	218665	60 %	0 %	20 %	20 %	17233224
117	NC_003276	GAATT	2	10	218900	218909	40 %	40 %	20 %	0 %	17233224
118	NC_003276	TGGGT	2	10	222915	222924	0 %	40 %	60 %	0 %	17233228
119	NC_003276	TGGGG	2	10	223860	223869	0 %	20 %	80 %	0 %	17233229
120	NC_003276	CATGG	2	10	225384	225393	20 %	20 %	40 %	20 %	17233229
121	NC_003276	CTACA	2	10	228996	229005	40 %	20 %	0 %	40 %	17233231
122	NC_003276	AAGTT	2	10	229130	229139	40 %	40 %	20 %	0 %	17233231
123	NC_003276	CAAAG	2	10	230170	230179	60 %	0 %	20 %	20 %	17233232
124	NC_003276	TCATC	2	10	232803	232812	20 %	40 %	0 %	40 %	17233236
125	NC_003276	TAATC	2	10	233080	233089	40 %	40 %	0 %	20 %	17233237
126	NC_003276	AAAAT	2	10	233168	233177	80 %	20 %	0 %	0 %	17233237
127	NC_003276	ACAAA	2	10	236822	236831	80 %	0 %	0 %	20 %	17233241
128	NC_003276	ATTGT	2	10	237161	237170	20 %	60 %	20 %	0 %	17233242
129	NC_003276	GATTT	2	10	238938	238947	20 %	60 %	20 %	0 %	17233243
130	NC_003276	ATTTA	2	10	239837	239846	40 %	60 %	0 %	0 %	17233243
131	NC_003276	TTGTT	2	10	240225	240234	0 %	80 %	20 %	0 %	17233243
132	NC_003276	AACTC	2	10	242302	242311	40 %	20 %	0 %	40 %	17233244
133	NC_003276	AGTCG	2	10	243283	243292	20 %	20 %	40 %	20 %	17233244
134	NC_003276	AACTC	2	10	245940	245949	40 %	20 %	0 %	40 %	17233247
135	NC_003276	AGTCG	2	10	246921	246930	20 %	20 %	40 %	20 %	17233247
136	NC_003276	TAATC	2	10	247665	247674	40 %	40 %	0 %	20 %	17233248
137	NC_003276	ATTTA	2	10	247887	247896	40 %	60 %	0 %	0 %	17233248
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.