MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003276	CCAA	2	8	4191	4198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_003276	AACC	2	8	9333	9340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_003276	TTTA	2	8	9404	9411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003276	CAAT	2	8	9761	9768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_003276	ATAC	2	8	9858	9865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_003276	ACAA	2	8	12215	12222	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003276	CAAA	2	8	15631	15638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_003276	TAAT	2	8	16839	16846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003276	CTTT	2	8	16849	16856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003276	TAAT	2	8	17620	17627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003276	ATAC	2	8	17657	17664	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003276	AAAT	2	8	17723	17730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003276	AAGA	2	8	18395	18402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003276	TCCT	2	8	18670	18677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_003276	CAAT	2	8	18827	18834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_003276	GTAT	2	8	21330	21337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003276	TGGT	2	8	25790	25797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003276	ATTG	2	8	26138	26145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003276	CTTT	2	8	26553	26560	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_003276	AGAT	2	8	26564	26571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003276	ATTG	2	8	26651	26658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003276	TTAG	2	8	33206	33213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003276	TTTA	2	8	33558	33565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003276	CTAA	2	8	35681	35688	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_003276	CAAG	2	8	41391	41398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_003276	AAAG	2	8	45777	45784	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003276	TACT	2	8	45802	45809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003276	CAAT	2	8	47915	47922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003276	TTGT	2	8	53403	53410	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003276	TCTT	2	8	54060	54067	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003276	TTCG	2	8	54108	54115	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_003276	AAAG	2	8	54230	54237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003276	GTAA	2	8	57661	57668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003276	AAAG	2	8	58038	58045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003276	TACA	2	8	61832	61839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_003276	ATGA	2	8	62270	62277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003276	TTAC	2	8	62658	62665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003276	TAAA	2	8	64647	64654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003276	CTTA	2	8	65076	65083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003276	CCCA	2	8	68184	68191	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_003276	TCAC	2	8	69726	69733	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003276	GTAA	2	8	69817	69824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003276	ATGA	2	8	74270	74277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003276	TTGC	2	8	74638	74645	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_003276	CACT	2	8	75046	75053	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_003276	ACAG	2	8	84416	84423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_003276	AGCA	2	8	84605	84612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_003276	TCAT	2	8	87505	87512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_003276	GCTG	2	8	90527	90534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003276	AGCA	2	8	92706	92713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003276	CATT	2	8	93932	93939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_003276	TAAT	2	8	94456	94463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003276	TGGT	2	8	100803	100810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003276	GGAA	2	8	104554	104561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003276	ATGT	2	8	106541	106548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003276	ATCA	2	8	107624	107631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_003276	CTTA	2	8	136108	136115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_003276	CGCA	2	8	143354	143361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_003276	TTGC	2	8	143465	143472	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003276	ATAA	2	8	143899	143906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003276	TAAA	2	8	143922	143929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003276	ACCA	2	8	144091	144098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_003276	CTTA	2	8	144157	144164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003276	TTAA	2	8	145734	145741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003276	GATT	2	8	148230	148237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003276	CAGA	2	8	153462	153469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_003276	TTAG	2	8	153777	153784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003276	TCAT	2	8	153858	153865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_003276	GTCA	2	8	155383	155390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_003276	AGGA	2	8	156507	156514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003276	AAAT	2	8	162907	162914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003276	ATTT	2	8	162968	162975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003276	TGCT	2	8	165164	165171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_003276	TTTA	2	8	165846	165853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003276	TTGA	2	8	167565	167572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003276	CCAA	2	8	169065	169072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_003276	ATTG	2	8	169167	169174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003276	CTTT	2	8	176319	176326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_003276	GAAT	2	8	176902	176909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003276	TAAA	2	8	180043	180050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003276	CCAG	2	8	180414	180421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_003276	AGTT	2	8	180802	180809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003276	AAAT	2	8	181922	181929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003276	GATT	2	8	182549	182556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003276	TCTA	2	8	184257	184264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_003276	ATTG	2	8	188290	188297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003276	AGCA	2	8	188475	188482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_003276	AAAT	2	8	193630	193637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003276	TTTA	2	8	198567	198574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003276	AGTT	2	8	199646	199653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003276	TTGA	2	8	201453	201460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003276	GCCA	2	8	203944	203951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_003276	GTTG	2	8	205240	205247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003276	CTAT	2	8	210852	210859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003276	ATGT	2	8	211461	211468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003276	TAAA	2	8	211482	211489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003276	AGAC	2	8	213820	213827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_003276	GCTT	2	8	219319	219326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_003276	TACA	2	8	231739	231746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_003276	AGTT	2	8	233817	233824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003276	CTAT	2	8	235288	235295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_003276	TAAT	2	8	235614	235621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003276	TCAA	2	8	241372	241379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003276	ATTT	2	8	241691	241698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003276	TTGT	2	8	241951	241958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003276	TGTT	2	8	243418	243425	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003276	CAGA	2	8	243446	243453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_003276	TCTT	2	8	245291	245298	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_003276	CAAA	2	8	248749	248756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_003276	AGCA	2	8	255432	255439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_003276	ATTA	2	8	255498	255505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003276	ATCT	2	8	255526	255533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_003276	ATAG	2	8	255534	255541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003276	GTAT	2	8	255769	255776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003276	GAAA	2	8	256294	256301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003276	TAAG	2	8	256401	256408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003276	CATA	2	8	256418	256425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_003276	ATAA	2	8	256430	256437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003276	GTTC	2	8	258248	258255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_003276	TAAC	2	8	262664	262671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_003276	ATTA	2	8	263199	263206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003276	ATTA	2	8	265788	265795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003276	TAAG	2	8	266112	266119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003276	AGCT	2	8	270926	270933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003276	AAAC	2	8	275371	275378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_003276	TTTA	2	8	275996	276003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003276	TGGA	2	8	276090	276097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003276	ATTT	2	8	277484	277491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003276	AAAC	2	8	277552	277559	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_003276	ACAG	2	8	278477	278484	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_003276	CAAT	2	8	279094	279101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_003276	CTTC	2	8	279145	279152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_003276	TGTT	2	8	279644	279651	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003276	CAAG	2	8	282798	282805	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_003276	TATT	2	8	289667	289674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003276	ATTG	2	8	291996	292003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003276	CTTA	2	8	292881	292888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_003276	AGTT	2	8	293853	293860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003276	TTAA	2	8	294394	294401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003276	ATAG	2	8	299333	299340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003276	TGGT	2	8	299349	299356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003276	AATA	2	8	299376	299383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003276	GATA	2	8	299389	299396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003276	ATCT	2	8	299416	299423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_003276	CAAT	2	8	300473	300480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_003276	TTTA	2	8	303407	303414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003276	TGGT	2	8	304025	304032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003276	GTCT	2	8	304841	304848	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_003276	TTTA	2	8	306000	306007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003276	TGGT	2	8	306187	306194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003276	TTTA	2	8	306213	306220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003276	TCGG	2	8	311213	311220	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_003276	AGAT	2	8	384884	384891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_003276	TTCT	2	8	407978	407985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.