MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 4755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003276	GCG	2	6	235	240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233018
2	NC_003276	ATA	2	6	414	419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233018
3	NC_003276	TGT	2	6	447	452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233018
4	NC_003276	CTT	2	6	467	472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233018
5	NC_003276	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233018
6	NC_003276	AAG	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233019
7	NC_003276	AAC	2	6	1180	1185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233019
8	NC_003276	TAA	2	6	1206	1211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233019
9	NC_003276	CGT	2	6	1417	1422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233019
10	NC_003276	CCT	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233019
11	NC_003276	TCC	2	6	1651	1656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233019
12	NC_003276	GCG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233019
13	NC_003276	AGA	2	6	1738	1743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233020
14	NC_003276	TAG	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233020
15	NC_003276	ACG	2	6	1974	1979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233020
16	NC_003276	TGA	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233020
17	NC_003276	ATT	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233020
18	NC_003276	GGT	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233020
19	NC_003276	TTG	2	6	2136	2141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233020
20	NC_003276	CAG	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233020
21	NC_003276	TTG	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233020
22	NC_003276	GGT	3	9	2320	2328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233020
23	NC_003276	CTT	2	6	2335	2340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233020
24	NC_003276	CAT	2	6	2423	2428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233020
25	NC_003276	AAT	2	6	2456	2461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233020
26	NC_003276	AAT	2	6	2466	2471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233020
27	NC_003276	CTT	2	6	2589	2594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233021
28	NC_003276	AAC	2	6	2680	2685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233021
29	NC_003276	TAA	3	9	2722	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233021
30	NC_003276	CTA	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233021
31	NC_003276	TGA	2	6	2752	2757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233021
32	NC_003276	TAA	2	6	2758	2763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233021
33	NC_003276	ATA	2	6	2811	2816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233021
34	NC_003276	CTT	2	6	3096	3101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233021
35	NC_003276	CTA	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233021
36	NC_003276	ATT	2	6	3208	3213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233021
37	NC_003276	TTG	2	6	3561	3566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233022
38	NC_003276	TTG	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233022
39	NC_003276	GAG	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233022
40	NC_003276	AAG	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233023
41	NC_003276	GAA	2	6	4076	4081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233023
42	NC_003276	TTA	2	6	4365	4370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233024
43	NC_003276	CTG	2	6	4430	4435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233024
44	NC_003276	CGA	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233024
45	NC_003276	GCT	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233024
46	NC_003276	CAA	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233024
47	NC_003276	TAT	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233024
48	NC_003276	TTG	2	6	4624	4629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233024
49	NC_003276	TCT	2	6	4641	4646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233024
50	NC_003276	TAG	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233024
51	NC_003276	CTT	2	6	4918	4923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233024
52	NC_003276	CTT	2	6	4964	4969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233024
53	NC_003276	GAT	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233025
54	NC_003276	TGT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233025
55	NC_003276	ATT	2	6	5385	5390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233025
56	NC_003276	ATC	2	6	5459	5464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233025
57	NC_003276	AAT	2	6	5491	5496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233025
58	NC_003276	ATC	2	6	5508	5513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233025
59	NC_003276	TTG	2	6	5591	5596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233025
60	NC_003276	TGG	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233025
61	NC_003276	ATT	2	6	5844	5849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233026
62	NC_003276	GAA	2	6	5856	5861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233026
63	NC_003276	CTG	2	6	5914	5919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233026
64	NC_003276	ATT	2	6	5966	5971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233026
65	NC_003276	AAC	2	6	6046	6051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233026
66	NC_003276	CTT	2	6	6070	6075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233026
67	NC_003276	TAA	2	6	6121	6126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233026
68	NC_003276	GAG	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233026
69	NC_003276	CAA	2	6	6157	6162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233026
70	NC_003276	TAT	2	6	6176	6181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233026
71	NC_003276	AAT	2	6	6212	6217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233026
72	NC_003276	TAA	2	6	6323	6328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233026
73	NC_003276	TGC	3	9	6464	6472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233026
74	NC_003276	TGT	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233026
75	NC_003276	TTG	2	6	6500	6505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233026
76	NC_003276	TGT	4	12	6543	6554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233026
77	NC_003276	CTT	2	6	6571	6576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233026
78	NC_003276	AAG	2	6	6652	6657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233026
79	NC_003276	AGA	2	6	6764	6769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233026
80	NC_003276	CCG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233026
81	NC_003276	ATT	2	6	6861	6866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233026
82	NC_003276	TTG	2	6	6920	6925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233026
83	NC_003276	ATC	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233026
84	NC_003276	AAT	2	6	6983	6988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233026
85	NC_003276	GCT	2	6	7050	7055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233026
86	NC_003276	TCA	2	6	7212	7217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233026
87	NC_003276	AAT	2	6	7237	7242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233026
88	NC_003276	TCA	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233026
89	NC_003276	AAT	2	6	7496	7501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233027
90	NC_003276	TAC	2	6	7747	7752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233027
91	NC_003276	GAA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233027
92	NC_003276	ATT	2	6	7852	7857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233027
93	NC_003276	ACG	2	6	7930	7935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233027
94	NC_003276	GGA	2	6	8045	8050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233027
95	NC_003276	CCA	2	6	8057	8062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233027
96	NC_003276	CTG	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233027
97	NC_003276	TCA	2	6	8117	8122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233027
98	NC_003276	TAA	2	6	8153	8158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233027
99	NC_003276	TAA	2	6	8274	8279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233027
100	NC_003276	TTC	2	6	8409	8414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233028
101	NC_003276	AAT	2	6	8487	8492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233028
102	NC_003276	CTG	2	6	8631	8636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233028
103	NC_003276	CTT	2	6	8702	8707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233028
104	NC_003276	CTT	2	6	8816	8821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233028
105	NC_003276	TTA	2	6	8827	8832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233028
106	NC_003276	GGA	2	6	8845	8850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233028
107	NC_003276	CAG	2	6	8867	8872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233028
108	NC_003276	TCT	2	6	8912	8917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233028
109	NC_003276	ATC	2	6	8922	8927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233028
110	NC_003276	CGC	2	6	9046	9051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233028
111	NC_003276	TGA	3	9	9106	9114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233028
112	NC_003276	CAC	2	6	9239	9244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233028
113	NC_003276	ATC	2	6	9444	9449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233029
114	NC_003276	TCA	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233029
115	NC_003276	CCA	3	9	9484	9492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233029
116	NC_003276	TCA	2	6	9538	9543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233029
117	NC_003276	CCA	2	6	9613	9618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233029
118	NC_003276	TTC	2	6	9633	9638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233029
119	NC_003276	AAG	2	6	9670	9675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233029
120	NC_003276	TCT	2	6	9709	9714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233029
121	NC_003276	GAA	2	6	10005	10010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233030
122	NC_003276	GCG	2	6	10015	10020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233030
123	NC_003276	ATT	2	6	10221	10226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233030
124	NC_003276	GTA	2	6	10248	10253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233030
125	NC_003276	CAA	2	6	10392	10397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233030
126	NC_003276	TGA	2	6	10538	10543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233030
127	NC_003276	CTA	2	6	10569	10574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233030
128	NC_003276	TAG	3	9	10613	10621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233030
129	NC_003276	CTA	2	6	10724	10729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233030
130	NC_003276	TTA	2	6	10807	10812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233030
131	NC_003276	TAT	2	6	10907	10912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233030
132	NC_003276	AAT	2	6	10925	10930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233030
133	NC_003276	GAA	2	6	11061	11066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233030
134	NC_003276	TAT	2	6	11123	11128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233030
135	NC_003276	AAT	2	6	11130	11135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233030
136	NC_003276	TAC	2	6	11273	11278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233030
137	NC_003276	CAC	2	6	11436	11441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233030
138	NC_003276	CAT	2	6	11604	11609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233030
139	NC_003276	ATA	2	6	11640	11645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233030
140	NC_003276	AAG	2	6	11656	11661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233030
141	NC_003276	TTA	2	6	11767	11772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233030
142	NC_003276	ACC	2	6	11876	11881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233030
143	NC_003276	TAT	3	9	11978	11986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233030
144	NC_003276	TTG	2	6	12317	12322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233031
145	NC_003276	ATG	2	6	12366	12371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233031
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147	NC_003276	ATC	2	6	12464	12469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233031
148	NC_003276	ATG	2	6	12581	12586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233031
149	NC_003276	TTG	2	6	12636	12641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233031
150	NC_003276	AAT	2	6	13086	13091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233032
151	NC_003276	CGC	2	6	13284	13289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233032
152	NC_003276	GTG	2	6	13312	13317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233032
153	NC_003276	CTA	2	6	13446	13451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233032
154	NC_003276	AAT	2	6	13584	13589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233032
155	NC_003276	CAG	2	6	13650	13655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233032
156	NC_003276	TCG	2	6	14057	14062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233033
157	NC_003276	TCA	2	6	14071	14076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233033
158	NC_003276	GCA	2	6	14228	14233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233033
159	NC_003276	TGC	2	6	14255	14260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233033
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163	NC_003276	AAC	2	6	15071	15076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233035
164	NC_003276	TGC	2	6	15114	15119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233035
165	NC_003276	ATT	2	6	15129	15134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233035
166	NC_003276	AAG	2	6	15149	15154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233035
167	NC_003276	TTA	2	6	15155	15160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233035
168	NC_003276	AGA	2	6	15213	15218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233035
169	NC_003276	ACT	2	6	15232	15237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233035
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172	NC_003276	TTA	2	6	15413	15418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233035
173	NC_003276	GTT	2	6	15449	15454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233035
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179	NC_003276	TGA	2	6	15860	15865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233036
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257	NC_003276	ATA	2	6	22215	22220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233042
258	NC_003276	GAT	2	6	22307	22312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233042
259	NC_003276	ATC	2	6	22584	22589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233042
260	NC_003276	TAA	2	6	22652	22657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233042
261	NC_003276	CAA	2	6	22712	22717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233042
262	NC_003276	CCT	2	6	22733	22738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233042
263	NC_003276	CTG	2	6	22788	22793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233042
264	NC_003276	AAT	2	6	22931	22936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233042
265	NC_003276	ATG	2	6	23041	23046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233042
266	NC_003276	TCT	2	6	23074	23079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233042
267	NC_003276	TAA	2	6	23090	23095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233042
268	NC_003276	CTT	2	6	23120	23125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233042
269	NC_003276	CAT	2	6	23162	23167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233042
270	NC_003276	ACT	2	6	23169	23174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233042
271	NC_003276	AAC	2	6	23266	23271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233042
272	NC_003276	TTC	2	6	23370	23375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233042
273	NC_003276	TCT	2	6	23407	23412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233042
274	NC_003276	ACG	2	6	23421	23426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233042
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276	NC_003276	TAA	2	6	23550	23555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233042
277	NC_003276	TAA	2	6	23571	23576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233042
278	NC_003276	GAG	2	6	23635	23640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233042
279	NC_003276	TTA	2	6	23665	23670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233042
280	NC_003276	TCT	2	6	23686	23691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233042
281	NC_003276	ATT	2	6	23694	23699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233042
282	NC_003276	GCA	2	6	23729	23734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233042
283	NC_003276	GAA	2	6	23759	23764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233042
284	NC_003276	TGG	2	6	23875	23880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233042
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286	NC_003276	GAA	2	6	23971	23976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233042
287	NC_003276	TTG	2	6	24009	24014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233042
288	NC_003276	ACT	3	9	24037	24045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233042
289	NC_003276	TCA	2	6	24058	24063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233042
290	NC_003276	TCA	2	6	24118	24123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233042
291	NC_003276	TGA	2	6	24164	24169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233042
292	NC_003276	TGA	2	6	24178	24183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233042
293	NC_003276	CTG	2	6	24240	24245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233042
294	NC_003276	CTT	2	6	24359	24364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233042
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300	NC_003276	CAA	2	6	24736	24741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233043
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334	NC_003276	TCA	2	6	28314	28319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233046
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336	NC_003276	CAA	2	6	28360	28365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233046
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340	NC_003276	TCA	2	6	28582	28587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233046
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369	NC_003276	GCC	2	6	30318	30323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233046
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371	NC_003276	TGA	2	6	30409	30414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233046
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377	NC_003276	TCT	2	6	30779	30784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233046
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380	NC_003276	ATG	2	6	30899	30904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233046
381	NC_003276	TTG	2	6	31322	31327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233047
382	NC_003276	GCA	2	6	31347	31352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233047
383	NC_003276	AGT	2	6	31353	31358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233047
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499	NC_003276	AGA	2	6	41136	41141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233064
500	NC_003276	GGC	2	6	41175	41180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233064

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