MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120delta

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003273	CAGCCC	2	12	2161	2172	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	17232878
2	NC_003273	TCACCT	2	12	4493	4504	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	17232881
3	NC_003273	GGTCAC	2	12	6171	6182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	17232882
4	NC_003273	GGGCGG	2	12	6236	6247	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	17232882
5	NC_003273	CATTAC	2	12	7726	7737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17232883
6	NC_003273	ACAGCA	2	12	8682	8693	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_003273	CTCAGT	2	12	13513	13524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_003273	CTTTGG	2	12	15667	15678	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	17232892
9	NC_003273	TTGGTT	2	12	19288	19299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17232898
10	NC_003273	GGCTGA	2	12	21981	21992	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	17232903
11	NC_003273	GATTGT	2	12	25185	25196	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	17232906
12	NC_003273	GAGGTA	2	12	25614	25625	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	17232907
13	NC_003273	ACCCTG	2	12	29045	29056	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17232911
14	NC_003273	TTTACT	2	12	29084	29095	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	17232911
15	NC_003273	GCTACT	2	12	30419	30430	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	17232913
16	NC_003273	TGAGAT	2	12	31205	31216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17232914
17	NC_003273	CCCTTA	2	12	34741	34752	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	17232918
18	NC_003273	AGTTTA	2	12	36396	36407	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003273	TCAGTT	2	12	37437	37448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_003273	TTGACC	2	12	48407	48418	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	17232935
21	NC_003273	CATTAC	2	12	55251	55262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17232939

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.