MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120delta

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003273	CAACT	2	10	3825	3834	40 %	20 %	0 %	40 %	17232881
2	NC_003273	GAATG	2	10	5532	5541	40 %	20 %	40 %	0 %	17232882
3	NC_003273	TTGAA	2	10	6082	6091	40 %	40 %	20 %	0 %	17232882
4	NC_003273	TTTGG	2	10	7267	7276	0 %	60 %	40 %	0 %	17232883
5	NC_003273	TGGCA	2	10	11271	11280	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_003273	CTTTA	2	10	12522	12531	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003273	CAATG	2	10	18646	18655	40 %	20 %	20 %	20 %	17232895
8	NC_003273	AAGGC	2	10	18912	18921	40 %	0 %	40 %	20 %	17232896
9	NC_003273	ACTTC	2	10	19751	19760	20 %	40 %	0 %	40 %	17232900
10	NC_003273	CAAAC	2	10	20643	20652	60 %	0 %	0 %	40 %	17232901
11	NC_003273	CAGGT	2	10	21967	21976	20 %	20 %	40 %	20 %	17232903
12	NC_003273	GAACT	2	10	24053	24062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_003273	TTTGG	2	10	24713	24722	0 %	60 %	40 %	0 %	17232905
14	NC_003273	AAGAG	2	10	31906	31915	60 %	0 %	40 %	0 %	17232915
15	NC_003273	AACGA	2	10	33372	33381	60 %	0 %	20 %	20 %	17232917
16	NC_003273	AATGT	2	10	35681	35690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003273	TTTTA	2	10	37456	37465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003273	AGATT	2	10	38617	38626	40 %	40 %	20 %	0 %	17232924
19	NC_003273	TGGAA	2	10	46053	46062	40 %	20 %	40 %	0 %	17232933
20	NC_003273	GAAAG	2	10	46085	46094	60 %	0 %	40 %	0 %	17232933
21	NC_003273	AAGGT	2	10	47007	47016	40 %	20 %	40 %	0 %	17232933
22	NC_003273	AAAGC	2	10	47129	47138	60 %	0 %	20 %	20 %	17232933
23	NC_003273	GAAAG	2	10	47578	47587	60 %	0 %	40 %	0 %	17232933
24	NC_003273	TAATT	2	10	49029	49038	40 %	60 %	0 %	0 %	17232935
25	NC_003273	ACCCC	2	10	49944	49953	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
26	NC_003273	CTTAT	2	10	52060	52069	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_003273	GTCTC	2	10	52618	52627	0 %	40 %	20 %	40 %	17232937
28	NC_003273	TTTGG	2	10	54792	54801	0 %	60 %	40 %	0 %	17232939
29	NC_003273	GTTAG	2	10	55212	55221	20 %	40 %	40 %	0 %	17232939

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.