MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120delta

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003273	CAAA	2	8	268	275	75 %	0 %	0 %	25 %	17232875
2	NC_003273	CTTA	2	8	678	685	25 %	50 %	0 %	25 %	17232875
3	NC_003273	TACA	2	8	903	910	50 %	25 %	0 %	25 %	17232876
4	NC_003273	CAAC	2	8	2895	2902	50 %	0 %	0 %	50 %	17232879
5	NC_003273	GCTG	2	8	3269	3276	0 %	25 %	50 %	25 %	17232880
6	NC_003273	TCCA	2	8	3898	3905	25 %	25 %	0 %	50 %	17232881
7	NC_003273	CAGC	2	8	4391	4398	25 %	0 %	25 %	50 %	17232881
8	NC_003273	GTCA	2	8	4827	4834	25 %	25 %	25 %	25 %	17232881
9	NC_003273	CCAC	2	8	5818	5825	25 %	0 %	0 %	75 %	17232882
10	NC_003273	CACT	2	8	5866	5873	25 %	25 %	0 %	50 %	17232882
11	NC_003273	GATT	2	8	6251	6258	25 %	50 %	25 %	0 %	17232882
12	NC_003273	GAAT	2	8	7113	7120	50 %	25 %	25 %	0 %	17232883
13	NC_003273	CTTT	2	8	7414	7421	0 %	75 %	0 %	25 %	17232883
14	NC_003273	CAAA	2	8	8157	8164	75 %	0 %	0 %	25 %	17232883
15	NC_003273	TGGC	2	8	8820	8827	0 %	25 %	50 %	25 %	17232884
16	NC_003273	TAAT	2	8	8923	8930	50 %	50 %	0 %	0 %	17232884
17	NC_003273	ATAA	2	8	9314	9321	75 %	25 %	0 %	0 %	17232884
18	NC_003273	CTGC	2	8	9888	9895	0 %	25 %	25 %	50 %	17232885
19	NC_003273	GCTT	2	8	10346	10353	0 %	50 %	25 %	25 %	17232887
20	NC_003273	CCTT	2	8	10448	10455	0 %	50 %	0 %	50 %	17232887
21	NC_003273	ACTC	2	8	10728	10735	25 %	25 %	0 %	50 %	17232888
22	NC_003273	CCAT	2	8	11605	11612	25 %	25 %	0 %	50 %	17232889
23	NC_003273	CAAC	2	8	11914	11921	50 %	0 %	0 %	50 %	17232889
24	NC_003273	GTTA	2	8	12960	12967	25 %	50 %	25 %	0 %	17232891
25	NC_003273	CTGC	2	8	13006	13013	0 %	25 %	25 %	50 %	17232891
26	NC_003273	ACTC	2	8	13600	13607	25 %	25 %	0 %	50 %	17232892
27	NC_003273	ATGG	2	8	14514	14521	25 %	25 %	50 %	0 %	17232892
28	NC_003273	TCTT	2	8	14568	14575	0 %	75 %	0 %	25 %	17232892
29	NC_003273	GACT	2	8	14936	14943	25 %	25 %	25 %	25 %	17232892
30	NC_003273	TTAA	2	8	15753	15760	50 %	50 %	0 %	0 %	17232892
31	NC_003273	CCCA	2	8	15880	15887	25 %	0 %	0 %	75 %	17232892
32	NC_003273	ACAA	2	8	16711	16718	75 %	0 %	0 %	25 %	17232893
33	NC_003273	TTCT	2	8	16805	16812	0 %	75 %	0 %	25 %	17232893
34	NC_003273	AACC	2	8	16867	16874	50 %	0 %	0 %	50 %	17232893
35	NC_003273	GGAA	2	8	17180	17187	50 %	0 %	50 %	0 %	17232894
36	NC_003273	CTAT	2	8	17694	17701	25 %	50 %	0 %	25 %	17232895
37	NC_003273	ATCA	2	8	18071	18078	50 %	25 %	0 %	25 %	17232895
38	NC_003273	TAAA	2	8	18387	18394	75 %	25 %	0 %	0 %	17232895
39	NC_003273	GAAA	2	8	19104	19111	75 %	0 %	25 %	0 %	17232897
40	NC_003273	ACTT	2	8	19578	19585	25 %	50 %	0 %	25 %	17232899
41	NC_003273	TAAC	2	8	20591	20598	50 %	25 %	0 %	25 %	17232901
42	NC_003273	GACC	2	8	20628	20635	25 %	0 %	25 %	50 %	17232901
43	NC_003273	ATGA	2	8	20789	20796	50 %	25 %	25 %	0 %	17232902
44	NC_003273	CAAT	2	8	20915	20922	50 %	25 %	0 %	25 %	17232902
45	NC_003273	GAGT	2	8	21000	21007	25 %	25 %	50 %	0 %	17232902
46	NC_003273	CCAA	2	8	21643	21650	50 %	0 %	0 %	50 %	17232903
47	NC_003273	AAAG	2	8	21850	21857	75 %	0 %	25 %	0 %	17232903
48	NC_003273	CAAA	2	8	22146	22153	75 %	0 %	0 %	25 %	17232903
49	NC_003273	CAGG	2	8	22225	22232	25 %	0 %	50 %	25 %	17232903
50	NC_003273	TGAG	2	8	22382	22389	25 %	25 %	50 %	0 %	17232903
51	NC_003273	AAAG	2	8	23524	23531	75 %	0 %	25 %	0 %	17232904
52	NC_003273	ATTG	2	8	23639	23646	25 %	50 %	25 %	0 %	17232904
53	NC_003273	TCTG	2	8	23855	23862	0 %	50 %	25 %	25 %	17232904
54	NC_003273	TGAA	2	8	23977	23984	50 %	25 %	25 %	0 %	17232904
55	NC_003273	AGAA	2	8	24394	24401	75 %	0 %	25 %	0 %	17232905
56	NC_003273	ATTA	2	8	24568	24575	50 %	50 %	0 %	0 %	17232905
57	NC_003273	TAAT	2	8	24864	24871	50 %	50 %	0 %	0 %	17232905
58	NC_003273	GGCT	2	8	24909	24916	0 %	25 %	50 %	25 %	17232905
59	NC_003273	CCTC	2	8	25215	25222	0 %	25 %	0 %	75 %	17232906
60	NC_003273	AAGA	2	8	25845	25852	75 %	0 %	25 %	0 %	17232907
61	NC_003273	AAGC	2	8	26109	26116	50 %	0 %	25 %	25 %	17232907
62	NC_003273	GATG	2	8	27433	27440	25 %	25 %	50 %	0 %	17232908
63	NC_003273	AAAT	2	8	28571	28578	75 %	25 %	0 %	0 %	17232910
64	NC_003273	TATC	2	8	29029	29036	25 %	50 %	0 %	25 %	17232911
65	NC_003273	AATA	2	8	30196	30203	75 %	25 %	0 %	0 %	17232913
66	NC_003273	TAAA	2	8	30272	30279	75 %	25 %	0 %	0 %	17232913
67	NC_003273	AAAC	2	8	30642	30649	75 %	0 %	0 %	25 %	17232913
68	NC_003273	AGCA	2	8	32038	32045	50 %	0 %	25 %	25 %	17232915
69	NC_003273	AAAC	2	8	32157	32164	75 %	0 %	0 %	25 %	17232915
70	NC_003273	TATG	2	8	32618	32625	25 %	50 %	25 %	0 %	17232916
71	NC_003273	TTTG	2	8	33522	33529	0 %	75 %	25 %	0 %	17232917
72	NC_003273	GTTG	2	8	33675	33682	0 %	50 %	50 %	0 %	17232917
73	NC_003273	GAAA	2	8	36161	36168	75 %	0 %	25 %	0 %	17232919
74	NC_003273	TTCA	2	8	36612	36619	25 %	50 %	0 %	25 %	17232920
75	NC_003273	TGCT	2	8	37002	37009	0 %	50 %	25 %	25 %	17232920
76	NC_003273	TCCT	2	8	38034	38041	0 %	50 %	0 %	50 %	17232923
77	NC_003273	TTAA	2	8	38274	38281	50 %	50 %	0 %	0 %	17232924
78	NC_003273	ATCA	2	8	38505	38512	50 %	25 %	0 %	25 %	17232924
79	NC_003273	GTAT	2	8	38517	38524	25 %	50 %	25 %	0 %	17232924
80	NC_003273	ATTT	2	8	39159	39166	25 %	75 %	0 %	0 %	17232925
81	NC_003273	ATTA	2	8	39192	39199	50 %	50 %	0 %	0 %	17232925
82	NC_003273	TTTA	2	8	39538	39545	25 %	75 %	0 %	0 %	17232926
83	NC_003273	GATT	2	8	39999	40006	25 %	50 %	25 %	0 %	17232926
84	NC_003273	GAGT	2	8	40452	40459	25 %	25 %	50 %	0 %	17232927
85	NC_003273	TCAA	2	8	40681	40688	50 %	25 %	0 %	25 %	17232927
86	NC_003273	CATC	2	8	40812	40819	25 %	25 %	0 %	50 %	17232927
87	NC_003273	GACA	2	8	41004	41011	50 %	0 %	25 %	25 %	17232927
88	NC_003273	TTTG	2	8	41061	41068	0 %	75 %	25 %	0 %	17232927
89	NC_003273	AACG	2	8	41945	41952	50 %	0 %	25 %	25 %	17232929
90	NC_003273	GTTT	2	8	42614	42621	0 %	75 %	25 %	0 %	17232929
91	NC_003273	AGAT	2	8	43410	43417	50 %	25 %	25 %	0 %	17232930
92	NC_003273	GCTT	2	8	43965	43972	0 %	50 %	25 %	25 %	17232931
93	NC_003273	CTTT	2	8	44297	44304	0 %	75 %	0 %	25 %	17232932
94	NC_003273	GTTG	2	8	44417	44424	0 %	50 %	50 %	0 %	17232932
95	NC_003273	TTCC	2	8	44813	44820	0 %	50 %	0 %	50 %	17232932
96	NC_003273	TGAT	2	8	46671	46678	25 %	50 %	25 %	0 %	17232933
97	NC_003273	ATTG	2	8	47167	47174	25 %	50 %	25 %	0 %	17232933
98	NC_003273	TGGA	2	8	47233	47240	25 %	25 %	50 %	0 %	17232933
99	NC_003273	CACG	2	8	47857	47864	25 %	0 %	25 %	50 %	17232934
100	NC_003273	AGGT	2	8	48596	48603	25 %	25 %	50 %	0 %	17232935
101	NC_003273	GACT	2	8	48626	48633	25 %	25 %	25 %	25 %	17232935
102	NC_003273	TCAA	2	8	48937	48944	50 %	25 %	0 %	25 %	17232935
103	NC_003273	ACCA	2	8	49301	49308	50 %	0 %	0 %	50 %	17232936
104	NC_003273	ACCA	2	8	49397	49404	50 %	0 %	0 %	50 %	17232936
105	NC_003273	ACCA	2	8	49493	49500	50 %	0 %	0 %	50 %	17232936
106	NC_003273	GAAT	2	8	54638	54645	50 %	25 %	25 %	0 %	17232939
107	NC_003273	AACG	2	8	54898	54905	50 %	0 %	25 %	25 %	17232939
108	NC_003273	CTTT	2	8	54939	54946	0 %	75 %	0 %	25 %	17232939
109	NC_003273	GAAG	2	8	55265	55272	50 %	0 %	50 %	0 %	17232939

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.