MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120delta

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003273	AG	3	6	694	699	50 %	0 %	50 %	0 %	17232875
2	NC_003273	AT	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003273	TA	3	6	2398	2403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003273	TC	3	6	2647	2652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_003273	TA	3	6	3025	3030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003273	TC	3	6	3759	3764	0 %	50 %	0 %	50 %	17232881
7	NC_003273	TC	3	6	3770	3775	0 %	50 %	0 %	50 %	17232881
8	NC_003273	GT	3	6	5606	5611	0 %	50 %	50 %	0 %	17232882
9	NC_003273	AG	3	6	6964	6969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003273	TA	3	6	7288	7293	50 %	50 %	0 %	0 %	17232883
11	NC_003273	AC	3	6	7335	7340	50 %	0 %	0 %	50 %	17232883
12	NC_003273	CA	3	6	7383	7388	50 %	0 %	0 %	50 %	17232883
13	NC_003273	AT	3	6	7759	7764	50 %	50 %	0 %	0 %	17232883
14	NC_003273	TC	3	6	8389	8394	0 %	50 %	0 %	50 %	17232883
15	NC_003273	AG	3	6	8583	8588	50 %	0 %	50 %	0 %	17232883
16	NC_003273	TC	3	6	8769	8774	0 %	50 %	0 %	50 %	17232884
17	NC_003273	AT	3	6	9719	9724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003273	CA	3	6	10625	10630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_003273	CT	3	6	11398	11403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_003273	CT	3	6	12008	12013	0 %	50 %	0 %	50 %	17232889
21	NC_003273	CG	3	6	12033	12038	0 %	0 %	50 %	50 %	17232889
22	NC_003273	AC	3	6	12741	12746	50 %	0 %	0 %	50 %	17232891
23	NC_003273	TC	3	6	13083	13088	0 %	50 %	0 %	50 %	17232891
24	NC_003273	CT	3	6	13135	13140	0 %	50 %	0 %	50 %	17232891
25	NC_003273	AT	3	6	13202	13207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003273	TA	3	6	13237	13242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003273	CA	3	6	13278	13283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_003273	AG	3	6	13411	13416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003273	TC	3	6	15861	15866	0 %	50 %	0 %	50 %	17232892
30	NC_003273	GT	3	6	17795	17800	0 %	50 %	50 %	0 %	17232895
31	NC_003273	CA	3	6	17863	17868	50 %	0 %	0 %	50 %	17232895
32	NC_003273	AC	3	6	19709	19714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_003273	GA	3	6	20740	20745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003273	AC	3	6	20869	20874	50 %	0 %	0 %	50 %	17232902
35	NC_003273	AG	3	6	22954	22959	50 %	0 %	50 %	0 %	17232903
36	NC_003273	GA	3	6	22987	22992	50 %	0 %	50 %	0 %	17232903
37	NC_003273	AG	3	6	23659	23664	50 %	0 %	50 %	0 %	17232904
38	NC_003273	AT	3	6	23735	23740	50 %	50 %	0 %	0 %	17232904
39	NC_003273	AT	3	6	24414	24419	50 %	50 %	0 %	0 %	17232905
40	NC_003273	AT	3	6	26102	26107	50 %	50 %	0 %	0 %	17232907
41	NC_003273	AG	3	6	26824	26829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003273	AC	4	8	27718	27725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_003273	GA	3	6	27726	27731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003273	AT	3	6	27785	27790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003273	TC	3	6	28774	28779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_003273	AT	3	6	29630	29635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003273	AC	3	6	30393	30398	50 %	0 %	0 %	50 %	17232913
48	NC_003273	TA	3	6	30899	30904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003273	AT	3	6	30970	30975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003273	GT	3	6	32277	32282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003273	AG	3	6	32405	32410	50 %	0 %	50 %	0 %	17232916
52	NC_003273	GA	3	6	33989	33994	50 %	0 %	50 %	0 %	17232917
53	NC_003273	AC	3	6	35144	35149	50 %	0 %	0 %	50 %	17232918
54	NC_003273	CG	3	6	35296	35301	0 %	0 %	50 %	50 %	17232918
55	NC_003273	TA	4	8	35753	35760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003273	CA	3	6	35937	35942	50 %	0 %	0 %	50 %	17232919
57	NC_003273	AT	3	6	36464	36469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003273	CA	3	6	37254	37259	50 %	0 %	0 %	50 %	17232921
59	NC_003273	GT	3	6	37568	37573	0 %	50 %	50 %	0 %	17232922
60	NC_003273	CT	3	6	38381	38386	0 %	50 %	0 %	50 %	17232924
61	NC_003273	AT	3	6	38938	38943	50 %	50 %	0 %	0 %	17232925
62	NC_003273	TG	3	6	40424	40429	0 %	50 %	50 %	0 %	17232927
63	NC_003273	TC	3	6	42687	42692	0 %	50 %	0 %	50 %	17232929
64	NC_003273	CA	3	6	42745	42750	50 %	0 %	0 %	50 %	17232929
65	NC_003273	AT	4	8	44156	44163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003273	GA	3	6	45224	45229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003273	AG	5	10	45809	45818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003273	CA	3	6	46712	46717	50 %	0 %	0 %	50 %	17232933
69	NC_003273	TC	3	6	48362	48367	0 %	50 %	0 %	50 %	17232935
70	NC_003273	AG	3	6	50282	50287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003273	GA	4	8	51525	51532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003273	TC	3	6	51604	51609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_003273	CA	4	8	51933	51940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_003273	AT	3	6	52246	52251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003273	CT	3	6	52342	52347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_003273	CT	3	6	52971	52976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_003273	TA	3	6	53747	53752	50 %	50 %	0 %	0 %	17232938
78	NC_003273	GC	3	6	54493	54498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_003273	TA	3	6	54813	54818	50 %	50 %	0 %	0 %	17232939
80	NC_003273	AC	3	6	54860	54865	50 %	0 %	0 %	50 %	17232939
81	NC_003273	AT	3	6	55284	55289	50 %	50 %	0 %	0 %	17232939

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.