MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 chromosome

Total Repeats: 1033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003272	TTTTG	2	10	3155	3164	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003272	ATCTA	2	10	12694	12703	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_003272	TCTAA	2	10	15636	15645	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_003272	TTGTA	2	10	19477	19486	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003272	AGTTA	2	10	21101	21110	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003272	TAGTA	2	10	30222	30231	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003272	TAAAA	2	10	39542	39551	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003272	AAAAT	2	10	39845	39854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003272	TTTAA	2	10	45928	45937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003272	AAATC	2	10	53687	53696	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_003272	TAAGT	2	10	70530	70539	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003272	ATCCC	2	10	75945	75954	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_003272	ATAAC	2	10	76708	76717	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_003272	AAATC	2	10	77940	77949	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_003272	ATTTT	2	10	94667	94676	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003272	ATTCT	2	10	101074	101083	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003272	TCCCA	2	10	101591	101600	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_003272	GTTTA	2	10	103366	103375	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003272	TTTAG	2	10	108882	108891	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003272	TTTAA	2	10	114077	114086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003272	ATTAA	2	10	116087	116096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003272	AAATT	2	10	116148	116157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003272	TATTT	2	10	135099	135108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003272	ATAGA	2	10	135224	135233	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003272	TCTTA	2	10	136359	136368	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_003272	TTTTA	2	10	136540	136549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003272	CTTTG	2	10	160883	160892	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_003272	CCTAC	2	10	166285	166294	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_003272	TTAAT	2	10	175439	175448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003272	TAACA	2	10	182038	182047	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_003272	GATTT	2	10	184745	184754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003272	GATTT	2	10	195611	195620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003272	CCTAC	2	10	210324	210333	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_003272	TTTGC	2	10	215979	215988	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003272	AGTGG	2	10	216039	216048	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003272	AAGTC	2	10	220674	220683	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_003272	GATTT	2	10	223670	223679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003272	TTAAA	2	10	225657	225666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003272	AATGA	2	10	236162	236171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003272	GCTAG	2	10	238093	238102	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_003272	AGCCA	2	10	255906	255915	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_003272	AGCGA	2	10	258143	258152	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_003272	ACGCT	2	10	259148	259157	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_003272	AGTTG	2	10	268489	268498	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003272	CGGTT	2	10	273785	273794	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_003272	AAATT	2	10	278029	278038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003272	CAATT	2	10	284242	284251	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_003272	TCGCT	2	10	292051	292060	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_003272	TGTAG	2	10	292139	292148	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003272	CCTAC	2	10	321985	321994	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_003272	CAAAT	2	10	322575	322584	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_003272	AATGA	2	10	327039	327048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003272	TCAAA	2	10	341974	341983	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_003272	TGATT	2	10	344466	344475	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003272	TGTCA	2	10	350495	350504	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_003272	CTAAC	2	10	359551	359560	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_003272	CTGGA	2	10	374704	374713	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_003272	CAACC	2	10	384204	384213	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_003272	TTCTC	2	10	393430	393439	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_003272	TAATT	2	10	397391	397400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003272	AATTT	2	10	398864	398873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003272	GAAAA	2	10	398933	398942	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003272	ATCCC	2	10	400712	400721	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_003272	TCGCT	2	10	401229	401238	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_003272	TACTG	2	10	403950	403959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_003272	AGCGT	2	10	412155	412164	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_003272	CAATT	2	10	417999	418008	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_003272	AAAGC	2	10	426645	426654	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003272	TTATT	2	10	432876	432885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003272	AAGTA	2	10	433330	433339	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003272	TTAAC	2	10	433359	433368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_003272	TTAAC	2	10	434607	434616	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_003272	AATTA	2	10	437601	437610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003272	AGGGT	2	10	445565	445574	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003272	GCCGC	2	10	445852	445861	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_003272	ACACA	2	10	447559	447568	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_003272	CAAGC	2	10	447818	447827	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_003272	GGTTA	2	10	457935	457944	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003272	TTCTT	2	10	469230	469239	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_003272	AAACT	2	10	473045	473054	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003272	AATTT	2	10	487069	487078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003272	TAAAA	2	10	512289	512298	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003272	ACTAA	2	10	514151	514160	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_003272	TAGGC	2	10	516019	516028	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_003272	GAATT	2	10	518868	518877	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003272	TCAAA	2	10	537955	537964	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_003272	AAACA	2	10	539008	539017	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_003272	TCTCT	2	10	546015	546024	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_003272	ATGCT	2	10	561653	561662	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_003272	AACTA	2	10	580206	580215	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_003272	CTCTT	2	10	580544	580553	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_003272	TAAAA	2	10	613779	613788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003272	ATTGA	2	10	614549	614558	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003272	AAGTA	2	10	616031	616040	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003272	AGCAA	2	10	618508	618517	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_003272	TTGAT	2	10	624196	624205	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003272	AAAGA	2	10	637126	637135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003272	ATTTG	2	10	644494	644503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003272	CTTTA	2	10	645797	645806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_003272	TGTTC	2	10	664045	664054	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_003272	TTGCA	2	10	668590	668599	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_003272	ATTTT	2	10	675619	675628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003272	GCCCA	2	10	676246	676255	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_003272	AAATT	2	10	681136	681145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003272	CATGA	2	10	684207	684216	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_003272	TAATT	2	10	693673	693682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003272	ATAGA	2	10	695865	695874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003272	CCCTT	2	10	704463	704472	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_003272	AGCGA	2	10	711696	711705	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_003272	ACTCT	2	10	716515	716524	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_003272	GTAAA	2	10	716563	716572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003272	GGAAC	2	10	742263	742272	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_003272	TTCAA	2	10	747063	747072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_003272	TCTAG	2	10	750324	750333	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_003272	GTCAG	2	10	750505	750514	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_003272	TTTTA	2	10	766231	766240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003272	GTTGA	2	10	773975	773984	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003272	CAACC	2	10	774054	774063	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_003272	CATTA	2	10	779901	779910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_003272	ATTGT	2	10	784260	784269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003272	AATTT	2	10	796757	796766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003272	AGGGT	2	10	814515	814524	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003272	GAAAG	2	10	815168	815177	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003272	AGTTT	2	10	815227	815236	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003272	TGTAT	2	10	829735	829744	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003272	TATCG	2	10	832259	832268	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_003272	GGTTG	2	10	833036	833045	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003272	CAACC	2	10	833122	833131	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_003272	TACAT	2	10	846296	846305	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_003272	AACTG	2	10	861109	861118	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_003272	CAGTT	2	10	881411	881420	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_003272	GGAAC	2	10	881457	881466	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_003272	AACTG	2	10	881527	881536	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_003272	ATTTG	2	10	881582	881591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003272	ATTTG	2	10	881593	881602	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003272	ATTTG	2	10	881604	881613	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003272	TTTGA	2	10	881616	881625	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003272	AAGTT	2	10	888283	888292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003272	GCAAG	2	10	892788	892797	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_003272	TTTAA	2	10	895424	895433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003272	GAATA	2	10	895561	895570	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003272	TTACC	2	10	897251	897260	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_003272	ATTGT	2	10	899626	899635	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003272	GGTTG	2	10	907428	907437	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003272	AACAC	2	10	910229	910238	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_003272	CTTAG	2	10	928407	928416	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_003272	GTATT	2	10	928577	928586	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003272	ATTAA	2	10	931492	931501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003272	AAACT	2	10	936091	936100	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_003272	TATCT	2	10	942634	942643	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_003272	ATAAC	2	10	958113	958122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_003272	TTATA	2	10	959250	959259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003272	GTGTT	2	10	959327	959336	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_003272	ATGTG	2	10	1006509	1006518	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_003272	TCTGT	2	10	1619338	1619347	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_003272	CAGAG	3	15	1635010	1635024	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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322	NC_003272	TCAAG	2	10	1906879	1906888	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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422	NC_003272	TCGTG	2	10	2501540	2501549	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
423	NC_003272	AGGAG	2	10	2501922	2501931	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_003272	GCGGA	2	10	2505184	2505193	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
427	NC_003272	TTTAA	2	10	2507986	2507995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_003272	ATGGT	2	10	2515161	2515170	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
429	NC_003272	ATGTT	2	10	2519427	2519436	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_003272	ATGCA	2	10	2581736	2581745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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462	NC_003272	ATTAA	2	10	2785037	2785046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_003272	TATAG	2	10	2971304	2971313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
499	NC_003272	AAAAT	2	10	2976365	2976374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_003272	GCTAC	3	15	2977938	2977952	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

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