MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 chromosome

Total Repeats: 3685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003272	CAGA	2	8	545	552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003272	TAGG	2	8	641	648	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003272	ACTA	2	8	942	949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003272	ATTT	2	8	1753	1760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003272	TCCC	2	8	2027	2034	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_003272	TAGC	2	8	2992	2999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003272	ACTC	2	8	3186	3193	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_003272	TTCC	2	8	9081	9088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003272	GGGT	2	8	9560	9567	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003272	TCAG	2	8	9636	9643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_003272	TAAT	2	8	9789	9796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003272	CCTG	2	8	9870	9877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003272	GAAG	2	8	11470	11477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003272	ACTT	2	8	11495	11502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003272	AATT	2	8	12309	12316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003272	ACTT	2	8	12420	12427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_003272	ATAC	2	8	12553	12560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_003272	TCTA	2	8	12586	12593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_003272	TAGA	2	8	12645	12652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003272	AAAT	2	8	14287	14294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003272	TCTT	2	8	14763	14770	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_003272	ATCT	2	8	14787	14794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_003272	AATC	2	8	20705	20712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003272	ATTA	3	12	20794	20805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003272	TTAA	2	8	21199	21206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003272	TATT	2	8	22057	22064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003272	GCTT	2	8	22113	22120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003272	TTAA	2	8	22596	22603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003272	TAAT	2	8	33336	33343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003272	TTTA	2	8	33499	33506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003272	TTGT	2	8	33532	33539	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003272	CCTC	2	8	36938	36945	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_003272	CTAA	2	8	38432	38439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_003272	GTTT	2	8	39026	39033	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003272	TTTC	2	8	39428	39435	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_003272	TAGT	2	8	39528	39535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003272	ATTT	2	8	39730	39737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003272	GTCA	2	8	45462	45469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_003272	AAAT	2	8	45754	45761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003272	AACT	2	8	45874	45881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_003272	TTAA	2	8	45998	46005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003272	AGCT	2	8	46350	46357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_003272	ACTA	2	8	46447	46454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_003272	ATTT	2	8	46508	46515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003272	ATTT	2	8	50968	50975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003272	AATA	2	8	51050	51057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003272	TAAA	2	8	51170	51177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003272	TGCT	2	8	51275	51282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_003272	CTAG	2	8	55086	55093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003272	ATTA	2	8	56319	56326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003272	AAAT	2	8	56328	56335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003272	AAAT	2	8	57083	57090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003272	ACTT	2	8	58354	58361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_003272	TTTA	2	8	59846	59853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003272	CGCC	2	8	59989	59996	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_003272	GCTT	2	8	60032	60039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_003272	ATAA	2	8	66038	66045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003272	TAAT	2	8	67129	67136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003272	CAAT	2	8	69051	69058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003272	TTAC	2	8	69287	69294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_003272	TGTT	2	8	69927	69934	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003272	ATTA	2	8	70971	70978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003272	TCTA	2	8	70983	70990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003272	TCAC	2	8	71013	71020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_003272	ATAG	2	8	72305	72312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003272	AGTT	2	8	72434	72441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003272	GAAT	2	8	75040	75047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003272	CTAT	2	8	75834	75841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_003272	GATA	3	12	75843	75854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003272	TCAA	2	8	76646	76653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003272	TAAA	2	8	77730	77737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003272	ATCA	2	8	77969	77976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_003272	AATA	2	8	82702	82709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003272	TAAA	2	8	82710	82717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003272	CAAT	2	8	84603	84610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_003272	TAGA	2	8	84661	84668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003272	GTTG	2	8	84795	84802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003272	CTGC	2	8	85448	85455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_003272	GCTT	2	8	85460	85467	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_003272	GGCA	2	8	85514	85521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_003272	CGTC	2	8	85725	85732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_003272	ATTA	2	8	85743	85750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003272	AAGT	2	8	91849	91856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003272	TTTA	2	8	94833	94840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003272	AATG	2	8	95141	95148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003272	TCAG	2	8	97056	97063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_003272	ACTC	2	8	99267	99274	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_003272	ATTT	2	8	100369	100376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003272	CAAC	2	8	100745	100752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_003272	CATA	2	8	100855	100862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_003272	CCTA	2	8	100914	100921	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_003272	GTCA	2	8	101491	101498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_003272	AGAA	2	8	105665	105672	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003272	TGAC	2	8	105934	105941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003272	TATT	2	8	108549	108556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003272	GTTA	2	8	109279	109286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003272	AATG	2	8	109333	109340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003272	AATT	2	8	110811	110818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003272	TAAA	2	8	111796	111803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003272	CAAA	2	8	111817	111824	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_003272	GCTT	2	8	114861	114868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_003272	TAAA	2	8	114929	114936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003272	GAAT	2	8	116122	116129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003272	ACAG	2	8	116394	116401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_003272	TGTA	2	8	120691	120698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003272	ATTG	2	8	129369	129376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003272	ATCA	2	8	129386	129393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_003272	TCAA	2	8	129396	129403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_003272	CATA	2	8	130671	130678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_003272	AATT	2	8	132770	132777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003272	ATAA	2	8	133807	133814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003272	AATT	2	8	135212	135219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003272	GGCT	2	8	135255	135262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_003272	CTTA	2	8	136305	136312	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_003272	TGAG	2	8	136346	136353	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003272	AAAT	2	8	141381	141388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003272	TAAA	2	8	147479	147486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003272	TACT	2	8	150801	150808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_003272	ATTG	2	8	150918	150925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003272	ATCC	2	8	150978	150985	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003272	TAAG	2	8	151112	151119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003272	AAAC	2	8	151154	151161	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_003272	ACCC	2	8	151202	151209	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_003272	ACAA	2	8	151700	151707	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003272	AGAC	2	8	152521	152528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_003272	AATT	2	8	152625	152632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003272	CTGT	2	8	156421	156428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_003272	ACCG	2	8	158217	158224	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_003272	TTCT	2	8	158505	158512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_003272	GGTT	2	8	159840	159847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003272	AAAC	2	8	160596	160603	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_003272	GATG	2	8	160647	160654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003272	TGAT	2	8	160835	160842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003272	GAAG	2	8	166478	166485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003272	GTTA	2	8	167800	167807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003272	ATCA	2	8	167823	167830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_003272	TAAA	3	12	168409	168420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003272	AGAT	2	8	168434	168441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003272	AGAT	2	8	177578	177585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003272	TAGA	2	8	177602	177609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003272	CTAC	2	8	180017	180024	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_003272	GTAC	2	8	182003	182010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_003272	AAAT	2	8	182160	182167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003272	AAAT	2	8	184896	184903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003272	ATTC	2	8	184957	184964	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_003272	ATTG	2	8	188358	188365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003272	AATA	2	8	190463	190470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003272	CATA	2	8	190551	190558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_003272	GTAG	2	8	191912	191919	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003272	CGTT	2	8	196167	196174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_003272	ATTT	2	8	197655	197662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003272	TAAG	2	8	197935	197942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003272	TCTT	2	8	197996	198003	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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