MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 chromosome

Total Repeats: 86157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003272	TCC	2	6	73	78	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_003272	TGT	2	6	82	87	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003272	TTG	2	6	328	333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003272	GCT	2	6	617	622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_003272	GCC	2	6	649	654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_003272	TTG	2	6	692	697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003272	CAT	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_003272	CTG	2	6	870	875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_003272	ACA	2	6	885	890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003272	ACA	2	6	932	937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_003272	ACA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_003272	ACC	2	6	959	964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_003272	AGT	2	6	1101	1106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227498
14	NC_003272	ACG	2	6	1158	1163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227498
15	NC_003272	CTA	2	6	1187	1192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227498
16	NC_003272	CAG	2	6	1304	1309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227498
17	NC_003272	ACC	2	6	1317	1322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227498
18	NC_003272	CTT	2	6	1358	1363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227498
19	NC_003272	CTT	2	6	1391	1396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227498
20	NC_003272	AGC	2	6	1455	1460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227498
21	NC_003272	ACA	2	6	1594	1599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227498
22	NC_003272	TCA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227498
23	NC_003272	ACA	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227498
24	NC_003272	ATT	2	6	1804	1809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003272	TAT	2	6	1814	1819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003272	ATT	2	6	1876	1881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003272	TTG	2	6	2159	2164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003272	TTG	2	6	2301	2306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003272	GTT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003272	TAA	2	6	2608	2613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003272	CAA	2	6	2727	2732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227499
32	NC_003272	CAT	2	6	2776	2781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227499
33	NC_003272	CTG	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_003272	CTA	2	6	3106	3111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_003272	GAG	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003272	CAC	2	6	3435	3440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227500
37	NC_003272	CAA	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227500
38	NC_003272	AAG	2	6	3451	3456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227500
39	NC_003272	GGC	2	6	3469	3474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227500
40	NC_003272	TGT	2	6	3486	3491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227500
41	NC_003272	GCT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227500
42	NC_003272	TTA	2	6	3908	3913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227500
43	NC_003272	CGG	2	6	3921	3926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227500
44	NC_003272	CAA	2	6	4005	4010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227500
45	NC_003272	ACG	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227500
46	NC_003272	CCG	2	6	4091	4096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17227500
47	NC_003272	CGC	3	9	4276	4284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17227500
48	NC_003272	ATA	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227500
49	NC_003272	TTG	2	6	4371	4376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003272	TCT	2	6	4485	4490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227501
51	NC_003272	TCA	3	9	4515	4523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227501
52	NC_003272	TTC	2	6	4533	4538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227501
53	NC_003272	GGT	2	6	4604	4609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227501
54	NC_003272	ATC	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227501
55	NC_003272	GAG	2	6	4709	4714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227501
56	NC_003272	GTC	2	6	4796	4801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227501
57	NC_003272	AGA	2	6	4931	4936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227501
58	NC_003272	GAT	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227501
59	NC_003272	TCA	2	6	5049	5054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227501
60	NC_003272	TGC	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227501
61	NC_003272	CAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227501
62	NC_003272	TGG	2	6	5126	5131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227501
63	NC_003272	ACG	2	6	5132	5137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227501
64	NC_003272	GTC	2	6	5183	5188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227501
65	NC_003272	TAG	2	6	5236	5241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227501
66	NC_003272	CAG	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227501
67	NC_003272	ACT	3	9	5298	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227501
68	NC_003272	ATG	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227501
69	NC_003272	ACG	2	6	5549	5554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227501
70	NC_003272	GAT	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227501
71	NC_003272	CTT	2	6	5716	5721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227501
72	NC_003272	TCT	3	9	5763	5771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227501
73	NC_003272	GTA	2	6	5872	5877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227501
74	NC_003272	CTT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227501
75	NC_003272	TGC	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227501
76	NC_003272	AAT	2	6	5933	5938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227501
77	NC_003272	CTG	2	6	5940	5945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227501
78	NC_003272	CAC	2	6	6224	6229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227502
79	NC_003272	TCT	2	6	6319	6324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227502
80	NC_003272	CAG	2	6	6335	6340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227502
81	NC_003272	CTG	2	6	6393	6398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227502
82	NC_003272	AAG	2	6	6412	6417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227502
83	NC_003272	CGT	2	6	6424	6429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227502
84	NC_003272	CAA	2	6	6438	6443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227502
85	NC_003272	AAG	2	6	6448	6453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227502
86	NC_003272	CAG	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227502
87	NC_003272	ACA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227502
88	NC_003272	ACT	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227503
89	NC_003272	CTG	2	6	6847	6852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227503
90	NC_003272	CTT	2	6	6859	6864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227503
91	NC_003272	CAG	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227503
92	NC_003272	ATG	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227503
93	NC_003272	TTG	2	6	6980	6985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227503
94	NC_003272	GTT	2	6	7021	7026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227503
95	NC_003272	TAA	3	9	7114	7122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227503
96	NC_003272	GCT	2	6	7364	7369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227504
97	NC_003272	TTG	2	6	7425	7430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227504
98	NC_003272	CTG	2	6	7449	7454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227504
99	NC_003272	TGC	2	6	7459	7464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227504
100	NC_003272	CTT	2	6	7502	7507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227504
101	NC_003272	GCT	3	9	7513	7521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227504
102	NC_003272	CAG	2	6	7529	7534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227504
103	NC_003272	AAT	2	6	7566	7571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227504
104	NC_003272	CTA	2	6	7867	7872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003272	ACA	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227505
106	NC_003272	ACT	2	6	8033	8038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227505
107	NC_003272	AGT	2	6	8078	8083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227505
108	NC_003272	CTG	2	6	8145	8150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227505
109	NC_003272	AGC	3	9	8200	8208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227505
110	NC_003272	AGC	2	6	8218	8223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227505
111	NC_003272	GTT	2	6	8297	8302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003272	ATG	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227506
113	NC_003272	ATG	2	6	8351	8356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227506
114	NC_003272	TCA	2	6	8499	8504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227506
115	NC_003272	AAT	2	6	8561	8566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227506
116	NC_003272	CAA	2	6	8663	8668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227506
117	NC_003272	ATG	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227507
118	NC_003272	ATT	2	6	9232	9237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227507
119	NC_003272	TAA	2	6	9279	9284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227507
120	NC_003272	TAA	2	6	9381	9386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227507
121	NC_003272	TTC	2	6	9576	9581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_003272	TTA	2	6	9619	9624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003272	CTT	2	6	9693	9698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_003272	CTC	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_003272	TTG	2	6	9781	9786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003272	TCC	2	6	9917	9922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_003272	CAC	2	6	10009	10014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_003272	TAT	2	6	10128	10133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227508
129	NC_003272	GTA	2	6	10369	10374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227508
130	NC_003272	GAC	2	6	10414	10419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227508
131	NC_003272	CAA	2	6	10529	10534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227508
132	NC_003272	TGT	2	6	10618	10623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227508
133	NC_003272	AAG	2	6	10732	10737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227508
134	NC_003272	CCA	2	6	10872	10877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227508
135	NC_003272	GCA	2	6	10933	10938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227508
136	NC_003272	TGA	2	6	11001	11006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227508
137	NC_003272	ACT	2	6	11085	11090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227508
138	NC_003272	AGC	2	6	11204	11209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227508
139	NC_003272	AGG	2	6	11237	11242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227508
140	NC_003272	TGG	2	6	11264	11269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227508
141	NC_003272	ACT	2	6	11303	11308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227508
142	NC_003272	ATG	2	6	11328	11333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227508
143	NC_003272	GAA	2	6	11336	11341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003272	AGA	2	6	11405	11410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003272	TTG	2	6	11462	11467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003272	CAT	2	6	11536	11541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_003272	ACA	2	6	11584	11589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227509
148	NC_003272	CAT	2	6	11604	11609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227509
149	NC_003272	AGG	2	6	11634	11639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227509
150	NC_003272	GAA	3	9	11901	11909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227510
151	NC_003272	GAT	2	6	11991	11996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227510
152	NC_003272	TGT	2	6	12083	12088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227510
153	NC_003272	ATG	2	6	12148	12153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227510
154	NC_003272	TTA	2	6	12225	12230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227510
155	NC_003272	TAT	2	6	12239	12244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227510
156	NC_003272	ATC	2	6	12247	12252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227510
157	NC_003272	TTC	2	6	12375	12380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_003272	ATA	2	6	12406	12411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_003272	CAT	2	6	12498	12503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_003272	AGC	2	6	12565	12570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_003272	GAC	2	6	12731	12736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227511
162	NC_003272	GAC	2	6	12739	12744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227511
163	NC_003272	ATA	2	6	12750	12755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227511
164	NC_003272	GAC	2	6	12820	12825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227511
165	NC_003272	ATC	2	6	12927	12932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227511
166	NC_003272	GGC	2	6	13043	13048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227511
167	NC_003272	CTT	2	6	13142	13147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227511
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172	NC_003272	GTT	2	6	13421	13426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227512
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181	NC_003272	AAT	2	6	14105	14110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227513
182	NC_003272	GTT	2	6	14132	14137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_003272	GTT	2	6	14153	14158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_003272	TAA	2	6	14187	14192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_003272	ATT	2	6	14707	14712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227514
189	NC_003272	TAA	2	6	14796	14801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_003272	ATA	2	6	15293	15298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_003272	AGG	2	6	15408	15413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_003272	ATG	2	6	15755	15760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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215	NC_003272	ATT	2	6	16894	16899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227516
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239	NC_003272	CTG	2	6	19512	19517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
240	NC_003272	GGA	2	6	19601	19606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_003272	ACT	2	6	19871	19876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227517
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251	NC_003272	GTA	2	6	20080	20085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227517
252	NC_003272	CTG	2	6	20116	20121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_003272	AAC	2	6	20160	20165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_003272	CCG	2	6	20185	20190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17227518
255	NC_003272	CTG	2	6	20200	20205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227518
256	NC_003272	ACA	2	6	20292	20297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227518
257	NC_003272	AAG	2	6	20326	20331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227518
258	NC_003272	TGT	2	6	20347	20352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227518
259	NC_003272	GGT	2	6	20373	20378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227518
260	NC_003272	CGT	2	6	20394	20399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227518
261	NC_003272	TAC	2	6	20427	20432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227518
262	NC_003272	AAG	2	6	20569	20574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227518
263	NC_003272	TGA	2	6	20690	20695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_003272	TGA	2	6	20743	20748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_003272	CAG	2	6	20911	20916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227519
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267	NC_003272	ATT	2	6	21093	21098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_003272	GAG	2	6	21161	21166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_003272	ACT	2	6	22702	22707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_003272	CAT	2	6	22746	22751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227522
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288	NC_003272	TGG	2	6	22978	22983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_003272	TCC	2	6	23469	23474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227524
292	NC_003272	TAC	2	6	23601	23606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227524
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294	NC_003272	TTG	2	6	23868	23873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_003272	CAA	2	6	23987	23992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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384	NC_003272	GTA	2	6	31838	31843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_003272	GCA	2	6	32059	32064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227528
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