MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120epsilon

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003270	TCGCT	2	10	1341	1350	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_003270	CACCC	2	10	2592	2601	20 %	0 %	0 %	80 %	17227466
3	NC_003270	TTACC	2	10	2637	2646	20 %	40 %	0 %	40 %	17227466
4	NC_003270	TGCCA	2	10	6834	6843	20 %	20 %	20 %	40 %	17227468
5	NC_003270	TGTGG	2	10	7649	7658	0 %	40 %	60 %	0 %	17227468
6	NC_003270	TGGTA	2	10	9608	9617	20 %	40 %	40 %	0 %	17227470
7	NC_003270	TTGGT	2	10	12172	12181	0 %	60 %	40 %	0 %	17227477
8	NC_003270	TGGCA	2	10	12247	12256	20 %	20 %	40 %	20 %	17227477
9	NC_003270	CAGAA	2	10	12762	12771	60 %	0 %	20 %	20 %	17227477
10	NC_003270	ACAGG	2	10	15853	15862	40 %	0 %	40 %	20 %	17227479
11	NC_003270	AAATT	2	10	16457	16466	60 %	40 %	0 %	0 %	17227479
12	NC_003270	ACCAA	2	10	18711	18720	60 %	0 %	0 %	40 %	17227480
13	NC_003270	AGTAA	2	10	23879	23888	60 %	20 %	20 %	0 %	17227483
14	NC_003270	TTCCC	2	10	25257	25266	0 %	40 %	0 %	60 %	17227484
15	NC_003270	CACAT	2	10	26194	26203	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_003270	TCGCC	2	10	27180	27189	0 %	20 %	20 %	60 %	17227485
17	NC_003270	AACAT	2	10	27760	27769	60 %	20 %	0 %	20 %	17227485
18	NC_003270	TTCAG	2	10	29980	29989	20 %	40 %	20 %	20 %	17227486
19	NC_003270	CTCAC	2	10	34335	34344	20 %	20 %	0 %	60 %	17227489
20	NC_003270	GATTT	2	10	34568	34577	20 %	60 %	20 %	0 %	17227489
21	NC_003270	GTTGG	2	10	35481	35490	0 %	40 %	60 %	0 %	17227490
22	NC_003270	CTGAA	2	10	35530	35539	40 %	20 %	20 %	20 %	17227490
23	NC_003270	ATTTT	2	10	36269	36278	20 %	80 %	0 %	0 %	17227491
24	NC_003270	AAAAT	2	10	37351	37360	80 %	20 %	0 %	0 %	17227492
25	NC_003270	GAACT	2	10	37373	37382	40 %	20 %	20 %	20 %	17227492
26	NC_003270	GAAAA	2	10	37632	37641	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003270	CCCAG	2	10	38566	38575	20 %	0 %	20 %	60 %	17227495
28	NC_003270	TCACT	2	10	38730	38739	20 %	40 %	0 %	40 %	17227495

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.