MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120epsilon

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003270	ATAC	2	8	178	185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003270	AGTG	2	8	1182	1189	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003270	GGGT	2	8	1243	1250	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003270	TTCG	2	8	1365	1372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_003270	CCAC	2	8	2003	2010	25 %	0 %	0 %	75 %	17227466
6	NC_003270	CACT	2	8	2051	2058	25 %	25 %	0 %	50 %	17227466
7	NC_003270	GATT	2	8	2436	2443	25 %	50 %	25 %	0 %	17227466
8	NC_003270	ATGG	2	8	3164	3171	25 %	25 %	50 %	0 %	17227466
9	NC_003270	TCGT	2	8	3732	3739	0 %	50 %	25 %	25 %	17227467
10	NC_003270	AACT	2	8	3819	3826	50 %	25 %	0 %	25 %	17227467
11	NC_003270	CACC	2	8	4042	4049	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_003270	GTTG	2	8	4113	4120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003270	ATTT	2	8	4420	4427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003270	TTGT	2	8	4461	4468	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003270	TTCA	2	8	4619	4626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_003270	ACTC	2	8	4800	4807	25 %	25 %	0 %	50 %	17227468
17	NC_003270	TGCT	2	8	5145	5152	0 %	50 %	25 %	25 %	17227468
18	NC_003270	GTGG	2	8	5368	5375	0 %	25 %	75 %	0 %	17227468
19	NC_003270	GATG	2	8	5528	5535	25 %	25 %	50 %	0 %	17227468
20	NC_003270	CAAG	2	8	6368	6375	50 %	0 %	25 %	25 %	17227468
21	NC_003270	CCAG	2	8	7171	7178	25 %	0 %	25 %	50 %	17227468
22	NC_003270	AATG	2	8	7244	7251	50 %	25 %	25 %	0 %	17227468
23	NC_003270	GGCT	2	8	7311	7318	0 %	25 %	50 %	25 %	17227468
24	NC_003270	CTGA	2	8	7463	7470	25 %	25 %	25 %	25 %	17227468
25	NC_003270	AGCA	2	8	7673	7680	50 %	0 %	25 %	25 %	17227468
26	NC_003270	AACA	2	8	8286	8293	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_003270	TATT	2	8	8401	8408	25 %	75 %	0 %	0 %	17227469
28	NC_003270	TGTT	2	8	8551	8558	0 %	75 %	25 %	0 %	17227469
29	NC_003270	TGAC	2	8	9114	9121	25 %	25 %	25 %	25 %	17227470
30	NC_003270	TTGA	2	8	9251	9258	25 %	50 %	25 %	0 %	17227470
31	NC_003270	ATTC	2	8	9694	9701	25 %	50 %	0 %	25 %	17227470
32	NC_003270	TGCT	2	8	9724	9731	0 %	50 %	25 %	25 %	17227470
33	NC_003270	ATTT	2	8	10210	10217	25 %	75 %	0 %	0 %	17227472
34	NC_003270	AAAG	3	12	10236	10247	75 %	0 %	25 %	0 %	17227472
35	NC_003270	TACA	2	8	10627	10634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_003270	ACTG	2	8	11288	11295	25 %	25 %	25 %	25 %	17227475
37	NC_003270	TCCT	2	8	11499	11506	0 %	50 %	0 %	50 %	17227475
38	NC_003270	AAGC	2	8	12021	12028	50 %	0 %	25 %	25 %	17227476
39	NC_003270	ATTT	2	8	12281	12288	25 %	75 %	0 %	0 %	17227477
40	NC_003270	GCAA	2	8	12443	12450	50 %	0 %	25 %	25 %	17227477
41	NC_003270	GCTG	2	8	12496	12503	0 %	25 %	50 %	25 %	17227477
42	NC_003270	CAAA	2	8	12931	12938	75 %	0 %	0 %	25 %	17227477
43	NC_003270	TGAG	2	8	13167	13174	25 %	25 %	50 %	0 %	17227477
44	NC_003270	AATA	2	8	14063	14070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003270	ACTC	2	8	14292	14299	25 %	25 %	0 %	50 %	17227478
46	NC_003270	ATTG	2	8	14424	14431	25 %	50 %	25 %	0 %	17227478
47	NC_003270	TCTG	2	8	14640	14647	0 %	50 %	25 %	25 %	17227478
48	NC_003270	TGAA	2	8	14762	14769	50 %	25 %	25 %	0 %	17227478
49	NC_003270	AGAA	2	8	16478	16485	75 %	0 %	25 %	0 %	17227479
50	NC_003270	GAAC	2	8	17274	17281	50 %	0 %	25 %	25 %	17227480
51	NC_003270	TAAT	2	8	17351	17358	50 %	50 %	0 %	0 %	17227480
52	NC_003270	TTGG	2	8	17652	17659	0 %	50 %	50 %	0 %	17227480
53	NC_003270	AATG	2	8	17812	17819	50 %	25 %	25 %	0 %	17227480
54	NC_003270	AATC	2	8	17874	17881	50 %	25 %	0 %	25 %	17227480
55	NC_003270	TACT	2	8	18123	18130	25 %	50 %	0 %	25 %	17227480
56	NC_003270	GAAA	2	8	18203	18210	75 %	0 %	25 %	0 %	17227480
57	NC_003270	ATAA	2	8	18322	18329	75 %	25 %	0 %	0 %	17227480
58	NC_003270	ATTT	2	8	18521	18528	25 %	75 %	0 %	0 %	17227480
59	NC_003270	GATT	2	8	18569	18576	25 %	50 %	25 %	0 %	17227480
60	NC_003270	TAAT	2	8	18671	18678	50 %	50 %	0 %	0 %	17227480
61	NC_003270	GTTT	2	8	18853	18860	0 %	75 %	25 %	0 %	17227480
62	NC_003270	GGCT	2	8	19661	19668	0 %	25 %	50 %	25 %	17227481
63	NC_003270	AACA	2	8	19905	19912	75 %	0 %	0 %	25 %	17227482
64	NC_003270	GTTA	2	8	19948	19955	25 %	50 %	25 %	0 %	17227482
65	NC_003270	ACTC	2	8	20209	20216	25 %	25 %	0 %	50 %	17227482
66	NC_003270	TTAT	2	8	20944	20951	25 %	75 %	0 %	0 %	17227483
67	NC_003270	CAAA	2	8	21470	21477	75 %	0 %	0 %	25 %	17227483
68	NC_003270	ACCC	2	8	21595	21602	25 %	0 %	0 %	75 %	17227483
69	NC_003270	ATGG	2	8	21760	21767	25 %	25 %	50 %	0 %	17227483
70	NC_003270	TAGT	2	8	22383	22390	25 %	50 %	25 %	0 %	17227483
71	NC_003270	ACAA	2	8	22607	22614	75 %	0 %	0 %	25 %	17227483
72	NC_003270	AGAA	2	8	22978	22985	75 %	0 %	25 %	0 %	17227483
73	NC_003270	ATTG	2	8	23191	23198	25 %	50 %	25 %	0 %	17227483
74	NC_003270	TTGA	2	8	23786	23793	25 %	50 %	25 %	0 %	17227483
75	NC_003270	AATT	2	8	24123	24130	50 %	50 %	0 %	0 %	17227483
76	NC_003270	ATGA	2	8	26145	26152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003270	TAAT	2	8	26186	26193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003270	GCCA	2	8	26519	26526	25 %	0 %	25 %	50 %	17227485
79	NC_003270	AATA	2	8	27099	27106	75 %	25 %	0 %	0 %	17227485
80	NC_003270	ATTA	2	8	27432	27439	50 %	50 %	0 %	0 %	17227485
81	NC_003270	CTTT	2	8	27457	27464	0 %	75 %	0 %	25 %	17227485
82	NC_003270	TAAA	2	8	28368	28375	75 %	25 %	0 %	0 %	17227485
83	NC_003270	AATT	2	8	28386	28393	50 %	50 %	0 %	0 %	17227485
84	NC_003270	GTTC	2	8	29618	29625	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_003270	TTAT	2	8	29756	29763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003270	TGCT	2	8	29964	29971	0 %	50 %	25 %	25 %	17227486
87	NC_003270	GAAA	2	8	30359	30366	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003270	GTTT	2	8	31106	31113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003270	TAAT	2	8	31550	31557	50 %	50 %	0 %	0 %	17227488
90	NC_003270	AAAT	2	8	31937	31944	75 %	25 %	0 %	0 %	17227488
91	NC_003270	ATTT	2	8	31987	31994	25 %	75 %	0 %	0 %	17227488
92	NC_003270	GAGC	2	8	32244	32251	25 %	0 %	50 %	25 %	17227488
93	NC_003270	ACCA	2	8	32396	32403	50 %	0 %	0 %	50 %	17227488
94	NC_003270	CAAG	2	8	33036	33043	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003270	TTAG	2	8	33356	33363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003270	CAGC	2	8	33571	33578	25 %	0 %	25 %	50 %	17227489
97	NC_003270	GATT	2	8	33669	33676	25 %	50 %	25 %	0 %	17227489
98	NC_003270	ATTA	2	8	33750	33757	50 %	50 %	0 %	0 %	17227489
99	NC_003270	TTTA	2	8	34076	34083	25 %	75 %	0 %	0 %	17227489
100	NC_003270	GCAA	2	8	34548	34555	50 %	0 %	25 %	25 %	17227489
101	NC_003270	GACT	2	8	35257	35264	25 %	25 %	25 %	25 %	17227490
102	NC_003270	TGTT	2	8	35833	35840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003270	GCCA	2	8	36691	36698	25 %	0 %	25 %	50 %	17227492
104	NC_003270	AGTC	2	8	36854	36861	25 %	25 %	25 %	25 %	17227492
105	NC_003270	CTAG	2	8	37624	37631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_003270	CTTT	2	8	38484	38491	0 %	75 %	0 %	25 %	17227495
107	NC_003270	GTCA	2	8	38656	38663	25 %	25 %	25 %	25 %	17227495
108	NC_003270	TACT	2	8	39851	39858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_003270	TTTC	2	8	40165	40172	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.