MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120epsilon

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003270	CCAC	2	8	2003	2010	25 %	0 %	0 %	75 %	17227466
2	NC_003270	CACT	2	8	2051	2058	25 %	25 %	0 %	50 %	17227466
3	NC_003270	GATT	2	8	2436	2443	25 %	50 %	25 %	0 %	17227466
4	NC_003270	ATGG	2	8	3164	3171	25 %	25 %	50 %	0 %	17227466
5	NC_003270	TCGT	2	8	3732	3739	0 %	50 %	25 %	25 %	17227467
6	NC_003270	AACT	2	8	3819	3826	50 %	25 %	0 %	25 %	17227467
7	NC_003270	ACTC	2	8	4800	4807	25 %	25 %	0 %	50 %	17227468
8	NC_003270	TGCT	2	8	5145	5152	0 %	50 %	25 %	25 %	17227468
9	NC_003270	GTGG	2	8	5368	5375	0 %	25 %	75 %	0 %	17227468
10	NC_003270	GATG	2	8	5528	5535	25 %	25 %	50 %	0 %	17227468
11	NC_003270	CAAG	2	8	6368	6375	50 %	0 %	25 %	25 %	17227468
12	NC_003270	CCAG	2	8	7171	7178	25 %	0 %	25 %	50 %	17227468
13	NC_003270	AATG	2	8	7244	7251	50 %	25 %	25 %	0 %	17227468
14	NC_003270	GGCT	2	8	7311	7318	0 %	25 %	50 %	25 %	17227468
15	NC_003270	CTGA	2	8	7463	7470	25 %	25 %	25 %	25 %	17227468
16	NC_003270	AGCA	2	8	7673	7680	50 %	0 %	25 %	25 %	17227468
17	NC_003270	TATT	2	8	8401	8408	25 %	75 %	0 %	0 %	17227469
18	NC_003270	TGTT	2	8	8551	8558	0 %	75 %	25 %	0 %	17227469
19	NC_003270	TGAC	2	8	9114	9121	25 %	25 %	25 %	25 %	17227470
20	NC_003270	TTGA	2	8	9251	9258	25 %	50 %	25 %	0 %	17227470
21	NC_003270	ATTC	2	8	9694	9701	25 %	50 %	0 %	25 %	17227470
22	NC_003270	TGCT	2	8	9724	9731	0 %	50 %	25 %	25 %	17227470
23	NC_003270	ATTT	2	8	10210	10217	25 %	75 %	0 %	0 %	17227472
24	NC_003270	AAAG	3	12	10236	10247	75 %	0 %	25 %	0 %	17227472
25	NC_003270	ACTG	2	8	11288	11295	25 %	25 %	25 %	25 %	17227475
26	NC_003270	TCCT	2	8	11499	11506	0 %	50 %	0 %	50 %	17227475
27	NC_003270	AAGC	2	8	12021	12028	50 %	0 %	25 %	25 %	17227476
28	NC_003270	ATTT	2	8	12281	12288	25 %	75 %	0 %	0 %	17227477
29	NC_003270	GCAA	2	8	12443	12450	50 %	0 %	25 %	25 %	17227477
30	NC_003270	GCTG	2	8	12496	12503	0 %	25 %	50 %	25 %	17227477
31	NC_003270	CAAA	2	8	12931	12938	75 %	0 %	0 %	25 %	17227477
32	NC_003270	TGAG	2	8	13167	13174	25 %	25 %	50 %	0 %	17227477
33	NC_003270	ACTC	2	8	14292	14299	25 %	25 %	0 %	50 %	17227478
34	NC_003270	ATTG	2	8	14424	14431	25 %	50 %	25 %	0 %	17227478
35	NC_003270	TCTG	2	8	14640	14647	0 %	50 %	25 %	25 %	17227478
36	NC_003270	TGAA	2	8	14762	14769	50 %	25 %	25 %	0 %	17227478
37	NC_003270	AGAA	2	8	16478	16485	75 %	0 %	25 %	0 %	17227479
38	NC_003270	GAAC	2	8	17274	17281	50 %	0 %	25 %	25 %	17227480
39	NC_003270	TAAT	2	8	17351	17358	50 %	50 %	0 %	0 %	17227480
40	NC_003270	TTGG	2	8	17652	17659	0 %	50 %	50 %	0 %	17227480
41	NC_003270	AATG	2	8	17812	17819	50 %	25 %	25 %	0 %	17227480
42	NC_003270	AATC	2	8	17874	17881	50 %	25 %	0 %	25 %	17227480
43	NC_003270	TACT	2	8	18123	18130	25 %	50 %	0 %	25 %	17227480
44	NC_003270	GAAA	2	8	18203	18210	75 %	0 %	25 %	0 %	17227480
45	NC_003270	ATAA	2	8	18322	18329	75 %	25 %	0 %	0 %	17227480
46	NC_003270	ATTT	2	8	18521	18528	25 %	75 %	0 %	0 %	17227480
47	NC_003270	GATT	2	8	18569	18576	25 %	50 %	25 %	0 %	17227480
48	NC_003270	TAAT	2	8	18671	18678	50 %	50 %	0 %	0 %	17227480
49	NC_003270	GTTT	2	8	18853	18860	0 %	75 %	25 %	0 %	17227480
50	NC_003270	GGCT	2	8	19661	19668	0 %	25 %	50 %	25 %	17227481
51	NC_003270	AACA	2	8	19905	19912	75 %	0 %	0 %	25 %	17227482
52	NC_003270	GTTA	2	8	19948	19955	25 %	50 %	25 %	0 %	17227482
53	NC_003270	ACTC	2	8	20209	20216	25 %	25 %	0 %	50 %	17227482
54	NC_003270	TTAT	2	8	20944	20951	25 %	75 %	0 %	0 %	17227483
55	NC_003270	CAAA	2	8	21470	21477	75 %	0 %	0 %	25 %	17227483
56	NC_003270	ACCC	2	8	21595	21602	25 %	0 %	0 %	75 %	17227483
57	NC_003270	ATGG	2	8	21760	21767	25 %	25 %	50 %	0 %	17227483
58	NC_003270	TAGT	2	8	22383	22390	25 %	50 %	25 %	0 %	17227483
59	NC_003270	ACAA	2	8	22607	22614	75 %	0 %	0 %	25 %	17227483
60	NC_003270	AGAA	2	8	22978	22985	75 %	0 %	25 %	0 %	17227483
61	NC_003270	ATTG	2	8	23191	23198	25 %	50 %	25 %	0 %	17227483
62	NC_003270	TTGA	2	8	23786	23793	25 %	50 %	25 %	0 %	17227483
63	NC_003270	AATT	2	8	24123	24130	50 %	50 %	0 %	0 %	17227483
64	NC_003270	GCCA	2	8	26519	26526	25 %	0 %	25 %	50 %	17227485
65	NC_003270	AATA	2	8	27099	27106	75 %	25 %	0 %	0 %	17227485
66	NC_003270	ATTA	2	8	27432	27439	50 %	50 %	0 %	0 %	17227485
67	NC_003270	CTTT	2	8	27457	27464	0 %	75 %	0 %	25 %	17227485
68	NC_003270	TAAA	2	8	28368	28375	75 %	25 %	0 %	0 %	17227485
69	NC_003270	AATT	2	8	28386	28393	50 %	50 %	0 %	0 %	17227485
70	NC_003270	TGCT	2	8	29964	29971	0 %	50 %	25 %	25 %	17227486
71	NC_003270	TAAT	2	8	31550	31557	50 %	50 %	0 %	0 %	17227488
72	NC_003270	AAAT	2	8	31937	31944	75 %	25 %	0 %	0 %	17227488
73	NC_003270	ATTT	2	8	31987	31994	25 %	75 %	0 %	0 %	17227488
74	NC_003270	GAGC	2	8	32244	32251	25 %	0 %	50 %	25 %	17227488
75	NC_003270	ACCA	2	8	32396	32403	50 %	0 %	0 %	50 %	17227488
76	NC_003270	CAGC	2	8	33571	33578	25 %	0 %	25 %	50 %	17227489
77	NC_003270	GATT	2	8	33669	33676	25 %	50 %	25 %	0 %	17227489
78	NC_003270	ATTA	2	8	33750	33757	50 %	50 %	0 %	0 %	17227489
79	NC_003270	TTTA	2	8	34076	34083	25 %	75 %	0 %	0 %	17227489
80	NC_003270	GCAA	2	8	34548	34555	50 %	0 %	25 %	25 %	17227489
81	NC_003270	GACT	2	8	35257	35264	25 %	25 %	25 %	25 %	17227490
82	NC_003270	GCCA	2	8	36691	36698	25 %	0 %	25 %	50 %	17227492
83	NC_003270	AGTC	2	8	36854	36861	25 %	25 %	25 %	25 %	17227492
84	NC_003270	CTTT	2	8	38484	38491	0 %	75 %	0 %	25 %	17227495
85	NC_003270	GTCA	2	8	38656	38663	25 %	25 %	25 %	25 %	17227495

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.