MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120epsilon

Total Repeats: 431

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003270	GGA	2	6	1566	1571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227466
2	NC_003270	TCA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227466
3	NC_003270	AGA	2	6	1584	1589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227466
4	NC_003270	GAC	2	6	1696	1701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
5	NC_003270	CAA	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
6	NC_003270	CGG	2	6	1896	1901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
7	NC_003270	GCA	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
8	NC_003270	ATG	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227466
9	NC_003270	ACC	2	6	2156	2161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227466
10	NC_003270	AAG	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227466
11	NC_003270	CAA	2	6	2281	2286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
12	NC_003270	ATT	2	6	2301	2306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227466
13	NC_003270	GCG	3	9	2423	2431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
14	NC_003270	GCG	2	6	2554	2559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
15	NC_003270	CAA	2	6	2647	2652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
16	NC_003270	ACT	2	6	2697	2702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227466
17	NC_003270	TGA	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227466
18	NC_003270	CAA	2	6	2716	2721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
19	NC_003270	AAC	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
20	NC_003270	GGT	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227466
21	NC_003270	CTG	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227466
22	NC_003270	TTC	2	6	2901	2906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227466
23	NC_003270	CAA	2	6	3068	3073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
24	NC_003270	CAA	2	6	3115	3120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227466
25	NC_003270	GCG	2	6	3133	3138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227466
26	NC_003270	CAG	2	6	3148	3153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
27	NC_003270	CTT	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227466
28	NC_003270	CAG	2	6	3184	3189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227466
29	NC_003270	GAT	2	6	3202	3207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227466
30	NC_003270	ATG	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227467
31	NC_003270	ACC	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227467
32	NC_003270	CTG	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227467
33	NC_003270	CCA	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227467
34	NC_003270	CTC	2	6	3581	3586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227467
35	NC_003270	AAT	2	6	3605	3610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227467
36	NC_003270	GTA	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227467
37	NC_003270	TAA	2	6	3746	3751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227467
38	NC_003270	CTC	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227468
39	NC_003270	TTC	2	6	4813	4818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
40	NC_003270	GTT	2	6	4965	4970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
41	NC_003270	TGT	2	6	5068	5073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
42	NC_003270	GTT	2	6	5301	5306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
43	NC_003270	ATT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227468
44	NC_003270	TCA	2	6	5357	5362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
45	NC_003270	TTG	2	6	5401	5406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
46	NC_003270	AAT	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227468
47	NC_003270	TTC	2	6	5812	5817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
48	NC_003270	TTG	2	6	5824	5829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
49	NC_003270	ATC	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
50	NC_003270	GCG	2	6	6014	6019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227468
51	NC_003270	TCA	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
52	NC_003270	AGC	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227468
53	NC_003270	TGA	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227468
54	NC_003270	TAC	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
55	NC_003270	TAA	2	6	6445	6450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227468
56	NC_003270	TGT	2	6	6458	6463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
57	NC_003270	TTC	2	6	6568	6573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
58	NC_003270	TTG	2	6	6707	6712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
59	NC_003270	AAT	2	6	6780	6785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17227468
60	NC_003270	GTA	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227468
61	NC_003270	CTC	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227468
62	NC_003270	TTG	3	9	6973	6981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227468
63	NC_003270	TTC	2	6	6997	7002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
64	NC_003270	CTA	2	6	7023	7028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227468
65	NC_003270	CAA	2	6	7116	7121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227468
66	NC_003270	CTG	2	6	7271	7276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227468
67	NC_003270	CAG	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227468
68	NC_003270	CTT	2	6	7419	7424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
69	NC_003270	TTA	2	6	7439	7444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227468
70	NC_003270	GCA	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227468
71	NC_003270	TTC	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227468
72	NC_003270	AAC	2	6	7851	7856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227468
73	NC_003270	AGG	2	6	7998	8003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227468
74	NC_003270	TCT	2	6	8431	8436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227469
75	NC_003270	AAG	2	6	8448	8453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227469
76	NC_003270	GTT	2	6	8476	8481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227469
77	NC_003270	TTC	2	6	8520	8525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227469
78	NC_003270	CTA	2	6	8977	8982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227470
79	NC_003270	TGC	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227470
80	NC_003270	ACG	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227470
81	NC_003270	ACC	2	6	9102	9107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227470
82	NC_003270	AGC	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227470
83	NC_003270	CCT	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227470
84	NC_003270	GAG	2	6	9231	9236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227470
85	NC_003270	TGG	2	6	9289	9294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227470
86	NC_003270	CAA	2	6	9306	9311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227470
87	NC_003270	ACG	2	6	9339	9344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227470
88	NC_003270	CGC	2	6	9352	9357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17227470
89	NC_003270	AGC	2	6	9361	9366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227470
90	NC_003270	ATT	2	6	9734	9739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227470
91	NC_003270	TGA	2	6	9766	9771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227470
92	NC_003270	CAA	2	6	9846	9851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227470
93	NC_003270	AAC	2	6	9940	9945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227471
94	NC_003270	TGA	2	6	9953	9958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227471
95	NC_003270	ACG	2	6	9998	10003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227471
96	NC_003270	CGG	2	6	10004	10009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227471
97	NC_003270	ATC	2	6	10052	10057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227471
98	NC_003270	AGC	2	6	10073	10078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227471
99	NC_003270	AAC	2	6	10097	10102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227472
100	NC_003270	CAC	2	6	10203	10208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227472
101	NC_003270	GTT	2	6	10284	10289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227472
102	NC_003270	TGA	2	6	10358	10363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227472
103	NC_003270	AGA	2	6	10731	10736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227474
104	NC_003270	TCA	2	6	10778	10783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227474
105	NC_003270	TGA	2	6	10806	10811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227474
106	NC_003270	GGA	2	6	10812	10817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227474
107	NC_003270	CAA	2	6	10970	10975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227475
108	NC_003270	CAA	2	6	11117	11122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227475
109	NC_003270	GCA	2	6	11159	11164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227475
110	NC_003270	ACT	2	6	11189	11194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227475
111	NC_003270	ACA	2	6	11309	11314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227475
112	NC_003270	CCG	2	6	11341	11346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17227475
113	NC_003270	CAA	2	6	11409	11414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227475
114	NC_003270	CAG	2	6	11452	11457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227475
115	NC_003270	AGT	2	6	11460	11465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227475
116	NC_003270	CAA	2	6	11646	11651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227476
117	NC_003270	CAG	2	6	11652	11657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227476
118	NC_003270	CAA	2	6	11664	11669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227476
119	NC_003270	CAA	2	6	11676	11681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227476
120	NC_003270	CCG	3	9	11857	11865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17227476
121	NC_003270	GAG	2	6	12101	12106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17227476
122	NC_003270	ATT	2	6	12114	12119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227477
123	NC_003270	GCC	2	6	12203	12208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17227477
124	NC_003270	TGA	2	6	12325	12330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227477
125	NC_003270	TAC	2	6	12359	12364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227477
126	NC_003270	CAG	2	6	12393	12398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227477
127	NC_003270	GCG	2	6	12413	12418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227477
128	NC_003270	TAG	2	6	12589	12594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227477
129	NC_003270	AGT	2	6	12655	12660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227477
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131	NC_003270	GGC	2	6	12962	12967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17227477
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258	NC_003270	CTA	2	6	22904	22909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227483
259	NC_003270	CGT	2	6	22928	22933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227483
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262	NC_003270	AGA	2	6	23251	23256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227483
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381	NC_003270	TGA	2	6	33510	33515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227489
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383	NC_003270	ACT	2	6	33816	33821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227489
384	NC_003270	AAC	2	6	33836	33841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227489
385	NC_003270	ACT	2	6	34282	34287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227489
386	NC_003270	TGA	2	6	34326	34331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227489
387	NC_003270	GTT	2	6	34393	34398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227489
388	NC_003270	CCT	2	6	34431	34436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227489
389	NC_003270	GCA	2	6	34599	34604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227489
390	NC_003270	GAA	3	9	34647	34655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227489
391	NC_003270	CTG	2	6	34958	34963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227489
392	NC_003270	CTC	2	6	35025	35030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17227489
393	NC_003270	ATG	2	6	35227	35232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227490
394	NC_003270	GAT	2	6	35265	35270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227490
395	NC_003270	TCA	2	6	35447	35452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227490
396	NC_003270	TGG	2	6	35946	35951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227491
397	NC_003270	ACA	3	9	35962	35970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227491
398	NC_003270	TCG	2	6	36000	36005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17227491
399	NC_003270	AAC	2	6	36048	36053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227491
400	NC_003270	AAG	2	6	36236	36241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227491
401	NC_003270	TGA	2	6	36642	36647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227491
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403	NC_003270	GAT	2	6	36748	36753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17227492
404	NC_003270	CTA	2	6	36767	36772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17227492
405	NC_003270	ATT	2	6	36790	36795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17227492
406	NC_003270	TGG	2	6	36848	36853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227492
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408	NC_003270	AAG	2	6	36953	36958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227492
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412	NC_003270	CAG	2	6	37429	37434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17227492
413	NC_003270	AAC	2	6	37445	37450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17227492
414	NC_003270	CCA	2	6	37465	37470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17227492
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420	NC_003270	AGA	2	6	37747	37752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17227493
421	NC_003270	TTG	2	6	37754	37759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227493
422	NC_003270	CTT	2	6	37845	37850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17227494
423	NC_003270	TGG	2	6	37899	37904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17227494
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431	NC_003270	TGT	2	6	39305	39310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17227496

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.