MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120gamma

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003267	AGTTA	2	10	123	132	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003267	TGCGC	2	10	1036	1045	0 %	20 %	40 %	40 %	17227375
3	NC_003267	CACCG	2	10	1329	1338	20 %	0 %	20 %	60 %	17227375
4	NC_003267	AGTTG	2	10	2108	2117	20 %	40 %	40 %	0 %	17227376
5	NC_003267	CAAAA	2	10	4261	4270	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_003267	CGACT	2	10	6689	6698	20 %	20 %	20 %	40 %	17227384
7	NC_003267	GTTTT	2	10	7592	7601	0 %	80 %	20 %	0 %	17227384
8	NC_003267	TTATA	2	10	9742	9751	40 %	60 %	0 %	0 %	17227388
9	NC_003267	CGATG	2	10	10076	10085	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003267	TCAAG	2	10	10729	10738	40 %	20 %	20 %	20 %	17227389
11	NC_003267	TTTCT	2	10	10855	10864	0 %	80 %	0 %	20 %	17227389
12	NC_003267	TGAAC	2	10	12415	12424	40 %	20 %	20 %	20 %	17227389
13	NC_003267	AATAT	2	10	15837	15846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003267	ACAGC	2	10	16073	16082	40 %	0 %	20 %	40 %	17227392
15	NC_003267	TGGGG	2	10	16293	16302	0 %	20 %	80 %	0 %	17227393
16	NC_003267	CTCAT	2	10	16669	16678	20 %	40 %	0 %	40 %	17227393
17	NC_003267	TAGAT	2	10	17287	17296	40 %	40 %	20 %	0 %	17227393
18	NC_003267	CTGAA	2	10	17821	17830	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_003267	ATTCA	2	10	20348	20357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_003267	AATAA	2	10	20674	20683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003267	GCTTT	2	10	20780	20789	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_003267	CCCAT	2	10	21983	21992	20 %	20 %	0 %	60 %	17227396
23	NC_003267	GAACC	2	10	28805	28814	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_003267	CGAAG	2	10	29942	29951	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_003267	ATCCA	2	10	30010	30019	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_003267	TAAAT	2	10	30030	30039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003267	TGGTC	2	10	32018	32027	0 %	40 %	40 %	20 %	17227406
28	NC_003267	ACTTT	2	10	32413	32422	20 %	60 %	0 %	20 %	17227406
29	NC_003267	GTGTG	2	10	33203	33212	0 %	40 %	60 %	0 %	17227407
30	NC_003267	CTGGT	2	10	33573	33582	0 %	40 %	40 %	20 %	17227408
31	NC_003267	ACTTT	2	10	33725	33734	20 %	60 %	0 %	20 %	17227408
32	NC_003267	CGAAT	2	10	35244	35253	40 %	20 %	20 %	20 %	17227408
33	NC_003267	GAATT	2	10	38136	38145	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003267	TACTG	2	10	43654	43663	20 %	40 %	20 %	20 %	17227413
35	NC_003267	TGTTC	2	10	47334	47343	0 %	60 %	20 %	20 %	17227418
36	NC_003267	TTCTT	2	10	47410	47419	0 %	80 %	0 %	20 %	17227418
37	NC_003267	AAAAT	2	10	47994	48003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003267	TTGGG	2	10	50660	50669	0 %	40 %	60 %	0 %	17227420
39	NC_003267	TTAAT	2	10	52622	52631	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003267	TGTTT	2	10	54458	54467	0 %	80 %	20 %	0 %	17227422
41	NC_003267	TGTCC	2	10	54962	54971	0 %	40 %	20 %	40 %	17227422
42	NC_003267	GGGGT	2	10	55841	55850	0 %	20 %	80 %	0 %	17227423
43	NC_003267	AAAAT	2	10	56251	56260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003267	TTTCT	2	10	56318	56327	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_003267	AATTG	2	10	57608	57617	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003267	CCTCT	2	10	60492	60501	0 %	40 %	0 %	60 %	17227431
47	NC_003267	GAACC	2	10	60600	60609	40 %	0 %	20 %	40 %	17227431
48	NC_003267	GGTAA	2	10	63076	63085	40 %	20 %	40 %	0 %	17227434
49	NC_003267	AGCGG	2	10	65322	65331	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_003267	AGTAG	2	10	65808	65817	40 %	20 %	40 %	0 %	17227436
51	NC_003267	CGCTG	2	10	69300	69309	0 %	20 %	40 %	40 %	17227436
52	NC_003267	CAATG	2	10	71429	71438	40 %	20 %	20 %	20 %	17227438
53	NC_003267	AATAA	2	10	71506	71515	80 %	20 %	0 %	0 %	17227438
54	NC_003267	CAATT	2	10	72211	72220	40 %	40 %	0 %	20 %	17227439
55	NC_003267	CACTC	2	10	72673	72682	20 %	20 %	0 %	60 %	17227440
56	NC_003267	CACCC	2	10	72828	72837	20 %	0 %	0 %	80 %	17227440
57	NC_003267	ATCAC	2	10	74558	74567	40 %	20 %	0 %	40 %	17227441
58	NC_003267	TTTTC	2	10	75561	75570	0 %	80 %	0 %	20 %	17227442
59	NC_003267	ACCAC	2	10	77392	77401	40 %	0 %	0 %	60 %	17227444
60	NC_003267	TCAGG	2	10	80338	80347	20 %	20 %	40 %	20 %	17227449
61	NC_003267	TCTAG	2	10	80880	80889	20 %	40 %	20 %	20 %	17227449
62	NC_003267	TTCTA	2	10	89529	89538	20 %	60 %	0 %	20 %	17227452
63	NC_003267	GAGTA	2	10	89849	89858	40 %	20 %	40 %	0 %	17227452
64	NC_003267	TTTCC	2	10	95555	95564	0 %	60 %	0 %	40 %	17227457
65	NC_003267	ATGAA	2	10	96984	96993	60 %	20 %	20 %	0 %	17227459
66	NC_003267	CTATC	2	10	101320	101329	20 %	40 %	0 %	40 %	17227464
67	NC_003267	AGAAA	2	10	101406	101415	80 %	0 %	20 %	0 %	17227464
68	NC_003267	TGCAG	2	10	101673	101682	20 %	20 %	40 %	20 %	17227464

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.