MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120gamma

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003267	TGCGC	2	10	1036	1045	0 %	20 %	40 %	40 %	17227375
2	NC_003267	CACCG	2	10	1329	1338	20 %	0 %	20 %	60 %	17227375
3	NC_003267	AGTTG	2	10	2108	2117	20 %	40 %	40 %	0 %	17227376
4	NC_003267	CGACT	2	10	6689	6698	20 %	20 %	20 %	40 %	17227384
5	NC_003267	GTTTT	2	10	7592	7601	0 %	80 %	20 %	0 %	17227384
6	NC_003267	TTATA	2	10	9742	9751	40 %	60 %	0 %	0 %	17227388
7	NC_003267	TCAAG	2	10	10729	10738	40 %	20 %	20 %	20 %	17227389
8	NC_003267	TTTCT	2	10	10855	10864	0 %	80 %	0 %	20 %	17227389
9	NC_003267	TGAAC	2	10	12415	12424	40 %	20 %	20 %	20 %	17227389
10	NC_003267	ACAGC	2	10	16073	16082	40 %	0 %	20 %	40 %	17227392
11	NC_003267	TGGGG	2	10	16293	16302	0 %	20 %	80 %	0 %	17227393
12	NC_003267	CTCAT	2	10	16669	16678	20 %	40 %	0 %	40 %	17227393
13	NC_003267	TAGAT	2	10	17287	17296	40 %	40 %	20 %	0 %	17227393
14	NC_003267	CCCAT	2	10	21983	21992	20 %	20 %	0 %	60 %	17227396
15	NC_003267	TGGTC	2	10	32018	32027	0 %	40 %	40 %	20 %	17227406
16	NC_003267	ACTTT	2	10	32413	32422	20 %	60 %	0 %	20 %	17227406
17	NC_003267	GTGTG	2	10	33203	33212	0 %	40 %	60 %	0 %	17227407
18	NC_003267	CTGGT	2	10	33573	33582	0 %	40 %	40 %	20 %	17227408
19	NC_003267	ACTTT	2	10	33725	33734	20 %	60 %	0 %	20 %	17227408
20	NC_003267	CGAAT	2	10	35244	35253	40 %	20 %	20 %	20 %	17227408
21	NC_003267	TACTG	2	10	43654	43663	20 %	40 %	20 %	20 %	17227413
22	NC_003267	TGTTC	2	10	47334	47343	0 %	60 %	20 %	20 %	17227418
23	NC_003267	TTCTT	2	10	47410	47419	0 %	80 %	0 %	20 %	17227418
24	NC_003267	TTGGG	2	10	50660	50669	0 %	40 %	60 %	0 %	17227420
25	NC_003267	TGTTT	2	10	54458	54467	0 %	80 %	20 %	0 %	17227422
26	NC_003267	TGTCC	2	10	54962	54971	0 %	40 %	20 %	40 %	17227422
27	NC_003267	GGGGT	2	10	55841	55850	0 %	20 %	80 %	0 %	17227423
28	NC_003267	CCTCT	2	10	60492	60501	0 %	40 %	0 %	60 %	17227431
29	NC_003267	GAACC	2	10	60600	60609	40 %	0 %	20 %	40 %	17227431
30	NC_003267	GGTAA	2	10	63076	63085	40 %	20 %	40 %	0 %	17227434
31	NC_003267	AGTAG	2	10	65808	65817	40 %	20 %	40 %	0 %	17227436
32	NC_003267	CGCTG	2	10	69300	69309	0 %	20 %	40 %	40 %	17227436
33	NC_003267	CAATG	2	10	71429	71438	40 %	20 %	20 %	20 %	17227438
34	NC_003267	AATAA	2	10	71506	71515	80 %	20 %	0 %	0 %	17227438
35	NC_003267	CAATT	2	10	72211	72220	40 %	40 %	0 %	20 %	17227439
36	NC_003267	CACTC	2	10	72673	72682	20 %	20 %	0 %	60 %	17227440
37	NC_003267	CACCC	2	10	72828	72837	20 %	0 %	0 %	80 %	17227440
38	NC_003267	ATCAC	2	10	74558	74567	40 %	20 %	0 %	40 %	17227441
39	NC_003267	TTTTC	2	10	75561	75570	0 %	80 %	0 %	20 %	17227442
40	NC_003267	ACCAC	2	10	77392	77401	40 %	0 %	0 %	60 %	17227444
41	NC_003267	TCAGG	2	10	80338	80347	20 %	20 %	40 %	20 %	17227449
42	NC_003267	TCTAG	2	10	80880	80889	20 %	40 %	20 %	20 %	17227449
43	NC_003267	TTCTA	2	10	89529	89538	20 %	60 %	0 %	20 %	17227452
44	NC_003267	GAGTA	2	10	89849	89858	40 %	20 %	40 %	0 %	17227452
45	NC_003267	TTTCC	2	10	95555	95564	0 %	60 %	0 %	40 %	17227457
46	NC_003267	ATGAA	2	10	96984	96993	60 %	20 %	20 %	0 %	17227459
47	NC_003267	CTATC	2	10	101320	101329	20 %	40 %	0 %	40 %	17227464
48	NC_003267	AGAAA	2	10	101406	101415	80 %	0 %	20 %	0 %	17227464
49	NC_003267	TGCAG	2	10	101673	101682	20 %	20 %	40 %	20 %	17227464

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.