MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120gamma

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003267	TTAG	2	8	85	92	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003267	AGTA	2	8	385	392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003267	AGAT	2	8	432	439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003267	TTTA	2	8	2845	2852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003267	TAAA	2	8	3549	3556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003267	ATCC	2	8	8048	8055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_003267	AATC	2	8	8152	8159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_003267	ATTC	2	8	10066	10073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_003267	ACTA	2	8	12936	12943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003267	CTGG	2	8	15686	15693	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_003267	ATCT	2	8	15770	15777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003267	TGAC	2	8	15801	15808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_003267	ATAA	2	8	17623	17630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003267	AAGC	2	8	17838	17845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003267	AGGA	2	8	21693	21700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003267	TTTA	2	8	22435	22442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003267	TCTT	2	8	25840	25847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_003267	TTAG	2	8	26925	26932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003267	ATTT	2	8	28230	28237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003267	TACA	2	8	28856	28863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003267	ATTA	2	8	29796	29803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003267	TGTT	2	8	29831	29838	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003267	ACCA	2	8	30001	30008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_003267	ATTT	2	8	32869	32876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003267	ATGT	2	8	47918	47925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003267	TTAT	2	8	51861	51868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003267	AACT	2	8	52591	52598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003267	TTTA	2	8	52642	52649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003267	AAAT	2	8	52747	52754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003267	CAAA	2	8	52972	52979	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003267	AAGC	2	8	53280	53287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_003267	TTAC	2	8	56328	56335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003267	TAAA	2	8	56390	56397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003267	TGTC	2	8	56884	56891	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_003267	CAAC	2	8	57171	57178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_003267	ATTA	2	8	60220	60227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003267	CCAA	2	8	60339	60346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003267	CAAA	2	8	61243	61250	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_003267	GGCA	2	8	64068	64075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003267	TACT	2	8	64231	64238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_003267	ATAG	2	8	64260	64267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003267	TTAA	2	8	64324	64331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003267	TAAT	2	8	65272	65279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003267	AATT	2	8	69898	69905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003267	TAAA	2	8	70554	70561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003267	TAAG	2	8	70856	70863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003267	AGTA	2	8	71172	71179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003267	AAAT	2	8	73505	73512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003267	AAAT	2	8	73650	73657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003267	ATTT	2	8	73732	73739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003267	ATCA	2	8	77159	77166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_003267	CCCT	2	8	78521	78528	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_003267	ATTA	2	8	82495	82502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003267	CAAA	2	8	83961	83968	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003267	AGCA	2	8	84087	84094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003267	ACAG	2	8	92942	92949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_003267	CTCA	2	8	97254	97261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.