MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120gamma

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003267	CAGT	2	8	634	641	25 %	25 %	25 %	25 %	17227375
2	NC_003267	GTGG	2	8	760	767	0 %	25 %	75 %	0 %	17227375
3	NC_003267	GCTT	2	8	1020	1027	0 %	50 %	25 %	25 %	17227375
4	NC_003267	GATT	2	8	1141	1148	25 %	50 %	25 %	0 %	17227375
5	NC_003267	TTGG	2	8	1180	1187	0 %	50 %	50 %	0 %	17227375
6	NC_003267	ATTA	2	8	2256	2263	50 %	50 %	0 %	0 %	17227376
7	NC_003267	AATC	2	8	2609	2616	50 %	25 %	0 %	25 %	17227377
8	NC_003267	CTGT	2	8	2822	2829	0 %	50 %	25 %	25 %	17227377
9	NC_003267	CTAG	2	8	4572	4579	25 %	25 %	25 %	25 %	17227380
10	NC_003267	CAAG	2	8	4604	4611	50 %	0 %	25 %	25 %	17227380
11	NC_003267	CAAT	2	8	4628	4635	50 %	25 %	0 %	25 %	17227380
12	NC_003267	GTCC	2	8	5240	5247	0 %	25 %	25 %	50 %	17227381
13	NC_003267	AATT	2	8	5268	5275	50 %	50 %	0 %	0 %	17227381
14	NC_003267	ACTG	2	8	5344	5351	25 %	25 %	25 %	25 %	17227381
15	NC_003267	TGGC	2	8	5571	5578	0 %	25 %	50 %	25 %	17227381
16	NC_003267	TGGC	2	8	6132	6139	0 %	25 %	50 %	25 %	17227382
17	NC_003267	TACT	2	8	7122	7129	25 %	50 %	0 %	25 %	17227384
18	NC_003267	AACG	2	8	7684	7691	50 %	0 %	25 %	25 %	17227384
19	NC_003267	TCCA	2	8	7760	7767	25 %	25 %	0 %	50 %	17227384
20	NC_003267	ATCA	2	8	8280	8287	50 %	25 %	0 %	25 %	17227385
21	NC_003267	TTTC	2	8	8944	8951	0 %	75 %	0 %	25 %	17227386
22	NC_003267	TGGT	2	8	9265	9272	0 %	50 %	50 %	0 %	17227387
23	NC_003267	ATTT	2	8	9852	9859	25 %	75 %	0 %	0 %	17227388
24	NC_003267	CATT	2	8	10557	10564	25 %	50 %	0 %	25 %	17227389
25	NC_003267	TATT	2	8	10754	10761	25 %	75 %	0 %	0 %	17227389
26	NC_003267	ATTT	2	8	11164	11171	25 %	75 %	0 %	0 %	17227389
27	NC_003267	TATC	2	8	11509	11516	25 %	50 %	0 %	25 %	17227389
28	NC_003267	TTTA	2	8	12322	12329	25 %	75 %	0 %	0 %	17227389
29	NC_003267	AATT	2	8	12583	12590	50 %	50 %	0 %	0 %	17227389
30	NC_003267	CAAC	2	8	13235	13242	50 %	0 %	0 %	50 %	17227390
31	NC_003267	CCCA	2	8	14009	14016	25 %	0 %	0 %	75 %	17227390
32	NC_003267	GCAA	2	8	14293	14300	50 %	0 %	25 %	25 %	17227390
33	NC_003267	GAGC	2	8	14776	14783	25 %	0 %	50 %	25 %	17227390
34	NC_003267	CTTG	2	8	14977	14984	0 %	50 %	25 %	25 %	17227390
35	NC_003267	AAAC	2	8	15420	15427	75 %	0 %	0 %	25 %	17227391
36	NC_003267	CAGA	2	8	15985	15992	50 %	0 %	25 %	25 %	17227392
37	NC_003267	GGAC	2	8	16024	16031	25 %	0 %	50 %	25 %	17227392
38	NC_003267	TCAG	2	8	16308	16315	25 %	25 %	25 %	25 %	17227393
39	NC_003267	TTCG	2	8	16419	16426	0 %	50 %	25 %	25 %	17227393
40	NC_003267	ACTT	2	8	16614	16621	25 %	50 %	0 %	25 %	17227393
41	NC_003267	CAAG	2	8	16711	16718	50 %	0 %	25 %	25 %	17227393
42	NC_003267	GAAC	2	8	16738	16745	50 %	0 %	25 %	25 %	17227393
43	NC_003267	AATT	2	8	16776	16783	50 %	50 %	0 %	0 %	17227393
44	NC_003267	CGAA	2	8	17356	17363	50 %	0 %	25 %	25 %	17227393
45	NC_003267	TGGT	2	8	18313	18320	0 %	50 %	50 %	0 %	17227394
46	NC_003267	GAGC	2	8	18699	18706	25 %	0 %	50 %	25 %	17227394
47	NC_003267	GTCA	2	8	19588	19595	25 %	25 %	25 %	25 %	17227394
48	NC_003267	CTTA	2	8	19981	19988	25 %	50 %	0 %	25 %	17227394
49	NC_003267	AAGT	2	8	20285	20292	50 %	25 %	25 %	0 %	17227394
50	NC_003267	AGCA	2	8	22236	22243	50 %	0 %	25 %	25 %	17227396
51	NC_003267	GATT	2	8	22974	22981	25 %	50 %	25 %	0 %	17227397
52	NC_003267	AGTG	2	8	24644	24651	25 %	25 %	50 %	0 %	17227397
53	NC_003267	ACCC	2	8	24811	24818	25 %	0 %	0 %	75 %	17227397
54	NC_003267	GCCA	2	8	26263	26270	25 %	0 %	25 %	50 %	17227398
55	NC_003267	TTTA	2	8	26540	26547	25 %	75 %	0 %	0 %	17227398
56	NC_003267	CTGA	2	8	27386	27393	25 %	25 %	25 %	25 %	17227399
57	NC_003267	ACAA	2	8	27756	27763	75 %	0 %	0 %	25 %	17227400
58	NC_003267	TTGA	2	8	28597	28604	25 %	50 %	25 %	0 %	17227402
59	NC_003267	TTTC	2	8	28623	28630	0 %	75 %	0 %	25 %	17227402
60	NC_003267	GATT	2	8	29552	29559	25 %	50 %	25 %	0 %	17227403
61	NC_003267	TTAA	2	8	30596	30603	50 %	50 %	0 %	0 %	17227404
62	NC_003267	CCTT	2	8	30765	30772	0 %	50 %	0 %	50 %	17227404
63	NC_003267	TACC	2	8	31460	31467	25 %	25 %	0 %	50 %	17227406
64	NC_003267	CTTT	2	8	31472	31479	0 %	75 %	0 %	25 %	17227406
65	NC_003267	AGCA	2	8	33521	33528	50 %	0 %	25 %	25 %	17227408
66	NC_003267	CTTT	2	8	34068	34075	0 %	75 %	0 %	25 %	17227408
67	NC_003267	AGAA	2	8	34536	34543	75 %	0 %	25 %	0 %	17227408
68	NC_003267	ATTC	2	8	34575	34582	25 %	50 %	0 %	25 %	17227408
69	NC_003267	TCAA	2	8	34583	34590	50 %	25 %	0 %	25 %	17227408
70	NC_003267	TCAA	2	8	35054	35061	50 %	25 %	0 %	25 %	17227408
71	NC_003267	AGGA	2	8	35312	35319	50 %	0 %	50 %	0 %	17227408
72	NC_003267	AGAA	2	8	36146	36153	75 %	0 %	25 %	0 %	17227408
73	NC_003267	AGAA	2	8	36182	36189	75 %	0 %	25 %	0 %	17227408
74	NC_003267	GAAG	2	8	36216	36223	50 %	0 %	50 %	0 %	17227408
75	NC_003267	CACG	2	8	36587	36594	25 %	0 %	25 %	50 %	17227408
76	NC_003267	AGGT	2	8	36600	36607	25 %	25 %	50 %	0 %	17227408
77	NC_003267	AGTA	2	8	36625	36632	50 %	25 %	25 %	0 %	17227408
78	NC_003267	CTTG	2	8	36828	36835	0 %	50 %	25 %	25 %	17227408
79	NC_003267	GACT	2	8	37469	37476	25 %	25 %	25 %	25 %	17227408
80	NC_003267	TGAG	2	8	38296	38303	25 %	25 %	50 %	0 %	17227409
81	NC_003267	TTTG	2	8	38501	38508	0 %	75 %	25 %	0 %	17227409
82	NC_003267	CTTG	2	8	38649	38656	0 %	50 %	25 %	25 %	17227409
83	NC_003267	GGTT	2	8	39704	39711	0 %	50 %	50 %	0 %	17227410
84	NC_003267	TTGA	2	8	40190	40197	25 %	50 %	25 %	0 %	17227411
85	NC_003267	AGGT	2	8	40679	40686	25 %	25 %	50 %	0 %	17227411
86	NC_003267	TGCT	2	8	41001	41008	0 %	50 %	25 %	25 %	17227411
87	NC_003267	ATTA	2	8	41427	41434	50 %	50 %	0 %	0 %	17227411
88	NC_003267	GTTT	2	8	41684	41691	0 %	75 %	25 %	0 %	17227411
89	NC_003267	AATT	2	8	42334	42341	50 %	50 %	0 %	0 %	17227412
90	NC_003267	TACT	2	8	42499	42506	25 %	50 %	0 %	25 %	17227412
91	NC_003267	GTAA	2	8	42941	42948	50 %	25 %	25 %	0 %	17227412
92	NC_003267	TTCT	2	8	43311	43318	0 %	75 %	0 %	25 %	17227413
93	NC_003267	CTGG	2	8	43943	43950	0 %	25 %	50 %	25 %	17227413
94	NC_003267	TAAC	2	8	43986	43993	50 %	25 %	0 %	25 %	17227413
95	NC_003267	TCTT	2	8	44400	44407	0 %	75 %	0 %	25 %	17227414
96	NC_003267	AATT	2	8	44666	44673	50 %	50 %	0 %	0 %	17227414
97	NC_003267	CCTC	2	8	44731	44738	0 %	25 %	0 %	75 %	17227414
98	NC_003267	TAGT	2	8	45939	45946	25 %	50 %	25 %	0 %	17227415
99	NC_003267	ATTT	2	8	46255	46262	25 %	75 %	0 %	0 %	17227416
100	NC_003267	CCCT	2	8	46292	46299	0 %	25 %	0 %	75 %	17227417
101	NC_003267	TCCT	2	8	47085	47092	0 %	50 %	0 %	50 %	17227417
102	NC_003267	TTTG	2	8	47379	47386	0 %	75 %	25 %	0 %	17227418
103	NC_003267	AGCA	2	8	48118	48125	50 %	0 %	25 %	25 %	17227419
104	NC_003267	CTTT	2	8	48655	48662	0 %	75 %	0 %	25 %	17227420
105	NC_003267	AGGA	2	8	48723	48730	50 %	0 %	50 %	0 %	17227420
106	NC_003267	TCTT	2	8	49388	49395	0 %	75 %	0 %	25 %	17227420
107	NC_003267	ATCT	2	8	49557	49564	25 %	50 %	0 %	25 %	17227420
108	NC_003267	GGCA	2	8	50064	50071	25 %	0 %	50 %	25 %	17227420
109	NC_003267	AATT	2	8	51160	51167	50 %	50 %	0 %	0 %	17227420
110	NC_003267	TCAG	2	8	51185	51192	25 %	25 %	25 %	25 %	17227420
111	NC_003267	CAAT	2	8	52022	52029	50 %	25 %	0 %	25 %	17227421
112	NC_003267	TTAC	2	8	52069	52076	25 %	50 %	0 %	25 %	17227421
113	NC_003267	TTTC	2	8	52453	52460	0 %	75 %	0 %	25 %	17227421
114	NC_003267	GGTT	2	8	53848	53855	0 %	50 %	50 %	0 %	17227422
115	NC_003267	TCTG	2	8	54350	54357	0 %	50 %	25 %	25 %	17227422
116	NC_003267	GGTA	2	8	54500	54507	25 %	25 %	50 %	0 %	17227422
117	NC_003267	TGTC	2	8	54889	54896	0 %	50 %	25 %	25 %	17227422
118	NC_003267	TGTC	2	8	54952	54959	0 %	50 %	25 %	25 %	17227422
119	NC_003267	GTAT	2	8	55176	55183	25 %	50 %	25 %	0 %	17227422
120	NC_003267	CTGT	2	8	55188	55195	0 %	50 %	25 %	25 %	17227422
121	NC_003267	TTTG	2	8	55732	55739	0 %	75 %	25 %	0 %	17227423
122	NC_003267	ATGG	2	8	58264	58271	25 %	25 %	50 %	0 %	17227425
123	NC_003267	GTGG	2	8	58366	58373	0 %	25 %	75 %	0 %	17227425
124	NC_003267	ACTG	2	8	58798	58805	25 %	25 %	25 %	25 %	17227426
125	NC_003267	ACGA	2	8	59087	59094	50 %	0 %	25 %	25 %	17227426
126	NC_003267	TTAG	2	8	59114	59121	25 %	50 %	25 %	0 %	17227426
127	NC_003267	GTTA	2	8	59238	59245	25 %	50 %	25 %	0 %	17227427
128	NC_003267	GTTC	2	8	59263	59270	0 %	50 %	25 %	25 %	17227427
129	NC_003267	ATAG	2	8	59355	59362	50 %	25 %	25 %	0 %	17227428
130	NC_003267	AAAG	2	8	59441	59448	75 %	0 %	25 %	0 %	17227428
131	NC_003267	TCAA	2	8	59527	59534	50 %	25 %	0 %	25 %	17227428
132	NC_003267	CTAA	2	8	59849	59856	50 %	25 %	0 %	25 %	17227430
133	NC_003267	TCAG	2	8	59881	59888	25 %	25 %	25 %	25 %	17227430
134	NC_003267	CAAA	2	8	60741	60748	75 %	0 %	0 %	25 %	17227432
135	NC_003267	TGGT	2	8	60879	60886	0 %	50 %	50 %	0 %	17227432
136	NC_003267	GGAC	2	8	60982	60989	25 %	0 %	50 %	25 %	17227432
137	NC_003267	TTGA	2	8	61192	61199	25 %	50 %	25 %	0 %	17227432
138	NC_003267	TTCC	2	8	61333	61340	0 %	50 %	0 %	50 %	17227433
139	NC_003267	CTTC	2	8	61349	61356	0 %	50 %	0 %	50 %	17227433
140	NC_003267	AATC	2	8	61441	61448	50 %	25 %	0 %	25 %	17227433
141	NC_003267	CTGG	2	8	61673	61680	0 %	25 %	50 %	25 %	17227433
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.