MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120gamma

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003267	GT	3	6	1479	1484	0 %	50 %	50 %	0 %	17227375
2	NC_003267	TA	3	6	1570	1575	50 %	50 %	0 %	0 %	17227376
3	NC_003267	AG	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	17227377
4	NC_003267	CT	3	6	3767	3772	0 %	50 %	0 %	50 %	17227379
5	NC_003267	AC	3	6	4728	4733	50 %	0 %	0 %	50 %	17227380
6	NC_003267	CT	3	6	5627	5632	0 %	50 %	0 %	50 %	17227381
7	NC_003267	CT	3	6	6188	6193	0 %	50 %	0 %	50 %	17227382
8	NC_003267	TC	3	6	6537	6542	0 %	50 %	0 %	50 %	17227383
9	NC_003267	TG	3	6	6757	6762	0 %	50 %	50 %	0 %	17227384
10	NC_003267	GA	3	6	7219	7224	50 %	0 %	50 %	0 %	17227384
11	NC_003267	GT	3	6	9251	9256	0 %	50 %	50 %	0 %	17227387
12	NC_003267	CT	3	6	11008	11013	0 %	50 %	0 %	50 %	17227389
13	NC_003267	AT	3	6	11124	11129	50 %	50 %	0 %	0 %	17227389
14	NC_003267	AG	4	8	12547	12554	50 %	0 %	50 %	0 %	17227389
15	NC_003267	CA	3	6	13563	13568	50 %	0 %	0 %	50 %	17227390
16	NC_003267	GC	3	6	13767	13772	0 %	0 %	50 %	50 %	17227390
17	NC_003267	AG	3	6	14071	14076	50 %	0 %	50 %	0 %	17227390
18	NC_003267	TA	3	6	14334	14339	50 %	50 %	0 %	0 %	17227390
19	NC_003267	TC	3	6	14514	14519	0 %	50 %	0 %	50 %	17227390
20	NC_003267	AT	3	6	15267	15272	50 %	50 %	0 %	0 %	17227391
21	NC_003267	TG	3	6	17125	17130	0 %	50 %	50 %	0 %	17227393
22	NC_003267	GA	3	6	18135	18140	50 %	0 %	50 %	0 %	17227394
23	NC_003267	AT	3	6	19512	19517	50 %	50 %	0 %	0 %	17227394
24	NC_003267	TG	4	8	19787	19794	0 %	50 %	50 %	0 %	17227394
25	NC_003267	CT	3	6	21060	21065	0 %	50 %	0 %	50 %	17227395
26	NC_003267	TC	3	6	21876	21881	0 %	50 %	0 %	50 %	17227396
27	NC_003267	TC	3	6	23175	23180	0 %	50 %	0 %	50 %	17227397
28	NC_003267	CT	3	6	23456	23461	0 %	50 %	0 %	50 %	17227397
29	NC_003267	CT	3	6	23645	23650	0 %	50 %	0 %	50 %	17227397
30	NC_003267	CT	3	6	23834	23839	0 %	50 %	0 %	50 %	17227397
31	NC_003267	CT	3	6	24311	24316	0 %	50 %	0 %	50 %	17227397
32	NC_003267	CT	3	6	24497	24502	0 %	50 %	0 %	50 %	17227397
33	NC_003267	CT	3	6	24689	24694	0 %	50 %	0 %	50 %	17227397
34	NC_003267	CT	3	6	24785	24790	0 %	50 %	0 %	50 %	17227397
35	NC_003267	CT	3	6	24881	24886	0 %	50 %	0 %	50 %	17227397
36	NC_003267	CT	3	6	25070	25075	0 %	50 %	0 %	50 %	17227397
37	NC_003267	TC	3	6	26758	26763	0 %	50 %	0 %	50 %	17227398
38	NC_003267	AG	4	8	27315	27322	50 %	0 %	50 %	0 %	17227399
39	NC_003267	AC	3	6	27851	27856	50 %	0 %	0 %	50 %	17227400
40	NC_003267	TC	4	8	31341	31348	0 %	50 %	0 %	50 %	17227405
41	NC_003267	CA	3	6	31496	31501	50 %	0 %	0 %	50 %	17227406
42	NC_003267	GA	3	6	31562	31567	50 %	0 %	50 %	0 %	17227406
43	NC_003267	AG	3	6	33353	33358	50 %	0 %	50 %	0 %	17227407
44	NC_003267	AG	3	6	34282	34287	50 %	0 %	50 %	0 %	17227408
45	NC_003267	TA	3	6	35651	35656	50 %	50 %	0 %	0 %	17227408
46	NC_003267	AG	3	6	36757	36762	50 %	0 %	50 %	0 %	17227408
47	NC_003267	AC	3	6	37620	37625	50 %	0 %	0 %	50 %	17227408
48	NC_003267	AT	3	6	37769	37774	50 %	50 %	0 %	0 %	17227408
49	NC_003267	AG	3	6	37814	37819	50 %	0 %	50 %	0 %	17227408
50	NC_003267	AG	3	6	37913	37918	50 %	0 %	50 %	0 %	17227408
51	NC_003267	GA	3	6	38353	38358	50 %	0 %	50 %	0 %	17227409
52	NC_003267	CT	3	6	40179	40184	0 %	50 %	0 %	50 %	17227411
53	NC_003267	CT	3	6	40237	40242	0 %	50 %	0 %	50 %	17227411
54	NC_003267	CT	3	6	40302	40307	0 %	50 %	0 %	50 %	17227411
55	NC_003267	GA	3	6	41435	41440	50 %	0 %	50 %	0 %	17227411
56	NC_003267	AT	3	6	41581	41586	50 %	50 %	0 %	0 %	17227411
57	NC_003267	TC	3	6	42259	42264	0 %	50 %	0 %	50 %	17227412
58	NC_003267	AT	3	6	42855	42860	50 %	50 %	0 %	0 %	17227412
59	NC_003267	TC	3	6	43118	43123	0 %	50 %	0 %	50 %	17227413
60	NC_003267	TA	3	6	44973	44978	50 %	50 %	0 %	0 %	17227414
61	NC_003267	AC	3	6	46846	46851	50 %	0 %	0 %	50 %	17227417
62	NC_003267	GT	3	6	48777	48782	0 %	50 %	50 %	0 %	17227420
63	NC_003267	AT	3	6	49112	49117	50 %	50 %	0 %	0 %	17227420
64	NC_003267	GT	3	6	49659	49664	0 %	50 %	50 %	0 %	17227420
65	NC_003267	GT	3	6	50088	50093	0 %	50 %	50 %	0 %	17227420
66	NC_003267	GC	3	6	50899	50904	0 %	0 %	50 %	50 %	17227420
67	NC_003267	CA	3	6	52227	52232	50 %	0 %	0 %	50 %	17227421
68	NC_003267	TG	3	6	53918	53923	0 %	50 %	50 %	0 %	17227422
69	NC_003267	AT	3	6	54299	54304	50 %	50 %	0 %	0 %	17227422
70	NC_003267	GT	3	6	54312	54317	0 %	50 %	50 %	0 %	17227422
71	NC_003267	CT	3	6	54434	54439	0 %	50 %	0 %	50 %	17227422
72	NC_003267	CG	3	6	54580	54585	0 %	0 %	50 %	50 %	17227422
73	NC_003267	CT	3	6	54647	54652	0 %	50 %	0 %	50 %	17227422
74	NC_003267	TC	4	8	55759	55766	0 %	50 %	0 %	50 %	17227423
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81	NC_003267	GA	3	6	61921	61926	50 %	0 %	50 %	0 %	17227433
82	NC_003267	TA	3	6	62380	62385	50 %	50 %	0 %	0 %	17227434
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84	NC_003267	TC	3	6	64443	64448	0 %	50 %	0 %	50 %	17227435
85	NC_003267	GC	3	6	65742	65747	0 %	0 %	50 %	50 %	17227436
86	NC_003267	TC	3	6	67189	67194	0 %	50 %	0 %	50 %	17227436
87	NC_003267	TC	3	6	67378	67383	0 %	50 %	0 %	50 %	17227436
88	NC_003267	TC	3	6	68908	68913	0 %	50 %	0 %	50 %	17227436
89	NC_003267	AG	3	6	72369	72374	50 %	0 %	50 %	0 %	17227439
90	NC_003267	CT	3	6	74643	74648	0 %	50 %	0 %	50 %	17227441
91	NC_003267	TC	3	6	74752	74757	0 %	50 %	0 %	50 %	17227441
92	NC_003267	CT	3	6	75546	75551	0 %	50 %	0 %	50 %	17227442
93	NC_003267	AC	3	6	75633	75638	50 %	0 %	0 %	50 %	17227442
94	NC_003267	TA	3	6	76771	76776	50 %	50 %	0 %	0 %	17227443
95	NC_003267	AT	3	6	78399	78404	50 %	50 %	0 %	0 %	17227445
96	NC_003267	AT	3	6	78745	78750	50 %	50 %	0 %	0 %	17227446
97	NC_003267	AC	3	6	79018	79023	50 %	0 %	0 %	50 %	17227447
98	NC_003267	CT	3	6	80016	80021	0 %	50 %	0 %	50 %	17227448
99	NC_003267	TG	3	6	80140	80145	0 %	50 %	50 %	0 %	17227448
100	NC_003267	GT	5	10	81259	81268	0 %	50 %	50 %	0 %	17227449
101	NC_003267	CA	3	6	81323	81328	50 %	0 %	0 %	50 %	17227449
102	NC_003267	AT	3	6	81919	81924	50 %	50 %	0 %	0 %	17227449
103	NC_003267	AC	3	6	84814	84819	50 %	0 %	0 %	50 %	17227451
104	NC_003267	AC	3	6	90671	90676	50 %	0 %	0 %	50 %	17227453
105	NC_003267	AG	3	6	91421	91426	50 %	0 %	50 %	0 %	17227453
106	NC_003267	GT	3	6	91501	91506	0 %	50 %	50 %	0 %	17227453
107	NC_003267	AT	3	6	96803	96808	50 %	50 %	0 %	0 %	17227459
108	NC_003267	AT	3	6	98010	98015	50 %	50 %	0 %	0 %	17227460
109	NC_003267	TG	3	6	98259	98264	0 %	50 %	50 %	0 %	17227460
110	NC_003267	AT	3	6	98807	98812	50 %	50 %	0 %	0 %	17227461
111	NC_003267	TA	3	6	101594	101599	50 %	50 %	0 %	0 %	17227464

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.