MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120zeta

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003241	TAC	2	6	125	130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_003241	ATG	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003241	TCT	2	6	242	247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_003241	ATC	2	6	270	275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_003241	GAC	2	6	316	321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_003241	ATG	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003241	AGA	2	6	499	504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003241	CGC	2	6	513	518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_003241	CTT	2	6	537	542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003241	AGA	3	9	687	695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003241	GCT	2	6	718	723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_003241	AAC	2	6	902	907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_003241	GTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003241	AAG	2	6	949	954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003241	TCG	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_003241	TGA	3	9	1137	1145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003241	ATG	2	6	1244	1249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003241	CTG	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17158063
19	NC_003241	GTA	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003241	TAC	2	6	1965	1970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_003241	CAA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_003241	ATC	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_003241	CGG	2	6	2424	2429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17158064
24	NC_003241	GCG	2	6	2449	2454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17158064
25	NC_003241	ATC	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158064
26	NC_003241	ATC	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158064
27	NC_003241	CAT	2	6	2840	2845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_003241	ATG	2	6	2915	2920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003241	GAT	2	6	2960	2965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
30	NC_003241	GCA	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17158065
31	NC_003241	TGC	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17158065
32	NC_003241	ATG	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
33	NC_003241	TAA	2	6	3327	3332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17158065
34	NC_003241	TGC	2	6	3376	3381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17158065
35	NC_003241	TCA	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158065
36	NC_003241	ATG	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
37	NC_003241	GAT	2	6	3428	3433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
38	NC_003241	AGT	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
39	NC_003241	TGA	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
40	NC_003241	CAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158065
41	NC_003241	GAA	2	6	3587	3592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17158065
42	NC_003241	AGG	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17158065
43	NC_003241	ACA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17158065
44	NC_003241	ATG	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
45	NC_003241	CCG	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17158065
46	NC_003241	ACC	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17158065
47	NC_003241	AGG	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17158065
48	NC_003241	AGG	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17158065
49	NC_003241	CGG	2	6	4069	4074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17158065
50	NC_003241	GAT	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158065
51	NC_003241	AAG	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17158066
52	NC_003241	TAA	2	6	4669	4674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003241	GAT	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003241	CGG	2	6	5095	5100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_003241	ATC	2	6	5150	5155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_003241	GAT	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003241	CAA	2	6	5299	5304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.