MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120beta

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003240	AGCTTT	2	12	1678	1689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17158640
2	NC_003240	GATGCT	2	12	1868	1879	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17158640
3	NC_003240	ACTTGG	2	12	1921	1932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17158640
4	NC_003240	TGCCAC	2	12	2846	2857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17158641
5	NC_003240	GAAGTC	2	12	6077	6088	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17158644
6	NC_003240	AACCTA	2	12	6798	6809	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	17158645
7	NC_003240	AGCGCC	2	12	7100	7111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	17158646
8	NC_003240	CAACGG	2	12	9077	9088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17158648
9	NC_003240	CAGAAG	2	12	9807	9818	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	17158649
10	NC_003240	CAAAAC	2	12	23397	23408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17158665
11	NC_003240	CGTCGC	2	12	23992	24003	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	17158666
12	NC_003240	ATAACA	2	12	27776	27787	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	17158668
13	NC_003240	GCAGAA	2	12	29229	29240	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	17158670
14	NC_003240	ACAGCC	2	12	33740	33751	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	17158674
15	NC_003240	AGATTT	2	12	36625	36636	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	17158675
16	NC_003240	TGGACA	2	12	44136	44147	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17158682
17	NC_003240	CACCAT	2	12	44844	44855	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	17158683
18	NC_003240	AGATAT	2	12	45836	45847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	17158685
19	NC_003240	CTGTTT	2	12	46013	46024	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	17158685
20	NC_003240	TGGCTT	2	12	46988	46999	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	17158687
21	NC_003240	AATTTA	2	12	49792	49803	50 %	50 %	0 %	0 %	17158688
22	NC_003240	AAATAG	2	12	52202	52213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	17158691
23	NC_003240	AAGATA	2	12	53023	53034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	17158692
24	NC_003240	TCAAAT	2	12	54565	54576	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	17158695
25	NC_003240	CAAACT	2	12	56796	56807	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	17158698
26	NC_003240	TTATTT	2	12	57216	57227	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	17158698
27	NC_003240	CATCTG	2	12	61953	61964	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	17158704
28	NC_003240	TTTTCT	2	12	72490	72501	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	17158713
29	NC_003240	ATAAAT	2	12	72553	72564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17158713
30	NC_003240	AATACC	2	12	77148	77159	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	17158719
31	NC_003240	ATGTTA	2	12	77330	77341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	17158719
32	NC_003240	GCATTG	2	12	77420	77431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17158719
33	NC_003240	GGTGCG	2	12	80783	80794	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	17158722
34	NC_003240	TTCTAC	2	12	82505	82516	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	17158724
35	NC_003240	GCTGTT	2	12	93037	93048	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	17158737
36	NC_003240	TTGAAT	2	12	94817	94828	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	17158740
37	NC_003240	TTGAAG	2	12	95406	95417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158740
38	NC_003240	CAATAC	2	12	95855	95866	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	17158741
39	NC_003240	AGCCGC	2	12	96054	96065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	17158741
40	NC_003240	TACGAG	2	12	100822	100833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17158746
41	NC_003240	GTGACT	2	12	101098	101109	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17158746
42	NC_003240	CTAACT	2	12	102424	102435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17158748
43	NC_003240	GAAATC	2	12	103024	103035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	17158749
44	NC_003240	GAAAGT	2	12	103768	103779	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	17158750
45	NC_003240	ATCGTT	2	12	104029	104040	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17158750
46	NC_003240	CTACCA	2	12	104393	104404	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	17158750
47	NC_003240	AGCTGT	2	12	104989	105000	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	17158750
48	NC_003240	GTACTT	2	12	108743	108754	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17158754
49	NC_003240	ACCTGC	2	12	112890	112901	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17158755
50	NC_003240	TAAGTC	2	12	114382	114393	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	17158757
51	NC_003240	GCTACA	2	12	114880	114891	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	17158758
52	NC_003240	TTGCGC	2	12	115397	115408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17158758
53	NC_003240	AAGTTA	2	12	115812	115823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	17158758
54	NC_003240	GGATTA	2	12	123998	124009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158764
55	NC_003240	ATGTTT	2	12	124799	124810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	17158765
56	NC_003240	CTGACT	2	12	128906	128917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	17158767
57	NC_003240	AGCCTC	2	12	131263	131274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	17158768
58	NC_003240	CAGTAG	2	12	132775	132786	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17158769
59	NC_003240	ATGGCA	2	12	133638	133649	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	17158770
60	NC_003240	AAAGTA	2	12	136303	136314	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	17158772
61	NC_003240	AATCGC	2	12	139529	139540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	17158777
62	NC_003240	ATAAAG	2	12	146080	146091	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	17158783
63	NC_003240	TGAAAT	2	12	150082	150093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	17158785
64	NC_003240	CTATTG	2	12	151131	151142	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17158785
65	NC_003240	GAGGGT	2	12	154463	154474	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	17158785
66	NC_003240	ACTCAA	2	12	155483	155494	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	17158785
67	NC_003240	GTTAAA	2	12	155828	155839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	17158786
68	NC_003240	CTTTTT	2	12	159291	159302	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	17158791
69	NC_003240	CTCCAA	2	12	162276	162287	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	17158795
70	NC_003240	GTGTAA	2	12	168909	168920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17158799
71	NC_003240	CATCAA	2	12	171606	171617	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	17158802
72	NC_003240	GATGGA	2	12	172335	172346	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	17158802
73	NC_003240	TCAAAG	2	12	174791	174802	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	17158806
74	NC_003240	AAATGT	2	12	175962	175973	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	17158808
75	NC_003240	CAACTG	2	12	178845	178856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	17158813
76	NC_003240	ATCCAA	2	12	183861	183872	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	17158821

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.