MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120beta

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003240	TAATA	2	10	158	167	60 %	40 %	0 %	0 %	17158638
2	NC_003240	AATTG	2	10	242	251	40 %	40 %	20 %	0 %	17158638
3	NC_003240	TTGGA	2	10	1957	1966	20 %	40 %	40 %	0 %	17158640
4	NC_003240	GAGAG	2	10	3029	3038	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003240	GCGCT	2	10	3322	3331	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_003240	TTGCA	2	10	3775	3784	20 %	40 %	20 %	20 %	17158642
7	NC_003240	CGATC	2	10	4129	4138	20 %	20 %	20 %	40 %	17158642
8	NC_003240	GAGCG	2	10	6707	6716	20 %	0 %	60 %	20 %	17158645
9	NC_003240	CAACA	2	10	8246	8255	60 %	0 %	0 %	40 %	17158647
10	NC_003240	TATTT	2	10	11541	11550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003240	TCAAA	2	10	11795	11804	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_003240	TCGAG	2	10	11937	11946	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_003240	TCTAA	2	10	12189	12198	40 %	40 %	0 %	20 %	17158652
14	NC_003240	GTATT	2	10	14525	14534	20 %	60 %	20 %	0 %	17158655
15	NC_003240	TCTTT	2	10	14703	14712	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003240	AACTG	2	10	16901	16910	40 %	20 %	20 %	20 %	17158659
17	NC_003240	AGTAA	2	10	17371	17380	60 %	20 %	20 %	0 %	17158660
18	NC_003240	GGCAT	2	10	17515	17524	20 %	20 %	40 %	20 %	17158660
19	NC_003240	AGGGT	2	10	18331	18340	20 %	20 %	60 %	0 %	17158661
20	NC_003240	ACAAT	2	10	22049	22058	60 %	20 %	0 %	20 %	17158664
21	NC_003240	GATAT	2	10	23338	23347	40 %	40 %	20 %	0 %	17158665
22	NC_003240	ATCAA	2	10	23365	23374	60 %	20 %	0 %	20 %	17158665
23	NC_003240	CTGTT	2	10	24203	24212	0 %	60 %	20 %	20 %	17158666
24	NC_003240	TTACT	2	10	27984	27993	20 %	60 %	0 %	20 %	17158669
25	NC_003240	TATCT	2	10	29994	30003	20 %	60 %	0 %	20 %	17158671
26	NC_003240	AACAA	2	10	30526	30535	80 %	0 %	0 %	20 %	17158671
27	NC_003240	AAAGA	2	10	31747	31756	80 %	0 %	20 %	0 %	17158672
28	NC_003240	ACCAA	2	10	32630	32639	60 %	0 %	0 %	40 %	17158673
29	NC_003240	ACAAA	2	10	33726	33735	80 %	0 %	0 %	20 %	17158674
30	NC_003240	ACTTC	2	10	34915	34924	20 %	40 %	0 %	40 %	17158675
31	NC_003240	AGTTA	2	10	37404	37413	40 %	40 %	20 %	0 %	17158676
32	NC_003240	CCCTC	2	10	39247	39256	0 %	20 %	0 %	80 %	17158676
33	NC_003240	TCAAC	2	10	39400	39409	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_003240	TTAAC	2	10	40655	40664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003240	AAGAA	3	15	42307	42321	80 %	0 %	20 %	0 %	17158680
36	NC_003240	ATCCA	2	10	45735	45744	40 %	20 %	0 %	40 %	17158685
37	NC_003240	ACTGC	2	10	46827	46836	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_003240	ATAGC	2	10	47134	47143	40 %	20 %	20 %	20 %	17158687
39	NC_003240	CTTTA	2	10	47791	47800	20 %	60 %	0 %	20 %	17158688
40	NC_003240	ATCCC	2	10	47984	47993	20 %	20 %	0 %	60 %	17158688
41	NC_003240	AGAAA	2	10	49984	49993	80 %	0 %	20 %	0 %	17158688
42	NC_003240	GTCGA	2	10	50630	50639	20 %	20 %	40 %	20 %	17158689
43	NC_003240	TGCAA	2	10	51203	51212	40 %	20 %	20 %	20 %	17158689
44	NC_003240	CTGGA	2	10	54114	54123	20 %	20 %	40 %	20 %	17158694
45	NC_003240	ACAGC	2	10	55960	55969	40 %	0 %	20 %	40 %	17158697
46	NC_003240	ATTGT	2	10	57253	57262	20 %	60 %	20 %	0 %	17158698
47	NC_003240	TTCTG	2	10	58114	58123	0 %	60 %	20 %	20 %	17158699
48	NC_003240	TCAGG	2	10	63053	63062	20 %	20 %	40 %	20 %	17158705
49	NC_003240	GATTG	2	10	65104	65113	20 %	40 %	40 %	0 %	17158706
50	NC_003240	AAGAG	2	10	65899	65908	60 %	0 %	40 %	0 %	17158707
51	NC_003240	CCTTA	2	10	70146	70155	20 %	40 %	0 %	40 %	17158710
52	NC_003240	GATTC	2	10	72464	72473	20 %	40 %	20 %	20 %	17158713
53	NC_003240	AGGAG	2	10	73652	73661	40 %	0 %	60 %	0 %	17158714
54	NC_003240	AAAGA	2	10	74707	74716	80 %	0 %	20 %	0 %	17158716
55	NC_003240	TGACC	2	10	75323	75332	20 %	20 %	20 %	40 %	17158717
56	NC_003240	TTCAG	2	10	76754	76763	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003240	TTTGG	2	10	78463	78472	0 %	60 %	40 %	0 %	17158720
58	NC_003240	TTTGG	2	10	81744	81753	0 %	60 %	40 %	0 %	17158723
59	NC_003240	CTTAT	2	10	82808	82817	20 %	60 %	0 %	20 %	17158725
60	NC_003240	AATCA	2	10	83045	83054	60 %	20 %	0 %	20 %	17158725
61	NC_003240	CAATT	2	10	84474	84483	40 %	40 %	0 %	20 %	17158728
62	NC_003240	ACAAT	2	10	88360	88369	60 %	20 %	0 %	20 %	17158732
63	NC_003240	TGACT	2	10	91974	91983	20 %	40 %	20 %	20 %	17158737
64	NC_003240	AATGC	2	10	92171	92180	40 %	20 %	20 %	20 %	17158737
65	NC_003240	AAATG	2	10	92270	92279	60 %	20 %	20 %	0 %	17158737
66	NC_003240	GTAAA	2	10	94193	94202	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003240	ATTAG	2	10	95962	95971	40 %	40 %	20 %	0 %	17158741
68	NC_003240	TGCCA	2	10	97411	97420	20 %	20 %	20 %	40 %	17158742
69	NC_003240	GTTGA	2	10	103730	103739	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003240	TCGAC	2	10	104900	104909	20 %	20 %	20 %	40 %	17158750
71	NC_003240	ACTGT	2	10	107171	107180	20 %	40 %	20 %	20 %	17158752
72	NC_003240	AACCG	2	10	110061	110070	40 %	0 %	20 %	40 %	17158754
73	NC_003240	ACCAG	2	10	111471	111480	40 %	0 %	20 %	40 %	17158755
74	NC_003240	TTTAC	2	10	112027	112036	20 %	60 %	0 %	20 %	17158755
75	NC_003240	GACTT	2	10	112458	112467	20 %	40 %	20 %	20 %	17158755
76	NC_003240	AAACT	2	10	113458	113467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_003240	CGCAA	2	10	115544	115553	40 %	0 %	20 %	40 %	17158758
78	NC_003240	AGCAA	2	10	116659	116668	60 %	0 %	20 %	20 %	17158758
79	NC_003240	TAGCC	2	10	121209	121218	20 %	20 %	20 %	40 %	17158762
80	NC_003240	TAATT	2	10	123241	123250	40 %	60 %	0 %	0 %	17158764
81	NC_003240	GCCTT	2	10	124014	124023	0 %	40 %	20 %	40 %	17158764
82	NC_003240	ACTTT	2	10	127730	127739	20 %	60 %	0 %	20 %	17158767
83	NC_003240	AACCA	2	10	127946	127955	60 %	0 %	0 %	40 %	17158767
84	NC_003240	TTGAA	2	10	128075	128084	40 %	40 %	20 %	0 %	17158767
85	NC_003240	ATGCG	2	10	128252	128261	20 %	20 %	40 %	20 %	17158767
86	NC_003240	CGTTC	2	10	129469	129478	0 %	40 %	20 %	40 %	17158767
87	NC_003240	AATTA	2	10	130248	130257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003240	GTTTG	2	10	130799	130808	0 %	60 %	40 %	0 %	17158768
89	NC_003240	AAAAC	2	10	134176	134185	80 %	0 %	0 %	20 %	17158771
90	NC_003240	CCAGT	2	10	134381	134390	20 %	20 %	20 %	40 %	17158771
91	NC_003240	GTGAT	2	10	134736	134745	20 %	40 %	40 %	0 %	17158771
92	NC_003240	AACGC	2	10	135523	135532	40 %	0 %	20 %	40 %	17158771
93	NC_003240	AACCA	2	10	137041	137050	60 %	0 %	0 %	40 %	17158772
94	NC_003240	AAAAC	2	10	138015	138024	80 %	0 %	0 %	20 %	17158774
95	NC_003240	CAAAC	2	10	143982	143991	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_003240	CTATT	2	10	144365	144374	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_003240	CTCAA	2	10	149189	149198	40 %	20 %	0 %	40 %	17158785
98	NC_003240	GAAGG	2	10	149897	149906	40 %	0 %	60 %	0 %	17158785
99	NC_003240	ACAAT	2	10	150168	150177	60 %	20 %	0 %	20 %	17158785
100	NC_003240	ACTAT	2	10	151311	151320	40 %	40 %	0 %	20 %	17158785
101	NC_003240	CCTCA	2	10	153427	153436	20 %	20 %	0 %	60 %	17158785
102	NC_003240	GTTCC	2	10	154049	154058	0 %	40 %	20 %	40 %	17158785
103	NC_003240	AAGTT	2	10	155883	155892	40 %	40 %	20 %	0 %	17158786
104	NC_003240	ACAAT	2	10	155974	155983	60 %	20 %	0 %	20 %	17158786
105	NC_003240	TACCT	2	10	157832	157841	20 %	40 %	0 %	40 %	17158789
106	NC_003240	GCATT	2	10	159118	159127	20 %	40 %	20 %	20 %	17158790
107	NC_003240	TAAAT	2	10	159382	159391	60 %	40 %	0 %	0 %	17158791
108	NC_003240	CCAAG	2	10	159419	159428	40 %	0 %	20 %	40 %	17158791
109	NC_003240	GGAAA	2	10	160677	160686	60 %	0 %	40 %	0 %	17158792
110	NC_003240	TTGAA	2	10	162993	163002	40 %	40 %	20 %	0 %	17158795
111	NC_003240	TGTCC	2	10	163612	163621	0 %	40 %	20 %	40 %	17158795
112	NC_003240	CTGGA	2	10	164047	164056	20 %	20 %	40 %	20 %	17158795
113	NC_003240	GTTGT	2	10	164167	164176	0 %	60 %	40 %	0 %	17158795
114	NC_003240	ATGAT	2	10	166504	166513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003240	AAACA	2	10	167698	167707	80 %	0 %	0 %	20 %	17158798
116	NC_003240	AAGAT	2	10	168414	168423	60 %	20 %	20 %	0 %	17158799
117	NC_003240	CAATA	2	10	169088	169097	60 %	20 %	0 %	20 %	17158799
118	NC_003240	ACTAC	2	10	169364	169373	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_003240	AGCCA	2	10	173950	173959	40 %	0 %	20 %	40 %	17158804
120	NC_003240	GCAAG	2	10	178934	178943	40 %	0 %	40 %	20 %	17158813
121	NC_003240	CTCAA	2	10	180467	180476	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_003240	TTTCT	2	10	181354	181363	0 %	80 %	0 %	20 %	17158818
123	NC_003240	AACCC	2	10	182622	182631	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_003240	AAATC	2	10	184404	184413	60 %	20 %	0 %	20 %	17158821
125	NC_003240	AAAAC	2	10	184537	184546	80 %	0 %	0 %	20 %	17158821

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.