MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120beta

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003240	GAGAG	2	10	3029	3038	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003240	GCGCT	2	10	3322	3331	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_003240	TATTT	2	10	11541	11550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003240	TCAAA	2	10	11795	11804	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_003240	TCGAG	2	10	11937	11946	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_003240	TCTTT	2	10	14703	14712	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003240	TCAAC	2	10	39400	39409	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_003240	TTAAC	2	10	40655	40664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_003240	ACTGC	2	10	46827	46836	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_003240	TTCAG	2	10	76754	76763	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_003240	GTAAA	2	10	94193	94202	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003240	GTTGA	2	10	103730	103739	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003240	AAACT	2	10	113458	113467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_003240	AATTA	2	10	130248	130257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003240	CAAAC	2	10	143982	143991	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_003240	CTATT	2	10	144365	144374	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003240	ATGAT	2	10	166504	166513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003240	ACTAC	2	10	169364	169373	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_003240	CTCAA	2	10	180467	180476	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_003240	AACCC	2	10	182622	182631	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.