MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120beta

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003240	CCAG	2	8	6465	6472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_003240	TACT	2	8	7525	7532	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_003240	GCTG	2	8	9637	9644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003240	ACAA	2	8	9651	9658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_003240	CTTC	2	8	9661	9668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_003240	AAAT	2	8	11633	11640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003240	AAAT	2	8	13091	13098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003240	ATAA	2	8	13426	13433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003240	TTTA	2	8	13927	13934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003240	GTAA	2	8	14244	14251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003240	ACAA	2	8	14310	14317	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003240	ACTT	2	8	18037	18044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_003240	TTGA	2	8	18055	18062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003240	ATCA	2	8	23658	23665	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_003240	ATTT	2	8	39419	39426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003240	ATTT	2	8	42994	43001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003240	ATTA	2	8	43091	43098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003240	TTGT	2	8	45424	45431	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003240	AAGT	2	8	46221	46228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003240	ATCA	2	8	46781	46788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003240	TGAT	2	8	56443	56450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003240	TTTA	2	8	58959	58966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003240	CAAA	2	8	59059	59066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003240	ATCA	2	8	61688	61695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_003240	ATTA	2	8	61776	61783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003240	AAAT	2	8	64272	64279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003240	ATTT	2	8	66337	66344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003240	TATT	2	8	66348	66355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003240	AAAT	2	8	66369	66376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003240	CAAG	2	8	69183	69190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003240	TAAC	2	8	69235	69242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_003240	ATAC	2	8	73795	73802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003240	TAAA	2	8	73922	73929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003240	AATC	2	8	74440	74447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_003240	AACT	2	8	74888	74895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_003240	TATT	2	8	79202	79209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003240	ACAA	2	8	79351	79358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003240	GCAA	2	8	79389	79396	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_003240	TTGA	2	8	84198	84205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003240	TGAA	2	8	86656	86663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003240	TTTC	2	8	87775	87782	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_003240	TTAG	2	8	87790	87797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003240	TTGC	2	8	88106	88113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_003240	TATC	2	8	89999	90006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_003240	ATTA	2	8	93758	93765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003240	TTGA	2	8	93839	93846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003240	GTAA	2	8	94175	94182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003240	TAAT	2	8	103718	103725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003240	AAGT	2	8	105519	105526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003240	AGCA	2	8	105654	105661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003240	ATAA	2	8	106758	106765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003240	CTTT	2	8	113077	113084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_003240	GTAG	2	8	113348	113355	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003240	TTGA	2	8	113450	113457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003240	AGGA	2	8	113488	113495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003240	ATCT	2	8	117986	117993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_003240	TATT	2	8	120691	120698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003240	ATCT	2	8	120721	120728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_003240	TAGC	2	8	121574	121581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003240	TGTT	2	8	122986	122993	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003240	TTTC	2	8	123113	123120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_003240	ATTC	2	8	126286	126293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_003240	AAGG	2	8	131992	131999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003240	CTTT	2	8	132120	132127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_003240	TTAT	2	8	132986	132993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003240	AGCT	2	8	133670	133677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_003240	AGTT	2	8	133921	133928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003240	TAAA	2	8	137224	137231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003240	ATTT	2	8	137687	137694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003240	TTCT	2	8	139718	139725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003240	TCAT	2	8	139728	139735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_003240	AATC	2	8	140417	140424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_003240	CTTT	2	8	142701	142708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_003240	CAAT	2	8	144094	144101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_003240	AATT	2	8	144387	144394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003240	GTTT	2	8	144441	144448	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003240	TTAC	2	8	144508	144515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_003240	CATT	2	8	146930	146937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_003240	AAGT	2	8	156889	156896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003240	ATTT	2	8	160287	160294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003240	TAGA	2	8	161472	161479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003240	TTTG	2	8	161837	161844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003240	GGTT	2	8	164543	164550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003240	AAGT	2	8	164711	164718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003240	TAAT	2	8	166321	166328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003240	AAAG	2	8	166474	166481	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003240	TAGT	2	8	166519	166526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003240	GCTT	2	8	174222	174229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_003240	CTTA	2	8	174492	174499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003240	CTGA	2	8	174502	174509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_003240	ATTA	2	8	177390	177397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003240	GTAC	2	8	179937	179944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_003240	GAAG	2	8	180968	180975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003240	AACC	2	8	182517	182524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_003240	ATTC	2	8	185416	185423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.