MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120beta

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003240	TG	3	6	152	157	0 %	50 %	50 %	0 %	17158638
2	NC_003240	TG	3	6	1218	1223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003240	GA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	50 %	0 %	17158640
4	NC_003240	AC	3	6	3180	3185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_003240	AT	3	6	3269	3274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003240	CA	3	6	3382	3387	50 %	0 %	0 %	50 %	17158642
7	NC_003240	TA	3	6	4095	4100	50 %	50 %	0 %	0 %	17158642
8	NC_003240	AG	3	6	4933	4938	50 %	0 %	50 %	0 %	17158644
9	NC_003240	AC	3	6	6648	6653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_003240	TG	3	6	6847	6852	0 %	50 %	50 %	0 %	17158645
11	NC_003240	CT	3	6	7126	7131	0 %	50 %	0 %	50 %	17158646
12	NC_003240	CT	3	6	7304	7309	0 %	50 %	0 %	50 %	17158646
13	NC_003240	TA	3	6	7585	7590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003240	TA	3	6	9780	9785	50 %	50 %	0 %	0 %	17158649
15	NC_003240	AT	3	6	10483	10488	50 %	50 %	0 %	0 %	17158650
16	NC_003240	AT	4	8	11591	11598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003240	AT	3	6	13214	13219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003240	AT	3	6	13908	13913	50 %	50 %	0 %	0 %	17158654
19	NC_003240	CT	3	6	14161	14166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_003240	TA	3	6	14509	14514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003240	GA	3	6	14629	14634	50 %	0 %	50 %	0 %	17158655
22	NC_003240	CT	3	6	14942	14947	0 %	50 %	0 %	50 %	17158656
23	NC_003240	CA	3	6	15241	15246	50 %	0 %	0 %	50 %	17158657
24	NC_003240	CT	3	6	15325	15330	0 %	50 %	0 %	50 %	17158657
25	NC_003240	AC	3	6	15440	15445	50 %	0 %	0 %	50 %	17158657
26	NC_003240	AC	3	6	15543	15548	50 %	0 %	0 %	50 %	17158657
27	NC_003240	TA	3	6	15966	15971	50 %	50 %	0 %	0 %	17158658
28	NC_003240	AT	3	6	16173	16178	50 %	50 %	0 %	0 %	17158658
29	NC_003240	TC	3	6	16895	16900	0 %	50 %	0 %	50 %	17158659
30	NC_003240	GT	3	6	18251	18256	0 %	50 %	50 %	0 %	17158661
31	NC_003240	GT	3	6	18734	18739	0 %	50 %	50 %	0 %	17158661
32	NC_003240	AC	3	6	18964	18969	50 %	0 %	0 %	50 %	17158661
33	NC_003240	AC	3	6	19038	19043	50 %	0 %	0 %	50 %	17158661
34	NC_003240	AT	3	6	19881	19886	50 %	50 %	0 %	0 %	17158662
35	NC_003240	TA	3	6	21351	21356	50 %	50 %	0 %	0 %	17158664
36	NC_003240	GT	3	6	22574	22579	0 %	50 %	50 %	0 %	17158664
37	NC_003240	CA	3	6	22851	22856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003240	AT	3	6	23603	23608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003240	TC	3	6	25030	25035	0 %	50 %	0 %	50 %	17158668
40	NC_003240	TA	3	6	27721	27726	50 %	50 %	0 %	0 %	17158668
41	NC_003240	GA	4	8	28271	28278	50 %	0 %	50 %	0 %	17158669
42	NC_003240	CT	3	6	28698	28703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_003240	TC	3	6	29348	29353	0 %	50 %	0 %	50 %	17158670
44	NC_003240	AT	3	6	30725	30730	50 %	50 %	0 %	0 %	17158672
45	NC_003240	CT	3	6	34859	34864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_003240	AC	3	6	34884	34889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_003240	TA	3	6	35256	35261	50 %	50 %	0 %	0 %	17158675
48	NC_003240	TA	3	6	35321	35326	50 %	50 %	0 %	0 %	17158675
49	NC_003240	AT	3	6	36819	36824	50 %	50 %	0 %	0 %	17158676
50	NC_003240	AC	3	6	36837	36842	50 %	0 %	0 %	50 %	17158676
51	NC_003240	AG	4	8	39086	39093	50 %	0 %	50 %	0 %	17158676
52	NC_003240	TA	3	6	39457	39462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003240	TC	3	6	40175	40180	0 %	50 %	0 %	50 %	17158677
54	NC_003240	AG	3	6	42720	42725	50 %	0 %	50 %	0 %	17158680
55	NC_003240	AC	3	6	43110	43115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_003240	AT	3	6	43691	43696	50 %	50 %	0 %	0 %	17158681
57	NC_003240	CA	3	6	44537	44542	50 %	0 %	0 %	50 %	17158682
58	NC_003240	AG	3	6	46247	46252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003240	AG	4	8	46533	46540	50 %	0 %	50 %	0 %	17158686
60	NC_003240	AT	3	6	49492	49497	50 %	50 %	0 %	0 %	17158688
61	NC_003240	AT	3	6	50010	50015	50 %	50 %	0 %	0 %	17158688
62	NC_003240	TG	3	6	50216	50221	0 %	50 %	50 %	0 %	17158688
63	NC_003240	TC	3	6	51045	51050	0 %	50 %	0 %	50 %	17158689
64	NC_003240	TC	3	6	52578	52583	0 %	50 %	0 %	50 %	17158691
65	NC_003240	AT	3	6	53777	53782	50 %	50 %	0 %	0 %	17158694
66	NC_003240	AT	3	6	54285	54290	50 %	50 %	0 %	0 %	17158695
67	NC_003240	TC	3	6	54755	54760	0 %	50 %	0 %	50 %	17158695
68	NC_003240	CA	3	6	55300	55305	50 %	0 %	0 %	50 %	17158696
69	NC_003240	TA	3	6	56833	56838	50 %	50 %	0 %	0 %	17158698
70	NC_003240	GT	3	6	57873	57878	0 %	50 %	50 %	0 %	17158699
71	NC_003240	TA	3	6	59018	59023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003240	AT	3	6	59089	59094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003240	AT	3	6	59114	59119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003240	GA	3	6	59499	59504	50 %	0 %	50 %	0 %	17158701
75	NC_003240	TC	3	6	59872	59877	0 %	50 %	0 %	50 %	17158702
76	NC_003240	AT	3	6	61246	61251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003240	AC	3	6	62056	62061	50 %	0 %	0 %	50 %	17158704
78	NC_003240	TC	3	6	62135	62140	0 %	50 %	0 %	50 %	17158704
79	NC_003240	TC	3	6	62630	62635	0 %	50 %	0 %	50 %	17158704
80	NC_003240	TC	4	8	63475	63482	0 %	50 %	0 %	50 %	17158705
81	NC_003240	CA	3	6	63548	63553	50 %	0 %	0 %	50 %	17158705
82	NC_003240	AG	3	6	64823	64828	50 %	0 %	50 %	0 %	17158706
83	NC_003240	CA	3	6	67999	68004	50 %	0 %	0 %	50 %	17158708
84	NC_003240	CT	4	8	68686	68693	0 %	50 %	0 %	50 %	17158709
85	NC_003240	TC	3	6	68958	68963	0 %	50 %	0 %	50 %	17158709
86	NC_003240	CA	3	6	69167	69172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_003240	TC	3	6	70538	70543	0 %	50 %	0 %	50 %	17158711
88	NC_003240	GC	3	6	71435	71440	0 %	0 %	50 %	50 %	17158712
89	NC_003240	GA	3	6	73054	73059	50 %	0 %	50 %	0 %	17158714
90	NC_003240	AT	3	6	73988	73993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003240	AT	3	6	75017	75022	50 %	50 %	0 %	0 %	17158717
92	NC_003240	AC	3	6	75084	75089	50 %	0 %	0 %	50 %	17158717
93	NC_003240	AT	3	6	75773	75778	50 %	50 %	0 %	0 %	17158717
94	NC_003240	CT	3	6	76231	76236	0 %	50 %	0 %	50 %	17158718
95	NC_003240	GT	3	6	77818	77823	0 %	50 %	50 %	0 %	17158719
96	NC_003240	TA	3	6	79045	79050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003240	AC	3	6	79636	79641	50 %	0 %	0 %	50 %	17158721
98	NC_003240	AG	3	6	79773	79778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003240	GT	3	6	80690	80695	0 %	50 %	50 %	0 %	17158722
100	NC_003240	GC	3	6	80771	80776	0 %	0 %	50 %	50 %	17158722
101	NC_003240	TA	3	6	81326	81331	50 %	50 %	0 %	0 %	17158723
102	NC_003240	CT	3	6	82029	82034	0 %	50 %	0 %	50 %	17158723
103	NC_003240	TC	3	6	82833	82838	0 %	50 %	0 %	50 %	17158725
104	NC_003240	AT	3	6	82950	82955	50 %	50 %	0 %	0 %	17158725
105	NC_003240	TC	3	6	83107	83112	0 %	50 %	0 %	50 %	17158725
106	NC_003240	TG	3	6	83795	83800	0 %	50 %	50 %	0 %	17158726
107	NC_003240	AT	3	6	84381	84386	50 %	50 %	0 %	0 %	17158727
108	NC_003240	AG	3	6	85420	85425	50 %	0 %	50 %	0 %	17158728
109	NC_003240	GA	3	6	87655	87660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003240	TA	3	6	89199	89204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003240	CA	3	6	90016	90021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_003240	TC	3	6	91460	91465	0 %	50 %	0 %	50 %	17158736
113	NC_003240	TC	3	6	91637	91642	0 %	50 %	0 %	50 %	17158736
114	NC_003240	AT	3	6	91709	91714	50 %	50 %	0 %	0 %	17158736
115	NC_003240	AC	4	8	92677	92684	50 %	0 %	0 %	50 %	17158737
116	NC_003240	CA	3	6	92772	92777	50 %	0 %	0 %	50 %	17158737
117	NC_003240	CA	3	6	92863	92868	50 %	0 %	0 %	50 %	17158737
118	NC_003240	CT	3	6	94481	94486	0 %	50 %	0 %	50 %	17158740
119	NC_003240	TC	3	6	98729	98734	0 %	50 %	0 %	50 %	17158744
120	NC_003240	GA	3	6	98738	98743	50 %	0 %	50 %	0 %	17158744
121	NC_003240	TA	3	6	99405	99410	50 %	50 %	0 %	0 %	17158744
122	NC_003240	GT	3	6	99796	99801	0 %	50 %	50 %	0 %	17158745
123	NC_003240	TA	3	6	100055	100060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003240	TC	3	6	100175	100180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_003240	GT	3	6	100271	100276	0 %	50 %	50 %	0 %	17158746
126	NC_003240	TC	3	6	101508	101513	0 %	50 %	0 %	50 %	17158747
127	NC_003240	TA	3	6	103106	103111	50 %	50 %	0 %	0 %	17158749
128	NC_003240	GC	3	6	103947	103952	0 %	0 %	50 %	50 %	17158750
129	NC_003240	GT	3	6	104714	104719	0 %	50 %	50 %	0 %	17158750
130	NC_003240	AC	3	6	106150	106155	50 %	0 %	0 %	50 %	17158751
131	NC_003240	TA	3	6	107368	107373	50 %	50 %	0 %	0 %	17158752
132	NC_003240	CA	3	6	109781	109786	50 %	0 %	0 %	50 %	17158754
133	NC_003240	AT	3	6	113421	113426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003240	TG	3	6	113506	113511	0 %	50 %	50 %	0 %	17158756
135	NC_003240	AC	3	6	114200	114205	50 %	0 %	0 %	50 %	17158757
136	NC_003240	AT	3	6	114999	115004	50 %	50 %	0 %	0 %	17158758
137	NC_003240	AC	3	6	115932	115937	50 %	0 %	0 %	50 %	17158758
138	NC_003240	CT	3	6	116558	116563	0 %	50 %	0 %	50 %	17158758
139	NC_003240	TA	3	6	117357	117362	50 %	50 %	0 %	0 %	17158759
140	NC_003240	AT	3	6	117526	117531	50 %	50 %	0 %	0 %	17158759
141	NC_003240	TA	3	6	117808	117813	50 %	50 %	0 %	0 %	17158759
142	NC_003240	AG	3	6	118888	118893	50 %	0 %	50 %	0 %	17158761
143	NC_003240	AC	3	6	119553	119558	50 %	0 %	0 %	50 %	17158761
144	NC_003240	AT	3	6	120265	120270	50 %	50 %	0 %	0 %	17158761
145	NC_003240	CT	4	8	120548	120555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_003240	AG	3	6	121543	121548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003240	GT	3	6	124719	124724	0 %	50 %	50 %	0 %	17158765
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.