MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120beta

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003240	TG	3	6	152	157	0 %	50 %	50 %	0 %	17158638
2	NC_003240	GA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	50 %	0 %	17158640
3	NC_003240	CA	3	6	3382	3387	50 %	0 %	0 %	50 %	17158642
4	NC_003240	TA	3	6	4095	4100	50 %	50 %	0 %	0 %	17158642
5	NC_003240	AG	3	6	4933	4938	50 %	0 %	50 %	0 %	17158644
6	NC_003240	TG	3	6	6847	6852	0 %	50 %	50 %	0 %	17158645
7	NC_003240	CT	3	6	7126	7131	0 %	50 %	0 %	50 %	17158646
8	NC_003240	CT	3	6	7304	7309	0 %	50 %	0 %	50 %	17158646
9	NC_003240	TA	3	6	9780	9785	50 %	50 %	0 %	0 %	17158649
10	NC_003240	AT	3	6	10483	10488	50 %	50 %	0 %	0 %	17158650
11	NC_003240	AT	3	6	13908	13913	50 %	50 %	0 %	0 %	17158654
12	NC_003240	GA	3	6	14629	14634	50 %	0 %	50 %	0 %	17158655
13	NC_003240	CT	3	6	14942	14947	0 %	50 %	0 %	50 %	17158656
14	NC_003240	CA	3	6	15241	15246	50 %	0 %	0 %	50 %	17158657
15	NC_003240	CT	3	6	15325	15330	0 %	50 %	0 %	50 %	17158657
16	NC_003240	AC	3	6	15440	15445	50 %	0 %	0 %	50 %	17158657
17	NC_003240	AC	3	6	15543	15548	50 %	0 %	0 %	50 %	17158657
18	NC_003240	TA	3	6	15966	15971	50 %	50 %	0 %	0 %	17158658
19	NC_003240	AT	3	6	16173	16178	50 %	50 %	0 %	0 %	17158658
20	NC_003240	TC	3	6	16895	16900	0 %	50 %	0 %	50 %	17158659
21	NC_003240	GT	3	6	18251	18256	0 %	50 %	50 %	0 %	17158661
22	NC_003240	GT	3	6	18734	18739	0 %	50 %	50 %	0 %	17158661
23	NC_003240	AC	3	6	18964	18969	50 %	0 %	0 %	50 %	17158661
24	NC_003240	AC	3	6	19038	19043	50 %	0 %	0 %	50 %	17158661
25	NC_003240	AT	3	6	19881	19886	50 %	50 %	0 %	0 %	17158662
26	NC_003240	TA	3	6	21351	21356	50 %	50 %	0 %	0 %	17158664
27	NC_003240	GT	3	6	22574	22579	0 %	50 %	50 %	0 %	17158664
28	NC_003240	TC	3	6	25030	25035	0 %	50 %	0 %	50 %	17158668
29	NC_003240	TA	3	6	27721	27726	50 %	50 %	0 %	0 %	17158668
30	NC_003240	GA	4	8	28271	28278	50 %	0 %	50 %	0 %	17158669
31	NC_003240	TC	3	6	29348	29353	0 %	50 %	0 %	50 %	17158670
32	NC_003240	AT	3	6	30725	30730	50 %	50 %	0 %	0 %	17158672
33	NC_003240	TA	3	6	35256	35261	50 %	50 %	0 %	0 %	17158675
34	NC_003240	TA	3	6	35321	35326	50 %	50 %	0 %	0 %	17158675
35	NC_003240	AT	3	6	36819	36824	50 %	50 %	0 %	0 %	17158676
36	NC_003240	AC	3	6	36837	36842	50 %	0 %	0 %	50 %	17158676
37	NC_003240	AG	4	8	39086	39093	50 %	0 %	50 %	0 %	17158676
38	NC_003240	TC	3	6	40175	40180	0 %	50 %	0 %	50 %	17158677
39	NC_003240	AG	3	6	42720	42725	50 %	0 %	50 %	0 %	17158680
40	NC_003240	AT	3	6	43691	43696	50 %	50 %	0 %	0 %	17158681
41	NC_003240	CA	3	6	44537	44542	50 %	0 %	0 %	50 %	17158682
42	NC_003240	AG	4	8	46533	46540	50 %	0 %	50 %	0 %	17158686
43	NC_003240	AT	3	6	49492	49497	50 %	50 %	0 %	0 %	17158688
44	NC_003240	AT	3	6	50010	50015	50 %	50 %	0 %	0 %	17158688
45	NC_003240	TG	3	6	50216	50221	0 %	50 %	50 %	0 %	17158688
46	NC_003240	TC	3	6	51045	51050	0 %	50 %	0 %	50 %	17158689
47	NC_003240	TC	3	6	52578	52583	0 %	50 %	0 %	50 %	17158691
48	NC_003240	AT	3	6	53777	53782	50 %	50 %	0 %	0 %	17158694
49	NC_003240	AT	3	6	54285	54290	50 %	50 %	0 %	0 %	17158695
50	NC_003240	TC	3	6	54755	54760	0 %	50 %	0 %	50 %	17158695
51	NC_003240	CA	3	6	55300	55305	50 %	0 %	0 %	50 %	17158696
52	NC_003240	TA	3	6	56833	56838	50 %	50 %	0 %	0 %	17158698
53	NC_003240	GT	3	6	57873	57878	0 %	50 %	50 %	0 %	17158699
54	NC_003240	GA	3	6	59499	59504	50 %	0 %	50 %	0 %	17158701
55	NC_003240	TC	3	6	59872	59877	0 %	50 %	0 %	50 %	17158702
56	NC_003240	AC	3	6	62056	62061	50 %	0 %	0 %	50 %	17158704
57	NC_003240	TC	3	6	62135	62140	0 %	50 %	0 %	50 %	17158704
58	NC_003240	TC	3	6	62630	62635	0 %	50 %	0 %	50 %	17158704
59	NC_003240	TC	4	8	63475	63482	0 %	50 %	0 %	50 %	17158705
60	NC_003240	CA	3	6	63548	63553	50 %	0 %	0 %	50 %	17158705
61	NC_003240	AG	3	6	64823	64828	50 %	0 %	50 %	0 %	17158706
62	NC_003240	CA	3	6	67999	68004	50 %	0 %	0 %	50 %	17158708
63	NC_003240	CT	4	8	68686	68693	0 %	50 %	0 %	50 %	17158709
64	NC_003240	TC	3	6	68958	68963	0 %	50 %	0 %	50 %	17158709
65	NC_003240	TC	3	6	70538	70543	0 %	50 %	0 %	50 %	17158711
66	NC_003240	GC	3	6	71435	71440	0 %	0 %	50 %	50 %	17158712
67	NC_003240	GA	3	6	73054	73059	50 %	0 %	50 %	0 %	17158714
68	NC_003240	AT	3	6	75017	75022	50 %	50 %	0 %	0 %	17158717
69	NC_003240	AC	3	6	75084	75089	50 %	0 %	0 %	50 %	17158717
70	NC_003240	AT	3	6	75773	75778	50 %	50 %	0 %	0 %	17158717
71	NC_003240	CT	3	6	76231	76236	0 %	50 %	0 %	50 %	17158718
72	NC_003240	GT	3	6	77818	77823	0 %	50 %	50 %	0 %	17158719
73	NC_003240	AC	3	6	79636	79641	50 %	0 %	0 %	50 %	17158721
74	NC_003240	GT	3	6	80690	80695	0 %	50 %	50 %	0 %	17158722
75	NC_003240	GC	3	6	80771	80776	0 %	0 %	50 %	50 %	17158722
76	NC_003240	TA	3	6	81326	81331	50 %	50 %	0 %	0 %	17158723
77	NC_003240	CT	3	6	82029	82034	0 %	50 %	0 %	50 %	17158723
78	NC_003240	TC	3	6	82833	82838	0 %	50 %	0 %	50 %	17158725
79	NC_003240	AT	3	6	82950	82955	50 %	50 %	0 %	0 %	17158725
80	NC_003240	TC	3	6	83107	83112	0 %	50 %	0 %	50 %	17158725
81	NC_003240	TG	3	6	83795	83800	0 %	50 %	50 %	0 %	17158726
82	NC_003240	AT	3	6	84381	84386	50 %	50 %	0 %	0 %	17158727
83	NC_003240	AG	3	6	85420	85425	50 %	0 %	50 %	0 %	17158728
84	NC_003240	TC	3	6	91460	91465	0 %	50 %	0 %	50 %	17158736
85	NC_003240	TC	3	6	91637	91642	0 %	50 %	0 %	50 %	17158736
86	NC_003240	AT	3	6	91709	91714	50 %	50 %	0 %	0 %	17158736
87	NC_003240	AC	4	8	92677	92684	50 %	0 %	0 %	50 %	17158737
88	NC_003240	CA	3	6	92772	92777	50 %	0 %	0 %	50 %	17158737
89	NC_003240	CA	3	6	92863	92868	50 %	0 %	0 %	50 %	17158737
90	NC_003240	CT	3	6	94481	94486	0 %	50 %	0 %	50 %	17158740
91	NC_003240	TC	3	6	98729	98734	0 %	50 %	0 %	50 %	17158744
92	NC_003240	GA	3	6	98738	98743	50 %	0 %	50 %	0 %	17158744
93	NC_003240	TA	3	6	99405	99410	50 %	50 %	0 %	0 %	17158744
94	NC_003240	GT	3	6	99796	99801	0 %	50 %	50 %	0 %	17158745
95	NC_003240	GT	3	6	100271	100276	0 %	50 %	50 %	0 %	17158746
96	NC_003240	TC	3	6	101508	101513	0 %	50 %	0 %	50 %	17158747
97	NC_003240	TA	3	6	103106	103111	50 %	50 %	0 %	0 %	17158749
98	NC_003240	GC	3	6	103947	103952	0 %	0 %	50 %	50 %	17158750
99	NC_003240	GT	3	6	104714	104719	0 %	50 %	50 %	0 %	17158750
100	NC_003240	AC	3	6	106150	106155	50 %	0 %	0 %	50 %	17158751
101	NC_003240	TA	3	6	107368	107373	50 %	50 %	0 %	0 %	17158752
102	NC_003240	CA	3	6	109781	109786	50 %	0 %	0 %	50 %	17158754
103	NC_003240	TG	3	6	113506	113511	0 %	50 %	50 %	0 %	17158756
104	NC_003240	AC	3	6	114200	114205	50 %	0 %	0 %	50 %	17158757
105	NC_003240	AT	3	6	114999	115004	50 %	50 %	0 %	0 %	17158758
106	NC_003240	AC	3	6	115932	115937	50 %	0 %	0 %	50 %	17158758
107	NC_003240	CT	3	6	116558	116563	0 %	50 %	0 %	50 %	17158758
108	NC_003240	TA	3	6	117357	117362	50 %	50 %	0 %	0 %	17158759
109	NC_003240	AT	3	6	117526	117531	50 %	50 %	0 %	0 %	17158759
110	NC_003240	TA	3	6	117808	117813	50 %	50 %	0 %	0 %	17158759
111	NC_003240	AG	3	6	118888	118893	50 %	0 %	50 %	0 %	17158761
112	NC_003240	AC	3	6	119553	119558	50 %	0 %	0 %	50 %	17158761
113	NC_003240	AT	3	6	120265	120270	50 %	50 %	0 %	0 %	17158761
114	NC_003240	GT	3	6	124719	124724	0 %	50 %	50 %	0 %	17158765
115	NC_003240	CA	3	6	125224	125229	50 %	0 %	0 %	50 %	17158765
116	NC_003240	TC	3	6	127722	127727	0 %	50 %	0 %	50 %	17158767
117	NC_003240	TC	3	6	130362	130367	0 %	50 %	0 %	50 %	17158768
118	NC_003240	GT	3	6	130556	130561	0 %	50 %	50 %	0 %	17158768
119	NC_003240	CG	3	6	130615	130620	0 %	0 %	50 %	50 %	17158768
120	NC_003240	CG	3	6	130887	130892	0 %	0 %	50 %	50 %	17158768
121	NC_003240	TC	3	6	135506	135511	0 %	50 %	0 %	50 %	17158771
122	NC_003240	GA	3	6	136348	136353	50 %	0 %	50 %	0 %	17158772
123	NC_003240	TA	3	6	146164	146169	50 %	50 %	0 %	0 %	17158783
124	NC_003240	GC	3	6	146998	147003	0 %	0 %	50 %	50 %	17158784
125	NC_003240	AT	3	6	147308	147313	50 %	50 %	0 %	0 %	17158784
126	NC_003240	AT	3	6	147916	147921	50 %	50 %	0 %	0 %	17158785
127	NC_003240	AC	3	6	153775	153780	50 %	0 %	0 %	50 %	17158785
128	NC_003240	GC	3	6	154753	154758	0 %	0 %	50 %	50 %	17158785
129	NC_003240	AT	3	6	156133	156138	50 %	50 %	0 %	0 %	17158786
130	NC_003240	CA	3	6	156460	156465	50 %	0 %	0 %	50 %	17158787
131	NC_003240	AC	3	6	157167	157172	50 %	0 %	0 %	50 %	17158788
132	NC_003240	AG	3	6	157733	157738	50 %	0 %	50 %	0 %	17158788
133	NC_003240	AG	3	6	158032	158037	50 %	0 %	50 %	0 %	17158789
134	NC_003240	TG	3	6	158473	158478	0 %	50 %	50 %	0 %	17158790
135	NC_003240	TA	3	6	158675	158680	50 %	50 %	0 %	0 %	17158790
136	NC_003240	AT	3	6	161228	161233	50 %	50 %	0 %	0 %	17158792
137	NC_003240	CT	3	6	162031	162036	0 %	50 %	0 %	50 %	17158794
138	NC_003240	TA	3	6	162697	162702	50 %	50 %	0 %	0 %	17158795
139	NC_003240	GA	3	6	163133	163138	50 %	0 %	50 %	0 %	17158795
140	NC_003240	TC	3	6	163692	163697	0 %	50 %	0 %	50 %	17158795
141	NC_003240	CT	3	6	165223	165228	0 %	50 %	0 %	50 %	17158796
142	NC_003240	AT	3	6	166152	166157	50 %	50 %	0 %	0 %	17158796
143	NC_003240	CA	3	6	167260	167265	50 %	0 %	0 %	50 %	17158798
144	NC_003240	AT	4	8	168164	168171	50 %	50 %	0 %	0 %	17158799
145	NC_003240	TG	3	6	170083	170088	0 %	50 %	50 %	0 %	17158801
146	NC_003240	TA	3	6	171120	171125	50 %	50 %	0 %	0 %	17158802
147	NC_003240	AT	3	6	172244	172249	50 %	50 %	0 %	0 %	17158802
148	NC_003240	AT	3	6	174093	174098	50 %	50 %	0 %	0 %	17158804
149	NC_003240	AT	3	6	175219	175224	50 %	50 %	0 %	0 %	17158807
150	NC_003240	GT	3	6	175380	175385	0 %	50 %	50 %	0 %	17158807
151	NC_003240	AG	3	6	176071	176076	50 %	0 %	50 %	0 %	17158808
152	NC_003240	GT	3	6	176234	176239	0 %	50 %	50 %	0 %	17158808
153	NC_003240	GA	3	6	176351	176356	50 %	0 %	50 %	0 %	17158808
154	NC_003240	AT	3	6	178046	178051	50 %	50 %	0 %	0 %	17158812
155	NC_003240	AG	3	6	178161	178166	50 %	0 %	50 %	0 %	17158812
156	NC_003240	CT	3	6	179221	179226	0 %	50 %	0 %	50 %	17158814
157	NC_003240	AT	3	6	180053	180058	50 %	50 %	0 %	0 %	17158816
158	NC_003240	CT	3	6	181778	181783	0 %	50 %	0 %	50 %	17158818
159	NC_003240	AG	3	6	184192	184197	50 %	0 %	50 %	0 %	17158821
160	NC_003240	AG	3	6	184501	184506	50 %	0 %	50 %	0 %	17158821
161	NC_003240	TA	3	6	184657	184662	50 %	50 %	0 %	0 %	17158821

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.