MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003212	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_003212	GACTTT	2	12	39406	39417	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_003212	CGCTTC	2	12	74869	74880	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_003212	GCTGTG	2	12	75971	75982	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_003212	AAAAAT	2	12	92507	92518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003212	CAGGTT	2	12	174210	174221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_003212	TTTTCT	2	12	254919	254930	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_003212	ATTCAA	2	12	260511	260522	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_003212	AAGGAA	2	12	262082	262093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003212	TAGGCG	2	12	263736	263747	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_003212	ATTCAA	2	12	266533	266544	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_003212	AAGGAA	2	12	268104	268115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003212	TAGGCG	2	12	269758	269769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_003212	TATAAA	2	12	277747	277758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003212	TTATAT	2	12	286366	286377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003212	TAAAAA	2	12	309605	309616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003212	AGATAT	2	12	336390	336401	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003212	AGGCAT	2	12	362989	363000	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_003212	TAAAAA	2	12	389215	389226	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003212	ATGATA	2	12	396892	396903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003212	AAACAA	2	12	417864	417875	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_003212	TTGTTT	2	12	417891	417902	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003212	AACGAC	2	12	430306	430317	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_003212	CTCCCT	2	12	444682	444693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_003212	TAATTA	2	12	462888	462899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003212	CATCGA	2	12	463092	463103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_003212	ATACAA	2	12	599394	599405	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_003212	AATAAA	2	12	610184	610195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003212	ATCATT	2	12	638462	638473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_003212	AAAATG	2	12	642779	642790	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003212	ATCATT	2	12	672783	672794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_003212	AAATAG	2	12	690144	690155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003212	TTTTAA	2	12	707790	707801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003212	TATAGG	2	12	725292	725303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003212	ACAATT	2	12	770979	770990	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_003212	AAATAG	2	12	879358	879369	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003212	GTAATC	2	12	886164	886175	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_003212	TTACAA	2	12	886182	886193	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_003212	ATGAAA	2	12	894779	894790	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003212	TTCTAA	2	12	904538	904549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_003212	GGGCGA	2	12	912813	912824	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_003212	ATTAAA	2	12	998391	998402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003212	ATATCG	2	12	998516	998527	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_003212	TTGACT	2	12	1020689	1020700	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_003212	ATTACA	2	12	1030395	1030406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_003212	AGGAAG	2	12	1030893	1030904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003212	AAAATA	2	12	1071821	1071832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003212	CTTTTT	2	12	1077021	1077032	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_003212	AAATAA	2	12	1113257	1113268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003212	TTTAGT	2	12	1117787	1117798	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003212	CTTTTT	2	12	1154763	1154774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_003212	ATGGAA	2	12	1163065	1163076	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003212	CTTTTT	2	12	1187502	1187513	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_003212	ATTGTT	2	12	1226245	1226256	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003212	TTTTTA	2	12	1264307	1264318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003212	TAAAAA	2	12	1266831	1266842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003212	AACATA	2	12	1269608	1269619	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_003212	TTTTTA	2	12	1296469	1296480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003212	GTACAA	2	12	1415845	1415856	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_003212	AAATTA	2	12	1442329	1442340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003212	TCCTAT	2	12	1481721	1481732	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_003212	TGAAAA	2	12	1481914	1481925	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003212	AAAGCC	2	12	1511269	1511280	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_003212	CTCTTC	2	12	1593578	1593589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_003212	GGTATA	2	12	1626830	1626841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003212	TAATTA	2	12	1629891	1629902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003212	ATATCT	2	12	1633279	1633290	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_003212	GGTTGT	2	12	1649395	1649406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003212	GAATAA	2	12	1650948	1650959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003212	CAAAAT	2	12	1660728	1660739	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_003212	AAAATA	2	12	1665044	1665055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003212	TAAAAA	2	12	1665951	1665962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003212	AAATAA	2	12	1709957	1709968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003212	CGCCTA	2	12	1795203	1795214	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_003212	TTTCCT	2	12	1796856	1796867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_003212	TTGAAT	2	12	1798428	1798439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003212	CGCCTA	2	12	1905032	1905043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_003212	TTTCCT	2	12	1906685	1906696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_003212	TTGAAT	2	12	1908257	1908268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003212	AAATGG	2	12	1909239	1909250	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003212	TTTTGA	2	12	1926646	1926657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003212	TAAAAA	2	12	1945594	1945605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003212	TAAAAA	2	12	1985788	1985799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003212	AAAAAG	2	12	1999270	1999281	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003212	CTCTAT	2	12	2016995	2017006	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_003212	TCATTT	2	12	2018193	2018204	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_003212	CATTTT	2	12	2026520	2026531	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_003212	GTTTTC	2	12	2045327	2045338	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_003212	AGTATA	2	12	2049045	2049056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003212	AGAAAA	2	12	2073752	2073763	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003212	ATTCCT	2	12	2085725	2085736	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_003212	TCTTTT	2	12	2122207	2122218	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_003212	TGTTTT	2	12	2189285	2189296	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003212	ACATAA	2	12	2232350	2232361	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_003212	GTTTTA	2	12	2243928	2243939	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003212	AATTTT	2	12	2326137	2326148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003212	AAATTG	2	12	2332315	2332326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003212	CTCTGT	2	12	2339148	2339159	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_003212	TTTGTT	2	12	2383679	2383690	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003212	CAATTC	2	12	2431852	2431863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_003212	AATTCA	2	12	2432636	2432647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_003212	AAATTA	2	12	2438855	2438866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003212	TTTTTA	2	12	2450581	2450592	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003212	TAATAC	2	12	2462254	2462265	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_003212	TTCTAC	2	12	2485951	2485962	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_003212	CGCCTA	2	12	2489063	2489074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_003212	TTTCCT	2	12	2490966	2490977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_003212	TTGAAT	2	12	2492538	2492549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003212	ATGTTT	2	12	2541424	2541435	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003212	AATATA	2	12	2587545	2587556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003212	TGCTGT	2	12	2615494	2615505	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_003212	TATCTG	2	12	2615595	2615606	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_003212	TCTTCA	2	12	2615729	2615740	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_003212	TTACAT	2	12	2629901	2629912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_003212	TATTTA	2	12	2685944	2685955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003212	TTAAAA	2	12	2689652	2689663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003212	ATCCCA	2	12	2697147	2697158	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_003212	TTTTTA	2	12	2708984	2708995	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003212	CGCCTA	2	12	2760058	2760069	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_003212	TTTCCT	2	12	2761961	2761972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_003212	TTGAAT	2	12	2763533	2763544	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003212	CCTCTT	2	12	2812463	2812474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_003212	TCTAAT	2	12	2833937	2833948	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_003212	TTTTAT	2	12	2895038	2895049	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003212	TTTCAT	2	12	2911222	2911233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_003212	TAAAAA	2	12	2953580	2953591	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.