MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 1222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003212	AACAAA	2	12	1031	1042	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	16799080
2	NC_003212	TATGGG	2	12	3676	3687	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16799082
3	NC_003212	TGAAAT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16799085
4	NC_003212	TTTGAT	2	12	6604	6615	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	16799085
5	NC_003212	TCGTAC	2	12	6621	6632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16799085
6	NC_003212	TTATAT	2	12	7638	7649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799085
7	NC_003212	TGAAGA	2	12	9550	9561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16799086
8	NC_003212	TTAATG	2	12	10349	10360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16799086
9	NC_003212	AGCAAA	2	12	14089	14100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16799090
10	NC_003212	TGAAAA	2	12	14713	14724	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799090
11	NC_003212	ATTTTC	2	12	19877	19888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16799094
12	NC_003212	TCACCA	2	12	31486	31497	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	16799108
13	NC_003212	GAAACG	2	12	33167	33178	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16799109
14	NC_003212	CGATTA	2	12	36916	36927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16799112
15	NC_003212	GTTGCA	2	12	37134	37145	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16799112
16	NC_003212	TGGCGG	2	12	42364	42375	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	16799117
17	NC_003212	TCAAAA	2	12	42487	42498	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16799117
18	NC_003212	AGAAAA	2	12	43405	43416	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16799119
19	NC_003212	ACAGTG	2	12	44072	44083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16799120
20	NC_003212	AAAAAT	2	12	44936	44947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	16799122
21	NC_003212	GCAGAA	2	12	48861	48872	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16799124
22	NC_003212	AGGTAA	2	12	48952	48963	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16799125
23	NC_003212	AGCAGA	2	12	53478	53489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16799129
24	NC_003212	AGCGAT	2	12	57223	57234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16799132
25	NC_003212	TAACGA	2	12	59055	59066	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16799133
26	NC_003212	AGAAAA	2	12	68406	68417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16799141
27	NC_003212	ATTTGA	2	12	75773	75784	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16799148
28	NC_003212	GTAAAA	2	12	77569	77580	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799150
29	NC_003212	TGCAAA	2	12	78022	78033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16799150
30	NC_003212	CAGCAT	2	12	83499	83510	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16799162
31	NC_003212	GAGTGG	2	12	85044	85055	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	16799164
32	NC_003212	ATCAGA	2	12	85745	85756	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16799164
33	NC_003212	TGAAGA	2	12	87922	87933	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16799168
34	NC_003212	GAAACA	2	12	89285	89296	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16799172
35	NC_003212	GAAAAA	2	12	91548	91559	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16799178
36	NC_003212	AAAAAC	2	12	93103	93114	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	16799182
37	NC_003212	GGAAGG	2	12	95507	95518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16799184
38	NC_003212	ATGGTA	2	12	99091	99102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799187
39	NC_003212	TGATAG	2	12	100162	100173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799190
40	NC_003212	TCACAC	2	12	100568	100579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	16799191
41	NC_003212	TCTTTT	2	12	100842	100853	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	16799192
42	NC_003212	AAAAAT	2	12	101080	101091	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	16799192
43	NC_003212	GAAAAA	2	12	106086	106097	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16799196
44	NC_003212	AACTGA	2	12	106110	106121	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16799196
45	NC_003212	TCAAAT	2	12	106134	106145	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16799196
46	NC_003212	TATAAG	2	12	108729	108740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16799197
47	NC_003212	GAAATC	2	12	109008	109019	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16799197
48	NC_003212	TTGATA	2	12	109674	109685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16799198
49	NC_003212	AGATAA	2	12	111264	111275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799200
50	NC_003212	ATGAAG	2	12	115716	115727	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16799207
51	NC_003212	GATATT	2	12	117913	117924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16799209
52	NC_003212	ACAAAT	3	18	118054	118071	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16799209
53	NC_003212	ACCTGA	2	12	120546	120557	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16799209
54	NC_003212	AAGATA	2	12	121247	121258	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799209
55	NC_003212	AAAGAA	2	12	123040	123051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16799209
56	NC_003212	TAACGG	2	12	124547	124558	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16799210
57	NC_003212	GCGATT	2	12	129242	129253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16799215
58	NC_003212	ACCAGA	2	12	129379	129390	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	16799215
59	NC_003212	ACGTAT	2	12	136074	136085	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16799218
60	NC_003212	AGTAAC	2	12	136241	136252	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16799218
61	NC_003212	GTAGAA	2	12	136467	136478	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16799218
62	NC_003212	GCAATT	2	12	139836	139847	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16799221
63	NC_003212	TTGTAG	2	12	144815	144826	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16799228
64	NC_003212	GAAAAT	2	12	149123	149134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799231
65	NC_003212	TAAAAT	2	12	151640	151651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799233
66	NC_003212	CAAAAT	2	12	151781	151792	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16799233
67	NC_003212	AGTTTT	2	12	157388	157399	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	16799240
68	NC_003212	CATGAA	2	12	164697	164708	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16799250
69	NC_003212	GTAGTT	2	12	166850	166861	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16799254
70	NC_003212	TCGATT	2	12	169496	169507	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16799255
71	NC_003212	TAGAAA	2	12	169596	169607	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799255
72	NC_003212	TAGAAG	2	12	170124	170135	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16799256
73	NC_003212	TAAAAA	2	12	178756	178767	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	16799265
74	NC_003212	GAAATT	2	12	185940	185951	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16799272
75	NC_003212	AGATTT	2	12	195821	195832	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16799280
76	NC_003212	ATTTTC	2	12	198074	198085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16799281
77	NC_003212	GTAAAA	2	12	200050	200061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799283
78	NC_003212	TTTTTA	2	12	203136	203147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	16799289
79	NC_003212	TTTCAC	2	12	203709	203720	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16799289
80	NC_003212	AAAGTA	2	12	204349	204360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799290
81	NC_003212	AAGCAA	2	12	207880	207891	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16799293
82	NC_003212	AAAGAT	2	12	213205	213216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799297
83	NC_003212	ACAATT	2	12	214535	214546	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16799298
84	NC_003212	AAAAGA	2	12	215080	215091	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16799298
85	NC_003212	AAAGAA	2	12	218347	218358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16799299
86	NC_003212	CTCCAA	2	12	222188	222199	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	16799301
87	NC_003212	CATTGA	2	12	225577	225588	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16799305
88	NC_003212	TTCTTT	2	12	237608	237619	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	16799319
89	NC_003212	ACCAGA	2	12	239352	239363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	16799320
90	NC_003212	GAAAAA	2	12	239698	239709	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16799321
91	NC_003212	TTTATC	2	12	239939	239950	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16799321
92	NC_003212	AATTGT	2	12	241207	241218	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16799323
93	NC_003212	ATCCAG	2	12	241731	241742	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16799323
94	NC_003212	GAACAA	2	12	244154	244165	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16799323
95	NC_003212	TGTCGG	2	12	250674	250685	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	16799329
96	NC_003212	GATATT	2	12	257202	257213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16799335
97	NC_003212	ACCAGA	2	12	258221	258232	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	16799336
98	NC_003212	TAGGTA	2	12	259987	259998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799337
99	NC_003212	ACTTAC	2	12	276610	276621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799342
100	NC_003212	CGGATA	2	12	279750	279761	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16799345
101	NC_003212	GTACGT	2	12	280073	280084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16799346
102	NC_003212	AAAGGT	2	12	281393	281404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16799346
103	NC_003212	GGTGCG	2	12	282361	282372	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	16799347
104	NC_003212	AAAGGA	2	12	282528	282539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799347
105	NC_003212	AAAAGA	2	12	283905	283916	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16799348
106	NC_003212	AGTTGT	2	12	285280	285291	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16799351
107	NC_003212	AAGTTG	2	12	285342	285353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799351
108	NC_003212	ACAGTA	2	12	286695	286706	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16799354
109	NC_003212	AAAACA	2	12	287070	287081	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	16799355
110	NC_003212	CTGTAG	2	12	290195	290206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16799360
111	NC_003212	TTCGTG	2	12	298590	298601	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	16799363
112	NC_003212	AGTTTG	2	12	303389	303400	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16799367
113	NC_003212	GTAAAT	2	12	304163	304174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16799367
114	NC_003212	TACAAG	2	12	306000	306011	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16799370
115	NC_003212	CGAAAT	2	12	306054	306065	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16799370
116	NC_003212	TCTTTT	2	12	310246	310257	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	16799373
117	NC_003212	TGCAGA	2	12	311691	311702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16799374
118	NC_003212	ATCAAT	2	12	312653	312664	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16799375
119	NC_003212	ATGAAA	2	12	313012	313023	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799376
120	NC_003212	TGAAAA	2	12	313202	313213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16799376
121	NC_003212	CTTTTG	2	12	314335	314346	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	16799378
122	NC_003212	CTTTTA	2	12	314869	314880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16799378
123	NC_003212	CGGCTT	2	12	315022	315033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799378
124	NC_003212	TCACCA	2	12	315268	315279	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	16799379
125	NC_003212	ACGTTG	2	12	317747	317758	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16799381
126	NC_003212	ATTCTT	2	12	322101	322112	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16799385
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131	NC_003212	GAACCA	2	12	342475	342486	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	16799403
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234	NC_003212	ACAATT	2	12	620841	620852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16799667
235	NC_003212	ACTTGA	2	12	621716	621727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16799667
236	NC_003212	ATTGAT	2	12	626255	626266	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16799671
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343	NC_003212	GTTTTC	2	12	873913	873924	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	16799913
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347	NC_003212	TTTGGA	2	12	878387	878398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16799916
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349	NC_003212	TTTAGA	2	12	881696	881707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16799922
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458	NC_003212	AGGCAG	2	12	1190350	1190361	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16800250
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461	NC_003212	GTAGAA	2	12	1193635	1193646	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16800254
462	NC_003212	ATTGTC	2	12	1199289	1199300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16800256
463	NC_003212	TTAAAC	2	12	1199635	1199646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16800256
464	NC_003212	TTGGGA	2	12	1200973	1200984	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16800258
465	NC_003212	CAAATT	2	12	1201857	1201868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16800258
466	NC_003212	GGTCAA	2	12	1202409	1202420	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16800258
467	NC_003212	GCCATT	2	12	1209267	1209278	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16800264
468	NC_003212	ATTGTT	2	12	1213186	1213197	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	16800267
469	NC_003212	AGTAGA	2	12	1215132	1215143	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16800269
470	NC_003212	TCGCAT	2	12	1217335	1217346	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16800272
471	NC_003212	TTTAAA	2	12	1220681	1220692	50 %	50 %	0 %	0 %	16800273
472	NC_003212	AAATCC	2	12	1222403	1222414	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16800273
473	NC_003212	CTTTTA	2	12	1224985	1224996	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16800276
474	NC_003212	TACAGA	2	12	1228105	1228116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16800280
475	NC_003212	TTTTGG	2	12	1229404	1229415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16800281
476	NC_003212	TTCTTT	2	12	1237924	1237935	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	16800291
477	NC_003212	CCCCAA	2	12	1238937	1238948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16800292
478	NC_003212	GAAACG	2	12	1238972	1238983	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16800292
479	NC_003212	ATTTAC	2	12	1241535	1241546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16800295
480	NC_003212	AGCGGA	2	12	1241894	1241905	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16800295
481	NC_003212	TCATTT	2	12	1244075	1244086	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16800297
482	NC_003212	TTATTT	2	12	1247083	1247094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	16800300
483	NC_003212	AAAAGA	2	12	1255099	1255110	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16800312
484	NC_003212	TAGATG	2	12	1255568	1255579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16800313
485	NC_003212	ACAGAA	2	12	1255693	1255704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16800313
486	NC_003212	TTAATC	2	12	1256679	1256690	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16800314
487	NC_003212	AAAGCA	2	12	1258732	1258743	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16800318
488	NC_003212	CTTTGG	2	12	1271999	1272010	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	16800337
489	NC_003212	CATTGT	2	12	1274170	1274181	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16800338
490	NC_003212	AACACT	2	12	1281276	1281287	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16800348
491	NC_003212	GGAAAG	2	12	1287128	1287139	50 %	0 %	50 %	0 %	16800352
492	NC_003212	TGAAAT	2	12	1288207	1288218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16800354
493	NC_003212	AAATTG	2	12	1290513	1290524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16800357
494	NC_003212	TATAAA	2	12	1291490	1291501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16800359
495	NC_003212	ATTTGA	2	12	1291748	1291759	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16800360
496	NC_003212	AAAGTT	2	12	1293848	1293859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16800364
497	NC_003212	GTTTGA	2	12	1299504	1299515	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16800373
498	NC_003212	GCTGAA	2	12	1300891	1300902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16800374
499	NC_003212	AACACT	2	12	1303607	1303618	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16800377
500	NC_003212	GCAAAA	2	12	1307409	1307420	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16800382

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