MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 2143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003212	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	16799081
2	NC_003212	TCATT	2	10	6863	6872	20 %	60 %	0 %	20 %	16799085
3	NC_003212	AGGTT	2	10	11291	11300	20 %	40 %	40 %	0 %	16799087
4	NC_003212	TTGAT	2	10	11756	11765	20 %	60 %	20 %	0 %	16799087
5	NC_003212	TTTTA	2	10	12429	12438	20 %	80 %	0 %	0 %	16799088
6	NC_003212	GTATG	2	10	13372	13381	20 %	40 %	40 %	0 %	16799089
7	NC_003212	TTTTA	2	10	14008	14017	20 %	80 %	0 %	0 %	16799090
8	NC_003212	AAAGA	2	10	14387	14396	80 %	0 %	20 %	0 %	16799090
9	NC_003212	CTGTT	2	10	16694	16703	0 %	60 %	20 %	20 %	16799092
10	NC_003212	ATGAA	2	10	17249	17258	60 %	20 %	20 %	0 %	16799092
11	NC_003212	GAATG	2	10	18990	18999	40 %	20 %	40 %	0 %	16799093
12	NC_003212	ATTAA	2	10	20658	20667	60 %	40 %	0 %	0 %	16799096
13	NC_003212	AAATC	2	10	21119	21128	60 %	20 %	0 %	20 %	16799096
14	NC_003212	ATTTT	2	10	21896	21905	20 %	80 %	0 %	0 %	16799097
15	NC_003212	GACCA	2	10	21981	21990	40 %	0 %	20 %	40 %	16799097
16	NC_003212	TGGAT	2	10	22240	22249	20 %	40 %	40 %	0 %	16799097
17	NC_003212	GAAAA	2	10	22777	22786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003212	GAAAA	2	10	23689	23698	80 %	0 %	20 %	0 %	16799098
19	NC_003212	ATTAT	2	10	23726	23735	40 %	60 %	0 %	0 %	16799099
20	NC_003212	CGAAT	2	10	27090	27099	40 %	20 %	20 %	20 %	16799104
21	NC_003212	GAAAA	2	10	27918	27927	80 %	0 %	20 %	0 %	16799105
22	NC_003212	AATAA	2	10	30434	30443	80 %	20 %	0 %	0 %	16799106
23	NC_003212	TTCGT	2	10	31638	31647	0 %	60 %	20 %	20 %	16799108
24	NC_003212	CAATC	2	10	32523	32532	40 %	20 %	0 %	40 %	16799109
25	NC_003212	TGAAA	2	10	32986	32995	60 %	20 %	20 %	0 %	16799109
26	NC_003212	ATTTT	2	10	35338	35347	20 %	80 %	0 %	0 %	16799111
27	NC_003212	TTGCG	2	10	36394	36403	0 %	40 %	40 %	20 %	16799111
28	NC_003212	AAAAC	2	10	39216	39225	80 %	0 %	0 %	20 %	16799113
29	NC_003212	ATTTT	2	10	39470	39479	20 %	80 %	0 %	0 %	16799114
30	NC_003212	AAATG	2	10	40593	40602	60 %	20 %	20 %	0 %	16799115
31	NC_003212	TGGTC	2	10	40792	40801	0 %	40 %	40 %	20 %	16799115
32	NC_003212	GTAGA	2	10	41680	41689	40 %	20 %	40 %	0 %	16799116
33	NC_003212	TTACT	2	10	42665	42674	20 %	60 %	0 %	20 %	16799118
34	NC_003212	GAAAT	2	10	43325	43334	60 %	20 %	20 %	0 %	16799119
35	NC_003212	TAAAA	2	10	44674	44683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003212	TGCTA	2	10	44848	44857	20 %	40 %	20 %	20 %	16799122
37	NC_003212	TTTTA	2	10	45016	45025	20 %	80 %	0 %	0 %	16799122
38	NC_003212	GTTAA	2	10	45641	45650	40 %	40 %	20 %	0 %	16799122
39	NC_003212	TTATG	2	10	46881	46890	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003212	CAAAA	2	10	47716	47725	80 %	0 %	0 %	20 %	16799124
41	NC_003212	TTTTA	2	10	50793	50802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003212	AAATG	2	10	54357	54366	60 %	20 %	20 %	0 %	16799129
43	NC_003212	GTTAT	2	10	55727	55736	20 %	60 %	20 %	0 %	16799129
44	NC_003212	ACGCC	2	10	59191	59200	20 %	0 %	20 %	60 %	16799133
45	NC_003212	AACTG	2	10	59224	59233	40 %	20 %	20 %	20 %	16799133
46	NC_003212	GAGAG	2	10	63157	63166	40 %	0 %	60 %	0 %	16799134
47	NC_003212	GCAAA	2	10	64339	64348	60 %	0 %	20 %	20 %	16799137
48	NC_003212	CAATA	2	10	64404	64413	60 %	20 %	0 %	20 %	16799137
49	NC_003212	GCCTT	2	10	65207	65216	0 %	40 %	20 %	40 %	16799138
50	NC_003212	CAAAA	2	10	65584	65593	80 %	0 %	0 %	20 %	16799138
51	NC_003212	TAAAA	2	10	67412	67421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003212	GCCTT	2	10	69427	69436	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_003212	CAAAA	2	10	69804	69813	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_003212	CGGCG	2	10	73481	73490	0 %	0 %	60 %	40 %	16799146
55	NC_003212	TCAAG	2	10	74376	74385	40 %	20 %	20 %	20 %	16799147
56	NC_003212	CAATT	2	10	76791	76800	40 %	40 %	0 %	20 %	16799149
57	NC_003212	TTTTC	2	10	76961	76970	0 %	80 %	0 %	20 %	16799149
58	NC_003212	AAAAG	2	10	77452	77461	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003212	ATGCC	2	10	78042	78051	20 %	20 %	20 %	40 %	16799150
60	NC_003212	GTTCA	2	10	78325	78334	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_003212	TTCTT	2	10	78688	78697	0 %	80 %	0 %	20 %	16799151
62	NC_003212	GTGAA	2	10	80581	80590	40 %	20 %	40 %	0 %	16799156
63	NC_003212	AGCTA	2	10	81587	81596	40 %	20 %	20 %	20 %	16799158
64	NC_003212	ACTTT	2	10	81806	81815	20 %	60 %	0 %	20 %	16799158
65	NC_003212	GAAAG	2	10	82089	82098	60 %	0 %	40 %	0 %	16799159
66	NC_003212	AAAAG	2	10	83137	83146	80 %	0 %	20 %	0 %	16799162
67	NC_003212	AAAGC	2	10	83592	83601	60 %	0 %	20 %	20 %	16799162
68	NC_003212	AGAAA	2	10	85772	85781	80 %	0 %	20 %	0 %	16799164
69	NC_003212	TTTAG	2	10	86866	86875	20 %	60 %	20 %	0 %	16799166
70	NC_003212	AGAAA	2	10	87015	87024	80 %	0 %	20 %	0 %	16799166
71	NC_003212	TTGAT	2	10	88059	88068	20 %	60 %	20 %	0 %	16799168
72	NC_003212	AAAAT	2	10	92401	92410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003212	GGTTA	2	10	92626	92635	20 %	40 %	40 %	0 %	16799180
74	NC_003212	TTTAT	2	10	93053	93062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003212	GCAAT	2	10	93294	93303	40 %	20 %	20 %	20 %	16799182
76	NC_003212	AGAAA	2	10	93765	93774	80 %	0 %	20 %	0 %	16799183
77	NC_003212	CTAAA	2	10	93971	93980	60 %	20 %	0 %	20 %	16799183
78	NC_003212	AACTT	2	10	95692	95701	40 %	40 %	0 %	20 %	16799184
79	NC_003212	TTGAT	2	10	95753	95762	20 %	60 %	20 %	0 %	16799184
80	NC_003212	AAGCA	2	10	97777	97786	60 %	0 %	20 %	20 %	16799185
81	NC_003212	ATCAA	2	10	100138	100147	60 %	20 %	0 %	20 %	16799190
82	NC_003212	TTGCT	2	10	100780	100789	0 %	60 %	20 %	20 %	16799192
83	NC_003212	AACGA	2	10	102823	102832	60 %	0 %	20 %	20 %	16799195
84	NC_003212	TGATT	2	10	104691	104700	20 %	60 %	20 %	0 %	16799196
85	NC_003212	AGCAA	2	10	105924	105933	60 %	0 %	20 %	20 %	16799196
86	NC_003212	AATCA	2	10	107659	107668	60 %	20 %	0 %	20 %	16799196
87	NC_003212	GGTGC	2	10	107923	107932	0 %	20 %	60 %	20 %	16799196
88	NC_003212	TAAAA	2	10	114243	114252	80 %	20 %	0 %	0 %	16799205
89	NC_003212	CAACA	2	10	114895	114904	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_003212	AGCAG	2	10	119232	119241	40 %	0 %	40 %	20 %	16799209
91	NC_003212	TCAAA	2	10	120186	120195	60 %	20 %	0 %	20 %	16799209
92	NC_003212	GTAAT	2	10	120572	120581	40 %	40 %	20 %	0 %	16799209
93	NC_003212	AAAAG	2	10	123637	123646	80 %	0 %	20 %	0 %	16799210
94	NC_003212	TGAAA	2	10	124619	124628	60 %	20 %	20 %	0 %	16799210
95	NC_003212	AAACA	2	10	127956	127965	80 %	0 %	0 %	20 %	16799213
96	NC_003212	GAAGA	2	10	128411	128420	60 %	0 %	40 %	0 %	16799214
97	NC_003212	GTTTT	2	10	129114	129123	0 %	80 %	20 %	0 %	16799215
98	NC_003212	TGAGT	2	10	130225	130234	20 %	40 %	40 %	0 %	16799215
99	NC_003212	AACAA	2	10	131961	131970	80 %	0 %	0 %	20 %	16799218
100	NC_003212	AAATT	2	10	133081	133090	60 %	40 %	0 %	0 %	16799218
101	NC_003212	ATTAA	2	10	133695	133704	60 %	40 %	0 %	0 %	16799218
102	NC_003212	TATCA	2	10	144248	144257	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_003212	TGTTA	2	10	144288	144297	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003212	AGAAA	2	10	145939	145948	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003212	AAAAG	2	10	146937	146946	80 %	0 %	20 %	0 %	16799230
106	NC_003212	TTGAA	2	10	149519	149528	40 %	40 %	20 %	0 %	16799231
107	NC_003212	GAAAT	2	10	150122	150131	60 %	20 %	20 %	0 %	16799232
108	NC_003212	GAATT	2	10	150763	150772	40 %	40 %	20 %	0 %	16799232
109	NC_003212	TAGAA	2	10	154355	154364	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003212	TTTTA	2	10	154768	154777	20 %	80 %	0 %	0 %	16799235
111	NC_003212	TTCCA	2	10	155536	155545	20 %	40 %	0 %	40 %	16799236
112	NC_003212	CATTC	2	10	156288	156297	20 %	40 %	0 %	40 %	16799237
113	NC_003212	TTTTA	2	10	156689	156698	20 %	80 %	0 %	0 %	16799238
114	NC_003212	AAAAG	2	10	156960	156969	80 %	0 %	20 %	0 %	16799239
115	NC_003212	AAAGT	2	10	157998	158007	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003212	AACAA	2	10	162597	162606	80 %	0 %	0 %	20 %	16799247
117	NC_003212	AGTTT	2	10	164422	164431	20 %	60 %	20 %	0 %	16799249
118	NC_003212	GATGC	2	10	164928	164937	20 %	20 %	40 %	20 %	16799250
119	NC_003212	TGTAA	2	10	165502	165511	40 %	40 %	20 %	0 %	16799251
120	NC_003212	AATTT	2	10	165884	165893	40 %	60 %	0 %	0 %	16799252
121	NC_003212	TGCTG	2	10	166316	166325	0 %	40 %	40 %	20 %	16799253
122	NC_003212	TTGTT	2	10	168250	168259	0 %	80 %	20 %	0 %	16799254
123	NC_003212	AAAAT	2	10	171556	171565	80 %	20 %	0 %	0 %	16799256
124	NC_003212	AACTT	2	10	172865	172874	40 %	40 %	0 %	20 %	16799259
125	NC_003212	ACAAA	2	10	172967	172976	80 %	0 %	0 %	20 %	16799259
126	NC_003212	ACTTG	2	10	173761	173770	20 %	40 %	20 %	20 %	16799259
127	NC_003212	TATTT	2	10	174454	174463	20 %	80 %	0 %	0 %	16799260
128	NC_003212	TTGGT	2	10	174557	174566	0 %	60 %	40 %	0 %	16799260
129	NC_003212	TTGGT	2	10	174608	174617	0 %	60 %	40 %	0 %	16799260
130	NC_003212	ATGCG	2	10	177153	177162	20 %	20 %	40 %	20 %	16799264
131	NC_003212	TATGA	2	10	177538	177547	40 %	40 %	20 %	0 %	16799264
132	NC_003212	AGATA	2	10	177939	177948	60 %	20 %	20 %	0 %	16799264
133	NC_003212	TATTG	2	10	178605	178614	20 %	60 %	20 %	0 %	16799265
134	NC_003212	ACTTT	2	10	178962	178971	20 %	60 %	0 %	20 %	16799266
135	NC_003212	ACGGC	2	10	180417	180426	20 %	0 %	40 %	40 %	16799267
136	NC_003212	TTTAA	2	10	180489	180498	40 %	60 %	0 %	0 %	16799267
137	NC_003212	AATTT	2	10	180675	180684	40 %	60 %	0 %	0 %	16799267
138	NC_003212	GATAA	2	10	180842	180851	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003212	ATTTC	2	10	182031	182040	20 %	60 %	0 %	20 %	16799269
140	NC_003212	AGGTC	2	10	182256	182265	20 %	20 %	40 %	20 %	16799269
141	NC_003212	AATAA	2	10	185635	185644	80 %	20 %	0 %	0 %	16799272
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143	NC_003212	ATGAA	2	10	188076	188085	60 %	20 %	20 %	0 %	16799274
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193	NC_003212	GAAAA	2	10	255473	255482	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_003212	TTGGT	2	10	256364	256373	0 %	60 %	40 %	0 %	16799333
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259	NC_003212	ATTGT	2	10	362298	362307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_003212	TGAAA	2	10	363022	363031	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_003212	GCCAA	2	10	363839	363848	40 %	0 %	20 %	40 %	16799427
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265	NC_003212	TTATG	2	10	369525	369534	20 %	60 %	20 %	0 %	16799430
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272	NC_003212	GGTTG	2	10	377279	377288	0 %	40 %	60 %	0 %	16799438
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