MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 1180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003212	TAAT	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003212	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003212	AATA	2	8	4513	4520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003212	AAAG	2	8	6007	6014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003212	AAAT	2	8	15894	15901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003212	TTAT	2	8	22751	22758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003212	AGGA	2	8	27854	27861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003212	CCTT	2	8	32153	32160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003212	AAGT	2	8	39269	39276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003212	GTAA	2	8	39319	39326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003212	ATAA	2	8	39356	39363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003212	AGTG	2	8	39433	39440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003212	GCTC	2	8	41581	41588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_003212	ATTT	2	8	42882	42889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003212	GTTA	2	8	46870	46877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003212	TTTG	2	8	52450	52457	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003212	CATA	2	8	52936	52943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_003212	AGAA	2	8	67229	67236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003212	AATA	2	8	67497	67504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003212	ATGA	2	8	68762	68769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003212	CTGG	2	8	68825	68832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_003212	AACC	2	8	69021	69028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_003212	AAAC	2	8	69120	69127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003212	ATTG	2	8	70407	70414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003212	TAGC	2	8	71502	71509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_003212	TGTA	2	8	78143	78150	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003212	TGAA	2	8	78273	78280	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003212	TAAA	2	8	78490	78497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003212	GTTT	2	8	79107	79114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003212	ATTT	2	8	86098	86105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003212	AGAA	2	8	86227	86234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003212	GAAG	2	8	88355	88362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003212	TGTT	2	8	92484	92491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003212	AAAG	2	8	101733	101740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003212	TGAA	2	8	114838	114845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003212	GACA	2	8	115284	115291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_003212	TTGA	2	8	116090	116097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003212	TTAA	2	8	116301	116308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003212	AATG	2	8	117161	117168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003212	ATTA	2	8	131407	131414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003212	AGGT	2	8	137480	137487	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003212	AAAT	2	8	138525	138532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003212	AACA	2	8	141870	141877	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_003212	ATTA	2	8	143918	143925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003212	CTTT	2	8	145866	145873	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003212	GAAT	2	8	145907	145914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003212	GGAG	2	8	145923	145930	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003212	AAAT	2	8	156856	156863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003212	TTGG	2	8	170009	170016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003212	ACCA	2	8	170045	170052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_003212	TTTA	2	8	187634	187641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003212	TAAA	2	8	187794	187801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003212	TTAA	2	8	193125	193132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003212	GAAT	2	8	202943	202950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003212	TACT	2	8	209802	209809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003212	AAGT	2	8	209824	209831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003212	GCTA	2	8	225848	225855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_003212	TATT	2	8	231530	231537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003212	TTGC	2	8	231903	231910	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003212	AAAT	2	8	232968	232975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003212	CAAA	2	8	233002	233009	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_003212	GTAG	2	8	233043	233050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003212	TCAT	2	8	233098	233105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003212	TGTT	2	8	235830	235837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003212	ATAA	2	8	239407	239414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003212	TTTG	2	8	239431	239438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003212	TCTT	2	8	240786	240793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_003212	GAAT	2	8	240824	240831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003212	ACAA	2	8	246386	246393	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_003212	GGGA	2	8	246532	246539	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003212	GAAG	2	8	247604	247611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003212	AACA	2	8	249577	249584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_003212	AATA	2	8	249726	249733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003212	AATT	2	8	253850	253857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003212	AAAT	2	8	254872	254879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003212	ATTC	2	8	255373	255380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_003212	AAAC	2	8	260438	260445	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_003212	CGAA	2	8	260592	260599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_003212	CCTG	2	8	260659	260666	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_003212	ATGG	2	8	261775	261782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003212	AGCC	2	8	261993	262000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_003212	TGTT	2	8	262155	262162	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003212	AGAA	2	8	262547	262554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003212	AAAG	2	8	262650	262657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003212	TACT	2	8	263089	263096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_003212	CACG	2	8	263110	263117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_003212	AGTG	2	8	263849	263856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003212	GGAA	2	8	263903	263910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003212	TAGG	2	8	264477	264484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003212	ATGG	2	8	264660	264667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003212	ATCG	2	8	265238	265245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_003212	AAAC	2	8	266460	266467	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_003212	CGAA	2	8	266614	266621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_003212	CCTG	2	8	266681	266688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_003212	ATGG	2	8	267797	267804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003212	AGCC	2	8	268015	268022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_003212	TGTT	2	8	268177	268184	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003212	AGAA	2	8	268569	268576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003212	AAAG	2	8	268672	268679	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003212	TACT	2	8	269111	269118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_003212	CACG	2	8	269132	269139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_003212	AGTG	2	8	269871	269878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003212	GGAA	2	8	269925	269932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003212	TAGG	2	8	270499	270506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003212	ATGG	2	8	270682	270689	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003212	ATCG	2	8	271260	271267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_003212	ATAA	2	8	271520	271527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003212	CCTT	2	8	276126	276133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_003212	AAGG	2	8	276142	276149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003212	AGAA	2	8	276178	276185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003212	AAAT	2	8	277646	277653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003212	TATG	2	8	277716	277723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003212	ACAA	2	8	290029	290036	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_003212	AAGG	2	8	290572	290579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003212	TAAA	2	8	291444	291451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003212	CTTT	2	8	291489	291496	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_003212	TACT	2	8	291645	291652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_003212	AATT	2	8	291740	291747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003212	CGAA	2	8	299771	299778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_003212	AAAG	2	8	301383	301390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003212	TTAA	2	8	302587	302594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003212	ATTA	2	8	302737	302744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003212	TTTG	2	8	304294	304301	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003212	ACAT	2	8	306544	306551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003212	CTAT	2	8	312747	312754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_003212	TGTA	2	8	314051	314058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003212	AAAT	2	8	316035	316042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003212	GAAA	2	8	321305	321312	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003212	TTAA	2	8	321357	321364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003212	TAAA	2	8	327277	327284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003212	GTTA	2	8	327357	327364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003212	TAAA	2	8	328818	328825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003212	TAAA	2	8	329678	329685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003212	GAAG	2	8	334808	334815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003212	ATTT	2	8	336539	336546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003212	ATAA	2	8	336628	336635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003212	AGAT	2	8	338445	338452	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003212	TTTA	2	8	338458	338465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003212	TAAT	2	8	339378	339385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003212	TAAA	2	8	339414	339421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003212	CAAT	2	8	347951	347958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_003212	TTTA	2	8	351308	351315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003212	ACCC	2	8	354052	354059	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_003212	TGTT	2	8	354941	354948	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003212	TAAA	2	8	359484	359491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003212	GAAC	2	8	359851	359858	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_003212	TTGT	2	8	360066	360073	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003212	AAAG	2	8	364969	364976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003212	CTTT	2	8	365000	365007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_003212	AGGG	2	8	365101	365108	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003212	ATTA	2	8	370067	370074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003212	GATT	2	8	372391	372398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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