MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262

Total Repeats: 39185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003212	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799080
2	NC_003212	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799080
3	NC_003212	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799080
4	NC_003212	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799080
5	NC_003212	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799080
6	NC_003212	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799080
7	NC_003212	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799080
8	NC_003212	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799080
9	NC_003212	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799080
10	NC_003212	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799080
11	NC_003212	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799080
12	NC_003212	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799080
13	NC_003212	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799080
14	NC_003212	TTA	2	6	1043	1048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799080
15	NC_003212	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16799080
16	NC_003212	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799080
17	NC_003212	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799080
18	NC_003212	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799080
19	NC_003212	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799080
20	NC_003212	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799080
21	NC_003212	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799080
22	NC_003212	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799080
23	NC_003212	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799081
24	NC_003212	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799081
25	NC_003212	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799081
26	NC_003212	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799081
27	NC_003212	TTC	2	6	2094	2099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799081
28	NC_003212	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799081
29	NC_003212	GAA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799081
30	NC_003212	TAC	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799081
31	NC_003212	ATT	2	6	2300	2305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799081
32	NC_003212	ATT	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799081
33	NC_003212	GAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799081
34	NC_003212	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799081
35	NC_003212	AAT	2	6	2549	2554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799081
36	NC_003212	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799081
37	NC_003212	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799081
38	NC_003212	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799081
39	NC_003212	GAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799081
40	NC_003212	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799081
41	NC_003212	GAT	2	6	2900	2905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799081
42	NC_003212	CTA	2	6	2961	2966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799081
43	NC_003212	ATG	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799082
44	NC_003212	ACA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799082
45	NC_003212	GAT	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799082
46	NC_003212	TGC	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799082
47	NC_003212	ATT	2	6	3314	3319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799082
48	NC_003212	GTA	2	6	3344	3349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799082
49	NC_003212	GGT	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799082
50	NC_003212	CGG	2	6	3426	3431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16799082
51	NC_003212	GAT	2	6	3506	3511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799082
52	NC_003212	CTA	2	6	3513	3518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799082
53	NC_003212	TGT	2	6	3667	3672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799082
54	NC_003212	GCA	2	6	3731	3736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799082
55	NC_003212	ACT	2	6	3814	3819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799082
56	NC_003212	GTT	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799082
57	NC_003212	CCT	2	6	3996	4001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16799082
58	NC_003212	AGT	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799082
59	NC_003212	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799082
60	NC_003212	TTA	2	6	4170	4175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799082
61	NC_003212	CGT	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799082
62	NC_003212	TGT	2	6	4237	4242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799082
63	NC_003212	TGG	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799082
64	NC_003212	CGA	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799082
65	NC_003212	CGA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799082
66	NC_003212	GGA	2	6	4723	4728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16799083
67	NC_003212	ATA	2	6	4860	4865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799083
68	NC_003212	TAT	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799084
69	NC_003212	AGA	2	6	5064	5069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799084
70	NC_003212	AGT	2	6	5088	5093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799084
71	NC_003212	AGA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799084
72	NC_003212	GCA	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799084
73	NC_003212	TCA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799084
74	NC_003212	GTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799084
75	NC_003212	GAT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799084
76	NC_003212	GAA	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799084
77	NC_003212	GAT	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799084
78	NC_003212	GAT	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799084
79	NC_003212	AAC	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799084
80	NC_003212	AGA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799085
81	NC_003212	TTG	2	6	6188	6193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799085
82	NC_003212	TTC	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799085
83	NC_003212	CGG	2	6	6360	6365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16799085
84	NC_003212	CGG	4	12	6372	6383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16799085
85	NC_003212	ACA	2	6	6595	6600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799085
86	NC_003212	CCA	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16799085
87	NC_003212	ATA	2	6	6839	6844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799085
88	NC_003212	AAT	2	6	6877	6882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799085
89	NC_003212	TTA	2	6	6941	6946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799085
90	NC_003212	TGA	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799085
91	NC_003212	TAT	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799085
92	NC_003212	ATG	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799085
93	NC_003212	GCT	2	6	7216	7221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799085
94	NC_003212	TTC	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799085
95	NC_003212	TGG	2	6	7350	7355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799085
96	NC_003212	GAA	2	6	7459	7464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799085
97	NC_003212	TGG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799085
98	NC_003212	ACT	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799085
99	NC_003212	ACC	2	6	7656	7661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16799085
100	NC_003212	AGA	2	6	7719	7724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799085
101	NC_003212	ACT	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799085
102	NC_003212	TCG	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799085
103	NC_003212	TAA	2	6	7969	7974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799085
104	NC_003212	CAT	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799086
105	NC_003212	TTG	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799086
106	NC_003212	TTG	2	6	8274	8279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799086
107	NC_003212	GGC	2	6	8416	8421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16799086
108	NC_003212	ACT	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799086
109	NC_003212	CAA	2	6	8482	8487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799086
110	NC_003212	ATG	2	6	8514	8519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799086
111	NC_003212	CAT	2	6	8621	8626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799086
112	NC_003212	CTG	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799086
113	NC_003212	GAT	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799086
114	NC_003212	GAA	2	6	8813	8818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
115	NC_003212	TTA	2	6	8844	8849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799086
116	NC_003212	TCG	2	6	8986	8991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799086
117	NC_003212	ATC	2	6	9084	9089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799086
118	NC_003212	ATT	2	6	9123	9128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799086
119	NC_003212	AGT	2	6	9142	9147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799086
120	NC_003212	TCG	2	6	9151	9156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799086
121	NC_003212	ATA	2	6	9228	9233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799086
122	NC_003212	ATT	2	6	9242	9247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799086
123	NC_003212	AAG	2	6	9285	9290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
124	NC_003212	GAA	3	9	9386	9394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
125	NC_003212	TGA	3	9	9442	9450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799086
126	NC_003212	ATT	2	6	9464	9469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799086
127	NC_003212	GAA	2	6	9473	9478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
128	NC_003212	AGA	2	6	9481	9486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
129	NC_003212	CGT	2	6	9512	9517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799086
130	NC_003212	GAA	3	9	9572	9580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
131	NC_003212	CGT	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799086
132	NC_003212	GGT	2	6	9653	9658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799086
133	NC_003212	GAT	2	6	9689	9694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799086
134	NC_003212	TTG	2	6	9708	9713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799086
135	NC_003212	TTC	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799086
136	NC_003212	ATC	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799086
137	NC_003212	TGA	2	6	9889	9894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799086
138	NC_003212	TTC	2	6	9905	9910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799086
139	NC_003212	ACT	2	6	9911	9916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799086
140	NC_003212	ACC	2	6	9938	9943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16799086
141	NC_003212	AGA	2	6	10087	10092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
142	NC_003212	AGA	2	6	10180	10185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
143	NC_003212	GTG	2	6	10263	10268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799086
144	NC_003212	TAG	2	6	10314	10319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799086
145	NC_003212	TGA	2	6	10447	10452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799086
146	NC_003212	AGA	3	9	10489	10497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
147	NC_003212	GAA	2	6	10514	10519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
148	NC_003212	CGA	2	6	10522	10527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799086
149	NC_003212	TGA	2	6	10549	10554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799086
150	NC_003212	AGA	2	6	10585	10590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799086
151	NC_003212	AGT	2	6	10761	10766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799087
152	NC_003212	AGC	2	6	10800	10805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799087
153	NC_003212	TAA	2	6	10817	10822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799087
154	NC_003212	ATC	2	6	10831	10836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799087
155	NC_003212	TTA	2	6	10850	10855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799087
156	NC_003212	ACA	2	6	11051	11056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799087
157	NC_003212	TGG	2	6	11264	11269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799087
158	NC_003212	AAG	2	6	11357	11362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799087
159	NC_003212	TTG	2	6	11444	11449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799087
160	NC_003212	GAA	2	6	11494	11499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799087
161	NC_003212	GCT	2	6	11626	11631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799087
162	NC_003212	TTA	2	6	11639	11644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799087
163	NC_003212	ACA	2	6	11658	11663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799087
164	NC_003212	TGA	2	6	11688	11693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799087
165	NC_003212	CGG	2	6	11712	11717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16799087
166	NC_003212	GAG	2	6	11818	11823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16799087
167	NC_003212	GTG	2	6	11855	11860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799087
168	NC_003212	TTA	2	6	11873	11878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799087
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174	NC_003212	ATT	3	9	12514	12522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799088
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258	NC_003212	TGT	2	6	19867	19872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799094
259	NC_003212	ATA	2	6	19933	19938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799095
260	NC_003212	TTG	2	6	19984	19989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799095
261	NC_003212	ATT	2	6	20004	20009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799095
262	NC_003212	ACA	2	6	20052	20057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799095
263	NC_003212	TTA	2	6	20071	20076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799095
264	NC_003212	AGC	2	6	20099	20104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799095
265	NC_003212	GCA	2	6	20178	20183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799095
266	NC_003212	CTT	2	6	20450	20455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799096
267	NC_003212	TGC	2	6	20471	20476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16799096
268	NC_003212	TTG	2	6	20524	20529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799096
269	NC_003212	ATC	2	6	20638	20643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799096
270	NC_003212	AGA	2	6	20651	20656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799096
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272	NC_003212	TGA	2	6	20783	20788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799096
273	NC_003212	GTT	2	6	20814	20819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799096
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280	NC_003212	TAC	2	6	21246	21251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799096
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282	NC_003212	ACA	2	6	21283	21288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799096
283	NC_003212	CTA	2	6	21359	21364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799096
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288	NC_003212	GAA	2	6	21794	21799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16799096
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290	NC_003212	TTC	2	6	22139	22144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16799097
291	NC_003212	CAA	2	6	22224	22229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799097
292	NC_003212	GCA	2	6	22308	22313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799097
293	NC_003212	GTT	2	6	22492	22497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799097
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295	NC_003212	GTT	2	6	22595	22600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799097
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299	NC_003212	TAC	2	6	23091	23096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799098
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301	NC_003212	TAT	2	6	23178	23183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16799098
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310	NC_003212	ATA	2	6	24091	24096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16799099
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333	NC_003212	ATG	2	6	25610	25615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799102
334	NC_003212	GGT	2	6	25655	25660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16799102
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372	NC_003212	ACT	2	6	28300	28305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16799105
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376	NC_003212	CAG	2	6	28443	28448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16799105
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379	NC_003212	TAG	3	9	28659	28667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16799105
380	NC_003212	GTT	2	6	28760	28765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16799105
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382	NC_003212	CAA	2	6	28843	28848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16799105
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