MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 2173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003210	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_003210	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	16802050
3	NC_003210	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	16802050
4	NC_003210	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	16802051
5	NC_003210	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	16802051
6	NC_003210	CAAAA	2	10	7073	7082	80 %	0 %	0 %	20 %	16802054
7	NC_003210	TTGAT	2	10	11755	11764	20 %	60 %	20 %	0 %	16802056
8	NC_003210	TTTTA	2	10	12428	12437	20 %	80 %	0 %	0 %	16802057
9	NC_003210	GTATG	2	10	13371	13380	20 %	40 %	40 %	0 %	16802058
10	NC_003210	AAAGA	2	10	14386	14395	80 %	0 %	20 %	0 %	16802059
11	NC_003210	ATGAA	2	10	17249	17258	60 %	20 %	20 %	0 %	16802061
12	NC_003210	GAATG	2	10	18991	19000	40 %	20 %	40 %	0 %	16802062
13	NC_003210	TAATT	2	10	20369	20378	40 %	60 %	0 %	0 %	16802065
14	NC_003210	ATTAA	2	10	21886	21895	60 %	40 %	0 %	0 %	16802066
15	NC_003210	AAATC	2	10	22347	22356	60 %	20 %	0 %	20 %	16802066
16	NC_003210	AACAT	2	10	22508	22517	60 %	20 %	0 %	20 %	16802066
17	NC_003210	TTTTA	2	10	23125	23134	20 %	80 %	0 %	0 %	16802067
18	NC_003210	GACCA	2	10	23209	23218	40 %	0 %	20 %	40 %	16802067
19	NC_003210	TGGAT	2	10	23468	23477	20 %	40 %	40 %	0 %	16802067
20	NC_003210	CAAAA	2	10	24469	24478	80 %	0 %	0 %	20 %	16802068
21	NC_003210	ATTAT	2	10	24954	24963	40 %	60 %	0 %	0 %	16802069
22	NC_003210	TCAGG	2	10	26123	26132	20 %	20 %	40 %	20 %	16802071
23	NC_003210	TTTAC	2	10	27123	27132	20 %	60 %	0 %	20 %	16802072
24	NC_003210	GAAAA	2	10	33064	33073	80 %	0 %	20 %	0 %	16802078
25	NC_003210	TGAAA	2	10	34219	34228	60 %	20 %	20 %	0 %	16802079
26	NC_003210	GAATG	2	10	36090	36099	40 %	20 %	40 %	0 %	16802081
27	NC_003210	AAATT	2	10	36217	36226	60 %	40 %	0 %	0 %	16802081
28	NC_003210	ATGGA	2	10	38338	38347	40 %	20 %	40 %	0 %	16802082
29	NC_003210	AAAAC	2	10	40444	40453	80 %	0 %	0 %	20 %	16802083
30	NC_003210	TTATT	2	10	41933	41942	20 %	80 %	0 %	0 %	16802085
31	NC_003210	AAAAG	2	10	43147	43156	80 %	0 %	20 %	0 %	16802085
32	NC_003210	ATAAA	2	10	43971	43980	80 %	20 %	0 %	0 %	16802086
33	NC_003210	ATTTT	2	10	45776	45785	20 %	80 %	0 %	0 %	16802088
34	NC_003210	GAAAC	2	10	47034	47043	60 %	0 %	20 %	20 %	16802089
35	NC_003210	GACTT	2	10	47273	47282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_003210	ATTTT	2	10	47360	47369	20 %	80 %	0 %	0 %	16802090
37	NC_003210	AAATG	2	10	48490	48499	60 %	20 %	20 %	0 %	16802091
38	NC_003210	ATGGT	2	10	49527	49536	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003210	GTAGA	2	10	49576	49585	40 %	20 %	40 %	0 %	16802092
40	NC_003210	TTACT	2	10	50558	50567	20 %	60 %	0 %	20 %	16802094
41	NC_003210	GAAAT	2	10	51216	51225	60 %	20 %	20 %	0 %	16802095
42	NC_003210	CTTAG	2	10	51315	51324	20 %	40 %	20 %	20 %	16802095
43	NC_003210	TAAAA	2	10	52566	52575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003210	TGCTA	2	10	52740	52749	20 %	40 %	20 %	20 %	16802098
45	NC_003210	TTTTA	2	10	52908	52917	20 %	80 %	0 %	0 %	16802098
46	NC_003210	AGTTA	2	10	54224	54233	40 %	40 %	20 %	0 %	16802099
47	NC_003210	TTATG	2	10	54773	54782	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003210	CGCAA	2	10	57737	57746	40 %	0 %	20 %	40 %	16802102
49	NC_003210	TTTTA	2	10	58685	58694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003210	AAACG	2	10	63068	63077	60 %	0 %	20 %	20 %	16802105
51	NC_003210	ATTAT	2	10	64036	64045	40 %	60 %	0 %	0 %	16802105
52	NC_003210	CGAAA	2	10	64554	64563	60 %	0 %	20 %	20 %	16802106
53	NC_003210	AAAAC	2	10	64564	64573	80 %	0 %	0 %	20 %	16802106
54	NC_003210	AACAA	2	10	65987	65996	80 %	0 %	0 %	20 %	16802108
55	NC_003210	GAGAG	2	10	71046	71055	40 %	0 %	60 %	0 %	16802110
56	NC_003210	GCAAA	2	10	72228	72237	60 %	0 %	20 %	20 %	16802113
57	NC_003210	CAATA	2	10	72293	72302	60 %	20 %	0 %	20 %	16802113
58	NC_003210	GCCTT	2	10	73093	73102	0 %	40 %	20 %	40 %	16802114
59	NC_003210	CAAAA	2	10	73470	73479	80 %	0 %	0 %	20 %	16802114
60	NC_003210	GAAAT	2	10	75659	75668	60 %	20 %	20 %	0 %	16802116
61	NC_003210	ATAGC	2	10	75679	75688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_003210	GCTTT	2	10	76457	76466	0 %	60 %	20 %	20 %	16802118
63	NC_003210	AGTAG	2	10	77802	77811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003210	AGTAA	2	10	78052	78061	60 %	20 %	20 %	0 %	16802120
65	NC_003210	TTATA	2	10	78301	78310	40 %	60 %	0 %	0 %	16802121
66	NC_003210	TATTT	2	10	78396	78405	20 %	80 %	0 %	0 %	16802122
67	NC_003210	GCTTG	2	10	80375	80384	0 %	40 %	40 %	20 %	16802124
68	NC_003210	AAACT	2	10	80385	80394	60 %	20 %	0 %	20 %	16802124
69	NC_003210	GCGCT	2	10	82430	82439	0 %	20 %	40 %	40 %	16802126
70	NC_003210	TAAAG	2	10	84430	84439	60 %	20 %	20 %	0 %	16802127
71	NC_003210	TCATT	2	10	87622	87631	20 %	60 %	0 %	20 %	16802132
72	NC_003210	ATTTT	2	10	87874	87883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003210	CTAAA	2	10	89987	89996	60 %	20 %	0 %	20 %	16802134
74	NC_003210	AAGTT	2	10	90413	90422	40 %	40 %	20 %	0 %	16802134
75	NC_003210	GAAAA	2	10	91330	91339	80 %	0 %	20 %	0 %	16802134
76	NC_003210	TGAAA	2	10	91572	91581	60 %	20 %	20 %	0 %	16802134
77	NC_003210	AAATT	2	10	91916	91925	60 %	40 %	0 %	0 %	16802134
78	NC_003210	AGCGG	2	10	92500	92509	20 %	0 %	60 %	20 %	16802134
79	NC_003210	AGTTA	2	10	93909	93918	40 %	40 %	20 %	0 %	16802134
80	NC_003210	GAAAT	2	10	94996	95005	60 %	20 %	20 %	0 %	16802135
81	NC_003210	AAAAG	2	10	95308	95317	80 %	0 %	20 %	0 %	16802135
82	NC_003210	TGAAA	2	10	96305	96314	60 %	20 %	20 %	0 %	16802135
83	NC_003210	TGCAT	2	10	98965	98974	20 %	40 %	20 %	20 %	16802138
84	NC_003210	TTACT	2	10	99211	99220	20 %	60 %	0 %	20 %	16802138
85	NC_003210	GTTTT	2	10	100809	100818	0 %	80 %	20 %	0 %	16802140
86	NC_003210	GAAGT	2	10	101090	101099	40 %	20 %	40 %	0 %	16802140
87	NC_003210	AGCGG	2	10	102409	102418	20 %	0 %	60 %	20 %	16802141
88	NC_003210	ATATC	2	10	108213	108222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_003210	TTCCA	2	10	108998	109007	20 %	40 %	0 %	40 %	16802151
90	NC_003210	AAAAG	2	10	110900	110909	80 %	0 %	20 %	0 %	16802153
91	NC_003210	ACGGT	2	10	112444	112453	20 %	20 %	40 %	20 %	16802154
92	NC_003210	GAAAT	2	10	113683	113692	60 %	20 %	20 %	0 %	16802155
93	NC_003210	GAATT	2	10	114324	114333	40 %	40 %	20 %	0 %	16802155
94	NC_003210	AACCA	2	10	118200	118209	60 %	0 %	0 %	40 %	16802158
95	NC_003210	CTTTA	2	10	118529	118538	20 %	60 %	0 %	20 %	16802158
96	NC_003210	CTCGA	2	10	119880	119889	20 %	20 %	20 %	40 %	16802160
97	NC_003210	TTCCA	2	10	120214	120223	20 %	40 %	0 %	40 %	16802160
98	NC_003210	TACTG	2	10	120479	120488	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_003210	TCTCT	2	10	121052	121061	0 %	60 %	0 %	40 %	16802161
100	NC_003210	TTTTA	2	10	121412	121421	20 %	80 %	0 %	0 %	16802162
101	NC_003210	AAAAG	2	10	121681	121690	80 %	0 %	20 %	0 %	16802163
102	NC_003210	AAAGT	2	10	122718	122727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003210	TTAGT	2	10	123839	123848	20 %	60 %	20 %	0 %	16802167
104	NC_003210	TTTAT	2	10	126839	126848	20 %	80 %	0 %	0 %	16802170
105	NC_003210	AAGTG	2	10	128861	128870	40 %	20 %	40 %	0 %	16802173
106	NC_003210	GTCAG	2	10	129322	129331	20 %	20 %	40 %	20 %	16802174
107	NC_003210	AATTT	2	10	130603	130612	40 %	60 %	0 %	0 %	16802176
108	NC_003210	TTGTT	2	10	132970	132979	0 %	80 %	20 %	0 %	16802178
109	NC_003210	ATTTT	2	10	134774	134783	20 %	80 %	0 %	0 %	16802180
110	NC_003210	AAAAT	2	10	136276	136285	80 %	20 %	0 %	0 %	16802180
111	NC_003210	AACTT	2	10	137602	137611	40 %	40 %	0 %	20 %	16802183
112	NC_003210	ACAAA	2	10	137704	137713	80 %	0 %	0 %	20 %	16802183
113	NC_003210	ACTTG	2	10	138498	138507	20 %	40 %	20 %	20 %	16802183
114	NC_003210	TTGGT	2	10	139294	139303	0 %	60 %	40 %	0 %	16802184
115	NC_003210	TGTTT	2	10	139637	139646	0 %	80 %	20 %	0 %	16802184
116	NC_003210	AGCCA	2	10	141163	141172	40 %	0 %	20 %	40 %	16802186
117	NC_003210	TATGA	2	10	142272	142281	40 %	40 %	20 %	0 %	16802188
118	NC_003210	TAACG	2	10	145253	145262	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_003210	TTTAT	2	10	145912	145921	20 %	80 %	0 %	0 %	16802195
120	NC_003210	ACTTT	2	10	147709	147718	20 %	60 %	0 %	20 %	16802198
121	NC_003210	ACGGC	2	10	149633	149642	20 %	0 %	40 %	40 %	16802200
122	NC_003210	TTTAA	2	10	149705	149714	40 %	60 %	0 %	0 %	16802200
123	NC_003210	AATTT	2	10	149891	149900	40 %	60 %	0 %	0 %	16802200
124	NC_003210	GATAA	2	10	150058	150067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003210	AATAA	2	10	151164	151173	80 %	20 %	0 %	0 %	16802201
126	NC_003210	GAATA	2	10	153124	153133	60 %	20 %	20 %	0 %	16802204
127	NC_003210	TTTAC	2	10	154323	154332	20 %	60 %	0 %	20 %	16802205
128	NC_003210	AGATG	2	10	154372	154381	40 %	20 %	40 %	0 %	16802205
129	NC_003210	ATATG	2	10	157039	157048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003210	TCTAA	2	10	159687	159696	40 %	40 %	0 %	20 %	16802208
131	NC_003210	AAATC	2	10	160202	160211	60 %	20 %	0 %	20 %	16802208
132	NC_003210	GGCTG	2	10	160239	160248	0 %	20 %	60 %	20 %	16802208
133	NC_003210	CGAAA	2	10	160817	160826	60 %	0 %	20 %	20 %	16802208
134	NC_003210	AAGAT	2	10	163206	163215	60 %	20 %	20 %	0 %	16802210
135	NC_003210	TGCGC	2	10	163327	163336	0 %	20 %	40 %	40 %	16802210
136	NC_003210	GAATT	2	10	163577	163586	40 %	40 %	20 %	0 %	16802211
137	NC_003210	AAATA	2	10	166632	166641	80 %	20 %	0 %	0 %	16802215
138	NC_003210	TTCTT	2	10	167837	167846	0 %	80 %	0 %	20 %	16802217
139	NC_003210	CTAAA	2	10	167985	167994	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_003210	TTCCA	2	10	168388	168397	20 %	40 %	0 %	40 %	16802218
141	NC_003210	AACCT	2	10	170159	170168	40 %	20 %	0 %	40 %	16802219
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193	NC_003210	GAAAA	2	10	232209	232218	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_003210	GAAAA	2	10	232412	232421	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_003210	AAACA	2	10	232505	232514	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_003210	TGATA	2	10	232982	232991	40 %	40 %	20 %	0 %	16802270
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201	NC_003210	AAGGT	2	10	240015	240024	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_003210	TCGTG	2	10	244568	244577	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
204	NC_003210	AAGGT	2	10	246036	246045	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_003210	ATTTG	2	10	321360	321369	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
250	NC_003210	TAGAT	2	10	321400	321409	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_003210	GTTTT	2	10	322530	322539	0 %	80 %	20 %	0 %	16802343
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254	NC_003210	ACTTT	2	10	326174	326183	20 %	60 %	0 %	20 %	16802346
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258	NC_003210	ATGAA	2	10	332567	332576	60 %	20 %	20 %	0 %	16802353
259	NC_003210	AGGAA	2	10	335610	335619	60 %	0 %	40 %	0 %	16802355
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261	NC_003210	AAGAT	2	10	336404	336413	60 %	20 %	20 %	0 %	16802355
262	NC_003210	AAATA	2	10	336421	336430	80 %	20 %	0 %	0 %	16802355
263	NC_003210	GATAT	2	10	337897	337906	40 %	40 %	20 %	0 %	16802357
264	NC_003210	ACGAA	2	10	337930	337939	60 %	0 %	20 %	20 %	16802357
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267	NC_003210	AAGTG	2	10	344233	344242	40 %	20 %	40 %	0 %	16802364
268	NC_003210	TTTGA	2	10	347471	347480	20 %	60 %	20 %	0 %	16802367
269	NC_003210	ATTGT	2	10	348553	348562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
270	NC_003210	TCAAG	2	10	348766	348775	40 %	20 %	20 %	20 %	16802369
271	NC_003210	GCCAA	2	10	350110	350119	40 %	0 %	20 %	40 %	16802370
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397	NC_003210	TCAAG	2	10	514984	514993	40 %	20 %	20 %	20 %	16802521
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400	NC_003210	ATACA	2	10	520394	520403	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_003210	AGAAA	2	10	522931	522940	80 %	0 %	20 %	0 %	16802531
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