MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003198	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003198	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_003198	TATTG	2	10	17582	17591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003198	GCGTC	2	10	28361	28370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_003198	TTTTA	2	10	33215	33224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003198	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003198	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003198	ATTTT	2	10	35222	35231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003198	TAAAA	2	10	44187	44196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003198	GAAGG	2	10	47360	47369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003198	AGCGC	2	10	57231	57240	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_003198	ATTTG	2	10	75255	75264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003198	AAGCG	2	10	81514	81523	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_003198	TAAAA	2	10	95578	95587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003198	TTTCC	2	10	96017	96026	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_003198	GCGCT	2	10	97737	97746	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_003198	AGCGC	2	10	97804	97813	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_003198	AAGCG	2	10	109095	109104	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_003198	TAATT	2	10	118139	118148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003198	ATTTT	2	10	118165	118174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003198	TAGTG	2	10	128220	128229	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003198	GGTTT	2	10	135578	135587	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003198	CCCAA	2	10	139592	139601	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_003198	TTGTT	2	10	140939	140948	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003198	CGCGG	2	10	160079	160088	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_003198	GCGCT	2	10	209274	209283	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_003198	CGCGT	2	10	209326	209335	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_003198	TTGCG	2	10	210239	210248	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_003198	ATTTA	2	10	217736	217745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003198	GTTGA	2	10	228632	228641	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003198	TTCAA	2	10	228738	228747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_003198	GGAAT	2	10	229492	229501	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003198	GCAGC	2	10	230151	230160	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_003198	TGCTC	2	10	243057	243066	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_003198	CGCTT	2	10	244247	244256	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_003198	GTCTG	2	10	253993	254002	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_003198	GCGCT	2	10	277557	277566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_003198	TGTGT	2	10	284659	284668	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003198	AATGA	2	10	286370	286379	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003198	AAATT	2	10	294649	294658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003198	ACAAA	2	10	295936	295945	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_003198	TTGTT	2	10	308909	308918	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003198	GCGGT	2	10	313616	313625	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_003198	TCCCG	2	10	322285	322294	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_003198	GGCCT	2	10	323175	323184	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_003198	TCGCT	2	10	323485	323494	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_003198	AATGC	2	10	328380	328389	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_003198	TATGT	2	10	328464	328473	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003198	TCTGT	2	10	348239	348248	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_003198	ATTCC	2	10	350801	350810	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_003198	GTTTT	2	10	358400	358409	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003198	AAGCG	2	10	365255	365264	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_003198	TGAAA	2	10	378326	378335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003198	TGAAA	2	10	378359	378368	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003198	ATCGG	2	10	386232	386241	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_003198	TTTCT	2	10	386903	386912	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003198	GATGC	2	10	390035	390044	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_003198	TAAAG	2	10	397256	397265	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003198	AAGCC	2	10	399047	399056	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_003198	ACGGC	2	10	399392	399401	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_003198	CCCGT	2	10	399946	399955	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_003198	CGTTT	2	10	400273	400282	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_003198	TTTTC	2	10	409393	409402	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_003198	CTTTG	2	10	409500	409509	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_003198	TACGG	2	10	410507	410516	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_003198	GCTAA	2	10	427066	427075	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_003198	TTAAA	2	10	428349	428358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003198	ACAAT	2	10	433213	433222	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003198	TTAAT	2	10	434079	434088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003198	CAGCA	2	10	436664	436673	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_003198	GACAA	2	10	437218	437227	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_003198	AACGC	2	10	450912	450921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_003198	CTCCA	2	10	459164	459173	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_003198	CTTTT	2	10	464204	464213	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_003198	GCGCC	2	10	465782	465791	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_003198	ACGAT	2	10	475505	475514	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_003198	GCAAC	2	10	479994	480003	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_003198	TTTGC	2	10	482277	482286	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_003198	ACTAA	2	10	497669	497678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_003198	GAAGA	2	10	500243	500252	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003198	ATGCG	2	10	500676	500685	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_003198	GCGCT	2	10	515061	515070	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_003198	CAGGT	2	10	517324	517333	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_003198	TGTTA	2	10	519182	519191	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003198	TTCAA	2	10	532489	532498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_003198	TTTAT	2	10	575575	575584	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003198	TATGG	2	10	576515	576524	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003198	AAAAT	2	10	584305	584314	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003198	AGGGA	2	10	596649	596658	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003198	GGCGC	2	10	596718	596727	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_003198	CTTCA	2	10	605501	605510	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_003198	CTTTT	2	10	615682	615691	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_003198	GTCGC	2	10	622894	622903	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_003198	TGCGG	2	10	623089	623098	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_003198	TGTAA	2	10	645272	645281	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003198	TTGAT	2	10	654483	654492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003198	CATTT	2	10	655282	655291	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_003198	TTATT	2	10	658493	658502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003198	AGTGG	2	10	668578	668587	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003198	TTATT	2	10	676726	676735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003198	TTTGT	2	10	676752	676761	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003198	CGCGC	2	10	678582	678591	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_003198	TTCAA	2	10	680630	680639	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_003198	ATAAG	2	10	681859	681868	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003198	GCATA	2	10	696521	696530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_003198	GTCCC	2	10	705568	705577	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_003198	GGCGG	2	10	720093	720102	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_003198	GCGCT	2	10	737436	737445	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_003198	GTTCT	2	10	756703	756712	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_003198	GGCGA	2	10	764734	764743	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_003198	AATAA	2	10	770660	770669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003198	TAAAA	2	10	783702	783711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003198	GGCGA	2	10	793610	793619	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_003198	GGCGA	2	10	793829	793838	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_003198	TGCGC	2	10	794060	794069	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_003198	GCGCT	2	10	800885	800894	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_003198	TATGG	2	10	806212	806221	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003198	ATTCT	2	10	819431	819440	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_003198	AATAA	2	10	831633	831642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003198	TCATT	2	10	839675	839684	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_003198	CGCTG	2	10	850971	850980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_003198	CGCAG	2	10	851940	851949	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_003198	TAATT	2	10	852903	852912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003198	CTTAT	2	10	855375	855384	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_003198	AAAGC	2	10	856126	856135	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_003198	AAATG	2	10	858480	858489	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003198	GCAGG	2	10	858517	858526	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_003198	ACCGC	2	10	866455	866464	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_003198	CAGGG	2	10	887220	887229	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_003198	GCGCT	2	10	912256	912265	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_003198	AGCGC	2	10	913270	913279	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_003198	AGGCG	2	10	933832	933841	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_003198	CCCTA	2	10	955673	955682	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_003198	ATCGA	2	10	960013	960022	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_003198	AAAAT	2	10	961370	961379	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003198	GGATT	2	10	964530	964539	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003198	GAATG	2	10	965175	965184	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003198	ATTCT	2	10	965446	965455	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_003198	GAGTT	2	10	973133	973142	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003198	CCTGA	2	10	984417	984426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_003198	GCAGC	2	10	984612	984621	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_003198	TTTTC	2	10	986042	986051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_003198	TTAGG	2	10	995371	995380	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003198	TTTGA	2	10	1001649	1001658	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003198	ATGGC	2	10	1021461	1021470	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_003198	CCTCG	2	10	1024579	1024588	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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461	NC_003198	CGCCA	2	10	3244537	3244546	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
462	NC_003198	GGATC	2	10	3244786	3244795	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
463	NC_003198	GCGCT	2	10	3245791	3245800	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
464	NC_003198	TCTTT	2	10	3255299	3255308	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
465	NC_003198	AGCGC	2	10	3259467	3259476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
466	NC_003198	ATCCT	2	10	3268870	3268879	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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