MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 9218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003198	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	16758995
2	NC_003198	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	16758995
3	NC_003198	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	16758996
4	NC_003198	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	16758997
5	NC_003198	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	16758997
6	NC_003198	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	16758997
7	NC_003198	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	16758997
8	NC_003198	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	16758997
9	NC_003198	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	16758999
10	NC_003198	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	16758999
11	NC_003198	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	16758999
12	NC_003198	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	16759000
13	NC_003198	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	16759000
14	NC_003198	TGGC	2	8	8819	8826	0 %	25 %	50 %	25 %	16759001
15	NC_003198	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	16759002
16	NC_003198	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	16759003
17	NC_003198	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	16759004
18	NC_003198	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	16759004
19	NC_003198	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	16759005
20	NC_003198	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	16759005
21	NC_003198	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	16759005
22	NC_003198	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	16759005
23	NC_003198	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	16759005
24	NC_003198	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	16759005
25	NC_003198	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	16759006
26	NC_003198	TCAG	2	8	15249	15256	25 %	25 %	25 %	25 %	16759007
27	NC_003198	TTTG	2	8	15539	15546	0 %	75 %	25 %	0 %	16759007
28	NC_003198	CGAA	2	8	15754	15761	50 %	0 %	25 %	25 %	16759007
29	NC_003198	ATTG	2	8	15766	15773	25 %	50 %	25 %	0 %	16759007
30	NC_003198	ATAA	2	8	16526	16533	75 %	25 %	0 %	0 %	16759009
31	NC_003198	CAGC	2	8	16733	16740	25 %	0 %	25 %	50 %	16759009
32	NC_003198	AATA	2	8	18002	18009	75 %	25 %	0 %	0 %	16759011
33	NC_003198	GGGC	2	8	18588	18595	0 %	0 %	75 %	25 %	16759011
34	NC_003198	CGTG	2	8	19288	19295	0 %	25 %	50 %	25 %	16759011
35	NC_003198	TCCA	2	8	20073	20080	25 %	25 %	0 %	50 %	16759012
36	NC_003198	CCAA	2	8	21289	21296	50 %	0 %	0 %	50 %	16759013
37	NC_003198	GACG	2	8	21635	21642	25 %	0 %	50 %	25 %	16759013
38	NC_003198	GCCG	2	8	21887	21894	0 %	0 %	50 %	50 %	16759013
39	NC_003198	TGGC	2	8	22288	22295	0 %	25 %	50 %	25 %	16759013
40	NC_003198	TGGC	2	8	22394	22401	0 %	25 %	50 %	25 %	16759013
41	NC_003198	CGCC	2	8	22660	22667	0 %	0 %	25 %	75 %	16759013
42	NC_003198	CTGG	2	8	23006	23013	0 %	25 %	50 %	25 %	16759013
43	NC_003198	TTTA	2	8	23504	23511	25 %	75 %	0 %	0 %	16759014
44	NC_003198	TTTC	2	8	23558	23565	0 %	75 %	0 %	25 %	16759014
45	NC_003198	TCTG	2	8	23961	23968	0 %	50 %	25 %	25 %	16759014
46	NC_003198	TGAA	2	8	24470	24477	50 %	25 %	25 %	0 %	16759015
47	NC_003198	CCAG	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	16759015
48	NC_003198	ACCG	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	16759016
49	NC_003198	TTTA	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	16759016
50	NC_003198	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	16759017
51	NC_003198	GGCG	2	8	28770	28777	0 %	0 %	75 %	25 %	16759017
52	NC_003198	ATGA	2	8	29975	29982	50 %	25 %	25 %	0 %	16759018
53	NC_003198	TGCT	2	8	30545	30552	0 %	50 %	25 %	25 %	16759020
54	NC_003198	TATC	2	8	30601	30608	25 %	50 %	0 %	25 %	16759020
55	NC_003198	GTAA	2	8	30638	30645	50 %	25 %	25 %	0 %	16759020
56	NC_003198	TTCG	2	8	30900	30907	0 %	50 %	25 %	25 %	16759020
57	NC_003198	GTCA	2	8	31410	31417	25 %	25 %	25 %	25 %	16759021
58	NC_003198	ACCG	2	8	32230	32237	25 %	0 %	25 %	50 %	16759022
59	NC_003198	AGGC	2	8	32268	32275	25 %	0 %	50 %	25 %	16759022
60	NC_003198	CCTG	2	8	32704	32711	0 %	25 %	25 %	50 %	16759023
61	NC_003198	CGCA	2	8	32894	32901	25 %	0 %	25 %	50 %	16759023
62	NC_003198	TAAA	2	8	32964	32971	75 %	25 %	0 %	0 %	16759023
63	NC_003198	TTAT	2	8	33533	33540	25 %	75 %	0 %	0 %	16759024
64	NC_003198	TTGG	2	8	33917	33924	0 %	50 %	50 %	0 %	16759024
65	NC_003198	CTTT	2	8	34297	34304	0 %	75 %	0 %	25 %	16759024
66	NC_003198	GAAG	2	8	34337	34344	50 %	0 %	50 %	0 %	16759024
67	NC_003198	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	16759025
68	NC_003198	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	16759025
69	NC_003198	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	16759025
70	NC_003198	TGAC	2	8	35736	35743	25 %	25 %	25 %	25 %	16759026
71	NC_003198	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	16759026
72	NC_003198	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	16759027
73	NC_003198	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	16759027
74	NC_003198	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	16759027
75	NC_003198	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	16759027
76	NC_003198	TCGT	2	8	38559	38566	0 %	50 %	25 %	25 %	16759027
77	NC_003198	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	16759027
78	NC_003198	GCGG	2	8	40536	40543	0 %	0 %	75 %	25 %	16759029
79	NC_003198	CTGG	2	8	40754	40761	0 %	25 %	50 %	25 %	16759029
80	NC_003198	CCGA	2	8	41271	41278	25 %	0 %	25 %	50 %	16759029
81	NC_003198	ATCG	2	8	41427	41434	25 %	25 %	25 %	25 %	16759029
82	NC_003198	TCAA	2	8	41488	41495	50 %	25 %	0 %	25 %	16759029
83	NC_003198	AACC	2	8	41754	41761	50 %	0 %	0 %	50 %	16759030
84	NC_003198	GAAA	2	8	41806	41813	75 %	0 %	25 %	0 %	16759030
85	NC_003198	GGTC	2	8	42378	42385	0 %	25 %	50 %	25 %	16759030
86	NC_003198	TTTG	2	8	42902	42909	0 %	75 %	25 %	0 %	16759030
87	NC_003198	GTAT	2	8	43196	43203	25 %	50 %	25 %	0 %	16759031
88	NC_003198	TCCG	2	8	43590	43597	0 %	25 %	25 %	50 %	16759031
89	NC_003198	ATGA	2	8	45652	45659	50 %	25 %	25 %	0 %	16759032
90	NC_003198	AACG	2	8	45954	45961	50 %	0 %	25 %	25 %	16759032
91	NC_003198	GAAA	2	8	46902	46909	75 %	0 %	25 %	0 %	16759033
92	NC_003198	GCTG	2	8	47108	47115	0 %	25 %	50 %	25 %	16759033
93	NC_003198	CACG	2	8	47806	47813	25 %	0 %	25 %	50 %	16759034
94	NC_003198	CAGC	2	8	47833	47840	25 %	0 %	25 %	50 %	16759034
95	NC_003198	CCTG	3	12	47969	47980	0 %	25 %	25 %	50 %	16759034
96	NC_003198	CATG	2	8	48538	48545	25 %	25 %	25 %	25 %	16759035
97	NC_003198	AAGT	2	8	49332	49339	50 %	25 %	25 %	0 %	16759035
98	NC_003198	CCAG	2	8	49390	49397	25 %	0 %	25 %	50 %	16759035
99	NC_003198	TTGA	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	16759035
100	NC_003198	GAAA	2	8	50506	50513	75 %	0 %	25 %	0 %	16759036
101	NC_003198	GCCA	2	8	50847	50854	25 %	0 %	25 %	50 %	16759036
102	NC_003198	TAAA	2	8	51240	51247	75 %	25 %	0 %	0 %	16759036
103	NC_003198	CATA	2	8	52886	52893	50 %	25 %	0 %	25 %	16759039
104	NC_003198	TCAG	2	8	52897	52904	25 %	25 %	25 %	25 %	16759039
105	NC_003198	GCCC	2	8	53069	53076	0 %	0 %	25 %	75 %	16759039
106	NC_003198	TGGC	2	8	53611	53618	0 %	25 %	50 %	25 %	16759039
107	NC_003198	AGCC	2	8	57438	57445	25 %	0 %	25 %	50 %	16759042
108	NC_003198	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	16759042
109	NC_003198	ATGG	2	8	57650	57657	25 %	25 %	50 %	0 %	16759042
110	NC_003198	TGAT	2	8	58322	58329	25 %	50 %	25 %	0 %	16759043
111	NC_003198	GCTG	2	8	58419	58426	0 %	25 %	50 %	25 %	16759043
112	NC_003198	TGGA	2	8	58991	58998	25 %	25 %	50 %	0 %	16759044
113	NC_003198	GATT	2	8	59389	59396	25 %	50 %	25 %	0 %	16759044
114	NC_003198	GATC	2	8	59758	59765	25 %	25 %	25 %	25 %	16759044
115	NC_003198	CTGC	2	8	60776	60783	0 %	25 %	25 %	50 %	16759045
116	NC_003198	CTGG	2	8	60883	60890	0 %	25 %	50 %	25 %	16759045
117	NC_003198	GTGG	2	8	61048	61055	0 %	25 %	75 %	0 %	16759045
118	NC_003198	CTGC	2	8	61258	61265	0 %	25 %	25 %	50 %	16759046
119	NC_003198	ACCA	2	8	61894	61901	50 %	0 %	0 %	50 %	16759047
120	NC_003198	GTGG	2	8	61929	61936	0 %	25 %	75 %	0 %	16759047
121	NC_003198	CATT	2	8	62119	62126	25 %	50 %	0 %	25 %	16759047
122	NC_003198	GCCA	2	8	64746	64753	25 %	0 %	25 %	50 %	16759048
123	NC_003198	GCTG	2	8	65134	65141	0 %	25 %	50 %	25 %	16759049
124	NC_003198	CAGC	2	8	65413	65420	25 %	0 %	25 %	50 %	16759049
125	NC_003198	CCCG	2	8	65741	65748	0 %	0 %	25 %	75 %	16759049
126	NC_003198	CCAG	2	8	66166	66173	25 %	0 %	25 %	50 %	16759049
127	NC_003198	TTCA	2	8	66881	66888	25 %	50 %	0 %	25 %	16759050
128	NC_003198	GAAG	2	8	67633	67640	50 %	0 %	50 %	0 %	16759051
129	NC_003198	CAGA	2	8	67806	67813	50 %	0 %	25 %	25 %	16759051
130	NC_003198	TTTC	2	8	68079	68086	0 %	75 %	0 %	25 %	16759051
131	NC_003198	AACA	2	8	68209	68216	75 %	0 %	0 %	25 %	16759051
132	NC_003198	AGTC	2	8	68238	68245	25 %	25 %	25 %	25 %	16759051
133	NC_003198	TAAT	2	8	68280	68287	50 %	50 %	0 %	0 %	16759051
134	NC_003198	ATTT	2	8	68666	68673	25 %	75 %	0 %	0 %	16759052
135	NC_003198	GTCG	2	8	68698	68705	0 %	25 %	50 %	25 %	16759052
136	NC_003198	GCAG	2	8	68983	68990	25 %	0 %	50 %	25 %	16759052
137	NC_003198	ACCG	2	8	69209	69216	25 %	0 %	25 %	50 %	16759052
138	NC_003198	GATC	2	8	69355	69362	25 %	25 %	25 %	25 %	16759052
139	NC_003198	GGCA	2	8	69729	69736	25 %	0 %	50 %	25 %	16759053
140	NC_003198	TCCA	2	8	69771	69778	25 %	25 %	0 %	50 %	16759053
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