MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 58849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003198	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758994
2	NC_003198	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758994
3	NC_003198	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
4	NC_003198	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16758995
5	NC_003198	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758995
6	NC_003198	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
7	NC_003198	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
8	NC_003198	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
9	NC_003198	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
10	NC_003198	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
11	NC_003198	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16758995
12	NC_003198	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
13	NC_003198	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
14	NC_003198	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
15	NC_003198	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758995
16	NC_003198	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16758995
17	NC_003198	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758995
18	NC_003198	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
19	NC_003198	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
20	NC_003198	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16758995
21	NC_003198	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16758995
22	NC_003198	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
23	NC_003198	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
24	NC_003198	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16758995
25	NC_003198	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16758995
26	NC_003198	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16758995
27	NC_003198	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16758995
28	NC_003198	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758995
29	NC_003198	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758995
30	NC_003198	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
31	NC_003198	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
32	NC_003198	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16758995
33	NC_003198	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
34	NC_003198	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758995
35	NC_003198	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16758995
36	NC_003198	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
37	NC_003198	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758995
38	NC_003198	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
39	NC_003198	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
40	NC_003198	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758995
41	NC_003198	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758995
42	NC_003198	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758995
43	NC_003198	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758995
44	NC_003198	ATT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16758995
45	NC_003198	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758995
46	NC_003198	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758995
47	NC_003198	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758995
48	NC_003198	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758996
49	NC_003198	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758996
50	NC_003198	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758996
51	NC_003198	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758996
52	NC_003198	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758996
53	NC_003198	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758996
54	NC_003198	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16758996
55	NC_003198	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16758996
56	NC_003198	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758996
57	NC_003198	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758996
58	NC_003198	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758996
59	NC_003198	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758996
60	NC_003198	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758996
61	NC_003198	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758996
62	NC_003198	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758997
63	NC_003198	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758997
64	NC_003198	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758997
65	NC_003198	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758997
66	NC_003198	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758997
67	NC_003198	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758997
68	NC_003198	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758997
69	NC_003198	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758997
70	NC_003198	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16758997
71	NC_003198	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758997
72	NC_003198	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758997
73	NC_003198	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758997
74	NC_003198	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758997
75	NC_003198	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16758997
76	NC_003198	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758997
77	NC_003198	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758997
78	NC_003198	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16758997
79	NC_003198	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758997
80	NC_003198	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758997
81	NC_003198	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758997
82	NC_003198	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758997
83	NC_003198	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758998
84	NC_003198	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16758998
85	NC_003198	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758998
86	NC_003198	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758998
87	NC_003198	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758998
88	NC_003198	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16758998
89	NC_003198	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758998
90	NC_003198	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16758998
91	NC_003198	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758998
92	NC_003198	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758998
93	NC_003198	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16758998
94	NC_003198	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16758999
95	NC_003198	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16758999
96	NC_003198	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758999
97	NC_003198	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758999
98	NC_003198	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16758999
99	NC_003198	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758999
100	NC_003198	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758999
101	NC_003198	GAT	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758999
102	NC_003198	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758999
103	NC_003198	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758999
104	NC_003198	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758999
105	NC_003198	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16758999
106	NC_003198	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16758999
107	NC_003198	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16758999
108	NC_003198	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16758999
109	NC_003198	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16758999
110	NC_003198	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16758999
111	NC_003198	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759000
112	NC_003198	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759000
113	NC_003198	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759000
114	NC_003198	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759000
115	NC_003198	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759000
116	NC_003198	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759000
117	NC_003198	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759000
118	NC_003198	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759000
119	NC_003198	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759000
120	NC_003198	CGT	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759000
121	NC_003198	GCA	2	6	8513	8518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759000
122	NC_003198	CTG	2	6	8610	8615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759000
123	NC_003198	GCG	2	6	8778	8783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759001
124	NC_003198	ACC	2	6	8837	8842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759001
125	NC_003198	ATC	2	6	8885	8890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759001
126	NC_003198	TGA	2	6	8914	8919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759001
127	NC_003198	GCT	2	6	9229	9234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759001
128	NC_003198	GTC	2	6	9310	9315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759001
129	NC_003198	CAG	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759002
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131	NC_003198	GAA	2	6	9598	9603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759002
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258	NC_003198	GTG	2	6	18515	18520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759011
259	NC_003198	AGA	2	6	18610	18615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759011
260	NC_003198	GCT	2	6	18631	18636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759011
261	NC_003198	GCT	2	6	18752	18757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759011
262	NC_003198	TGA	2	6	18777	18782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759011
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265	NC_003198	CTG	2	6	18887	18892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759011
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283	NC_003198	CGC	2	6	20242	20247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759012
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289	NC_003198	CGC	2	6	20474	20479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759012
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291	NC_003198	CCG	2	6	20491	20496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759012
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379	NC_003198	GCG	2	6	30239	30244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759019
380	NC_003198	GGC	2	6	30454	30459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759019
381	NC_003198	TGG	2	6	30688	30693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759020
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